MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008567	AT	3	6	704	709	50 %	50 %	0 %	0 %	117621744
2	NC_008567	AT	3	6	3541	3546	50 %	50 %	0 %	0 %	117621750
3	NC_008567	AG	3	6	3805	3810	50 %	0 %	50 %	0 %	117621751
4	NC_008567	TA	3	6	3974	3979	50 %	50 %	0 %	0 %	117621751
5	NC_008567	TA	3	6	4206	4211	50 %	50 %	0 %	0 %	117621752
6	NC_008567	TA	3	6	4536	4541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621753
7	NC_008567	AT	3	6	4545	4550	50 %	50 %	0 %	0 %	117621753
8	NC_008567	TA	3	6	4652	4657	50 %	50 %	0 %	0 %	117621753
9	NC_008567	AT	3	6	5444	5449	50 %	50 %	0 %	0 %	117621754
10	NC_008567	AT	3	6	5530	5535	50 %	50 %	0 %	0 %	117621754
11	NC_008567	AT	3	6	6458	6463	50 %	50 %	0 %	0 %	117621756
12	NC_008567	AT	3	6	6680	6685	50 %	50 %	0 %	0 %	117621756
13	NC_008567	AT	3	6	7540	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	117621757
14	NC_008567	AT	3	6	8413	8418	50 %	50 %	0 %	0 %	117621760
15	NC_008567	TA	3	6	9226	9231	50 %	50 %	0 %	0 %	117621761
16	NC_008567	CT	3	6	9273	9278	0 %	50 %	0 %	50 %	117621761
17	NC_008567	TA	3	6	9900	9905	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
18	NC_008567	AT	3	6	9962	9967	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
19	NC_008567	AT	3	6	10717	10722	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
20	NC_008567	AT	3	6	11158	11163	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
21	NC_008567	AC	3	6	11299	11304	50 %	0 %	0 %	50 %	117621762
22	NC_008567	TA	3	6	12471	12476	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
23	NC_008567	TA	3	6	12847	12852	50 %	50 %	0 %	0 %	117621762
24	NC_008567	AC	3	6	13879	13884	50 %	0 %	0 %	50 %	117621763
25	NC_008567	AT	3	6	14409	14414	50 %	50 %	0 %	0 %	117621764
26	NC_008567	TA	3	6	15219	15224	50 %	50 %	0 %	0 %	117621766
27	NC_008567	AT	3	6	16250	16255	50 %	50 %	0 %	0 %	117621769
28	NC_008567	AT	3	6	17144	17149	50 %	50 %	0 %	0 %	117621771
29	NC_008567	AT	3	6	17287	17292	50 %	50 %	0 %	0 %	117621772
30	NC_008567	AT	3	6	17767	17772	50 %	50 %	0 %	0 %	117621774
31	NC_008567	TA	4	8	21511	21518	50 %	50 %	0 %	0 %	117621779
32	NC_008567	AT	3	6	21887	21892	50 %	50 %	0 %	0 %	117621780
33	NC_008567	TA	3	6	21938	21943	50 %	50 %	0 %	0 %	117621780
34	NC_008567	AT	3	6	22362	22367	50 %	50 %	0 %	0 %	117621781
35	NC_008567	AT	3	6	22968	22973	50 %	50 %	0 %	0 %	117621782
36	NC_008567	TA	3	6	30059	30064	50 %	50 %	0 %	0 %	117621793
37	NC_008567	GT	3	6	30899	30904	0 %	50 %	50 %	0 %	117621797
38	NC_008567	TA	3	6	30969	30974	50 %	50 %	0 %	0 %	117621797
39	NC_008567	AT	3	6	31465	31470	50 %	50 %	0 %	0 %	117621798

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.