MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia ambifaria AMMD chromosome 1

Total Repeats: 92728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008390	TCG	2	6	399630	399635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350414
10002	NC_008390	GAC	2	6	399710	399715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350414
10003	NC_008390	CGA	2	6	399834	399839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350414
10004	NC_008390	ACA	2	6	399887	399892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115350415
10005	NC_008390	CCA	2	6	399902	399907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115350415
10006	NC_008390	GAA	2	6	399957	399962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350415
10007	NC_008390	TAC	2	6	399976	399981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350415
10008	NC_008390	GAA	2	6	399987	399992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350415
10009	NC_008390	CTT	2	6	400008	400013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10010	NC_008390	TCGCGT	2	12	400097	400108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10011	NC_008390	CAT	2	6	400119	400124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350415
10012	NC_008390	GCTG	2	8	400142	400149	0 %	25 %	50 %	25 %	115350415
10013	NC_008390	TTC	2	6	400183	400188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10014	NC_008390	GTC	2	6	400189	400194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10015	NC_008390	CG	3	6	400244	400249	0 %	0 %	50 %	50 %	115350415
10016	NC_008390	TTC	2	6	400303	400308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10017	NC_008390	CTG	2	6	400315	400320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10018	NC_008390	GC	3	6	400346	400351	0 %	0 %	50 %	50 %	115350415
10019	NC_008390	TTG	2	6	400385	400390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115350415
10020	NC_008390	CTT	2	6	400452	400457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10021	NC_008390	GAA	2	6	400569	400574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350415
10022	NC_008390	TAC	2	6	400618	400623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350415
10023	NC_008390	TTC	2	6	400636	400641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10024	NC_008390	TTC	2	6	400681	400686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10025	NC_008390	GGC	2	6	400699	400704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350415
10026	NC_008390	AAC	2	6	400720	400725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115350415
10027	NC_008390	CGC	2	6	400751	400756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350415
10028	NC_008390	TGC	2	6	400799	400804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10029	NC_008390	GC	3	6	400803	400808	0 %	0 %	50 %	50 %	115350415
10030	NC_008390	GAC	2	6	400809	400814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10031	NC_008390	TGA	2	6	400835	400840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350415
10032	NC_008390	GCT	2	6	400851	400856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10033	NC_008390	CG	5	10	400876	400885	0 %	0 %	50 %	50 %	115350415
10034	NC_008390	TCG	2	6	400925	400930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10035	NC_008390	CGT	3	9	400965	400973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10036	NC_008390	CGG	2	6	400982	400987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350415
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10038	NC_008390	TTC	2	6	401053	401058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10039	NC_008390	TCG	2	6	401081	401086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350415
10040	NC_008390	GCC	2	6	401121	401126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350415
10041	NC_008390	TTC	2	6	401179	401184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350415
10042	NC_008390	CGC	2	6	401204	401209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350415
10043	NC_008390	AGC	2	6	401222	401227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350415
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10045	NC_008390	GCT	2	6	401331	401336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350416
10046	NC_008390	GGC	2	6	401337	401342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350416
10047	NC_008390	GCCG	2	8	401343	401350	0 %	0 %	50 %	50 %	115350416
10048	NC_008390	GC	3	6	401352	401357	0 %	0 %	50 %	50 %	115350416
10049	NC_008390	GC	3	6	401423	401428	0 %	0 %	50 %	50 %	115350416
10050	NC_008390	TTGT	2	8	401431	401438	0 %	75 %	25 %	0 %	115350416
10051	NC_008390	CGAC	2	8	401540	401547	25 %	0 %	25 %	50 %	115350416
10052	NC_008390	GAA	2	6	401592	401597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350416
10053	NC_008390	GCC	2	6	401613	401618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350416
10054	NC_008390	GTCG	2	8	401625	401632	0 %	25 %	50 %	25 %	115350416
10055	NC_008390	GC	3	6	401641	401646	0 %	0 %	50 %	50 %	115350416
10056	NC_008390	CGA	2	6	401688	401693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350416
10057	NC_008390	AAC	2	6	401713	401718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115350416
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10059	NC_008390	AAGAC	2	10	401789	401798	60 %	0 %	20 %	20 %	115350416
10060	NC_008390	GAG	2	6	401803	401808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115350416
10061	NC_008390	TCG	2	6	401831	401836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350416
10062	NC_008390	CAG	2	6	401842	401847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350416
10063	NC_008390	CGC	2	6	401867	401872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350416
10064	NC_008390	TGG	2	6	401900	401905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115350416
10065	NC_008390	CAG	2	6	401935	401940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350416
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10068	NC_008390	CAA	2	6	402238	402243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115350417
10069	NC_008390	TGA	2	6	402261	402266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350417
