MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	AT	3	6	1152	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	117621571
2	NC_008564	TA	3	6	2793	2798	50 %	50 %	0 %	0 %	117621573
3	NC_008564	CA	3	6	3278	3283	50 %	0 %	0 %	50 %	117621574
4	NC_008564	CA	3	6	5048	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	117621576
5	NC_008564	TA	3	6	5533	5538	50 %	50 %	0 %	0 %	117621577
6	NC_008564	AG	3	6	6060	6065	50 %	0 %	50 %	0 %	117621577
7	NC_008564	AT	3	6	7053	7058	50 %	50 %	0 %	0 %	117621578
8	NC_008564	GA	3	6	8296	8301	50 %	0 %	50 %	0 %	117621581
9	NC_008564	AT	3	6	9147	9152	50 %	50 %	0 %	0 %	117621582
10	NC_008564	AG	3	6	9697	9702	50 %	0 %	50 %	0 %	117621583
11	NC_008564	AT	3	6	9910	9915	50 %	50 %	0 %	0 %	117621583
12	NC_008564	AC	3	6	10363	10368	50 %	0 %	0 %	50 %	117621583
13	NC_008564	AT	3	6	11016	11021	50 %	50 %	0 %	0 %	117621585
14	NC_008564	AC	3	6	14327	14332	50 %	0 %	0 %	50 %	117621589
15	NC_008564	AC	3	6	14420	14425	50 %	0 %	0 %	50 %	117621589
16	NC_008564	TA	4	8	14658	14665	50 %	50 %	0 %	0 %	117621589
17	NC_008564	AT	3	6	14684	14689	50 %	50 %	0 %	0 %	117621589
18	NC_008564	AC	3	6	14794	14799	50 %	0 %	0 %	50 %	117621589
19	NC_008564	AT	3	6	15579	15584	50 %	50 %	0 %	0 %	117621590
20	NC_008564	AT	3	6	15821	15826	50 %	50 %	0 %	0 %	117621590
21	NC_008564	TA	3	6	16448	16453	50 %	50 %	0 %	0 %	117621591
22	NC_008564	AC	3	6	16575	16580	50 %	0 %	0 %	50 %	117621591
23	NC_008564	GA	4	8	16637	16644	50 %	0 %	50 %	0 %	117621591
24	NC_008564	TC	3	6	19249	19254	0 %	50 %	0 %	50 %	117621596
25	NC_008564	AT	3	6	20497	20502	50 %	50 %	0 %	0 %	117621597
26	NC_008564	AT	3	6	20664	20669	50 %	50 %	0 %	0 %	117621598
27	NC_008564	AG	3	6	21122	21127	50 %	0 %	50 %	0 %	117621598
28	NC_008564	GA	3	6	21162	21167	50 %	0 %	50 %	0 %	117621598
29	NC_008564	AT	3	6	22161	22166	50 %	50 %	0 %	0 %	117621599
30	NC_008564	AG	3	6	22262	22267	50 %	0 %	50 %	0 %	117621599
31	NC_008564	AT	3	6	22907	22912	50 %	50 %	0 %	0 %	117621601
32	NC_008564	TA	3	6	23138	23143	50 %	50 %	0 %	0 %	117621601
33	NC_008564	AG	3	6	23606	23611	50 %	0 %	50 %	0 %	117621602
34	NC_008564	AT	3	6	23809	23814	50 %	50 %	0 %	0 %	117621603
35	NC_008564	TA	3	6	23822	23827	50 %	50 %	0 %	0 %	117621603
36	NC_008564	AG	3	6	24310	24315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621603
37	NC_008564	CT	3	6	25649	25654	0 %	50 %	0 %	50 %	117621604
38	NC_008564	AT	3	6	25746	25751	50 %	50 %	0 %	0 %	117621604
39	NC_008564	AG	3	6	29025	29030	50 %	0 %	50 %	0 %	117621607
