MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia cepacia AMMD plasmid 1

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008385	GGTC	2	8	446	453	0 %	25 %	50 %	25 %	115345483
2	NC_008385	AGGG	2	8	514	521	25 %	0 %	75 %	0 %	115345483
3	NC_008385	AGGA	2	8	550	557	50 %	0 %	50 %	0 %	115345483
4	NC_008385	GGGC	2	8	1202	1209	0 %	0 %	75 %	25 %	115345485
5	NC_008385	CGGC	2	8	1324	1331	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
6	NC_008385	CGGC	2	8	1540	1547	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
7	NC_008385	TCAA	2	8	1920	1927	50 %	25 %	0 %	25 %	115345485
8	NC_008385	CGGT	2	8	1928	1935	0 %	25 %	50 %	25 %	115345485
9	NC_008385	CGGC	2	8	2006	2013	0 %	0 %	50 %	50 %	115345485
10	NC_008385	CCAC	2	8	2197	2204	25 %	0 %	0 %	75 %	115345485
11	NC_008385	AGCG	2	8	3913	3920	25 %	0 %	50 %	25 %	115345486
12	NC_008385	GGCG	2	8	4038	4045	0 %	0 %	75 %	25 %	115345487
13	NC_008385	GGGA	2	8	4071	4078	25 %	0 %	75 %	0 %	115345487
14	NC_008385	TCGC	2	8	4187	4194	0 %	25 %	25 %	50 %	115345487
15	NC_008385	CCTA	2	8	4513	4520	25 %	25 %	0 %	50 %	115345488
16	NC_008385	CGGC	2	8	4829	4836	0 %	0 %	50 %	50 %	115345488
17	NC_008385	GGCG	2	8	5262	5269	0 %	0 %	75 %	25 %	115345489
18	NC_008385	TCGC	2	8	5379	5386	0 %	25 %	25 %	50 %	115345489
19	NC_008385	TGGC	2	8	5527	5534	0 %	25 %	50 %	25 %	115345489
20	NC_008385	CGAG	2	8	5721	5728	25 %	0 %	50 %	25 %	115345489
21	NC_008385	ACGA	2	8	6152	6159	50 %	0 %	25 %	25 %	115345490
22	NC_008385	GCCG	2	8	6187	6194	0 %	0 %	50 %	50 %	115345490
23	NC_008385	TGGG	2	8	6317	6324	0 %	25 %	75 %	0 %	115345490
24	NC_008385	GCCT	2	8	7907	7914	0 %	25 %	25 %	50 %	115345493
25	NC_008385	GCCG	3	12	7949	7960	0 %	0 %	50 %	50 %	115345493
26	NC_008385	GGCC	2	8	8295	8302	0 %	0 %	50 %	50 %	115345494
27	NC_008385	CGAG	2	8	8405	8412	25 %	0 %	50 %	25 %	115345494
28	NC_008385	GCCA	2	8	8663	8670	25 %	0 %	25 %	50 %	115345494
29	NC_008385	CCCT	2	8	8864	8871	0 %	25 %	0 %	75 %	115345494
30	NC_008385	TGCG	2	8	9210	9217	0 %	25 %	50 %	25 %	115345494
31	NC_008385	GGCC	2	8	9339	9346	0 %	0 %	50 %	50 %	115345495
32	NC_008385	TGGC	2	8	9919	9926	0 %	25 %	50 %	25 %	115345495
33	NC_008385	CCGG	2	8	10173	10180	0 %	0 %	50 %	50 %	115345495
34	NC_008385	CGGC	2	8	10534	10541	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
35	NC_008385	GCCA	2	8	10635	10642	25 %	0 %	25 %	50 %	115345496
36	NC_008385	AGCG	2	8	10938	10945	25 %	0 %	50 %	25 %	115345496
37	NC_008385	CGAC	2	8	11176	11183	25 %	0 %	25 %	50 %	115345496
38	NC_008385	CGGC	2	8	11435	11442	0 %	0 %	50 %	50 %	115345496
39	NC_008385	GGCG	2	8	11773	11780	0 %	0 %	75 %	25 %	115345497
40	NC_008385	AAGG	2	8	12495	12502	50 %	0 %	50 %	0 %	115345498
