MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 90743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008542	CGAT	2	8	160467	160474	25 %	25 %	25 %	25 %	229220798
4002	NC_008542	GCG	2	6	160524	160529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220798
4003	NC_008542	GAC	2	6	160531	160536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4004	NC_008542	GC	3	6	160547	160552	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798
4005	NC_008542	CGC	2	6	160557	160562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220798
4006	NC_008542	CGA	2	6	160596	160601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4007	NC_008542	GC	3	6	160607	160612	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798
4008	NC_008542	GCG	2	6	160631	160636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220798
4009	NC_008542	CGA	2	6	160641	160646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4010	NC_008542	CG	3	6	160650	160655	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798
4011	NC_008542	GTC	2	6	160708	160713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4012	NC_008542	CG	4	8	160761	160768	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798
4013	NC_008542	ACGC	2	8	160783	160790	25 %	0 %	25 %	50 %	229220798
4014	NC_008542	TGC	2	6	160796	160801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4015	NC_008542	GTGC	2	8	160874	160881	0 %	25 %	50 %	25 %	229220798
4016	NC_008542	GCG	2	6	160919	160924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220798
4017	NC_008542	TGG	2	6	160944	160949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229220798
4018	NC_008542	GCGG	2	8	160954	160961	0 %	0 %	75 %	25 %	229220798
4019	NC_008542	CGA	2	6	161010	161015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4020	NC_008542	CGCGG	2	10	161025	161034	0 %	0 %	60 %	40 %	229220798
4021	NC_008542	GCC	2	6	161053	161058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220798
4022	NC_008542	CGG	2	6	161097	161102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220798
4023	NC_008542	GAC	2	6	161113	161118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4024	NC_008542	GAA	2	6	161125	161130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229220798
4025	NC_008542	TTC	2	6	161131	161136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229220798
4026	NC_008542	AGT	2	6	161142	161147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229220798
4027	NC_008542	TCG	2	6	161159	161164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4028	NC_008542	CGC	2	6	161169	161174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220798
4029	NC_008542	GAA	2	6	161254	161259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229220798
4030	NC_008542	GC	3	6	161261	161266	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798
4031	NC_008542	CGA	2	6	161286	161291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220798
4032	NC_008542	TTC	2	6	161344	161349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229220798
4033	NC_008542	GCC	2	6	161383	161388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220798
4034	NC_008542	GC	3	6	161412	161417	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798
4035	NC_008542	GCG	2	6	161423	161428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220798
4036	NC_008542	CG	5	10	161940	161949	0 %	0 %	50 %	50 %	116688171
4037	NC_008542	GCT	2	6	161978	161983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688171
4038	NC_008542	GCC	2	6	161997	162002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688171
4039	NC_008542	GGT	2	6	162053	162058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688171
4040	NC_008542	CGG	3	9	162075	162083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688171
4041	NC_008542	GTA	2	6	162084	162089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688171
4042	NC_008542	GCC	2	6	162090	162095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688171
4043	NC_008542	GCG	2	6	162114	162119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688171
4044	NC_008542	CCT	2	6	162146	162151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688171
4045	NC_008542	CGA	2	6	162167	162172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688171
4046	NC_008542	GCG	3	9	162188	162196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688171
4047	NC_008542	GCCGG	2	10	162206	162215	0 %	0 %	60 %	40 %	116688171
4048	NC_008542	CGAG	2	8	162242	162249	25 %	0 %	50 %	25 %	116688171
4049	NC_008542	GCA	2	6	162261	162266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688171
4050	NC_008542	GCG	2	6	162524	162529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688172
4051	NC_008542	CGG	2	6	162543	162548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688172
4052	NC_008542	CGT	2	6	162550	162555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4053	NC_008542	GCG	2	6	162567	162572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688172
4054	NC_008542	GAT	2	6	162578	162583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688172
