MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	AACAA	2	10	5280	5289	80 %	0 %	0 %	20 %	117621804
2	NC_008568	CAAAA	2	10	5493	5502	80 %	0 %	0 %	20 %	117621804
3	NC_008568	AAAAT	2	10	6481	6490	80 %	20 %	0 %	0 %	117621805
4	NC_008568	AAAAT	2	10	7604	7613	80 %	20 %	0 %	0 %	117621806
5	NC_008568	AGAAA	2	10	8409	8418	80 %	0 %	20 %	0 %	117621807
6	NC_008568	TCAAA	2	10	8691	8700	60 %	20 %	0 %	20 %	117621807
7	NC_008568	GATAA	2	10	9613	9622	60 %	20 %	20 %	0 %	117621809
8	NC_008568	AACTA	2	10	9975	9984	60 %	20 %	0 %	20 %	117621809
9	NC_008568	ATAAA	2	10	10535	10544	80 %	20 %	0 %	0 %	117621809
10	NC_008568	TACTT	2	10	11749	11758	20 %	60 %	0 %	20 %	117621811
11	NC_008568	AAAAT	2	10	14007	14016	80 %	20 %	0 %	0 %	117621813
12	NC_008568	AGAAA	2	10	14035	14044	80 %	0 %	20 %	0 %	117621813
13	NC_008568	AAATT	2	10	14106	14115	60 %	40 %	0 %	0 %	117621813
14	NC_008568	TCCTT	2	10	16480	16489	0 %	60 %	0 %	40 %	117621815
15	NC_008568	ATTTG	2	10	20540	20549	20 %	60 %	20 %	0 %	117621821
16	NC_008568	ATATT	2	10	21390	21399	40 %	60 %	0 %	0 %	117621822
17	NC_008568	TCAAA	2	10	21655	21664	60 %	20 %	0 %	20 %	117621822
18	NC_008568	AGAAT	2	10	23039	23048	60 %	20 %	20 %	0 %	117621826
19	NC_008568	AAGAA	2	10	23424	23433	80 %	0 %	20 %	0 %	117621826
20	NC_008568	CTTTA	2	10	25187	25196	20 %	60 %	0 %	20 %	117621830
21	NC_008568	TATAT	2	10	27048	27057	40 %	60 %	0 %	0 %	117621831
22	NC_008568	TTGAT	2	10	27397	27406	20 %	60 %	20 %	0 %	117621831
23	NC_008568	TTTCT	2	10	27491	27500	0 %	80 %	0 %	20 %	117621831
24	NC_008568	GTGTG	2	10	28411	28420	0 %	40 %	60 %	0 %	117621833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.