MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp60

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008564	CCAA	2	8	1320	1327	50 %	0 %	0 %	50 %	117621571
2	NC_008564	TTGT	2	8	1715	1722	0 %	75 %	25 %	0 %	117621572
3	NC_008564	AAAC	2	8	2084	2091	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
4	NC_008564	AAAC	2	8	2159	2166	75 %	0 %	0 %	25 %	117621572
5	NC_008564	GAAA	2	8	2874	2881	75 %	0 %	25 %	0 %	117621573
6	NC_008564	ATTT	2	8	3373	3380	25 %	75 %	0 %	0 %	117621574
7	NC_008564	ACAA	2	8	4000	4007	75 %	0 %	0 %	25 %	117621575
8	NC_008564	TAAT	2	8	5146	5153	50 %	50 %	0 %	0 %	117621576
9	NC_008564	ATTT	2	8	5156	5163	25 %	75 %	0 %	0 %	117621576
10	NC_008564	TAAA	2	8	5778	5785	75 %	25 %	0 %	0 %	117621577
11	NC_008564	TCAA	2	8	6104	6111	50 %	25 %	0 %	25 %	117621577
12	NC_008564	ATCA	2	8	6166	6173	50 %	25 %	0 %	25 %	117621577
13	NC_008564	ATAA	2	8	6996	7003	75 %	25 %	0 %	0 %	117621578
14	NC_008564	AGCA	2	8	7354	7361	50 %	0 %	25 %	25 %	117621579
15	NC_008564	TTCA	2	8	7378	7385	25 %	50 %	0 %	25 %	117621579
16	NC_008564	TTTC	2	8	8078	8085	0 %	75 %	0 %	25 %	117621580
17	NC_008564	ACAA	2	8	8274	8281	75 %	0 %	0 %	25 %	117621581
18	NC_008564	GCAA	2	8	8542	8549	50 %	0 %	25 %	25 %	117621581
19	NC_008564	AAAC	2	8	8608	8615	75 %	0 %	0 %	25 %	117621581
20	NC_008564	ACAA	2	8	8960	8967	75 %	0 %	0 %	25 %	117621581
21	NC_008564	CAAT	2	8	9116	9123	50 %	25 %	0 %	25 %	117621582
22	NC_008564	AAAT	2	8	10158	10165	75 %	25 %	0 %	0 %	117621583
23	NC_008564	ATTT	2	8	10487	10494	25 %	75 %	0 %	0 %	117621583
24	NC_008564	TGGT	2	8	10642	10649	0 %	50 %	50 %	0 %	117621583
25	NC_008564	AAAG	2	8	10849	10856	75 %	0 %	25 %	0 %	117621584
26	NC_008564	AAAT	2	8	10921	10928	75 %	25 %	0 %	0 %	117621585
27	NC_008564	ATCA	2	8	11586	11593	50 %	25 %	0 %	25 %	117621586
28	NC_008564	TATT	2	8	11900	11907	25 %	75 %	0 %	0 %	117621587
29	NC_008564	GCAA	2	8	11940	11947	50 %	0 %	25 %	25 %	117621587
30	NC_008564	GTAA	2	8	12014	12021	50 %	25 %	25 %	0 %	117621587
31	NC_008564	AAGT	2	8	12228	12235	50 %	25 %	25 %	0 %	117621587
32	NC_008564	TAAG	2	8	12450	12457	50 %	25 %	25 %	0 %	117621587
33	NC_008564	AAAT	2	8	12707	12714	75 %	25 %	0 %	0 %	117621587
34	NC_008564	GAAG	2	8	13308	13315	50 %	0 %	50 %	0 %	117621588
35	NC_008564	TAAA	2	8	14354	14361	75 %	25 %	0 %	0 %	117621589
36	NC_008564	GAAA	2	8	14368	14375	75 %	0 %	25 %	0 %	117621589
