MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	T	6	6	375	380	0 %	100 %	0 %	0 %	117621800
2	NC_008568	T	7	7	790	796	0 %	100 %	0 %	0 %	117621801
3	NC_008568	T	6	6	1884	1889	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
4	NC_008568	T	7	7	2169	2175	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
5	NC_008568	T	7	7	2309	2315	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
6	NC_008568	T	7	7	2392	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
7	NC_008568	A	6	6	4905	4910	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
8	NC_008568	T	6	6	5033	5038	0 %	100 %	0 %	0 %	117621804
9	NC_008568	A	6	6	5060	5065	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
10	NC_008568	A	6	6	5223	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
11	NC_008568	A	6	6	5339	5344	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
12	NC_008568	A	6	6	5528	5533	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
13	NC_008568	T	7	7	6817	6823	0 %	100 %	0 %	0 %	117621805
14	NC_008568	T	7	7	7427	7433	0 %	100 %	0 %	0 %	117621806
15	NC_008568	T	6	6	7618	7623	0 %	100 %	0 %	0 %	117621806
16	NC_008568	T	6	6	7625	7630	0 %	100 %	0 %	0 %	117621806
17	NC_008568	A	8	8	7763	7770	100 %	0 %	0 %	0 %	117621806
18	NC_008568	A	6	6	8078	8083	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
19	NC_008568	A	7	7	8085	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
20	NC_008568	A	6	6	8137	8142	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
21	NC_008568	A	6	6	8447	8452	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
22	NC_008568	T	6	6	8540	8545	0 %	100 %	0 %	0 %	117621807
23	NC_008568	A	6	6	8722	8727	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
24	NC_008568	A	6	6	8800	8805	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
25	NC_008568	A	8	8	8926	8933	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
26	NC_008568	A	6	6	9239	9244	100 %	0 %	0 %	0 %	117621808
27	NC_008568	T	6	6	9313	9318	0 %	100 %	0 %	0 %	117621808
28	NC_008568	A	8	8	9391	9398	100 %	0 %	0 %	0 %	117621808
29	NC_008568	A	7	7	9701	9707	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
30	NC_008568	A	8	8	9763	9770	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
31	NC_008568	A	6	6	9911	9916	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
32	NC_008568	A	7	7	10108	10114	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
33	NC_008568	A	6	6	10167	10172	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
34	NC_008568	A	7	7	10276	10282	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
35	NC_008568	A	6	6	10385	10390	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
36	NC_008568	A	7	7	10504	10510	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
37	NC_008568	A	6	6	10629	10634	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
38	NC_008568	T	7	7	10675	10681	0 %	100 %	0 %	0 %	117621809
39	NC_008568	A	6	6	10727	10732	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
40	NC_008568	A	7	7	10751	10757	100 %	0 %	0 %	0 %	117621810
41	NC_008568	A	7	7	10818	10824	100 %	0 %	0 %	0 %	117621810
42	NC_008568	T	6	6	11677	11682	0 %	100 %	0 %	0 %	117621811
43	NC_008568	T	6	6	11768	11773	0 %	100 %	0 %	0 %	117621811
44	NC_008568	A	6	6	12129	12134	100 %	0 %	0 %	0 %	117621812
45	NC_008568	A	7	7	12190	12196	100 %	0 %	0 %	0 %	117621812
46	NC_008568	A	6	6	12836	12841	100 %	0 %	0 %	0 %	117621812
47	NC_008568	A	6	6	13925	13930	100 %	0 %	0 %	0 %	117621813
48	NC_008568	T	8	8	14653	14660	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
49	NC_008568	T	6	6	14855	14860	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
50	NC_008568	T	6	6	15020	15025	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
51	NC_008568	T	7	7	15128	15134	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
52	NC_008568	T	6	6	15174	15179	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
53	NC_008568	T	7	7	15196	15202	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
54	NC_008568	T	6	6	15263	15268	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
55	NC_008568	T	7	7	15301	15307	0 %	100 %	0 %	0 %	117621814
56	NC_008568	T	6	6	16651	16656	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
