MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 60459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008542	TGA	2	6	176	181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688025
2	NC_008542	CTG	2	6	208	213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688025
3	NC_008542	CAG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688025
4	NC_008542	CGC	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688025
5	NC_008542	GCC	2	6	439	444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688025
6	NC_008542	GCT	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688025
7	NC_008542	CGG	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688025
8	NC_008542	CGC	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688025
9	NC_008542	CGC	2	6	516	521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688025
10	NC_008542	CGG	2	6	584	589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688025
11	NC_008542	CCG	2	6	590	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688025
12	NC_008542	CAC	2	6	598	603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688025
13	NC_008542	CGA	2	6	612	617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688025
14	NC_008542	CGG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688025
15	NC_008542	CCG	2	6	806	811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688025
16	NC_008542	CGG	2	6	864	869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688025
17	NC_008542	GCT	3	9	915	923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688025
18	NC_008542	GTG	2	6	979	984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688025
19	NC_008542	CGA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688025
20	NC_008542	CTA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688025
21	NC_008542	CTG	3	9	1042	1050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688025
22	NC_008542	CGA	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688025
23	NC_008542	TTC	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688025
24	NC_008542	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688025
25	NC_008542	TCG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688025
26	NC_008542	ATC	2	6	1144	1149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688025
27	NC_008542	CGA	2	6	1185	1190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688025
28	NC_008542	TTC	2	6	1318	1323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688025
29	NC_008542	CTG	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688025
30	NC_008542	AGA	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688025
31	NC_008542	ACA	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688025
32	NC_008542	GAA	2	6	1539	1544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688025
33	NC_008542	AGA	2	6	1607	1612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688025
34	NC_008542	CGG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688025
35	NC_008542	CAC	2	6	1653	1658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688025
36	NC_008542	TGC	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688025
37	NC_008542	CGA	2	6	1686	1691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688025
38	NC_008542	GCA	2	6	1694	1699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688025
39	NC_008542	CTC	2	6	1956	1961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688026
40	NC_008542	TCG	2	6	1987	1992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688026
41	NC_008542	CGC	2	6	1995	2000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688026
42	NC_008542	CTG	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688026
43	NC_008542	CAC	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688026
44	NC_008542	ACC	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688026
45	NC_008542	GCT	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688026
46	NC_008542	GGC	2	6	2258	2263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688026
47	NC_008542	CGA	2	6	2264	2269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688026
48	NC_008542	GCA	2	6	2369	2374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688026
49	NC_008542	CTA	2	6	2384	2389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688026
50	NC_008542	TGC	2	6	2401	2406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688026
51	NC_008542	TCG	3	9	2407	2415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688026
52	NC_008542	TCG	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688026
53	NC_008542	GGC	2	6	2484	2489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688026
54	NC_008542	GCC	2	6	2497	2502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688026
55	NC_008542	CGA	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688026
56	NC_008542	TCG	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688026
57	NC_008542	GAA	2	6	2712	2717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688026
58	NC_008542	CAT	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688026
59	NC_008542	GAA	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688026
60	NC_008542	ACG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688026
61	NC_008542	CAG	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
62	NC_008542	TCG	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
63	NC_008542	CAC	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688027
64	NC_008542	TGA	2	6	3543	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688027
65	NC_008542	CGG	2	6	3562	3567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
66	NC_008542	GGC	2	6	3599	3604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
67	NC_008542	CCG	2	6	3664	3669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688027
68	NC_008542	AAG	2	6	3677	3682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688027
69	NC_008542	GTG	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688027
70	NC_008542	AAC	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688027
71	NC_008542	CGG	2	6	3952	3957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
72	NC_008542	TCG	2	6	3969	3974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
73	NC_008542	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688027
74	NC_008542	TTC	2	6	4016	4021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688027
75	NC_008542	AAC	2	6	4106	4111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688027
76	NC_008542	CGG	2	6	4126	4131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
77	NC_008542	TCA	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688027
78	NC_008542	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688027
79	NC_008542	GAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
80	NC_008542	CGA	2	6	4231	4236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
81	NC_008542	TTC	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688027
82	NC_008542	CTG	2	6	4376	4381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
83	NC_008542	ATC	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688027
84	NC_008542	TCG	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
85	NC_008542	TGC	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
86	NC_008542	TCG	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
87	NC_008542	GCT	2	6	4675	4680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
88	NC_008542	GTC	2	6	4681	4686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
89	NC_008542	CAT	4	12	4771	4782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688027
90	NC_008542	GCT	3	9	4819	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
91	NC_008542	GCC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688027
92	NC_008542	GAC	2	6	4937	4942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
93	NC_008542	TGC	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
94	NC_008542	GCG	3	9	5009	5017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
95	NC_008542	CTG	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
96	NC_008542	GTG	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688027
97	NC_008542	GAG	2	6	5153	5158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688027
98	NC_008542	TGC	2	6	5188	5193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
99	NC_008542	ATG	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688027
100	NC_008542	GAA	2	6	5212	5217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688027
101	NC_008542	GTG	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688027
102	NC_008542	CGG	2	6	5334	5339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
103	NC_008542	CAG	2	6	5345	5350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
