MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 90743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008542	GC	3	6	141784	141789	0 %	0 %	50 %	50 %	116688154
3502	NC_008542	GCG	2	6	141825	141830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688154
3503	NC_008542	GGC	2	6	141840	141845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688154
3504	NC_008542	CTG	2	6	141850	141855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3505	NC_008542	GCGCC	2	10	141875	141884	0 %	0 %	40 %	60 %	116688154
3506	NC_008542	GAC	2	6	141934	141939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3507	NC_008542	CTG	2	6	141949	141954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3508	NC_008542	GCG	2	6	141967	141972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688154
3509	NC_008542	CGA	2	6	141975	141980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3510	NC_008542	GGT	3	9	142104	142112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688154
3511	NC_008542	GC	3	6	142123	142128	0 %	0 %	50 %	50 %	116688154
3512	NC_008542	CGA	2	6	142140	142145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3513	NC_008542	TGC	2	6	142157	142162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3514	NC_008542	GC	3	6	142161	142166	0 %	0 %	50 %	50 %	116688154
3515	NC_008542	GGT	2	6	142170	142175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688154
3516	NC_008542	CGGCC	2	10	142195	142204	0 %	0 %	40 %	60 %	116688154
3517	NC_008542	ACG	2	6	142262	142267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3518	NC_008542	CGC	4	12	142314	142325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688154
3519	NC_008542	TGA	2	6	142343	142348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688154
3520	NC_008542	GC	3	6	142354	142359	0 %	0 %	50 %	50 %	116688154
3521	NC_008542	GAC	2	6	142390	142395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3522	NC_008542	GCT	2	6	142404	142409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688154
3523	NC_008542	CGG	3	9	142412	142420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688154
3524	NC_008542	AGCGG	2	10	142422	142431	20 %	0 %	60 %	20 %	116688154
3525	NC_008542	CGA	2	6	142471	142476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3526	NC_008542	GTC	2	6	142550	142555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3527	NC_008542	CG	4	8	142591	142598	0 %	0 %	50 %	50 %	116688155
3528	NC_008542	TGT	2	6	142660	142665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116688155
3529	NC_008542	GCG	2	6	142693	142698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688155
3530	NC_008542	CGT	2	6	142702	142707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3531	NC_008542	GGT	2	6	142739	142744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116688155
3532	NC_008542	CG	3	6	142783	142788	0 %	0 %	50 %	50 %	116688155
3533	NC_008542	GCG	2	6	142795	142800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688155
3534	NC_008542	GGCG	2	8	142820	142827	0 %	0 %	75 %	25 %	116688155
3535	NC_008542	CGAACG	2	12	142840	142851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3536	NC_008542	GCC	2	6	142858	142863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688155
3537	NC_008542	GCC	2	6	142916	142921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688155
3538	NC_008542	CGA	2	6	142924	142929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3539	NC_008542	ATCGAG	2	12	142952	142963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116688155
3540	NC_008542	GCA	2	6	142996	143001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3541	NC_008542	GCA	2	6	143005	143010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3542	NC_008542	CG	3	6	143053	143058	0 %	0 %	50 %	50 %	116688155
3543	NC_008542	GCC	2	6	143137	143142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688155
3544	NC_008542	TCG	2	6	143145	143150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3545	NC_008542	CGT	2	6	143168	143173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688155
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3547	NC_008542	GC	3	6	143251	143256	0 %	0 %	50 %	50 %	116688155
3548	NC_008542	GGCC	2	8	143257	143264	0 %	0 %	50 %	50 %	116688155
3549	NC_008542	CGA	2	6	143266	143271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3550	NC_008542	CGG	2	6	143284	143289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688155
3551	NC_008542	CGA	2	6	143302	143307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688155
3552	NC_008542	GAT	2	6	143487	143492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116688156
3553	NC_008542	GCC	2	6	143509	143514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688156
3554	NC_008542	GC	3	6	143536	143541	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3555	NC_008542	GC	3	6	143544	143549	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3556	NC_008542	GCC	2	6	143560	143565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688156
3557	NC_008542	GCC	2	6	143575	143580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688156
3558	NC_008542	GCG	2	6	143606	143611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3559	NC_008542	TCGGCG	2	12	143762	143773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116688156
3560	NC_008542	CTG	2	6	143830	143835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
3561	NC_008542	CGCGC	2	10	143836	143845	0 %	0 %	40 %	60 %	116688156
3562	NC_008542	CGG	2	6	143855	143860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3563	NC_008542	CGG	2	6	143874	143879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3564	NC_008542	CGGCG	2	10	143907	143916	0 %	0 %	60 %	40 %	116688156
3565	NC_008542	ACG	2	6	143944	143949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688156
3566	NC_008542	CGG	2	6	143985	143990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
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3569	NC_008542	CG	3	6	144086	144091	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3570	NC_008542	CGG	2	6	144125	144130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3571	NC_008542	CGCTGT	2	12	144143	144154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
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3573	NC_008542	GCT	2	6	144213	144218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
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3581	NC_008542	TCG	2	6	144368	144373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
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3583	NC_008542	GGCT	2	8	144424	144431	0 %	25 %	50 %	25 %	116688156
3584	NC_008542	TCG	2	6	144470	144475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
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3586	NC_008542	CGGC	2	8	144500	144507	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3587	NC_008542	CGGGCT	2	12	144516	144527	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116688156