10070	NC_008390	CAT	2	6	402325	402330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115350417
10071	NC_008390	CGA	2	6	402343	402348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350417
10072	NC_008390	CCCGCA	2	12	402355	402366	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	115350417
10073	NC_008390	GCCG	2	8	402373	402380	0 %	0 %	50 %	50 %	115350417
10074	NC_008390	GC	3	6	402391	402396	0 %	0 %	50 %	50 %	115350417
10075	NC_008390	CTG	2	6	402413	402418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350417
10076	NC_008390	GTTC	2	8	402436	402443	0 %	50 %	25 %	25 %	115350417
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10081	NC_008390	GAG	2	6	402572	402577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115350417
10082	NC_008390	CGC	2	6	402603	402608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350417
10083	NC_008390	GAA	2	6	402646	402651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350417
10084	NC_008390	TGA	2	6	402663	402668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350417
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10086	NC_008390	CGT	2	6	402737	402742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350417
10087	NC_008390	TGA	2	6	402743	402748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350417
10088	NC_008390	CTG	2	6	402844	402849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350418
10089	NC_008390	CG	3	6	402850	402855	0 %	0 %	50 %	50 %	115350418
10090	NC_008390	GTG	2	6	402864	402869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115350418
10091	NC_008390	CGC	2	6	402887	402892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350418
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10093	NC_008390	CGTG	2	8	402939	402946	0 %	25 %	50 %	25 %	115350418
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10109	NC_008390	C	6	6	404693	404698	0 %	0 %	0 %	100 %	115350419
10110	NC_008390	CGA	2	6	404710	404715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350419
10111	NC_008390	CA	3	6	404743	404748	50 %	0 %	0 %	50 %	115350419
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10113	NC_008390	GC	3	6	404873	404878	0 %	0 %	50 %	50 %	115350419
10114	NC_008390	CTT	2	6	404881	404886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350419
10115	NC_008390	GACG	2	8	404947	404954	25 %	0 %	50 %	25 %	115350419
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10119	NC_008390	TA	3	6	405063	405068	50 %	50 %	0 %	0 %	115350419
10120	NC_008390	AAG	2	6	405092	405097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350419
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10239	NC_008390	GCT	2	6	410877	410882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350423
10240	NC_008390	CGTC	2	8	410889	410896	0 %	25 %	25 %	50 %	115350423
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10355	NC_008390	TTGAAT	2	12	416432	416443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115350425
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10357	NC_008390	TGC	2	6	416474	416479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350425
10358	NC_008390	GCG	2	6	416486	416491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350425
10359	NC_008390	AG	3	6	416493	416498	50 %	0 %	50 %	0 %	115350425
10360	NC_008390	ATTT	2	8	416505	416512	25 %	75 %	0 %	0 %	115350425
10361	NC_008390	TGA	2	6	418124	418129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350426
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10364	NC_008390	TGA	2	6	418389	418394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350426
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10474	NC_008390	AAGA	2	8	425839	425846	75 %	0 %	25 %	0 %	115350435
10475	NC_008390	GCC	2	6	425877	425882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350435
10476	NC_008390	GCGAT	2	10	425915	425924	20 %	20 %	40 %	20 %	115350435
10477	NC_008390	TCG	3	9	425945	425953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10478	NC_008390	GTC	2	6	425956	425961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10479	NC_008390	AGC	2	6	425990	425995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10480	NC_008390	CGA	2	6	426042	426047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10481	NC_008390	TGA	2	6	426050	426055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115350435
10482	NC_008390	CG	3	6	426068	426073	0 %	0 %	50 %	50 %	115350435
10483	NC_008390	GGC	2	6	426109	426114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350435
10484	NC_008390	GTC	2	6	426169	426174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10485	NC_008390	GCC	2	6	426194	426199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350435
10486	NC_008390	CG	3	6	426207	426212	0 %	0 %	50 %	50 %	115350435
10487	NC_008390	CAA	2	6	426234	426239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115350435
10488	NC_008390	CTG	2	6	426268	426273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10489	NC_008390	GAA	2	6	426285	426290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350435
10490	NC_008390	GCA	2	6	426294	426299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10491	NC_008390	GCG	2	6	426326	426331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115350435
10492	NC_008390	GAC	2	6	426347	426352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350435
10493	NC_008390	AGCG	2	8	426390	426397	25 %	0 %	50 %	25 %	115350436
10494	NC_008390	CGC	2	6	426408	426413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115350436
10495	NC_008390	CGA	2	6	426429	426434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350436
10496	NC_008390	TCG	2	6	426437	426442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115350436
10497	NC_008390	AGA	2	6	426443	426448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115350436
10498	NC_008390	CGA	2	6	426557	426562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115350436
10499	NC_008390	CG	4	8	426567	426574	0 %	0 %	50 %	50 %	115350436
10500	NC_008390	GATCAA	2	12	426702	426713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115350436

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