37	NC_008564	AAAT	2	8	14609	14616	75 %	25 %	0 %	0 %	117621589
38	NC_008564	TAAA	2	8	14726	14733	75 %	25 %	0 %	0 %	117621589
39	NC_008564	ATTT	2	8	15697	15704	25 %	75 %	0 %	0 %	117621590
40	NC_008564	TCAA	2	8	16100	16107	50 %	25 %	0 %	25 %	117621591
41	NC_008564	TAAA	2	8	16650	16657	75 %	25 %	0 %	0 %	117621591
42	NC_008564	TAAA	2	8	16734	16741	75 %	25 %	0 %	0 %	117621591
43	NC_008564	ATAA	2	8	16801	16808	75 %	25 %	0 %	0 %	117621592
44	NC_008564	AAAG	2	8	17131	17138	75 %	0 %	25 %	0 %	117621592
45	NC_008564	CTTT	2	8	17244	17251	0 %	75 %	0 %	25 %	117621592
46	NC_008564	TTAA	2	8	17644	17651	50 %	50 %	0 %	0 %	117621593
47	NC_008564	ATTT	2	8	18136	18143	25 %	75 %	0 %	0 %	117621594
48	NC_008564	GAAA	2	8	18426	18433	75 %	0 %	25 %	0 %	117621594
49	NC_008564	GTTT	2	8	18607	18614	0 %	75 %	25 %	0 %	117621595
50	NC_008564	GTCT	2	8	18939	18946	0 %	50 %	25 %	25 %	117621595
51	NC_008564	ATTT	2	8	19217	19224	25 %	75 %	0 %	0 %	117621596
52	NC_008564	TTTC	2	8	20516	20523	0 %	75 %	0 %	25 %	117621597
53	NC_008564	AAAT	2	8	21285	21292	75 %	25 %	0 %	0 %	117621599
54	NC_008564	CAAT	2	8	21329	21336	50 %	25 %	0 %	25 %	117621599
55	NC_008564	AGAA	2	8	21380	21387	75 %	0 %	25 %	0 %	117621599
56	NC_008564	TTTG	2	8	22398	22405	0 %	75 %	25 %	0 %	117621599
57	NC_008564	TAAA	2	8	22704	22711	75 %	25 %	0 %	0 %	117621600
58	NC_008564	AAAG	2	8	22970	22977	75 %	0 %	25 %	0 %	117621601
59	NC_008564	CTTT	2	8	23918	23925	0 %	75 %	0 %	25 %	117621603
60	NC_008564	TAAA	2	8	24069	24076	75 %	25 %	0 %	0 %	117621603
61	NC_008564	GAAA	2	8	25148	25155	75 %	0 %	25 %	0 %	117621604
62	NC_008564	ATTT	2	8	25434	25441	25 %	75 %	0 %	0 %	117621604
63	NC_008564	ATTA	2	8	25549	25556	50 %	50 %	0 %	0 %	117621604
64	NC_008564	TATG	2	8	25672	25679	25 %	50 %	25 %	0 %	117621604
65	NC_008564	AATA	2	8	25837	25844	75 %	25 %	0 %	0 %	117621604
66	NC_008564	ACAA	2	8	26913	26920	75 %	0 %	0 %	25 %	117621605
67	NC_008564	TAAA	2	8	27407	27414	75 %	25 %	0 %	0 %	117621606
68	NC_008564	GCTT	2	8	27442	27449	0 %	50 %	25 %	25 %	117621606
69	NC_008564	AGCT	2	8	27491	27498	25 %	25 %	25 %	25 %	117621606
70	NC_008564	AAAG	2	8	27739	27746	75 %	0 %	25 %	0 %	117621606
71	NC_008564	TTTC	2	8	27751	27758	0 %	75 %	0 %	25 %	117621606
72	NC_008564	TGAT	2	8	28264	28271	25 %	50 %	25 %	0 %	117621607
73	NC_008564	AATT	2	8	28391	28398	50 %	50 %	0 %	0 %	117621607
74	NC_008564	TTTC	2	8	28440	28447	0 %	75 %	0 %	25 %	117621607
