MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp34

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008566	ATATA	2	10	926	935	60 %	40 %	0 %	0 %	117621707
2	NC_008566	TTGGG	2	10	1266	1275	0 %	40 %	60 %	0 %	117621707
3	NC_008566	TACAA	2	10	1727	1736	60 %	20 %	0 %	20 %	117621707
4	NC_008566	TTTAA	2	10	3400	3409	40 %	60 %	0 %	0 %	117621710
5	NC_008566	CTTAT	2	10	7256	7265	20 %	60 %	0 %	20 %	117621715
6	NC_008566	TCTTT	2	10	10040	10049	0 %	80 %	0 %	20 %	117621718
7	NC_008566	AATTT	2	10	12868	12877	40 %	60 %	0 %	0 %	117621720
8	NC_008566	TATTT	2	10	13330	13339	20 %	80 %	0 %	0 %	117621721
9	NC_008566	TGAAA	2	10	13736	13745	60 %	20 %	20 %	0 %	117621722
10	NC_008566	ATAAA	2	10	14071	14080	80 %	20 %	0 %	0 %	117621722
11	NC_008566	TAGAA	2	10	24701	24710	60 %	20 %	20 %	0 %	117621732
12	NC_008566	TAATT	2	10	24810	24819	40 %	60 %	0 %	0 %	117621732
13	NC_008566	TTTTC	2	10	25084	25093	0 %	80 %	0 %	20 %	117621732
14	NC_008566	TATAT	2	10	25808	25817	40 %	60 %	0 %	0 %	117621733
15	NC_008566	TTTAA	2	10	26605	26614	40 %	60 %	0 %	0 %	117621736
16	NC_008566	AATAA	2	10	28927	28936	80 %	20 %	0 %	0 %	117621739
17	NC_008566	TTCTT	2	10	30017	30026	0 %	80 %	0 %	20 %	117621740
18	NC_008566	TGTTT	2	10	30589	30598	0 %	80 %	20 %	0 %	117621740

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.