4055	NC_008542	TCA	2	6	162586	162591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688172
4056	NC_008542	GC	3	6	162625	162630	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4057	NC_008542	GC	3	6	162652	162657	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4058	NC_008542	GCTCGA	2	12	162700	162711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4059	NC_008542	GCA	2	6	162730	162735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4060	NC_008542	CGGG	2	8	162739	162746	0 %	0 %	75 %	25 %	116688172
4061	NC_008542	GCC	3	9	162749	162757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688172
4062	NC_008542	CGT	2	6	162766	162771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4063	NC_008542	GGCC	2	8	162781	162788	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4064	NC_008542	CG	3	6	162835	162840	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4065	NC_008542	GC	3	6	162857	162862	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4066	NC_008542	GC	3	6	162880	162885	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4067	NC_008542	AGC	2	6	162921	162926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4068	NC_008542	GTGCC	2	10	162943	162952	0 %	20 %	40 %	40 %	116688172
4069	NC_008542	CAGCGC	2	12	163004	163015	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116688172
4070	NC_008542	AGC	2	6	163044	163049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4071	NC_008542	GCC	3	9	163052	163060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688172
4072	NC_008542	CTC	2	6	163070	163075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688172
4073	NC_008542	GCG	2	6	163090	163095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688172
4074	NC_008542	GGC	2	6	163135	163140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688172
4075	NC_008542	CGA	2	6	163156	163161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4076	NC_008542	GCG	2	6	163193	163198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688172
4077	NC_008542	GC	3	6	163226	163231	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4078	NC_008542	CG	3	6	163242	163247	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4079	NC_008542	TCG	2	6	163260	163265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4080	NC_008542	CGA	2	6	163288	163293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4081	NC_008542	GGC	2	6	163300	163305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688172
4082	NC_008542	CG	3	6	163323	163328	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4083	NC_008542	CAC	2	6	163361	163366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688172
4084	NC_008542	AGC	2	6	163389	163394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4085	NC_008542	GC	4	8	163415	163422	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4086	NC_008542	GC	3	6	163438	163443	0 %	0 %	50 %	50 %	116688172
4087	NC_008542	CGAAAC	2	12	163525	163536	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116688172
4088	NC_008542	GAC	2	6	163560	163565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688172
4089	NC_008542	CAT	2	6	163957	163962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688173
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4091	NC_008542	CGG	2	6	164042	164047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688173
4092	NC_008542	CCAGC	2	10	164107	164116	20 %	0 %	20 %	60 %	116688173
4093	NC_008542	CG	3	6	164142	164147	0 %	0 %	50 %	50 %	116688173
4094	NC_008542	CGG	2	6	164199	164204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688173
4095	NC_008542	AGC	2	6	164248	164253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688173
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4097	NC_008542	GCGG	2	8	164287	164294	0 %	0 %	75 %	25 %	116688173
4098	NC_008542	CGC	2	6	164297	164302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688173
4099	NC_008542	CGT	2	6	164309	164314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688173
4100	NC_008542	CGGC	2	8	164351	164358	0 %	0 %	50 %	50 %	116688173
4101	NC_008542	GC	3	6	164403	164408	0 %	0 %	50 %	50 %	116688173
4102	NC_008542	GCC	2	6	164437	164442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688173
4103	NC_008542	TGC	2	6	164476	164481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688173
4104	NC_008542	CGG	2	6	164501	164506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688173
4105	NC_008542	ACC	2	6	164518	164523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688173
4106	NC_008542	GCG	2	6	164534	164539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688173
4107	NC_008542	CG	3	6	164561	164566	0 %	0 %	50 %	50 %	116688173
4108	NC_008542	GGCC	2	8	164567	164574	0 %	0 %	50 %	50 %	116688173
4109	NC_008542	CAG	2	6	164625	164630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688173
4110	NC_008542	AGC	2	6	164640	164645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688173
4111	NC_008542	CAT	2	6	164974	164979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688174