75	NC_008564	ATTT	2	8	28812	28819	25 %	75 %	0 %	0 %	117621607
76	NC_008564	CAAA	2	8	28978	28985	75 %	0 %	0 %	25 %	117621607
77	NC_008564	TTAA	2	8	29421	29428	50 %	50 %	0 %	0 %	117621607
78	NC_008564	ATAA	2	8	29693	29700	75 %	25 %	0 %	0 %	117621608
79	NC_008564	ATGA	2	8	31706	31713	50 %	25 %	25 %	0 %	117621611
80	NC_008564	TGTT	2	8	31935	31942	0 %	75 %	25 %	0 %	117621611
81	NC_008564	TCTT	2	8	33307	33314	0 %	75 %	0 %	25 %	117621614
82	NC_008564	ATTA	2	8	33549	33556	50 %	50 %	0 %	0 %	117621615
83	NC_008564	CAAG	2	8	34041	34048	50 %	0 %	25 %	25 %	117621615
84	NC_008564	GAAT	2	8	34256	34263	50 %	25 %	25 %	0 %	117621615
85	NC_008564	CAAA	2	8	34391	34398	75 %	0 %	0 %	25 %	117621615
86	NC_008564	CAAT	2	8	34953	34960	50 %	25 %	0 %	25 %	117621616
87	NC_008564	ACAT	3	12	35064	35075	50 %	25 %	0 %	25 %	117621617
88	NC_008564	TATG	2	8	35091	35098	25 %	50 %	25 %	0 %	117621617
89	NC_008564	TAAA	2	8	36149	36156	75 %	25 %	0 %	0 %	117621619
90	NC_008564	TAAA	2	8	36560	36567	75 %	25 %	0 %	0 %	117621619
91	NC_008564	TTTA	2	8	37634	37641	25 %	75 %	0 %	0 %	117621620
92	NC_008564	AGTT	2	8	37653	37660	25 %	50 %	25 %	0 %	117621620
93	NC_008564	AGAA	2	8	38145	38152	75 %	0 %	25 %	0 %	117621621
94	NC_008564	TAAT	2	8	38923	38930	50 %	50 %	0 %	0 %	117621622
95	NC_008564	TTCA	2	8	39215	39222	25 %	50 %	0 %	25 %	117621623
96	NC_008564	ATGA	2	8	39874	39881	50 %	25 %	25 %	0 %	117621624
97	NC_008564	TAAT	2	8	39899	39906	50 %	50 %	0 %	0 %	117621624
98	NC_008564	ATTT	2	8	40020	40027	25 %	75 %	0 %	0 %	117621624
99	NC_008564	ATTT	2	8	40044	40051	25 %	75 %	0 %	0 %	117621624
100	NC_008564	TTTG	2	8	40086	40093	0 %	75 %	25 %	0 %	117621624
101	NC_008564	ATTT	2	8	41317	41324	25 %	75 %	0 %	0 %	117621626
102	NC_008564	TTTA	2	8	41942	41949	25 %	75 %	0 %	0 %	117621626
103	NC_008564	GTTT	2	8	43382	43389	0 %	75 %	25 %	0 %	117621628
104	NC_008564	TTTA	2	8	43405	43412	25 %	75 %	0 %	0 %	117621628
105	NC_008564	ACTT	2	8	44178	44185	25 %	50 %	0 %	25 %	117621629
106	NC_008564	TTTA	2	8	44334	44341	25 %	75 %	0 %	0 %	117621629
107	NC_008564	TTGC	2	8	45033	45040	0 %	50 %	25 %	25 %	117621630
108	NC_008564	TTAA	2	8	45405	45412	50 %	50 %	0 %	0 %	117621631
109	NC_008564	GTTT	2	8	45610	45617	0 %	75 %	25 %	0 %	117621631
110	NC_008564	TTTC	2	8	46237	46244	0 %	75 %	0 %	25 %	117621631
111	NC_008564	AATT	2	8	46325	46332	50 %	50 %	0 %	0 %	117621631
112	NC_008564	TGCT	2	8	46553	46560	0 %	50 %	25 %	25 %	117621632
