MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	AT	3	6	891	896	50 %	50 %	0 %	0 %	117621801
2	NC_008568	TA	3	6	1416	1421	50 %	50 %	0 %	0 %	117621802
3	NC_008568	CA	3	6	1981	1986	50 %	0 %	0 %	50 %	117621803
4	NC_008568	CA	3	6	2147	2152	50 %	0 %	0 %	50 %	117621803
5	NC_008568	AT	3	6	6447	6452	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
6	NC_008568	AT	3	6	6731	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
7	NC_008568	TC	3	6	6836	6841	0 %	50 %	0 %	50 %	117621805
8	NC_008568	TA	3	6	8002	8007	50 %	50 %	0 %	0 %	117621807
9	NC_008568	AT	3	6	9189	9194	50 %	50 %	0 %	0 %	117621808
10	NC_008568	AT	3	6	9456	9461	50 %	50 %	0 %	0 %	117621808
11	NC_008568	AT	3	6	9871	9876	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
12	NC_008568	AT	3	6	9941	9946	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
13	NC_008568	TA	3	6	10021	10026	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
14	NC_008568	AT	3	6	10305	10310	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
15	NC_008568	TA	3	6	10624	10629	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
16	NC_008568	GT	3	6	10670	10675	0 %	50 %	50 %	0 %	117621809
17	NC_008568	AT	3	6	11685	11690	50 %	50 %	0 %	0 %	117621811
18	NC_008568	TG	3	6	11790	11795	0 %	50 %	50 %	0 %	117621811
19	NC_008568	TG	3	6	12016	12021	0 %	50 %	50 %	0 %	117621812
20	NC_008568	AT	3	6	12597	12602	50 %	50 %	0 %	0 %	117621812
21	NC_008568	AT	3	6	12795	12800	50 %	50 %	0 %	0 %	117621812
22	NC_008568	CT	3	6	16738	16743	0 %	50 %	0 %	50 %	117621815
23	NC_008568	AT	3	6	18322	18327	50 %	50 %	0 %	0 %	117621817
24	NC_008568	AT	3	6	18889	18894	50 %	50 %	0 %	0 %	117621818
25	NC_008568	AG	3	6	19570	19575	50 %	0 %	50 %	0 %	117621820
26	NC_008568	TA	3	6	19994	19999	50 %	50 %	0 %	0 %	117621820
27	NC_008568	AT	3	6	20269	20274	50 %	50 %	0 %	0 %	117621821
28	NC_008568	TA	3	6	20459	20464	50 %	50 %	0 %	0 %	117621821
29	NC_008568	AT	3	6	20935	20940	50 %	50 %	0 %	0 %	117621822
30	NC_008568	TA	3	6	21283	21288	50 %	50 %	0 %	0 %	117621822
31	NC_008568	TA	4	8	23528	23535	50 %	50 %	0 %	0 %	117621827
32	NC_008568	CA	3	6	24296	24301	50 %	0 %	0 %	50 %	117621828
33	NC_008568	TA	3	6	24310	24315	50 %	50 %	0 %	0 %	117621828
34	NC_008568	AC	3	6	25587	25592	50 %	0 %	0 %	50 %	117621830
35	NC_008568	AT	3	6	26403	26408	50 %	50 %	0 %	0 %	117621830
36	NC_008568	TG	3	6	27506	27511	0 %	50 %	50 %	0 %	117621831
37	NC_008568	GC	3	6	28097	28102	0 %	0 %	50 %	50 %	117621832

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.