MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 3

Total Repeats: 27790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008544	GTCGAC	2	12	126678	126689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3002	NC_008544	GTCG	2	8	126707	126714	0 %	25 %	50 %	25 %	116686362
3003	NC_008544	ACG	2	6	126841	126846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3004	NC_008544	CGA	2	6	126884	126889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3005	NC_008544	ACG	2	6	126904	126909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3006	NC_008544	CGTCGA	2	12	126923	126934	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3007	NC_008544	TCG	2	6	126955	126960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3008	NC_008544	CGA	2	6	126995	127000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3009	NC_008544	GAC	2	6	127061	127066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3010	NC_008544	CGC	2	6	127102	127107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3011	NC_008544	CGT	2	6	127142	127147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3012	NC_008544	CGAGC	2	10	127154	127163	20 %	0 %	40 %	40 %	116686362
3013	NC_008544	GTT	2	6	127178	127183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686362
3014	NC_008544	CGC	3	9	127217	127225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3015	NC_008544	TTG	2	6	127272	127277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686362
3016	NC_008544	CGCCGT	2	12	127297	127308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116686362
3017	NC_008544	GTT	2	6	127316	127321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686362
3018	NC_008544	GCC	2	6	127454	127459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3019	NC_008544	GCC	2	6	127479	127484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3020	NC_008544	CGC	3	9	127526	127534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3021	NC_008544	ACCG	2	8	127547	127554	25 %	0 %	25 %	50 %	116686362
3022	NC_008544	GC	3	6	127594	127599	0 %	0 %	50 %	50 %	116686362
3023	NC_008544	GGA	2	6	127601	127606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686362
3024	NC_008544	CTG	2	6	127649	127654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3025	NC_008544	CGG	2	6	127810	127815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686362
3026	NC_008544	GCC	2	6	127817	127822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3027	NC_008544	CGATCG	2	12	127828	127839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3028	NC_008544	GTC	2	6	127893	127898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3029	NC_008544	GCCG	2	8	127922	127929	0 %	0 %	50 %	50 %	116686362
3030	NC_008544	CGAG	2	8	127996	128003	25 %	0 %	50 %	25 %	116686362
3031	NC_008544	GC	3	6	128011	128016	0 %	0 %	50 %	50 %	116686362
3032	NC_008544	CCG	2	6	128017	128022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3033	NC_008544	CGC	3	9	128042	128050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3034	NC_008544	GTT	2	6	128072	128077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686362
3035	NC_008544	CGG	2	6	128089	128094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686362
3036	NC_008544	CGC	3	9	128105	128113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3037	NC_008544	CGC	2	6	128134	128139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3038	NC_008544	GACG	2	8	128249	128256	25 %	0 %	50 %	25 %	116686362
3039	NC_008544	CTG	2	6	128348	128353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3040	NC_008544	CGT	2	6	128387	128392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3041	NC_008544	GCC	2	6	128393	128398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686362
3042	NC_008544	TGCGCA	2	12	128427	128438	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3043	NC_008544	AAC	2	6	128448	128453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116686362
3044	NC_008544	GCG	2	6	128541	128546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686362
3045	NC_008544	GC	4	8	128554	128561	0 %	0 %	50 %	50 %	116686362
3046	NC_008544	CGA	2	6	128564	128569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686362
3047	NC_008544	CGC	2	6	128845	128850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686363
3048	NC_008544	CGG	2	6	128915	128920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686363
3049	NC_008544	ACG	2	6	128929	128934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686363
3050	NC_008544	CG	3	6	128950	128955	0 %	0 %	50 %	50 %	116686363
3051	NC_008544	CCG	2	6	128969	128974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686363
3052	NC_008544	GGC	2	6	129047	129052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686363
3053	NC_008544	GGC	2	6	129070	129075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686363
3054	NC_008544	GCC	2	6	129112	129117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686363
3055	NC_008544	GATC	2	8	129146	129153	25 %	25 %	25 %	25 %	116686363
3056	NC_008544	CAC	2	6	130152	130157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686364
3057	NC_008544	TCG	2	6	130187	130192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686364
3058	NC_008544	CG	3	6	130239	130244	0 %	0 %	50 %	50 %	116686364
3059	NC_008544	CG	3	6	130288	130293	0 %	0 %	50 %	50 %	116686364
