MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TCG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445180
2	NC_008598	CTT	2	6	724	729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445180
3	NC_008598	CGT	2	6	736	741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445180
4	NC_008598	ATC	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445180
5	NC_008598	CAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445180
6	NC_008598	GAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445180
7	NC_008598	CAC	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445180
8	NC_008598	ATT	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
9	NC_008598	TGC	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445181
10	NC_008598	GTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445181
11	NC_008598	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
12	NC_008598	TCA	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445181
13	NC_008598	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445181
14	NC_008598	CTT	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445181
15	NC_008598	TTA	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
16	NC_008598	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445181
17	NC_008598	ATT	2	6	2934	2939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
18	NC_008598	TCA	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445181
19	NC_008598	CCT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445182
20	NC_008598	TCT	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
21	NC_008598	TTC	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
22	NC_008598	CTT	2	6	3138	3143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
23	NC_008598	GTT	2	6	3167	3172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445182
24	NC_008598	TAA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445182
25	NC_008598	TAC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445182
26	NC_008598	TTC	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
27	NC_008598	ATA	2	6	3571	3576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445182
28	NC_008598	CAG	2	6	4206	4211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445183
29	NC_008598	TCA	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445183
30	NC_008598	CTT	2	6	4296	4301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445183
31	NC_008598	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445183
32	NC_008598	CTT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
33	NC_008598	TCT	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
34	NC_008598	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445184
35	NC_008598	TGT	2	6	4668	4673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445184
36	NC_008598	TTC	2	6	4697	4702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
37	NC_008598	ATA	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
38	NC_008598	GTT	2	6	5859	5864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445185
39	NC_008598	CAT	3	9	5868	5876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
40	NC_008598	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
41	NC_008598	ATT	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445185
42	NC_008598	AAT	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
43	NC_008598	TTC	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445185
44	NC_008598	ACT	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
45	NC_008598	GCA	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445185
46	NC_008598	CTC	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445185
47	NC_008598	AAT	2	6	6184	6189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
48	NC_008598	TAA	2	6	6329	6334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445186
49	NC_008598	TCT	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
50	NC_008598	CTA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445186
51	NC_008598	CTT	2	6	6536	6541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
52	NC_008598	TGC	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445186
53	NC_008598	GAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445186
54	NC_008598	TCT	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
55	NC_008598	TGC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445186
56	NC_008598	CAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445186
57	NC_008598	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445186
58	NC_008598	TCC	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445187
59	NC_008598	CTG	2	6	8958	8963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445188
60	NC_008598	TAT	2	6	9087	9092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445188
61	NC_008598	TCA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445188
62	NC_008598	TTC	2	6	9226	9231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
63	NC_008598	TTC	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
64	NC_008598	CTT	2	6	9459	9464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
65	NC_008598	AGA	2	6	9622	9627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445189
66	NC_008598	ATG	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445190
67	NC_008598	AAT	2	6	9947	9952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445190
68	NC_008598	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445190
69	NC_008598	TTA	2	6	10144	10149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445190
70	NC_008598	TTC	3	9	10156	10164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445190
71	NC_008598	ACC	2	6	10270	10275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445190
72	NC_008598	CCT	2	6	10513	10518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445191
73	NC_008598	ATC	3	9	10779	10787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445191
74	NC_008598	TGT	2	6	10887	10892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445192
75	NC_008598	GTT	2	6	10957	10962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445192
76	NC_008598	TCT	2	6	11026	11031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445192
77	NC_008598	CTT	2	6	11051	11056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445192
78	NC_008598	CTG	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445192
79	NC_008598	CCT	2	6	11246	11251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445193
80	NC_008598	TGC	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445193
81	NC_008598	GTG	2	6	11423	11428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118445193
82	NC_008598	TTC	2	6	11444	11449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
83	NC_008598	TAA	2	6	11452	11457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445193
84	NC_008598	TCT	3	9	11632	11640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
85	NC_008598	AGG	2	6	11685	11690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118445193
86	NC_008598	CTT	2	6	11702	11707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
87	NC_008598	CTT	2	6	11891	11896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
88	NC_008598	TTC	3	9	11928	11936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
89	NC_008598	CCT	2	6	11971	11976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445194
90	NC_008598	ATT	2	6	11988	11993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445194
91	NC_008598	TCT	2	6	12028	12033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445194
92	NC_008598	TTG	2	6	12184	12189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445194
93	NC_008598	CAT	2	6	12214	12219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445194
94	NC_008598	GTT	2	6	12229	12234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445194
95	NC_008598	ATG	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445195
96	NC_008598	TAA	2	6	12381	12386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445195
97	NC_008598	TCA	2	6	12395	12400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445195
98	NC_008598	ACG	2	6	12439	12444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445195
99	NC_008598	TTC	2	6	12449	12454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445195
100	NC_008598	TGA	2	6	12546	12551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445196
101	NC_008598	CTT	2	6	12595	12600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445196
102	NC_008598	CTT	2	6	12797	12802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445197
103	NC_008598	CAC	2	6	12823	12828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445197
104	NC_008598	ATC	2	6	12953	12958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445197
105	NC_008598	AGT	2	6	12984	12989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445197
106	NC_008598	TGT	2	6	13024	13029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445197
107	NC_008598	ACT	2	6	13079	13084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445197
108	NC_008598	ATG	2	6	13344	13349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445197
109	NC_008598	CTT	2	6	13373	13378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445197
110	NC_008598	GTT	2	6	13403	13408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445197
111	NC_008598	CAA	2	6	13441	13446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445197
112	NC_008598	ATC	2	6	13482	13487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445197
113	NC_008598	CCA	2	6	13512	13517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445197
114	NC_008598	ATC	2	6	13740	13745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445198
115	NC_008598	AGA	2	6	13890	13895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445198
116	NC_008598	GTA	2	6	13912	13917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445198
117	NC_008598	TGT	2	6	13923	13928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445198
118	NC_008598	GTA	2	6	13936	13941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445198
119	NC_008598	TCT	2	6	14161	14166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445198
120	NC_008598	AGA	2	6	14189	14194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445198
121	NC_008598	TGT	2	6	14253	14258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445198
122	NC_008598	ACA	2	6	14293	14298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445198
123	NC_008598	ATA	2	6	14329	14334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445198
124	NC_008598	CTT	2	6	14370	14375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445199
125	NC_008598	CTG	2	6	14531	14536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445199
126	NC_008598	CCT	2	6	14777	14782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445200
127	NC_008598	ATC	2	6	14957	14962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445200
128	NC_008598	CTG	2	6	14993	14998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445200
129	NC_008598	CAT	3	9	15081	15089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445200
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