41	NC_008385	GCAA	2	8	12646	12653	50 %	0 %	25 %	25 %	115345498
42	NC_008385	GCCG	2	8	12964	12971	0 %	0 %	50 %	50 %	115345499
43	NC_008385	CTGG	2	8	13662	13669	0 %	25 %	50 %	25 %	115345500
44	NC_008385	ACGA	2	8	13804	13811	50 %	0 %	25 %	25 %	115345500
45	NC_008385	CTTT	2	8	14098	14105	0 %	75 %	0 %	25 %	115345501
46	NC_008385	GCTG	2	8	14203	14210	0 %	25 %	50 %	25 %	115345501
47	NC_008385	GCCG	2	8	14305	14312	0 %	0 %	50 %	50 %	115345501
48	NC_008385	CAGC	2	8	14452	14459	25 %	0 %	25 %	50 %	115345501
49	NC_008385	GGGC	2	8	14956	14963	0 %	0 %	75 %	25 %	115345502
50	NC_008385	TCCA	2	8	15397	15404	25 %	25 %	0 %	50 %	115345503
51	NC_008385	CGGC	2	8	16932	16939	0 %	0 %	50 %	50 %	115345503
52	NC_008385	AGGA	2	8	17490	17497	50 %	0 %	50 %	0 %	115345503
53	NC_008385	GCGA	2	8	17835	17842	25 %	0 %	50 %	25 %	115345504
54	NC_008385	GGTG	2	8	18269	18276	0 %	25 %	75 %	0 %	115345504
55	NC_008385	CCGT	2	8	18423	18430	0 %	25 %	25 %	50 %	115345504
56	NC_008385	TGGA	2	8	18474	18481	25 %	25 %	50 %	0 %	115345504
57	NC_008385	CGGC	2	8	18803	18810	0 %	0 %	50 %	50 %	115345504
58	NC_008385	GCAA	2	8	19288	19295	50 %	0 %	25 %	25 %	115345504
59	NC_008385	TCCG	2	8	19926	19933	0 %	25 %	25 %	50 %	115345505
60	NC_008385	CCGT	2	8	19984	19991	0 %	25 %	25 %	50 %	115345506
61	NC_008385	GGCC	2	8	21033	21040	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
62	NC_008385	AGCG	2	8	21151	21158	25 %	0 %	50 %	25 %	115345506
63	NC_008385	GCCG	2	8	21893	21900	0 %	0 %	50 %	50 %	115345506
64	NC_008385	GCCG	2	8	22569	22576	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
65	NC_008385	GCCG	2	8	22615	22622	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
66	NC_008385	ACCC	2	8	22785	22792	25 %	0 %	0 %	75 %	115345508
67	NC_008385	CGGC	2	8	23403	23410	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
68	NC_008385	CGAC	2	8	23636	23643	25 %	0 %	25 %	50 %	115345508
69	NC_008385	ATGG	2	8	25636	25643	25 %	25 %	50 %	0 %	115345508
70	NC_008385	CCGG	2	8	25723	25730	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
71	NC_008385	GTCG	2	8	25891	25898	0 %	25 %	50 %	25 %	115345508
72	NC_008385	GCAA	2	8	26030	26037	50 %	0 %	25 %	25 %	115345508
73	NC_008385	CCGG	2	8	26342	26349	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
74	NC_008385	GCCG	2	8	26409	26416	0 %	0 %	50 %	50 %	115345508
75	NC_008385	CAAT	2	8	27181	27188	50 %	25 %	0 %	25 %	115345509
76	NC_008385	GAGC	2	8	27425	27432	25 %	0 %	50 %	25 %	115345509
77	NC_008385	GATT	2	8	28180	28187	25 %	50 %	25 %	0 %	115345509
78	NC_008385	GGCA	2	8	28519	28526	25 %	0 %	50 %	25 %	115345509
79	NC_008385	CGTC	2	8	29580	29587	0 %	25 %	25 %	50 %	115345511