57	NC_008568	A	6	6	16667	16672	100 %	0 %	0 %	0 %	117621815
58	NC_008568	T	6	6	16822	16827	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
59	NC_008568	T	6	6	17026	17031	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
60	NC_008568	T	6	6	17155	17160	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
61	NC_008568	T	7	7	17235	17241	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
62	NC_008568	T	7	7	17245	17251	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
63	NC_008568	T	8	8	17328	17335	0 %	100 %	0 %	0 %	117621815
64	NC_008568	G	7	7	18106	18112	0 %	0 %	100 %	0 %	117621817
65	NC_008568	T	6	6	18384	18389	0 %	100 %	0 %	0 %	117621817
66	NC_008568	A	7	7	18401	18407	100 %	0 %	0 %	0 %	117621817
67	NC_008568	T	6	6	18519	18524	0 %	100 %	0 %	0 %	117621817
68	NC_008568	A	6	6	18919	18924	100 %	0 %	0 %	0 %	117621818
69	NC_008568	A	6	6	19211	19216	100 %	0 %	0 %	0 %	117621819
70	NC_008568	A	7	7	19409	19415	100 %	0 %	0 %	0 %	117621820
71	NC_008568	A	8	8	19508	19515	100 %	0 %	0 %	0 %	117621820
72	NC_008568	T	6	6	19525	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	117621820
73	NC_008568	T	6	6	20391	20396	0 %	100 %	0 %	0 %	117621821
74	NC_008568	T	6	6	20550	20555	0 %	100 %	0 %	0 %	117621821
75	NC_008568	T	7	7	21162	21168	0 %	100 %	0 %	0 %	117621822
76	NC_008568	A	6	6	21178	21183	100 %	0 %	0 %	0 %	117621822
77	NC_008568	A	8	8	21220	21227	100 %	0 %	0 %	0 %	117621822
78	NC_008568	A	7	7	21254	21260	100 %	0 %	0 %	0 %	117621822
79	NC_008568	A	6	6	21454	21459	100 %	0 %	0 %	0 %	117621822
80	NC_008568	A	6	6	21543	21548	100 %	0 %	0 %	0 %	117621822
81	NC_008568	A	7	7	21585	21591	100 %	0 %	0 %	0 %	117621822
82	NC_008568	T	6	6	21672	21677	0 %	100 %	0 %	0 %	117621822
83	NC_008568	A	9	9	22820	22828	100 %	0 %	0 %	0 %	117621825
84	NC_008568	T	7	7	23348	23354	0 %	100 %	0 %	0 %	117621826
85	NC_008568	T	6	6	23458	23463	0 %	100 %	0 %	0 %	117621826
86	NC_008568	T	6	6	23485	23490	0 %	100 %	0 %	0 %	117621827
87	NC_008568	T	6	6	23583	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	117621827
88	NC_008568	T	6	6	23611	23616	0 %	100 %	0 %	0 %	117621827
89	NC_008568	T	6	6	23974	23979	0 %	100 %	0 %	0 %	117621828
90	NC_008568	A	7	7	24318	24324	100 %	0 %	0 %	0 %	117621828
91	NC_008568	T	8	8	24588	24595	0 %	100 %	0 %	0 %	117621828
92	NC_008568	T	6	6	24701	24706	0 %	100 %	0 %	0 %	117621828
93	NC_008568	A	7	7	25242	25248	100 %	0 %	0 %	0 %	117621830
94	NC_008568	A	6	6	25706	25711	100 %	0 %	0 %	0 %	117621830
95	NC_008568	T	6	6	25814	25819	0 %	100 %	0 %	0 %	117621830
96	NC_008568	A	6	6	26178	26183	100 %	0 %	0 %	0 %	117621830
97	NC_008568	T	6	6	26202	26207	0 %	100 %	0 %	0 %	117621830
98	NC_008568	A	6	6	26275	26280	100 %	0 %	0 %	0 %	117621830
99	NC_008568	A	6	6	26461	26466	100 %	0 %	0 %	0 %	117621831
100	NC_008568	A	6	6	26620	26625	100 %	0 %	0 %	0 %	117621831
101	NC_008568	T	6	6	26897	26902	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
102	NC_008568	T	8	8	26904	26911	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
103	NC_008568	T	8	8	26913	26920	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
104	NC_008568	T	6	6	26942	26947	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
105	NC_008568	T	6	6	26957	26962	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
106	NC_008568	T	8	8	26964	26971	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
107	NC_008568	T	6	6	26998	27003	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
108	NC_008568	T	6	6	27126	27131	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
109	NC_008568	T	6	6	27309	27314	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
110	NC_008568	T	6	6	27358	27363	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
111	NC_008568	T	8	8	27444	27451	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
112	NC_008568	T	8	8	27554	27561	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
113	NC_008568	T	6	6	27591	27596	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
114	NC_008568	T	7	7	27606	27612	0 %	100 %	0 %	0 %	117621831
115	NC_008568	T	6	6	28130	28135	0 %	100 %	0 %	0 %	117621832
116	NC_008568	T	7	7	28509	28515	0 %	100 %	0 %	0 %	117621833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.