MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 2

Total Repeats: 67560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
67501	NC_008391	TTC	2	6	2645299	2645304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115360315
67502	NC_008391	CG	3	6	2645309	2645314	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67503	NC_008391	GCC	2	6	2645331	2645336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360315
67504	NC_008391	ATC	2	6	2645348	2645353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115360315
67505	NC_008391	CTT	2	6	2645367	2645372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115360315
67506	NC_008391	CGA	2	6	2645397	2645402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67507	NC_008391	GCTGCG	2	12	2645418	2645429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115360315
67508	NC_008391	CGT	2	6	2645450	2645455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67509	NC_008391	GC	3	6	2645481	2645486	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67510	NC_008391	GCCG	2	8	2645493	2645500	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67511	NC_008391	AGCG	2	8	2645527	2645534	25 %	0 %	50 %	25 %	115360315
67512	NC_008391	GCG	2	6	2645585	2645590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360315
67513	NC_008391	CG	3	6	2645593	2645598	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67514	NC_008391	CGGC	2	8	2645687	2645694	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67515	NC_008391	GCG	2	6	2645695	2645700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360315
67516	NC_008391	GCCG	2	8	2645706	2645713	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67517	NC_008391	GAGC	2	8	2645787	2645794	25 %	0 %	50 %	25 %	115360315
67518	NC_008391	CGC	2	6	2645820	2645825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360315
67519	NC_008391	GCT	2	6	2645838	2645843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67520	NC_008391	CGC	2	6	2645846	2645851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360315
67521	NC_008391	CGA	2	6	2645868	2645873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67522	NC_008391	CG	4	8	2645877	2645884	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67523	NC_008391	GC	3	6	2645925	2645930	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67524	NC_008391	GCCG	2	8	2645960	2645967	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67525	NC_008391	GTG	2	6	2645993	2645998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115360315
67526	NC_008391	CGATGC	2	12	2646003	2646014	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67527	NC_008391	TGG	2	6	2646017	2646022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115360315
67528	NC_008391	CGT	2	6	2646023	2646028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67529	NC_008391	CGA	3	9	2646039	2646047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67530	NC_008391	GC	4	8	2646130	2646137	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67531	NC_008391	CGA	2	6	2646150	2646155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67532	NC_008391	GCC	2	6	2646165	2646170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360315
67533	NC_008391	CACG	2	8	2646219	2646226	25 %	0 %	25 %	50 %	115360315
67534	NC_008391	CGA	2	6	2646240	2646245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360315
67535	NC_008391	GC	3	6	2646264	2646269	0 %	0 %	50 %	50 %	115360315
67536	NC_008391	CTGAA	2	10	2646274	2646283	40 %	20 %	20 %	20 %	115360315
67537	NC_008391	CACTC	2	10	2646334	2646343	20 %	20 %	0 %	60 %	115360316
67538	NC_008391	GGC	2	6	2646383	2646388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360316
67539	NC_008391	GC	3	6	2646387	2646392	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67540	NC_008391	GTC	2	6	2646393	2646398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360316
67541	NC_008391	GC	4	8	2646404	2646411	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67542	NC_008391	GCC	2	6	2646417	2646422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360316
67543	NC_008391	GC	3	6	2646488	2646493	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67544	NC_008391	GC	4	8	2646547	2646554	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67545	NC_008391	TCG	2	6	2646568	2646573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115360316
67546	NC_008391	GGC	2	6	2646585	2646590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360316
67547	NC_008391	GC	3	6	2646600	2646605	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67548	NC_008391	GC	3	6	2646631	2646636	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67549	NC_008391	GCG	2	6	2646640	2646645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360316
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67551	NC_008391	ATCG	2	8	2646693	2646700	25 %	25 %	25 %	25 %	115360316
67552	NC_008391	GC	3	6	2646719	2646724	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67553	NC_008391	GC	3	6	2646738	2646743	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67554	NC_008391	CGG	2	6	2646752	2646757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115360316
67555	NC_008391	CG	3	6	2646763	2646768	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
67556	NC_008391	CGC	2	6	2646815	2646820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115360316
67557	NC_008391	GC	3	6	2646819	2646824	0 %	0 %	50 %	50 %	115360316
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67560	NC_008391	GCA	2	6	2646900	2646905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115360316

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.