MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	TCTT	2	8	805	812	0 %	75 %	0 %	25 %	117621801
2	NC_008568	TTTG	2	8	1523	1530	0 %	75 %	25 %	0 %	117621802
3	NC_008568	AGAT	2	8	1699	1706	50 %	25 %	25 %	0 %	117621803
4	NC_008568	CTTT	2	8	4968	4975	0 %	75 %	0 %	25 %	117621804
5	NC_008568	AAAT	2	8	5010	5017	75 %	25 %	0 %	0 %	117621804
6	NC_008568	GATA	2	8	5332	5339	50 %	25 %	25 %	0 %	117621804
7	NC_008568	ATTA	2	8	6513	6520	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
8	NC_008568	TCTA	2	8	6526	6533	25 %	50 %	0 %	25 %	117621805
9	NC_008568	AATC	2	8	6590	6597	50 %	25 %	0 %	25 %	117621805
10	NC_008568	AATG	2	8	6660	6667	50 %	25 %	25 %	0 %	117621805
11	NC_008568	GATT	2	8	7074	7081	25 %	50 %	25 %	0 %	117621805
12	NC_008568	CATT	2	8	7803	7810	25 %	50 %	0 %	25 %	117621806
13	NC_008568	TACT	2	8	8066	8073	25 %	50 %	0 %	25 %	117621807
14	NC_008568	CAAA	2	8	8148	8155	75 %	0 %	0 %	25 %	117621807
15	NC_008568	GATT	2	8	8339	8346	25 %	50 %	25 %	0 %	117621807
16	NC_008568	AGCA	2	8	9384	9391	50 %	0 %	25 %	25 %	117621808
17	NC_008568	ATCA	2	8	9918	9925	50 %	25 %	0 %	25 %	117621809
18	NC_008568	GCAA	2	8	10312	10319	50 %	0 %	25 %	25 %	117621809
19	NC_008568	AAAT	2	8	10491	10498	75 %	25 %	0 %	0 %	117621809
20	NC_008568	TAAA	2	8	10589	10596	75 %	25 %	0 %	0 %	117621809
21	NC_008568	AAAG	2	8	10603	10610	75 %	0 %	25 %	0 %	117621809
22	NC_008568	TTAA	2	8	10721	10728	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
23	NC_008568	TAAA	2	8	10761	10768	75 %	25 %	0 %	0 %	117621810
24	NC_008568	AGAA	2	8	12102	12109	75 %	0 %	25 %	0 %	117621812
25	NC_008568	AGTG	2	8	12752	12759	25 %	25 %	50 %	0 %	117621812
26	NC_008568	TGTA	2	8	14678	14685	25 %	50 %	25 %	0 %	117621814
27	NC_008568	GTTT	2	8	14839	14846	0 %	75 %	25 %	0 %	117621814
28	NC_008568	ATCT	2	8	16406	16413	25 %	50 %	0 %	25 %	117621815
29	NC_008568	TTGA	2	8	16754	16761	25 %	50 %	25 %	0 %	117621815
30	NC_008568	ATTA	2	8	16766	16773	50 %	50 %	0 %	0 %	117621815
31	NC_008568	GTTT	2	8	17142	17149	0 %	75 %	25 %	0 %	117621815
32	NC_008568	TAAA	2	8	18335	18342	75 %	25 %	0 %	0 %	117621817
33	NC_008568	TGAT	2	8	19175	19182	25 %	50 %	25 %	0 %	117621819
34	NC_008568	AATA	2	8	19651	19658	75 %	25 %	0 %	0 %	117621820
35	NC_008568	TATT	2	8	19870	19877	25 %	75 %	0 %	0 %	117621820
36	NC_008568	TATT	2	8	19975	19982	25 %	75 %	0 %	0 %	117621820
37	NC_008568	CTAA	2	8	20046	20053	50 %	25 %	0 %	25 %	117621820
38	NC_008568	ATTT	2	8	20363	20370	25 %	75 %	0 %	0 %	117621821
39	NC_008568	AAGA	2	8	21019	21026	75 %	0 %	25 %	0 %	117621822
40	NC_008568	AGTA	2	8	21498	21505	50 %	25 %	25 %	0 %	117621822
41	NC_008568	ATCA	2	8	21520	21527	50 %	25 %	0 %	25 %	117621822
42	NC_008568	GATA	2	8	21856	21863	50 %	25 %	25 %	0 %	117621822
43	NC_008568	CAAG	2	8	21872	21879	50 %	0 %	25 %	25 %	117621822
44	NC_008568	TAAA	2	8	22226	22233	75 %	25 %	0 %	0 %	117621823
45	NC_008568	TTGT	2	8	22235	22242	0 %	75 %	25 %	0 %	117621823
46	NC_008568	TAAT	2	8	22291	22298	50 %	50 %	0 %	0 %	117621823
47	NC_008568	CAAA	2	8	22357	22364	75 %	0 %	0 %	25 %	117621824
48	NC_008568	TATG	2	8	22945	22952	25 %	50 %	25 %	0 %	117621826
49	NC_008568	CTGT	2	8	22979	22986	0 %	50 %	25 %	25 %	117621826
50	NC_008568	TTTG	2	8	23333	23340	0 %	75 %	25 %	0 %	117621826
51	NC_008568	TTGT	2	8	23552	23559	0 %	75 %	25 %	0 %	117621827
52	NC_008568	AAAT	2	8	23623	23630	75 %	25 %	0 %	0 %	117621827
53	NC_008568	ATTC	2	8	24039	24046	25 %	50 %	0 %	25 %	117621828
54	NC_008568	CTAT	2	8	24283	24290	25 %	50 %	0 %	25 %	117621828
55	NC_008568	TAAT	3	12	24719	24730	50 %	50 %	0 %	0 %	117621828
56	NC_008568	ACAG	2	8	24778	24785	50 %	0 %	25 %	25 %	117621829
57	NC_008568	AACA	3	12	24828	24839	75 %	0 %	0 %	25 %	117621829
58	NC_008568	TTGA	2	8	25727	25734	25 %	50 %	25 %	0 %	117621830
59	NC_008568	CAAA	2	8	25999	26006	75 %	0 %	0 %	25 %	117621830
60	NC_008568	CACC	2	8	26606	26613	25 %	0 %	0 %	75 %	117621831
61	NC_008568	GTAA	2	8	26883	26890	50 %	25 %	25 %	0 %	117621831
62	NC_008568	TTTC	2	8	27533	27540	0 %	75 %	0 %	25 %	117621831
63	NC_008568	TGGT	2	8	28042	28049	0 %	50 %	50 %	0 %	117621832
64	NC_008568	TTAT	2	8	28456	28463	25 %	75 %	0 %	0 %	117621833
65	NC_008568	TACA	3	12	28466	28477	50 %	25 %	0 %	25 %	117621833

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.