MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008598	TCG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445180
2	NC_008598	TACCT	2	10	707	716	20 %	40 %	0 %	40 %	118445180
3	NC_008598	CTT	2	6	724	729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445180
4	NC_008598	CGT	2	6	736	741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445180
5	NC_008598	ATC	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445180
6	NC_008598	CTTCA	2	10	953	962	20 %	40 %	0 %	40 %	118445180
7	NC_008598	TAGT	2	8	1101	1108	25 %	50 %	25 %	0 %	118445180
8	NC_008598	CAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445180
9	NC_008598	TA	3	6	1199	1204	50 %	50 %	0 %	0 %	118445180
10	NC_008598	GAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445180
11	NC_008598	ACAA	2	8	1315	1322	75 %	0 %	0 %	25 %	118445180
12	NC_008598	CCTTT	2	10	1328	1337	0 %	60 %	0 %	40 %	118445180
13	NC_008598	TTTC	2	8	1375	1382	0 %	75 %	0 %	25 %	118445180
14	NC_008598	CATT	2	8	1435	1442	25 %	50 %	0 %	25 %	118445180
15	NC_008598	TA	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	118445180
16	NC_008598	CAC	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445180
17	NC_008598	ATT	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
18	NC_008598	TCTTT	2	10	2430	2439	0 %	80 %	0 %	20 %	118445181
19	NC_008598	TGC	2	6	2457	2462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445181
20	NC_008598	TTTC	2	8	2466	2473	0 %	75 %	0 %	25 %	118445181
21	NC_008598	GTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445181
22	NC_008598	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
23	NC_008598	TCA	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445181
24	NC_008598	TTCG	2	8	2638	2645	0 %	50 %	25 %	25 %	118445181
25	NC_008598	AT	3	6	2650	2655	50 %	50 %	0 %	0 %	118445181
26	NC_008598	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445181
27	NC_008598	CTT	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445181
28	NC_008598	TA	3	6	2766	2771	50 %	50 %	0 %	0 %	118445181
29	NC_008598	TAAA	2	8	2783	2790	75 %	25 %	0 %	0 %	118445181
30	NC_008598	ATTAT	2	10	2875	2884	40 %	60 %	0 %	0 %	118445181
31	NC_008598	TTA	2	6	2897	2902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
32	NC_008598	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445181
33	NC_008598	ATT	2	6	2934	2939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445181
34	NC_008598	TCA	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445181
35	NC_008598	CCT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445182
36	NC_008598	CT	3	6	3011	3016	0 %	50 %	0 %	50 %	118445182
37	NC_008598	TCT	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
38	NC_008598	TTC	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
39	NC_008598	AGCA	2	8	3090	3097	50 %	0 %	25 %	25 %	118445182
40	NC_008598	CTT	2	6	3138	3143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
41	NC_008598	TA	3	6	3155	3160	50 %	50 %	0 %	0 %	118445182
42	NC_008598	GTT	2	6	3167	3172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445182
43	NC_008598	AGTA	2	8	3246	3253	50 %	25 %	25 %	0 %	118445182
44	NC_008598	TAA	2	6	3332	3337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445182
45	NC_008598	AAAT	2	8	3351	3358	75 %	25 %	0 %	0 %	118445182
46	NC_008598	TAC	2	6	3365	3370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445182
47	NC_008598	TTC	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445182
48	NC_008598	TGTT	2	8	3449	3456	0 %	75 %	25 %	0 %	118445182
49	NC_008598	ATA	2	6	3571	3576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445182
50	NC_008598	A	6	6	4108	4113	100 %	0 %	0 %	0 %	118445183
51	NC_008598	CAG	2	6	4206	4211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445183
52	NC_008598	TC	3	6	4231	4236	0 %	50 %	0 %	50 %	118445183
53	NC_008598	TCA	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445183
54	NC_008598	CTT	2	6	4296	4301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445183
55	NC_008598	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445183
56	NC_008598	CTT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
57	NC_008598	TCT	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
58	NC_008598	AT	3	6	4511	4516	50 %	50 %	0 %	0 %	118445184
59	NC_008598	AT	3	6	4528	4533	50 %	50 %	0 %	0 %	118445184
60	NC_008598	TACT	2	8	4537	4544	25 %	50 %	0 %	25 %	118445184
61	NC_008598	TTACA	2	10	4615	4624	40 %	40 %	0 %	20 %	118445184
62	NC_008598	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445184
63	NC_008598	TGT	2	6	4668	4673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445184
64	NC_008598	TTC	2	6	4697	4702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445184
65	NC_008598	T	6	6	5792	5797	0 %	100 %	0 %	0 %	118445185
66	NC_008598	ATA	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
67	NC_008598	GTT	2	6	5859	5864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445185
68	NC_008598	CAT	3	9	5868	5876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
69	NC_008598	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
70	NC_008598	ATT	2	6	5910	5915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445185
71	NC_008598	AAT	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
72	NC_008598	CT	3	6	5972	5977	0 %	50 %	0 %	50 %	118445185