3060	NC_008544	CCTGAT	2	12	130311	130322	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116686364
3061	NC_008544	CGC	2	6	130353	130358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686364
3062	NC_008544	GCT	2	6	130365	130370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686364
3063	NC_008544	ATC	2	6	130405	130410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686364
3064	NC_008544	GCC	2	6	130417	130422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686364
3065	NC_008544	ATCGC	2	10	130436	130445	20 %	20 %	20 %	40 %	116686364
3066	NC_008544	CGG	2	6	130493	130498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686364
3067	NC_008544	CG	3	6	130506	130511	0 %	0 %	50 %	50 %	116686364
3068	NC_008544	CAGC	2	8	130542	130549	25 %	0 %	25 %	50 %	116686364
3069	NC_008544	GCC	2	6	130588	130593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686364
3070	NC_008544	GC	3	6	130599	130604	0 %	0 %	50 %	50 %	116686364
3071	NC_008544	GCGA	2	8	130606	130613	25 %	0 %	50 %	25 %	116686364
3072	NC_008544	CTG	2	6	130618	130623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686364
3073	NC_008544	CCG	2	6	130639	130644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686364
3074	NC_008544	GCAC	2	8	130673	130680	25 %	0 %	25 %	50 %	116686364
3075	NC_008544	CG	3	6	130694	130699	0 %	0 %	50 %	50 %	116686364
3076	NC_008544	ATC	2	6	130709	130714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686364
3077	NC_008544	GC	3	6	130755	130760	0 %	0 %	50 %	50 %	116686364
3078	NC_008544	GGC	2	6	130886	130891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686364
3079	NC_008544	GCCG	2	8	130914	130921	0 %	0 %	50 %	50 %	116686364
3080	NC_008544	G	7	7	130926	130932	0 %	0 %	100 %	0 %	116686364
3081	NC_008544	CAC	2	6	130933	130938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686364
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3083	NC_008544	CGG	2	6	130968	130973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686365
3084	NC_008544	CTG	3	9	130991	130999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3085	NC_008544	GCG	2	6	131000	131005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686365
3086	NC_008544	GCG	2	6	131021	131026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686365
3087	NC_008544	GGA	2	6	131080	131085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686365
3088	NC_008544	ACG	2	6	131093	131098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3089	NC_008544	CGA	2	6	131107	131112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3090	NC_008544	CGC	2	6	131116	131121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686365
3091	NC_008544	GTG	2	6	131197	131202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686365
3092	NC_008544	CG	3	6	131207	131212	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3093	NC_008544	GC	3	6	131267	131272	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3094	NC_008544	CCGA	2	8	131333	131340	25 %	0 %	25 %	50 %	116686365
3095	NC_008544	GC	3	6	131395	131400	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3096	NC_008544	TTC	2	6	131525	131530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116686365
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3098	NC_008544	GC	3	6	131556	131561	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3099	NC_008544	GCG	2	6	131586	131591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686365
3100	NC_008544	CGCC	2	8	131673	131680	0 %	0 %	25 %	75 %	116686365
3101	NC_008544	GC	3	6	131681	131686	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3102	NC_008544	CG	3	6	131697	131702	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3103	NC_008544	GTCG	2	8	131725	131732	0 %	25 %	50 %	25 %	116686365
3104	NC_008544	GC	3	6	131791	131796	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3105	NC_008544	CGGCG	2	10	131839	131848	0 %	0 %	60 %	40 %	116686365
3106	NC_008544	GCC	2	6	132034	132039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686365
3107	NC_008544	ATC	2	6	132089	132094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686365
3108	NC_008544	CTG	2	6	132110	132115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3109	NC_008544	CAC	2	6	132134	132139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686365
3110	NC_008544	CGA	2	6	132211	132216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3111	NC_008544	CG	3	6	132220	132225	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3112	NC_008544	ACG	2	6	132243	132248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3113	NC_008544	GCA	2	6	132253	132258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
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3115	NC_008544	GC	4	8	132316	132323	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3116	NC_008544	CGA	2	6	132330	132335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3117	NC_008544	GCT	3	9	132352	132360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3118	NC_008544	CG	3	6	132372	132377	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3119	NC_008544	TCGA	2	8	132398	132405	25 %	25 %	25 %	25 %	116686365
3120	NC_008544	GCA	2	6	132408	132413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3121	NC_008544	CGA	2	6	132436	132441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3122	NC_008544	GCT	2	6	132511	132516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3123	NC_008544	GAC	2	6	132518	132523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
