MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	ATATA	2	10	1696	1705	60 %	40 %	0 %	0 %	117621572
2	NC_008564	TACAA	2	10	2479	2488	60 %	20 %	0 %	20 %	117621572
3	NC_008564	ATTTA	2	10	3443	3452	40 %	60 %	0 %	0 %	117621574
4	NC_008564	GAATT	2	10	4091	4100	40 %	40 %	20 %	0 %	117621575
5	NC_008564	AAATT	2	10	4135	4144	60 %	40 %	0 %	0 %	117621575
6	NC_008564	GCATA	2	10	4955	4964	40 %	20 %	20 %	20 %	117621576
7	NC_008564	CGTCT	2	10	5842	5851	0 %	40 %	20 %	40 %	117621577
8	NC_008564	TAAAT	2	10	6735	6744	60 %	40 %	0 %	0 %	117621577
9	NC_008564	AAGAA	2	10	7575	7584	80 %	0 %	20 %	0 %	117621579
10	NC_008564	CAATT	2	10	8230	8239	40 %	40 %	0 %	20 %	117621581
11	NC_008564	TATAC	2	10	8550	8559	40 %	40 %	0 %	20 %	117621581
12	NC_008564	AACAA	2	10	9585	9594	80 %	0 %	0 %	20 %	117621582
13	NC_008564	ACAAA	2	10	11503	11512	80 %	0 %	0 %	20 %	117621586
14	NC_008564	GAAGT	2	10	13135	13144	40 %	20 %	40 %	0 %	117621588
15	NC_008564	CAAAA	2	10	14210	14219	80 %	0 %	0 %	20 %	117621589
16	NC_008564	ATAAA	2	10	14969	14978	80 %	20 %	0 %	0 %	117621589
17	NC_008564	AAAAC	2	10	14999	15008	80 %	0 %	0 %	20 %	117621589
18	NC_008564	GAAAA	2	10	15398	15407	80 %	0 %	20 %	0 %	117621589
19	NC_008564	ATTCA	2	10	16306	16315	40 %	40 %	0 %	20 %	117621591
20	NC_008564	GATTT	2	10	16677	16686	20 %	60 %	20 %	0 %	117621591
21	NC_008564	ATTTT	2	10	19646	19655	20 %	80 %	0 %	0 %	117621596
22	NC_008564	AATAG	2	10	19724	19733	60 %	20 %	20 %	0 %	117621596
23	NC_008564	TATTT	2	10	20307	20316	20 %	80 %	0 %	0 %	117621597
24	NC_008564	AATAA	2	10	20629	20638	80 %	20 %	0 %	0 %	117621598
25	NC_008564	AATGA	2	10	22033	22042	60 %	20 %	20 %	0 %	117621599
26	NC_008564	CAAAA	2	10	22482	22491	80 %	0 %	0 %	20 %	117621599
27	NC_008564	AATTA	2	10	23633	23642	60 %	40 %	0 %	0 %	117621602
28	NC_008564	GAAGA	2	10	26769	26778	60 %	0 %	40 %	0 %	117621605
29	NC_008564	ATTTT	2	10	27877	27886	20 %	80 %	0 %	0 %	117621606
30	NC_008564	TGCTT	2	10	29596	29605	0 %	60 %	20 %	20 %	117621608
31	NC_008564	ATTTT	2	10	30343	30352	20 %	80 %	0 %	0 %	117621609
32	NC_008564	CAAAT	2	10	31267	31276	60 %	20 %	0 %	20 %	117621610
33	NC_008564	TTTAA	2	10	31997	32006	40 %	60 %	0 %	0 %	117621611
34	NC_008564	GAAAT	2	10	32170	32179	60 %	20 %	20 %	0 %	117621612
35	NC_008564	TTAAT	2	10	34507	34516	40 %	60 %	0 %	0 %	117621615
36	NC_008564	AGTAC	2	10	34635	34644	40 %	20 %	20 %	20 %	117621616
37	NC_008564	GTTTA	2	10	35339	35348	20 %	60 %	20 %	0 %	117621617
38	NC_008564	AGCTT	2	10	36308	36317	20 %	40 %	20 %	20 %	117621619
39	NC_008564	TTTGT	2	10	37777	37786	0 %	80 %	20 %	0 %	117621621
40	NC_008564	TATTT	2	10	39079	39088	20 %	80 %	0 %	0 %	117621623
41	NC_008564	AAATC	2	10	39305	39314	60 %	20 %	0 %	20 %	117621623
42	NC_008564	TGGGT	2	10	40336	40345	0 %	40 %	60 %	0 %	117621625
43	NC_008564	GAATT	2	10	41558	41567	40 %	40 %	20 %	0 %	117621626
44	NC_008564	TTTGA	2	10	43563	43572	20 %	60 %	20 %	0 %	117621628
45	NC_008564	ATTTG	2	10	44628	44637	20 %	60 %	20 %	0 %	117621629
46	NC_008564	TTATC	2	10	46582	46591	20 %	60 %	0 %	20 %	117621632
47	NC_008564	TTTGT	2	10	47157	47166	0 %	80 %	20 %	0 %	117621632
48	NC_008564	ATTTT	2	10	49142	49151	20 %	80 %	0 %	0 %	117621634
49	NC_008564	TTATT	2	10	49362	49371	20 %	80 %	0 %	0 %	117621634
50	NC_008564	ATTTA	2	10	52430	52439	40 %	60 %	0 %	0 %	117621637
51	NC_008564	GTTTT	2	10	53285	53294	0 %	80 %	20 %	0 %	117621638
52	NC_008564	TGTCT	2	10	54809	54818	0 %	60 %	20 %	20 %	117621640
53	NC_008564	TTTAG	2	10	55406	55415	20 %	60 %	20 %	0 %	117621640
54	NC_008564	TTTGA	2	10	56314	56323	20 %	60 %	20 %	0 %	117621641
55	NC_008564	ATTTT	2	10	57078	57087	20 %	80 %	0 %	0 %	117621642
56	NC_008564	AATAA	2	10	57106	57115	80 %	20 %	0 %	0 %	117621642
57	NC_008564	ATTAT	2	10	57835	57844	40 %	60 %	0 %	0 %	117621643
58	NC_008564	AAAAT	2	10	59495	59504	80 %	20 %	0 %	0 %	117621645

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.