MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam plasmid pALH1

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008598	CTT	2	6	33901	33906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445217
502	NC_008598	CGTC	2	8	34008	34015	0 %	25 %	25 %	50 %	118445217
503	NC_008598	ATA	2	6	34170	34175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445218
504	NC_008598	TCT	2	6	34225	34230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445218
505	NC_008598	TTA	2	6	34231	34236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445218
506	NC_008598	TAA	2	6	34263	34268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445218
507	NC_008598	TGTC	2	8	34280	34287	0 %	50 %	25 %	25 %	118445218
508	NC_008598	CAG	2	6	34316	34321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445218
509	NC_008598	AGA	2	6	34343	34348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445218
510	NC_008598	AGT	2	6	34356	34361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445218
511	NC_008598	TTCG	2	8	34936	34943	0 %	50 %	25 %	25 %	118445219
512	NC_008598	CCA	2	6	35052	35057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445219
513	NC_008598	CGT	2	6	35106	35111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445219
514	NC_008598	TCA	2	6	35167	35172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445219
515	NC_008598	CCA	2	6	35210	35215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445219
516	NC_008598	ATTT	2	8	35260	35267	25 %	75 %	0 %	0 %	118445219
517	NC_008598	AT	3	6	35310	35315	50 %	50 %	0 %	0 %	118445219
518	NC_008598	TGA	2	6	35362	35367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445219
519	NC_008598	GAA	2	6	35592	35597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445219
520	NC_008598	CAA	2	6	35656	35661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445219
521	NC_008598	AGA	2	6	35705	35710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445219
522	NC_008598	ATT	2	6	35718	35723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445219
523	NC_008598	AAAC	2	8	35768	35775	75 %	0 %	0 %	25 %	118445219
524	NC_008598	TGG	2	6	35822	35827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118445219
525	NC_008598	T	6	6	35897	35902	0 %	100 %	0 %	0 %	118445219
526	NC_008598	TAAC	2	8	35950	35957	50 %	25 %	0 %	25 %	118445219
527	NC_008598	GAA	2	6	35973	35978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445219
528	NC_008598	ACTA	2	8	36026	36033	50 %	25 %	0 %	25 %	118445219
529	NC_008598	AAC	2	6	36152	36157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445219
530	NC_008598	AAAGA	2	10	36245	36254	80 %	0 %	20 %	0 %	118445220
531	NC_008598	TAT	2	6	36312	36317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445220
532	NC_008598	ATT	2	6	36322	36327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445220
533	NC_008598	GAA	3	9	36332	36340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445220
534	NC_008598	GGT	2	6	36362	36367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118445220
535	NC_008598	T	6	6	36367	36372	0 %	100 %	0 %	0 %	118445220
536	NC_008598	ACTA	2	8	36377	36384	50 %	25 %	0 %	25 %	118445220
537	NC_008598	CGT	2	6	36391	36396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445220
538	NC_008598	AAT	2	6	36446	36451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445220
539	NC_008598	ATT	2	6	36473	36478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445220
540	NC_008598	AGA	2	6	36692	36697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445221
541	NC_008598	CATA	2	8	36740	36747	50 %	25 %	0 %	25 %	118445221
542	NC_008598	TCAAT	2	10	36856	36865	40 %	40 %	0 %	20 %	118445221
543	NC_008598	AGA	3	9	36875	36883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445221
544	NC_008598	AGA	3	9	36938	36946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445221
545	NC_008598	GAA	2	6	36972	36977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445221
546	NC_008598	ATG	2	6	37033	37038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445221
547	NC_008598	GTT	2	6	37158	37163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445221
548	NC_008598	A	6	6	37173	37178	100 %	0 %	0 %	0 %	118445221
549	NC_008598	GCA	3	9	37197	37205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445221
550	NC_008598	AAC	2	6	37216	37221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445221
551	NC_008598	ACA	2	6	37289	37294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445221
552	NC_008598	AGG	2	6	37367	37372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118445221
553	NC_008598	GATT	2	8	37391	37398	25 %	50 %	25 %	0 %	118445221
554	NC_008598	ATC	2	6	37412	37417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445221
555	NC_008598	A	6	6	37446	37451	100 %	0 %	0 %	0 %	118445221
556	NC_008598	CCA	2	6	37530	37535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445221
557	NC_008598	TAA	2	6	37549	37554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445221
558	NC_008598	GAAAA	2	10	37555	37564	80 %	0 %	20 %	0 %	118445221
559	NC_008598	AGG	2	6	37568	37573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118445221
560	NC_008598	GAT	2	6	37623	37628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445222
561	NC_008598	GAAAAT	2	12	37629	37640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118445222
562	NC_008598	GAA	2	6	37683	37688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445222
563	NC_008598	TTTTAC	2	12	37705	37716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118445222
564	NC_008598	GAA	2	6	37755	37760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445222
565	NC_008598	AT	3	6	37761	37766	50 %	50 %	0 %	0 %	118445222
566	NC_008598	AAG	2	6	37845	37850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445222
567	NC_008598	TCA	2	6	37904	37909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445222
568	NC_008598	TTTA	2	8	38130	38137	25 %	75 %	0 %	0 %	118445223
569	NC_008598	ACC	2	6	38145	38150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118445223
570	NC_008598	TAC	2	6	38212	38217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445223
571	NC_008598	GAA	2	6	38241	38246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445223
572	NC_008598	GAT	2	6	38323	38328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445223
573	NC_008598	GAA	2	6	38479	38484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445223
574	NC_008598	TCCA	2	8	38544	38551	25 %	25 %	0 %	50 %	118445223