4112	NC_008542	AGA	2	6	165084	165089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116688174
4113	NC_008542	CGAAG	2	10	165103	165112	40 %	0 %	40 %	20 %	116688174
4114	NC_008542	CGC	2	6	165133	165138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688174
4115	NC_008542	GGC	2	6	165157	165162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688174
4116	NC_008542	GCT	2	6	165190	165195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688174
4117	NC_008542	CAC	2	6	165211	165216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116688174
4118	NC_008542	AAGG	2	8	165224	165231	50 %	0 %	50 %	0 %	116688174
4119	NC_008542	AGG	2	6	165300	165305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688174
4120	NC_008542	GAC	2	6	165350	165355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688174
4121	NC_008542	GAT	2	6	165364	165369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688174
4122	NC_008542	AGC	2	6	165375	165380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688174
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4124	NC_008542	CAT	2	6	165421	165426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688174
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4127	NC_008542	CGA	2	6	165559	165564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688174
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4242	NC_008542	CGA	2	6	171173	171178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688177
4243	NC_008542	CGC	2	6	171221	171226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688177
4244	NC_008542	GC	3	6	171249	171254	0 %	0 %	50 %	50 %	116688177
4245	NC_008542	GC	3	6	171606	171611	0 %	0 %	50 %	50 %	116688178
4246	NC_008542	GTC	2	6	171635	171640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688178
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4358	NC_008542	CATGA	2	10	176467	176476	40 %	20 %	20 %	20 %	116688182
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4362	NC_008542	CGG	2	6	176733	176738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688183
4363	NC_008542	ACG	2	6	176764	176769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688183
4364	NC_008542	GCT	2	6	176787	176792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688183
4365	NC_008542	ATC	2	6	176873	176878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688183
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4367	NC_008542	TCGCGC	2	12	176918	176929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116688183
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4387	NC_008542	GC	3	6	177590	177595	0 %	0 %	50 %	50 %	116688184
4388	NC_008542	CG	3	6	177615	177620	0 %	0 %	50 %	50 %	116688184
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4393	NC_008542	TCCG	2	8	177790	177797	0 %	25 %	25 %	50 %	116688184
4394	NC_008542	CG	3	6	177796	177801	0 %	0 %	50 %	50 %	116688184
4395	NC_008542	CTG	2	6	177831	177836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688184
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4445	NC_008542	TCG	2	6	180152	180157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688186
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4454	NC_008542	GC	3	6	180350	180355	0 %	0 %	50 %	50 %	116688186
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4476	NC_008542	GTGG	2	8	181011	181018	0 %	25 %	75 %	0 %	116688186
4477	NC_008542	CG	3	6	181042	181047	0 %	0 %	50 %	50 %	116688186
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4483	NC_008542	GC	3	6	181334	181339	0 %	0 %	50 %	50 %	116688186
4484	NC_008542	CGC	2	6	181347	181352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688186
4485	NC_008542	CGC	2	6	181383	181388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688186
4486	NC_008542	CGC	2	6	181410	181415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688186
4487	NC_008542	GCA	2	6	181419	181424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688186
4488	NC_008542	GAC	2	6	181426	181431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688186
4489	NC_008542	CTGC	2	8	181438	181445	0 %	25 %	25 %	50 %	116688186
4490	NC_008542	GC	3	6	181448	181453	0 %	0 %	50 %	50 %	116688186
4491	NC_008542	CGA	2	6	181613	181618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688187
4492	NC_008542	CCG	2	6	181619	181624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688187
4493	NC_008542	CG	3	6	181632	181637	0 %	0 %	50 %	50 %	116688187
4494	NC_008542	CGC	2	6	181747	181752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688187
4495	NC_008542	CG	4	8	181754	181761	0 %	0 %	50 %	50 %	116688187
4496	NC_008542	CTG	3	9	181785	181793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688187
4497	NC_008542	TCG	2	6	181807	181812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688187
4498	NC_008542	CGAT	2	8	181813	181820	25 %	25 %	25 %	25 %	116688187
4499	NC_008542	GCG	2	6	181844	181849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688187
4500	NC_008542	AGG	2	6	181957	181962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116688187

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