3124	NC_008544	GC	3	6	132549	132554	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3125	NC_008544	CCGG	2	8	132577	132584	0 %	0 %	50 %	50 %	116686365
3126	NC_008544	CTG	2	6	132647	132652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686365
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3128	NC_008544	CTG	2	6	132731	132736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686365
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3133	NC_008544	CAG	2	6	132803	132808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686365
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3243	NC_008544	GCC	2	6	136066	136071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686369
3244	NC_008544	CAG	2	6	136075	136080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686369
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3360	NC_008544	GGCC	2	8	139923	139930	0 %	0 %	50 %	50 %	116686372
3361	NC_008544	CGAGGT	2	12	139956	139967	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116686372
3362	NC_008544	CGA	2	6	140007	140012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686372
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3364	NC_008544	GCA	2	6	140070	140075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686372
3365	NC_008544	GTC	2	6	140237	140242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686373
3366	NC_008544	ACG	2	6	140269	140274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686373
3367	NC_008544	CTG	2	6	140342	140347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686373
3368	NC_008544	GCA	2	6	140443	140448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686373
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3370	NC_008544	GGC	2	6	140485	140490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686373
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3372	NC_008544	TGGC	2	8	140525	140532	0 %	25 %	50 %	25 %	116686373
3373	NC_008544	CG	3	6	140542	140547	0 %	0 %	50 %	50 %	116686373
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3383	NC_008544	GCC	2	6	140778	140783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686373
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3386	NC_008544	TCGA	2	8	140834	140841	25 %	25 %	25 %	25 %	116686373
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3392	NC_008544	CGGGCT	2	12	140992	141003	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116686373
3393	NC_008544	GCC	2	6	141021	141026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686373
3394	NC_008544	CGC	2	6	141027	141032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686373
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3396	NC_008544	CTG	2	6	141065	141070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686373
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3405	NC_008544	CG	5	10	141695	141704	0 %	0 %	50 %	50 %	116686374
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3475	NC_008544	CG	3	6	144044	144049	0 %	0 %	50 %	50 %	116686375
3476	NC_008544	CGG	2	6	144070	144075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686375
3477	NC_008544	CGA	2	6	144079	144084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686375
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3479	NC_008544	TGC	2	6	144196	144201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686376
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3481	NC_008544	CGG	2	6	144327	144332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686376
3482	NC_008544	CGC	2	6	144350	144355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686376
3483	NC_008544	CAG	2	6	144360	144365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686376
3484	NC_008544	GC	3	6	144369	144374	0 %	0 %	50 %	50 %	116686376
3485	NC_008544	GCCG	2	8	144410	144417	0 %	0 %	50 %	50 %	116686376
3486	NC_008544	GCCG	2	8	144425	144432	0 %	0 %	50 %	50 %	116686376
3487	NC_008544	GCG	2	6	144434	144439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686376
3488	NC_008544	CGAT	2	8	144440	144447	25 %	25 %	25 %	25 %	116686376
3489	NC_008544	CGG	2	6	144461	144466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686376
3490	NC_008544	GTC	2	6	144507	144512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686376
3491	NC_008544	CCGG	2	8	144524	144531	0 %	0 %	50 %	50 %	116686376
3492	NC_008544	AGC	2	6	144556	144561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686376
3493	NC_008544	GGC	2	6	144562	144567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686376
3494	NC_008544	GC	3	6	144616	144621	0 %	0 %	50 %	50 %	116686376
3495	NC_008544	CGAG	2	8	144662	144669	25 %	0 %	50 %	25 %	116686376
3496	NC_008544	CGC	2	6	144676	144681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686376
3497	NC_008544	GCC	2	6	144714	144719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686376
3498	NC_008544	CGA	2	6	144731	144736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686376
3499	NC_008544	AGC	2	6	144766	144771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686376
3500	NC_008544	GC	3	6	144770	144775	0 %	0 %	50 %	50 %	116686376

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