575	NC_008598	TGC	2	6	38581	38586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445223
576	NC_008598	CAT	2	6	38673	38678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445223
577	NC_008598	CAT	2	6	38739	38744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445223
578	NC_008598	ATC	2	6	38749	38754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445223
579	NC_008598	TTA	2	6	38783	38788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445223
580	NC_008598	TTA	2	6	38798	38803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445223
581	NC_008598	TCC	2	6	38869	38874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445223
582	NC_008598	ATT	2	6	38891	38896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445223
583	NC_008598	CCT	2	6	39127	39132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445224
584	NC_008598	CT	3	6	39171	39176	0 %	50 %	0 %	50 %	118445224
585	NC_008598	ATC	2	6	39245	39250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445224
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587	NC_008598	ATA	2	6	39364	39369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445224
588	NC_008598	TTAA	2	8	39438	39445	50 %	50 %	0 %	0 %	118445225
589	NC_008598	CTA	2	6	39476	39481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445225
590	NC_008598	CAA	2	6	39489	39494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445225
591	NC_008598	TTA	2	6	39530	39535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445225
592	NC_008598	TGC	2	6	39571	39576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445225
593	NC_008598	TTC	2	6	39598	39603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445225
594	NC_008598	GGC	2	6	39611	39616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118445225
595	NC_008598	T	6	6	39672	39677	0 %	100 %	0 %	0 %	118445225
596	NC_008598	TTC	2	6	39691	39696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445225
597	NC_008598	TTC	2	6	39706	39711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445225
598	NC_008598	ATA	2	6	39760	39765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118445225
599	NC_008598	TCT	2	6	39833	39838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445225
600	NC_008598	AGG	2	6	39910	39915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118445225
601	NC_008598	TTC	2	6	39916	39921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445225
602	NC_008598	TCT	2	6	39980	39985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445225
603	NC_008598	TTTC	2	8	39993	40000	0 %	75 %	0 %	25 %	118445225
604	NC_008598	TCT	2	6	40004	40009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445225
605	NC_008598	TGTT	2	8	40018	40025	0 %	75 %	25 %	0 %	118445225
606	NC_008598	ATC	2	6	40055	40060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445225
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608	NC_008598	GTA	2	6	40096	40101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445225
609	NC_008598	TAGT	2	8	40126	40133	25 %	50 %	25 %	0 %	118445226
610	NC_008598	TGA	2	6	40173	40178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445226
611	NC_008598	AACA	2	8	40221	40228	75 %	0 %	0 %	25 %	118445226
612	NC_008598	TGA	2	6	40248	40253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445226
613	NC_008598	TTTC	2	8	40329	40336	0 %	75 %	0 %	25 %	118445226
614	NC_008598	CTG	2	6	40412	40417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445226
615	NC_008598	CGTC	2	8	40435	40442	0 %	25 %	25 %	50 %	118445226
616	NC_008598	AC	3	6	40459	40464	50 %	0 %	0 %	50 %	118445226
617	NC_008598	AAG	2	6	40544	40549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445226
618	NC_008598	CTC	2	6	40568	40573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118445226
619	NC_008598	AT	3	6	40712	40717	50 %	50 %	0 %	0 %	118445226
620	NC_008598	CA	3	6	40762	40767	50 %	0 %	0 %	50 %	118445226
621	NC_008598	TAG	2	6	40817	40822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445226
622	NC_008598	CAG	2	6	40844	40849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445226
623	NC_008598	AGA	2	6	40874	40879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118445226
624	NC_008598	TTC	2	6	40903	40908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445226
625	NC_008598	TCT	2	6	41015	41020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445226
626	NC_008598	TTA	2	6	41056	41061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445226
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885	NC_008598	TCAAT	2	10	54353	54362	40 %	40 %	0 %	20 %	118445240
886	NC_008598	ACA	2	6	54388	54393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118445240
887	NC_008598	CTT	2	6	54395	54400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445240
888	NC_008598	GCT	2	6	54478	54483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445240
889	NC_008598	TTC	2	6	54508	54513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445240
890	NC_008598	ACCA	2	8	54585	54592	50 %	0 %	0 %	50 %	118445240
891	NC_008598	TC	3	6	54674	54679	0 %	50 %	0 %	50 %	118445240
892	NC_008598	TTTA	2	8	54711	54718	25 %	75 %	0 %	0 %	118445240
893	NC_008598	AGTA	2	8	54746	54753	50 %	25 %	25 %	0 %	118445240
894	NC_008598	TCTTT	2	10	54789	54798	0 %	80 %	0 %	20 %	118445240
895	NC_008598	TTAA	2	8	54817	54824	50 %	50 %	0 %	0 %	118445240
896	NC_008598	CTT	2	6	54833	54838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118445240
897	NC_008598	TTA	2	6	54887	54892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118445240
898	NC_008598	CAG	2	6	54896	54901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118445240
899	NC_008598	TA	3	6	54930	54935	50 %	50 %	0 %	0 %	118445240
900	NC_008598	GTC	2	6	54946	54951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445240
901	NC_008598	ATC	2	6	54957	54962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118445240
902	NC_008598	TAAA	2	8	55004	55011	75 %	25 %	0 %	0 %	118445240
903	NC_008598	GTC	2	6	55068	55073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118445240
904	NC_008598	TTCAT	2	10	55087	55096	20 %	60 %	0 %	20 %	118445240
905	NC_008598	TGT	2	6	55168	55173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118445240
906	NC_008598	ATG	2	6	55201	55206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118445240
907	NC_008598	CT	3	6	55234	55239	0 %	50 %	0 %	50 %	118445240

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