MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 3

Total Repeats: 27790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008544	GA	3	6	19424	19429	50 %	0 %	50 %	0 %	116686265
502	NC_008544	GCA	2	6	19503	19508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686265
503	NC_008544	CG	3	6	19770	19775	0 %	0 %	50 %	50 %	116686266
504	NC_008544	CTCG	2	8	19825	19832	0 %	25 %	25 %	50 %	116686266
505	NC_008544	TCG	2	6	19868	19873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686266
506	NC_008544	AGG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686266
507	NC_008544	TGT	2	6	19980	19985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686266
508	NC_008544	ATTTTA	2	12	19988	19999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116686266
509	NC_008544	CGC	2	6	20283	20288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686267
510	NC_008544	CAGC	2	8	20339	20346	25 %	0 %	25 %	50 %	116686267
511	NC_008544	GTC	2	6	20391	20396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686267
512	NC_008544	GCC	2	6	20397	20402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686267
513	NC_008544	AGC	3	9	20795	20803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686268
514	NC_008544	CTG	2	6	20827	20832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686268
515	NC_008544	TCG	2	6	20877	20882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686268
516	NC_008544	TCA	2	6	20895	20900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686268
517	NC_008544	GC	3	6	20907	20912	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
518	NC_008544	GCC	2	6	20944	20949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
519	NC_008544	GC	3	6	21042	21047	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
520	NC_008544	CCG	2	6	21072	21077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
521	NC_008544	CGG	3	9	21126	21134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686268
522	NC_008544	GTA	2	6	21187	21192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116686268
523	NC_008544	TTG	2	6	21245	21250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116686268
524	NC_008544	CGG	2	6	21373	21378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686268
525	NC_008544	GCC	3	9	21395	21403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
526	NC_008544	CGA	2	6	21433	21438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686268
527	NC_008544	CGG	2	6	21472	21477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686268
528	NC_008544	TCA	2	6	21495	21500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116686268
529	NC_008544	CAC	2	6	21502	21507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686268
530	NC_008544	GC	3	6	21534	21539	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
531	NC_008544	CGC	2	6	21544	21549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
532	NC_008544	CG	3	6	21627	21632	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
533	NC_008544	AGG	2	6	21641	21646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686268
534	NC_008544	GAGCG	2	10	21658	21667	20 %	0 %	60 %	20 %	116686268
535	NC_008544	ACG	2	6	21722	21727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686268
536	NC_008544	GCC	2	6	21762	21767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686268
537	NC_008544	CGGC	3	12	21811	21822	0 %	0 %	50 %	50 %	116686268
538	NC_008544	CG	4	8	22152	22159	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
539	NC_008544	CG	3	6	22162	22167	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
540	NC_008544	GCG	2	6	22241	22246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686269
541	NC_008544	ACTTTC	2	12	22265	22276	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116686269
542	NC_008544	GCG	2	6	22543	22548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686269
543	NC_008544	CG	4	8	22575	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
544	NC_008544	CGGCCG	2	12	22589	22600	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
545	NC_008544	CGC	2	6	22608	22613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686269
546	NC_008544	CG	3	6	22635	22640	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
547	NC_008544	GCCG	2	8	22653	22660	0 %	0 %	50 %	50 %	116686269
548	NC_008544	CAG	2	6	22683	22688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686269
549	NC_008544	ACG	2	6	23100	23105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686270
550	NC_008544	ACC	2	6	23113	23118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686270
551	NC_008544	GTG	2	6	23132	23137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116686270
552	NC_008544	GC	3	6	23141	23146	0 %	0 %	50 %	50 %	116686270
553	NC_008544	TGC	2	6	23154	23159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686270
554	NC_008544	GCAT	2	8	23189	23196	25 %	25 %	25 %	25 %	116686270
555	NC_008544	CGT	2	6	23249	23254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686270
556	NC_008544	GGTC	2	8	23260	23267	0 %	25 %	50 %	25 %	116686270
557	NC_008544	CCCCAG	2	12	23282	23293	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116686270
558	NC_008544	CAC	2	6	23312	23317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116686270