113	NC_008564	TTTA	2	8	46751	46758	25 %	75 %	0 %	0 %	117621632
114	NC_008564	TCTA	2	8	47589	47596	25 %	50 %	0 %	25 %	117621633
115	NC_008564	CATT	2	8	47692	47699	25 %	50 %	0 %	25 %	117621633
116	NC_008564	TGAT	2	8	47946	47953	25 %	50 %	25 %	0 %	117621633
117	NC_008564	ATTT	2	8	47975	47982	25 %	75 %	0 %	0 %	117621633
118	NC_008564	CTTG	2	8	48460	48467	0 %	50 %	25 %	25 %	117621633
119	NC_008564	GTTT	2	8	48594	48601	0 %	75 %	25 %	0 %	117621633
120	NC_008564	GTTT	2	8	48621	48628	0 %	75 %	25 %	0 %	117621633
121	NC_008564	CTAT	2	8	49094	49101	25 %	50 %	0 %	25 %	117621634
122	NC_008564	ATTT	2	8	49207	49214	25 %	75 %	0 %	0 %	117621634
123	NC_008564	TTTG	2	8	49916	49923	0 %	75 %	25 %	0 %	117621635
124	NC_008564	TCAT	2	8	50698	50705	25 %	50 %	0 %	25 %	117621636
125	NC_008564	TTGT	2	8	50953	50960	0 %	75 %	25 %	0 %	117621636
126	NC_008564	AAAT	2	8	51291	51298	75 %	25 %	0 %	0 %	117621636
127	NC_008564	ATTT	2	8	51755	51762	25 %	75 %	0 %	0 %	117621637
128	NC_008564	AAAT	2	8	52307	52314	75 %	25 %	0 %	0 %	117621637
129	NC_008564	ATTT	2	8	52860	52867	25 %	75 %	0 %	0 %	117621638
130	NC_008564	TAAT	2	8	53674	53681	50 %	50 %	0 %	0 %	117621639
131	NC_008564	TGTT	2	8	53973	53980	0 %	75 %	25 %	0 %	117621639
132	NC_008564	TTGT	2	8	54180	54187	0 %	75 %	25 %	0 %	117621639
133	NC_008564	AAAT	2	8	54252	54259	75 %	25 %	0 %	0 %	117621639
134	NC_008564	GGTT	2	8	54383	54390	0 %	50 %	50 %	0 %	117621639
135	NC_008564	TAAT	2	8	54671	54678	50 %	50 %	0 %	0 %	117621640
136	NC_008564	CTAT	2	8	54917	54924	25 %	50 %	0 %	25 %	117621640
137	NC_008564	TATT	2	8	55023	55030	25 %	75 %	0 %	0 %	117621640
138	NC_008564	AATT	2	8	55134	55141	50 %	50 %	0 %	0 %	117621640
139	NC_008564	ATTT	2	8	55159	55166	25 %	75 %	0 %	0 %	117621640
140	NC_008564	TTGT	2	8	55177	55184	0 %	75 %	25 %	0 %	117621640
141	NC_008564	TATT	2	8	56086	56093	25 %	75 %	0 %	0 %	117621641
142	NC_008564	GATT	2	8	56340	56347	25 %	50 %	25 %	0 %	117621641
143	NC_008564	TATT	2	8	57187	57194	25 %	75 %	0 %	0 %	117621642
144	NC_008564	TTTA	2	8	57230	57237	25 %	75 %	0 %	0 %	117621642
145	NC_008564	AATT	2	8	57278	57285	50 %	50 %	0 %	0 %	117621642
146	NC_008564	ATTT	2	8	57734	57741	25 %	75 %	0 %	0 %	117621643
147	NC_008564	AAAT	2	8	58618	58625	75 %	25 %	0 %	0 %	117621644
148	NC_008564	ATTG	2	8	59900	59907	25 %	50 %	25 %	0 %	117621645

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.