73	NC_008598	TTC	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445185
74	NC_008598	ACT	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445185
75	NC_008598	GCA	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445185
76	NC_008598	TC	3	6	6121	6126	0 %	50 %	0 %	50 %	118445185
77	NC_008598	CTC	2	6	6141	6146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445185
78	NC_008598	AAT	2	6	6184	6189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445185
79	NC_008598	TAA	2	6	6329	6334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445186
80	NC_008598	TCT	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
81	NC_008598	CTA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445186
82	NC_008598	CTT	2	6	6536	6541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
83	NC_008598	TGC	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445186
84	NC_008598	TGAC	2	8	6580	6587	25 %	25 %	25 %	25 %	118445186
85	NC_008598	ACTG	2	8	6603	6610	25 %	25 %	25 %	25 %	118445186
86	NC_008598	GAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445186
87	NC_008598	TCT	2	6	6652	6657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445186
88	NC_008598	TGC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445186
89	NC_008598	AAATC	2	10	6702	6711	60 %	20 %	0 %	20 %	118445186
90	NC_008598	CAT	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445186
91	NC_008598	TAA	2	6	6907	6912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445186
92	NC_008598	T	6	6	7381	7386	0 %	100 %	0 %	0 %	118445187
93	NC_008598	CATTTT	2	12	7536	7547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118445187
94	NC_008598	TCC	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445187
95	NC_008598	CTG	2	6	8958	8963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445188
96	NC_008598	TAT	2	6	9087	9092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445188
97	NC_008598	ACCC	2	8	9103	9110	25 %	0 %	0 %	75 %	118445188
98	NC_008598	TCA	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445188
99	NC_008598	TTC	2	6	9226	9231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
100	NC_008598	TTC	2	6	9262	9267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
101	NC_008598	AAAC	2	8	9375	9382	75 %	0 %	0 %	25 %	118445188
102	NC_008598	AATA	2	8	9441	9448	75 %	25 %	0 %	0 %	118445188
103	NC_008598	CTT	2	6	9459	9464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445188
104	NC_008598	TC	3	6	9501	9506	0 %	50 %	0 %	50 %	118445188
105	NC_008598	TTTTCT	2	12	9585	9596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118445189
106	NC_008598	AGA	2	6	9622	9627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445189
107	NC_008598	T	6	6	9911	9916	0 %	100 %	0 %	0 %	118445190
108	NC_008598	ATG	2	6	9932	9937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445190
109	NC_008598	AAT	2	6	9947	9952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445190
110	NC_008598	TATT	2	8	10078	10085	25 %	75 %	0 %	0 %	118445190
111	NC_008598	TCA	2	6	10123	10128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445190
112	NC_008598	TTA	2	6	10144	10149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445190
113	NC_008598	TTC	3	9	10156	10164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445190
114	NC_008598	ACTT	2	8	10200	10207	25 %	50 %	0 %	25 %	118445190
115	NC_008598	GT	3	6	10221	10226	0 %	50 %	50 %	0 %	118445190
116	NC_008598	ACC	2	6	10270	10275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445190
117	NC_008598	CCT	2	6	10513	10518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445191
118	NC_008598	GTAG	2	8	10608	10615	25 %	25 %	50 %	0 %	118445191
119	NC_008598	GTATTT	2	12	10646	10657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118445191
120	NC_008598	TTTC	2	8	10674	10681	0 %	75 %	0 %	25 %	118445191
121	NC_008598	ATC	3	9	10779	10787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445191
122	NC_008598	TGT	2	6	10887	10892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445192
123	NC_008598	AGATA	2	10	10947	10956	60 %	20 %	20 %	0 %	118445192
124	NC_008598	GTT	2	6	10957	10962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445192
125	NC_008598	TCT	2	6	11026	11031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445192
126	NC_008598	CTT	2	6	11051	11056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445192
127	NC_008598	CTG	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445192
128	NC_008598	TAACTG	2	12	11076	11087	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118445192
129	NC_008598	CCT	2	6	11246	11251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445193
130	NC_008598	TTTCTT	2	12	11262	11273	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118445193
131	NC_008598	TGC	2	6	11301	11306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445193
132	NC_008598	TA	3	6	11382	11387	50 %	50 %	0 %	0 %	118445193
133	NC_008598	GTG	2	6	11423	11428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118445193
134	NC_008598	TTC	2	6	11444	11449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445193
135	NC_008598	TAA	2	6	11452	11457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445193
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256	NC_008598	A	8	8	17374	17381	100 %	0 %	0 %	0 %	118445203
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