MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	ATC	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
2	NC_008568	TAC	2	6	468	473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
3	NC_008568	TAA	2	6	479	484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621800
4	NC_008568	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621801
5	NC_008568	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621801
6	NC_008568	TAA	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621801
7	NC_008568	ATA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621801
8	NC_008568	TAT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621802
9	NC_008568	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621802
10	NC_008568	TAA	2	6	1577	1582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621802
11	NC_008568	CAT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621802
12	NC_008568	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621802
13	NC_008568	ATA	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
14	NC_008568	TCT	2	6	1867	1872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621803
15	NC_008568	TAA	2	6	1972	1977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
16	NC_008568	AAT	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
17	NC_008568	ATC	2	6	2081	2086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621803
18	NC_008568	TCT	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621803
19	NC_008568	AGA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621803
20	NC_008568	ACA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621804
21	NC_008568	AAT	2	6	5248	5253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621804
22	NC_008568	ACG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621804
23	NC_008568	ACC	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621804
24	NC_008568	TAT	2	6	5309	5314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621804
25	NC_008568	GAA	2	6	5429	5434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621804
26	NC_008568	ATA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621804
27	NC_008568	AAG	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621804
28	NC_008568	TAA	2	6	6692	6697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
29	NC_008568	TCA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621805
30	NC_008568	TAA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
31	NC_008568	TAC	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621805
32	NC_008568	ATA	2	6	6949	6954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
33	NC_008568	GAA	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621805
34	NC_008568	CCA	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621806
35	NC_008568	GTT	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621806
36	NC_008568	ATC	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621806
37	NC_008568	TTA	2	6	7295	7300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621806
38	NC_008568	CAT	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621806
39	NC_008568	TAT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621806
40	NC_008568	CAA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621806
41	NC_008568	AAT	2	6	7396	7401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
42	NC_008568	TAA	2	6	7487	7492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
43	NC_008568	AAT	2	6	7680	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
44	NC_008568	ATT	2	6	8058	8063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
45	NC_008568	ATT	2	6	8196	8201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
46	NC_008568	GAA	2	6	8289	8294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
47	NC_008568	ATG	2	6	8316	8321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621807
48	NC_008568	CAA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
49	NC_008568	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
50	NC_008568	TAA	2	6	8453	8458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621807
51	NC_008568	AAC	2	6	8484	8489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
52	NC_008568	TTA	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
53	NC_008568	TAA	2	6	8519	8524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621807
54	NC_008568	CAA	2	6	8629	8634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
55	NC_008568	TAC	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621807
56	NC_008568	GAA	2	6	8670	8675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
57	NC_008568	CAA	2	6	8711	8716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
58	NC_008568	AGG	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621807
59	NC_008568	AGA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
60	NC_008568	AGA	2	6	9196	9201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
61	NC_008568	AGA	2	6	9295	9300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
62	NC_008568	AGA	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
63	NC_008568	ATA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
64	NC_008568	AAT	2	6	9640	9645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
65	NC_008568	AGA	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621809
66	NC_008568	TAA	2	6	9885	9890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
67	NC_008568	TAA	2	6	9968	9973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
68	NC_008568	ATT	2	6	10060	10065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621809
69	NC_008568	AAG	2	6	10067	10072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621809
70	NC_008568	GAA	2	6	10081	10086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621809
71	NC_008568	ATA	2	6	10271	10276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
72	NC_008568	CAA	2	6	10377	10382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621809
73	NC_008568	ATA	2	6	10436	10441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
74	NC_008568	GAT	2	6	10515	10520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621809
75	NC_008568	GTA	2	6	10616	10621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621809
76	NC_008568	TGT	2	6	11716	11721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621811
77	NC_008568	TAA	2	6	11838	11843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621811
78	NC_008568	TTA	2	6	11851	11856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621811
79	NC_008568	TAA	2	6	12074	12079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621812
80	NC_008568	ATC	2	6	12145	12150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621812
81	NC_008568	TAA	2	6	12170	12175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621812
82	NC_008568	GAA	3	9	12207	12215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621812
83	NC_008568	ATT	2	6	12230	12235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621812
84	NC_008568	AGA	2	6	12260	12265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621812
85	NC_008568	GTG	2	6	12325	12330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621812
86	NC_008568	GTG	2	6	12334	12339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621812
87	NC_008568	TGA	2	6	12449	12454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621812
88	NC_008568	AGA	4	12	12458	12469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621812
89	NC_008568	AGA	3	9	12488	12496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621812
90	NC_008568	TTA	3	9	12497	12505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621812
91	NC_008568	TGA	2	6	12506	12511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621812
92	NC_008568	CAA	2	6	12622	12627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621812
93	NC_008568	AGA	2	6	12683	12688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621812
94	NC_008568	AGA	2	6	12707	12712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621812
95	NC_008568	TTA	2	6	12909	12914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621812
96	NC_008568	AAT	2	6	12932	12937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621812
97	NC_008568	ATT	2	6	13942	13947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621813
98	NC_008568	CTT	2	6	13963	13968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621813
99	NC_008568	ATG	2	6	13998	14003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621813
100	NC_008568	GAT	2	6	14018	14023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621813
101	NC_008568	AAT	2	6	14123	14128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621813
102	NC_008568	TTC	2	6	14146	14151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621813
103	NC_008568	ATT	2	6	14619	14624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621814
104	NC_008568	TAA	2	6	14744	14749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621814
105	NC_008568	ATA	2	6	14788	14793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621814
106	NC_008568	CAA	2	6	14872	14877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621814
107	NC_008568	CGT	2	6	14881	14886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621814
108	NC_008568	ACA	2	6	14941	14946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621814
109	NC_008568	TAT	2	6	15037	15042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621814
110	NC_008568	TTC	3	9	15116	15124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621814
111	NC_008568	AGC	2	6	15189	15194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621814
112	NC_008568	CTT	2	6	15223	15228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621814
113	NC_008568	CTT	2	6	15241	15246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621814
114	NC_008568	CTT	2	6	15259	15264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621814
115	NC_008568	CTT	2	6	16431	16436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
116	NC_008568	GAA	2	6	16437	16442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621815
117	NC_008568	CTT	2	6	16459	16464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
118	NC_008568	GAA	2	6	16465	16470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621815
119	NC_008568	GTT	2	6	16471	16476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621815
120	NC_008568	AGA	3	9	16514	16522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621815
121	NC_008568	ACC	2	6	16580	16585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621815
122	NC_008568	TTC	2	6	16591	16596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
123	NC_008568	TAA	2	6	16748	16753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621815
124	NC_008568	TTC	2	6	16781	16786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
125	NC_008568	TAT	2	6	16841	16846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621815
126	NC_008568	TTC	2	6	16855	16860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
127	NC_008568	TTA	2	6	16920	16925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621815
128	NC_008568	TCA	2	6	17034	17039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621815
129	NC_008568	CTT	2	6	17059	17064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
130	NC_008568	TCT	2	6	17076	17081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621815
131	NC_008568	ATA	2	6	17087	17092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621815
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.