3588	NC_008542	TCG	2	6	144530	144535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
3589	NC_008542	CGG	2	6	144536	144541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
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3591	NC_008542	CGG	2	6	144587	144592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3592	NC_008542	CGT	2	6	144666	144671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
3593	NC_008542	GC	3	6	144681	144686	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3594	NC_008542	ACG	2	6	144712	144717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688156
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3596	NC_008542	TCG	2	6	144749	144754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
3597	NC_008542	TGCG	2	8	144830	144837	0 %	25 %	50 %	25 %	116688156
3598	NC_008542	CG	3	6	144840	144845	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3599	NC_008542	GCG	2	6	144901	144906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3600	NC_008542	CGGC	2	8	144933	144940	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3601	NC_008542	CGT	2	6	144957	144962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688156
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3603	NC_008542	CGG	2	6	144999	145004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3604	NC_008542	CGGC	2	8	145006	145013	0 %	0 %	50 %	50 %	116688156
3605	NC_008542	CGA	2	6	145017	145022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688156
3606	NC_008542	CGA	2	6	145029	145034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688156
3607	NC_008542	CGG	2	6	145064	145069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688156
3608	NC_008542	GT	3	6	145092	145097	0 %	50 %	50 %	0 %	116688156
3609	NC_008542	GCG	2	6	145372	145377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688157
3610	NC_008542	CG	4	8	145391	145398	0 %	0 %	50 %	50 %	116688157
3611	NC_008542	AGCGC	2	10	145429	145438	20 %	0 %	40 %	40 %	116688157
3612	NC_008542	GC	4	8	145453	145460	0 %	0 %	50 %	50 %	116688157
3613	NC_008542	TCG	2	6	145473	145478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688157
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3615	NC_008542	GTC	2	6	145506	145511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688157
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3617	NC_008542	CAG	2	6	145532	145537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688157
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3621	NC_008542	GCG	2	6	145639	145644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688157
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3743	NC_008542	GC	4	8	150521	150528	0 %	0 %	50 %	50 %	116688161
3744	NC_008542	GTCG	2	8	150543	150550	0 %	25 %	50 %	25 %	116688161
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3746	NC_008542	CG	4	8	150582	150589	0 %	0 %	50 %	50 %	116688161
3747	NC_008542	CCGG	2	8	150590	150597	0 %	0 %	50 %	50 %	116688161
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3857	NC_008542	ACG	2	6	155058	155063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688166
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3859	NC_008542	TCGC	2	8	155118	155125	0 %	25 %	25 %	50 %	116688166
3860	NC_008542	GC	3	6	155124	155129	0 %	0 %	50 %	50 %	116688166
3861	NC_008542	AGC	2	6	155217	155222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688166
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3863	NC_008542	TCC	2	6	155247	155252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116688166
3864	NC_008542	CG	3	6	155256	155261	0 %	0 %	50 %	50 %	116688166
3865	NC_008542	CGC	2	6	155317	155322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688166
3866	NC_008542	CGAG	2	8	155353	155360	25 %	0 %	50 %	25 %	116688166
3867	NC_008542	CGTCG	2	10	155387	155396	0 %	20 %	40 %	40 %	116688166
3868	NC_008542	CG	3	6	155438	155443	0 %	0 %	50 %	50 %	116688166
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3871	NC_008542	GGCA	2	8	155562	155569	25 %	0 %	50 %	25 %	116688167
3872	NC_008542	GCGG	2	8	155583	155590	0 %	0 %	75 %	25 %	116688167
3873	NC_008542	GCT	2	6	155602	155607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688167
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3885	NC_008542	CGA	2	6	156205	156210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688167
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3890	NC_008542	GCT	2	6	156442	156447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688167
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3892	NC_008542	CGT	2	6	156503	156508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688167
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3904	NC_008542	TTCG	2	8	156993	157000	0 %	50 %	25 %	25 %	116688168
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3974	NC_008542	CGGCCG	2	12	159260	159271	0 %	0 %	50 %	50 %	116688168
3975	NC_008542	CAG	2	6	159282	159287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688168
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3981	NC_008542	CGGCG	2	10	159575	159584	0 %	0 %	60 %	40 %	116688168
3982	NC_008542	GCG	2	6	159616	159621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688168
3983	NC_008542	CGCGA	2	10	159622	159631	20 %	0 %	40 %	40 %	116688168
3984	NC_008542	CTG	2	6	159654	159659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688168
3985	NC_008542	GGC	2	6	159663	159668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688168
3986	NC_008542	CAT	2	6	159698	159703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688168
3987	NC_008542	GCG	2	6	159715	159720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688168
3988	NC_008542	TCA	2	6	159740	159745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116688168
3989	NC_008542	GGCGTC	2	12	159853	159864	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116688169
3990	NC_008542	GTCG	2	8	159874	159881	0 %	25 %	50 %	25 %	116688169
3991	NC_008542	GCCG	2	8	159886	159893	0 %	0 %	50 %	50 %	116688169
3992	NC_008542	CA	3	6	159914	159919	50 %	0 %	0 %	50 %	116688169
3993	NC_008542	CTT	2	6	159939	159944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116688169
3994	NC_008542	GGC	2	6	159958	159963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116688169
3995	NC_008542	CGA	2	6	159975	159980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688169
3996	NC_008542	GCC	2	6	160013	160018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116688169
3997	NC_008542	CGA	2	6	160029	160034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116688169
3998	NC_008542	TCG	2	6	160175	160180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116688169
3999	NC_008542	CG	4	8	160386	160393	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798
4000	NC_008542	CG	4	8	160455	160462	0 %	0 %	50 %	50 %	229220798

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