MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	AG	3	6	1310	1315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621707
2	NC_008566	AT	3	6	2536	2541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
3	NC_008566	AC	3	6	2565	2570	50 %	0 %	0 %	50 %	117621708
4	NC_008566	AT	3	6	2571	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	117621708
5	NC_008566	AT	3	6	3253	3258	50 %	50 %	0 %	0 %	117621709
6	NC_008566	CT	3	6	7037	7042	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
7	NC_008566	CT	3	6	7097	7102	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
8	NC_008566	CT	3	6	7118	7123	0 %	50 %	0 %	50 %	117621715
9	NC_008566	AT	3	6	7352	7357	50 %	50 %	0 %	0 %	117621715
10	NC_008566	AC	4	8	7370	7377	50 %	0 %	0 %	50 %	117621715
11	NC_008566	AT	4	8	7776	7783	50 %	50 %	0 %	0 %	117621715
12	NC_008566	AC	3	6	9302	9307	50 %	0 %	0 %	50 %	117621717
13	NC_008566	TA	4	8	11790	11797	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
14	NC_008566	TA	4	8	11924	11931	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
15	NC_008566	TA	4	8	11946	11953	50 %	50 %	0 %	0 %	117621719
16	NC_008566	AC	3	6	12110	12115	50 %	0 %	0 %	50 %	117621719
17	NC_008566	TA	3	6	13545	13550	50 %	50 %	0 %	0 %	117621721
18	NC_008566	TA	3	6	13565	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	117621721
19	NC_008566	TA	3	6	13948	13953	50 %	50 %	0 %	0 %	117621722
20	NC_008566	AT	3	6	14208	14213	50 %	50 %	0 %	0 %	117621722
21	NC_008566	GT	3	6	15853	15858	0 %	50 %	50 %	0 %	117621723
22	NC_008566	TA	3	6	16093	16098	50 %	50 %	0 %	0 %	117621723
23	NC_008566	GT	3	6	16179	16184	0 %	50 %	50 %	0 %	117621723
24	NC_008566	TA	3	6	16301	16306	50 %	50 %	0 %	0 %	117621723
25	NC_008566	TG	3	6	16317	16322	0 %	50 %	50 %	0 %	117621723
26	NC_008566	TA	3	6	17907	17912	50 %	50 %	0 %	0 %	117621724
27	NC_008566	GA	3	6	18261	18266	50 %	0 %	50 %	0 %	117621725
28	NC_008566	TA	4	8	18897	18904	50 %	50 %	0 %	0 %	117621726
29	NC_008566	CT	3	6	19832	19837	0 %	50 %	0 %	50 %	117621728
30	NC_008566	CA	3	6	19997	20002	50 %	0 %	0 %	50 %	117621728
31	NC_008566	AT	3	6	20932	20937	50 %	50 %	0 %	0 %	117621730
32	NC_008566	CT	3	6	22192	22197	0 %	50 %	0 %	50 %	117621731
33	NC_008566	TA	3	6	24320	24325	50 %	50 %	0 %	0 %	117621732
34	NC_008566	AT	3	6	26327	26332	50 %	50 %	0 %	0 %	117621734
35	NC_008566	CT	3	6	32445	32450	0 %	50 %	0 %	50 %	117621741
36	NC_008566	AT	4	8	32734	32741	50 %	50 %	0 %	0 %	117621741
37	NC_008566	TA	3	6	33505	33510	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
38	NC_008566	AT	3	6	33636	33641	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
39	NC_008566	AT	3	6	33892	33897	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
40	NC_008566	AT	3	6	33900	33905	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742
41	NC_008566	TA	3	6	34001	34006	50 %	50 %	0 %	0 %	117621742

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.