559	NC_008544	GC	3	6	23330	23335	0 %	0 %	50 %	50 %	116686270
560	NC_008544	GAG	2	6	23354	23359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686270
561	NC_008544	CCG	2	6	23374	23379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686270
562	NC_008544	CTG	2	6	23486	23491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686270
563	NC_008544	GCC	3	9	23498	23506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686270
564	NC_008544	CAG	2	6	23627	23632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686270
565	NC_008544	GCA	2	6	23638	23643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686270
566	NC_008544	GCC	2	6	23798	23803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686270
567	NC_008544	GGCT	2	8	23871	23878	0 %	25 %	50 %	25 %	116686270
568	NC_008544	GCT	2	6	23887	23892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686270
569	NC_008544	CG	3	6	23899	23904	0 %	0 %	50 %	50 %	116686270
570	NC_008544	CGT	2	6	23917	23922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686270
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572	NC_008544	TCG	2	6	23974	23979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686270
573	NC_008544	ATT	2	6	23981	23986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116686270
574	NC_008544	CGATG	2	10	24181	24190	20 %	20 %	40 %	20 %	116686271
575	NC_008544	CGA	2	6	24211	24216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686271
576	NC_008544	CGA	2	6	24249	24254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686271
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578	NC_008544	CGTGGT	2	12	24283	24294	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116686271
579	NC_008544	CGT	2	6	24361	24366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686271
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581	NC_008544	TGC	2	6	24462	24467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686271
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585	NC_008544	CGA	3	9	24588	24596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686271
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589	NC_008544	GC	3	6	24654	24659	0 %	0 %	50 %	50 %	116686271
590	NC_008544	ACG	2	6	24696	24701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686271
591	NC_008544	GCT	2	6	24706	24711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686271
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593	NC_008544	CGG	2	6	24750	24755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686271
594	NC_008544	GCAG	2	8	24757	24764	25 %	0 %	50 %	25 %	116686271
595	NC_008544	CGC	2	6	24811	24816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686271
596	NC_008544	CGC	2	6	24829	24834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686271
597	NC_008544	TGC	2	6	24849	24854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686271
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599	NC_008544	GC	3	6	24910	24915	0 %	0 %	50 %	50 %	116686271
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601	NC_008544	GC	3	6	24982	24987	0 %	0 %	50 %	50 %	116686271
602	NC_008544	GAG	2	6	25007	25012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116686271
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605	NC_008544	CGG	2	6	25167	25172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686272
606	NC_008544	GCC	2	6	25264	25269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116686272
607	NC_008544	GCG	2	6	25272	25277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686272
608	NC_008544	CAGGC	2	10	25351	25360	20 %	0 %	40 %	40 %	116686272
609	NC_008544	CG	4	8	25397	25404	0 %	0 %	50 %	50 %	116686272
610	NC_008544	CATGAC	2	12	25409	25420	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116686272
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612	NC_008544	GAC	2	6	25440	25445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686273
613	NC_008544	ACCT	2	8	25476	25483	25 %	25 %	0 %	50 %	116686273
614	NC_008544	GCCA	2	8	25566	25573	25 %	0 %	25 %	50 %	116686273
615	NC_008544	TCG	2	6	25585	25590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686273
616	NC_008544	CTG	2	6	25689	25694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686273
617	NC_008544	TGC	2	6	25714	25719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686273
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619	NC_008544	TCG	2	6	25777	25782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686273
620	NC_008544	TGC	2	6	25783	25788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686273
621	NC_008544	ATCA	2	8	25800	25807	50 %	25 %	0 %	25 %	116686273
622	NC_008544	GGAC	2	8	25808	25815	25 %	0 %	50 %	25 %	116686273
623	NC_008544	CGT	2	6	25903	25908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116686274
624	NC_008544	GCG	2	6	25955	25960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686274
625	NC_008544	CGA	2	6	26032	26037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116686274
626	NC_008544	GCG	2	6	26079	26084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116686274
627	NC_008544	CG	4	8	26104	26111	0 %	0 %	50 %	50 %	116686274
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