40	NC_008564	GA	3	6	31115	31120	50 %	0 %	50 %	0 %	117621610
41	NC_008564	GA	3	6	31359	31364	50 %	0 %	50 %	0 %	117621610
42	NC_008564	AT	3	6	31536	31541	50 %	50 %	0 %	0 %	117621610
43	NC_008564	GA	3	6	31568	31573	50 %	0 %	50 %	0 %	117621610
44	NC_008564	AG	3	6	33424	33429	50 %	0 %	50 %	0 %	117621614
45	NC_008564	TC	3	6	34208	34213	0 %	50 %	0 %	50 %	117621615
46	NC_008564	AG	3	6	35238	35243	50 %	0 %	50 %	0 %	117621617
47	NC_008564	AG	3	6	36042	36047	50 %	0 %	50 %	0 %	117621619
48	NC_008564	GA	3	6	36604	36609	50 %	0 %	50 %	0 %	117621619
49	NC_008564	TC	3	6	36669	36674	0 %	50 %	0 %	50 %	117621619
50	NC_008564	GA	3	6	39058	39063	50 %	0 %	50 %	0 %	117621623
51	NC_008564	GA	4	8	39197	39204	50 %	0 %	50 %	0 %	117621623
52	NC_008564	AG	3	6	39786	39791	50 %	0 %	50 %	0 %	117621624
53	NC_008564	GT	3	6	40269	40274	0 %	50 %	50 %	0 %	117621624
54	NC_008564	AT	3	6	40500	40505	50 %	50 %	0 %	0 %	117621625
55	NC_008564	AT	3	6	42962	42967	50 %	50 %	0 %	0 %	117621628
56	NC_008564	TA	3	6	44691	44696	50 %	50 %	0 %	0 %	117621629
57	NC_008564	AT	3	6	46303	46308	50 %	50 %	0 %	0 %	117621631
58	NC_008564	TA	3	6	46594	46599	50 %	50 %	0 %	0 %	117621632
59	NC_008564	AT	3	6	46843	46848	50 %	50 %	0 %	0 %	117621632
60	NC_008564	TG	3	6	47935	47940	0 %	50 %	50 %	0 %	117621633
61	NC_008564	GT	3	6	48002	48007	0 %	50 %	50 %	0 %	117621633
62	NC_008564	AT	3	6	49005	49010	50 %	50 %	0 %	0 %	117621634
63	NC_008564	TG	3	6	50107	50112	0 %	50 %	50 %	0 %	117621635
64	NC_008564	GT	3	6	51322	51327	0 %	50 %	50 %	0 %	117621636
65	NC_008564	GC	3	6	51359	51364	0 %	0 %	50 %	50 %	117621636
66	NC_008564	GT	3	6	51840	51845	0 %	50 %	50 %	0 %	117621637
67	NC_008564	TG	3	6	51914	51919	0 %	50 %	50 %	0 %	117621637
68	NC_008564	GT	3	6	53875	53880	0 %	50 %	50 %	0 %	117621639
69	NC_008564	AT	3	6	54172	54177	50 %	50 %	0 %	0 %	117621639
70	NC_008564	GT	3	6	54283	54288	0 %	50 %	50 %	0 %	117621639
71	NC_008564	TA	3	6	55168	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	117621640
72	NC_008564	AT	3	6	55778	55783	50 %	50 %	0 %	0 %	117621641
73	NC_008564	AT	3	6	56015	56020	50 %	50 %	0 %	0 %	117621641
74	NC_008564	AT	3	6	56049	56054	50 %	50 %	0 %	0 %	117621641
75	NC_008564	GT	3	6	56098	56103	0 %	50 %	50 %	0 %	117621641
76	NC_008564	TG	4	8	56667	56674	0 %	50 %	50 %	0 %	117621642
77	NC_008564	TA	3	6	58884	58889	50 %	50 %	0 %	0 %	117621644
78	NC_008564	TA	3	6	59595	59600	50 %	50 %	0 %	0 %	117621645

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.