80	NC_008385	CCAG	2	8	29802	29809	25 %	0 %	25 %	50 %	115345511
81	NC_008385	CGGC	2	8	30863	30870	0 %	0 %	50 %	50 %	115345513
82	NC_008385	CGGC	2	8	30904	30911	0 %	0 %	50 %	50 %	115345513
83	NC_008385	CCGG	2	8	31153	31160	0 %	0 %	50 %	50 %	115345513
84	NC_008385	CGGC	2	8	31206	31213	0 %	0 %	50 %	50 %	115345513
85	NC_008385	GCTG	2	8	31789	31796	0 %	25 %	50 %	25 %	115345515
86	NC_008385	CGTT	2	8	32329	32336	0 %	50 %	25 %	25 %	115345516
87	NC_008385	GGCG	2	8	32648	32655	0 %	0 %	75 %	25 %	115345516
88	NC_008385	CGGC	2	8	33186	33193	0 %	0 %	50 %	50 %	115345517
89	NC_008385	GTTC	2	8	33289	33296	0 %	50 %	25 %	25 %	115345517
90	NC_008385	TGCC	2	8	33571	33578	0 %	25 %	25 %	50 %	115345517
91	NC_008385	GCCA	2	8	34548	34555	25 %	0 %	25 %	50 %	115345517
92	NC_008385	TGGC	2	8	34588	34595	0 %	25 %	50 %	25 %	115345517
93	NC_008385	CTCG	2	8	35172	35179	0 %	25 %	25 %	50 %	115345519
94	NC_008385	CGGT	2	8	36112	36119	0 %	25 %	50 %	25 %	115345520
95	NC_008385	CCGC	2	8	36351	36358	0 %	0 %	25 %	75 %	115345520
96	NC_008385	ACGA	2	8	36933	36940	50 %	0 %	25 %	25 %	115345520
97	NC_008385	GACG	2	8	36985	36992	25 %	0 %	50 %	25 %	115345520
98	NC_008385	CGGC	2	8	37085	37092	0 %	0 %	50 %	50 %	115345521
99	NC_008385	GATT	2	8	37132	37139	25 %	50 %	25 %	0 %	115345521
100	NC_008385	GCCG	2	8	37281	37288	0 %	0 %	50 %	50 %	115345521
101	NC_008385	CTGG	2	8	37479	37486	0 %	25 %	50 %	25 %	115345521
102	NC_008385	AGGG	2	8	38397	38404	25 %	0 %	75 %	0 %	115345522
103	NC_008385	CACG	2	8	38496	38503	25 %	0 %	25 %	50 %	115345523
104	NC_008385	GTAG	2	8	38566	38573	25 %	25 %	50 %	0 %	115345523
105	NC_008385	CCAC	2	8	38637	38644	25 %	0 %	0 %	75 %	115345523
106	NC_008385	CCAC	2	8	39008	39015	25 %	0 %	0 %	75 %	115345523
107	NC_008385	CGGC	2	8	39286	39293	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
108	NC_008385	GCCG	2	8	40203	40210	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
109	NC_008385	CGGC	2	8	40509	40516	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
110	NC_008385	GCCG	2	8	40689	40696	0 %	0 %	50 %	50 %	115345524
111	NC_008385	CGTG	2	8	41126	41133	0 %	25 %	50 %	25 %	115345524
112	NC_008385	CAGC	2	8	42434	42441	25 %	0 %	25 %	50 %	115345526
113	NC_008385	TTGC	2	8	42574	42581	0 %	50 %	25 %	25 %	115345526
114	NC_008385	TCGG	2	8	42894	42901	0 %	25 %	50 %	25 %	115345527
115	NC_008385	TCGG	2	8	43024	43031	0 %	25 %	50 %	25 %	115345527
116	NC_008385	CAAT	2	8	43133	43140	50 %	25 %	0 %	25 %	115345527
117	NC_008385	GGTG	2	8	43227	43234	0 %	25 %	75 %	0 %	115345527
118	NC_008385	GGTC	2	8	43553	43560	0 %	25 %	50 %	25 %	115345527

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.