104	NC_008542	ACC	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688027
105	NC_008542	TCA	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688027
106	NC_008542	GCA	2	6	5418	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
107	NC_008542	GCT	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
108	NC_008542	AGC	2	6	5526	5531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
109	NC_008542	ACG	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688027
110	NC_008542	GCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
111	NC_008542	CTG	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
112	NC_008542	TGC	2	6	5596	5601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688027
113	NC_008542	TAC	2	6	5614	5619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688027
114	NC_008542	CGG	2	6	5645	5650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688027
115	NC_008542	GCG	2	6	6574	6579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688028
116	NC_008542	CGA	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688028
117	NC_008542	GAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688028
118	NC_008542	TTG	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688028
119	NC_008542	TCG	2	6	6996	7001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
120	NC_008542	CGC	2	6	7054	7059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688028
121	NC_008542	CGG	2	6	7063	7068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688028
122	NC_008542	ACA	2	6	7092	7097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688028
123	NC_008542	GGC	2	6	7204	7209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688028
124	NC_008542	TCG	2	6	7227	7232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
125	NC_008542	AGA	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688028
126	NC_008542	CGG	2	6	7250	7255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688028
127	NC_008542	TGC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
128	NC_008542	TCG	2	6	7466	7471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
129	NC_008542	GCT	2	6	7545	7550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
130	NC_008542	CGT	3	9	7567	7575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
131	NC_008542	TCA	2	6	7698	7703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688028
132	NC_008542	CTG	2	6	7724	7729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
133	NC_008542	CTG	2	6	7739	7744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
134	NC_008542	GCG	2	6	7755	7760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688028
135	NC_008542	TGC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688028
136	NC_008542	ACG	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688028
137	NC_008542	GGA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688028
138	NC_008542	GCT	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688029
139	NC_008542	AGC	2	6	8125	8130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688029
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141	NC_008542	CGA	2	6	8246	8251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688029
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144	NC_008542	CGA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688029
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146	NC_008542	GAC	2	6	8648	8653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688029
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150	NC_008542	CAA	2	6	8872	8877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688030
151	NC_008542	TCT	2	6	8921	8926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688030
152	NC_008542	GAA	2	6	9326	9331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688031
153	NC_008542	ATC	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688031
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155	NC_008542	CTA	2	6	9415	9420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688031
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157	NC_008542	AAC	2	6	9491	9496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116688031
158	NC_008542	CGC	2	6	9535	9540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688031
159	NC_008542	CTG	2	6	9551	9556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688031
160	NC_008542	TGA	2	6	9605	9610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688032
161	NC_008542	CGC	2	6	9685	9690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688032
162	NC_008542	TGA	2	6	9696	9701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688032
163	NC_008542	GAT	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688032
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165	NC_008542	GCT	2	6	9791	9796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688032
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239	NC_008542	CCT	2	6	20441	20446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688041
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249	NC_008542	CGG	2	6	22119	22124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688042
250	NC_008542	CGC	2	6	22143	22148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688042
251	NC_008542	CTG	2	6	22160	22165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688042
252	NC_008542	ATG	2	6	22169	22174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688042
253	NC_008542	CGA	2	6	22351	22356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688043
254	NC_008542	CGT	2	6	22363	22368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
255	NC_008542	GTC	2	6	22383	22388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
256	NC_008542	TGA	2	6	22414	22419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688043
257	NC_008542	TGA	2	6	22435	22440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688043
258	NC_008542	GCC	3	9	22553	22561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
259	NC_008542	CGC	2	6	22615	22620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
260	NC_008542	CGC	2	6	22628	22633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688043
261	NC_008542	GCT	2	6	22663	22668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
262	NC_008542	GCG	2	6	22719	22724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688043
263	NC_008542	TCG	2	6	22756	22761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
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265	NC_008542	CGT	2	6	22792	22797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
266	NC_008542	GCA	2	6	22798	22803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688043
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268	NC_008542	GCG	2	6	22822	22827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688043
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270	NC_008542	CGT	2	6	22864	22869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688043
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272	NC_008542	GCG	2	6	22976	22981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688043
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275	NC_008542	TTC	2	6	23147	23152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688043
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277	NC_008542	CCA	2	6	23190	23195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688044
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279	NC_008542	TTC	2	6	23305	23310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688044
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282	NC_008542	TCA	2	6	23616	23621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688044
283	NC_008542	GCG	2	6	23630	23635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688044
284	NC_008542	CGC	2	6	24101	24106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688045
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286	NC_008542	CAG	2	6	24145	24150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688045
287	NC_008542	CCT	2	6	24247	24252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688046
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497	NC_008542	CAC	2	6	36484	36489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688055
498	NC_008542	GCC	2	6	36528	36533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688055
499	NC_008542	TCG	2	6	36537	36542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688055
500	NC_008542	CGT	2	6	36565	36570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688055

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