MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 665

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008273	AAT	2	6	21943	21948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074110
502	NC_008273	AAAAT	2	10	21998	22007	80 %	20 %	0 %	0 %	111074110
503	NC_008273	A	6	6	22011	22016	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
504	NC_008273	A	6	6	22023	22028	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
505	NC_008273	A	6	6	22042	22047	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
506	NC_008273	AAT	2	6	22098	22103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074110
507	NC_008273	CTGG	2	8	22145	22152	0 %	25 %	50 %	25 %	111074110
508	NC_008273	TTA	2	6	22251	22256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074110
509	NC_008273	A	7	7	22279	22285	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
510	NC_008273	GAA	2	6	22366	22371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074110
511	NC_008273	A	7	7	22370	22376	100 %	0 %	0 %	0 %	111074110
512	NC_008273	TCT	2	6	22473	22478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074110
513	NC_008273	AAAT	2	8	22500	22507	75 %	25 %	0 %	0 %	111074110
514	NC_008273	ATTT	3	12	22526	22537	25 %	75 %	0 %	0 %	111074110
515	NC_008273	ATA	2	6	22613	22618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074110
516	NC_008273	TCT	2	6	22630	22635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074110
517	NC_008273	CAAA	2	8	22637	22644	75 %	0 %	0 %	25 %	111074110
518	NC_008273	CTAT	2	8	22691	22698	25 %	50 %	0 %	25 %	111074111
519	NC_008273	ATA	2	6	22765	22770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074111
520	NC_008273	TTTC	2	8	22771	22778	0 %	75 %	0 %	25 %	111074111
521	NC_008273	TAA	2	6	22927	22932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074111
522	NC_008273	AC	3	6	23017	23022	50 %	0 %	0 %	50 %	111074111
523	NC_008273	TAC	2	6	23227	23232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
524	NC_008273	ATCT	2	8	23254	23261	25 %	50 %	0 %	25 %	111074112
525	NC_008273	AATTTT	2	12	23357	23368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074112
526	NC_008273	T	7	7	23395	23401	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
527	NC_008273	TTTA	2	8	23417	23424	25 %	75 %	0 %	0 %	111074112
528	NC_008273	GCA	2	6	23472	23477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074112
529	NC_008273	TCA	2	6	23478	23483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
530	NC_008273	AACTC	2	10	23544	23553	40 %	20 %	0 %	40 %	111074112
531	NC_008273	TAC	2	6	23576	23581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
532	NC_008273	CAA	2	6	23590	23595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074112
533	NC_008273	TAA	2	6	23599	23604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
534	NC_008273	CAT	2	6	23608	23613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
535	NC_008273	ATT	2	6	23621	23626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074112
536	NC_008273	TAA	2	6	23633	23638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
537	NC_008273	CTT	2	6	23683	23688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074112
538	NC_008273	CAT	2	6	23731	23736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
539	NC_008273	A	6	6	23844	23849	100 %	0 %	0 %	0 %	111074112
540	NC_008273	TACT	2	8	23850	23857	25 %	50 %	0 %	25 %	111074112
541	NC_008273	ACT	2	6	23897	23902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
542	NC_008273	ACT	2	6	23918	23923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
543	NC_008273	TAA	2	6	23959	23964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
544	NC_008273	CCAT	2	8	23966	23973	25 %	25 %	0 %	50 %	111074112
545	NC_008273	TTG	2	6	23977	23982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074112
546	NC_008273	CTA	2	6	23986	23991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074112
547	NC_008273	AAT	2	6	24019	24024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074112
548	NC_008273	ATTT	2	8	24049	24056	25 %	75 %	0 %	0 %	111074112
549	NC_008273	ACA	2	6	24066	24071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074112
550	NC_008273	AT	3	6	24138	24143	50 %	50 %	0 %	0 %	111074112
551	NC_008273	CCA	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074112
552	NC_008273	T	6	6	24338	24343	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
553	NC_008273	T	6	6	24364	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
554	NC_008273	TTG	2	6	24419	24424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074112
555	NC_008273	ATT	2	6	24452	24457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074112
556	NC_008273	T	6	6	24456	24461	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
557	NC_008273	T	7	7	24474	24480	0 %	100 %	0 %	0 %	111074112
558	NC_008273	TTTA	2	8	25235	25242	25 %	75 %	0 %	0 %	111074113
559	NC_008273	ATAA	2	8	25261	25268	75 %	25 %	0 %	0 %	111074113
560	NC_008273	TATC	2	8	25367	25374	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
561	NC_008273	TAGAT	2	10	25383	25392	40 %	40 %	20 %	0 %	111074113
562	NC_008273	AT	3	6	25391	25396	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
563	NC_008273	TTA	2	6	25429	25434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074113
564	NC_008273	TATC	2	8	25454	25461	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
565	NC_008273	ATAA	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	111074113
566	NC_008273	T	7	7	25495	25501	0 %	100 %	0 %	0 %	111074113
567	NC_008273	ATCT	2	8	25509	25516	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
568	NC_008273	AT	3	6	25532	25537	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
569	NC_008273	TATC	2	8	25562	25569	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
570	NC_008273	AT	3	6	25586	25591	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
571	NC_008273	TCT	2	6	25604	25609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074113
572	NC_008273	ATT	2	6	25618	25623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074113
573	NC_008273	GAA	2	6	25661	25666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074113
574	NC_008273	CCT	2	6	25682	25687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111074113
575	NC_008273	T	6	6	25714	25719	0 %	100 %	0 %	0 %	111074113
576	NC_008273	TATAT	2	10	25728	25737	40 %	60 %	0 %	0 %	111074113
577	NC_008273	TTA	2	6	25770	25775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074114
578	NC_008273	T	7	7	25805	25811	0 %	100 %	0 %	0 %	111074114
579	NC_008273	TCA	2	6	25825	25830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074114
580	NC_008273	AAT	2	6	25834	25839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074114
581	NC_008273	TAA	2	6	25845	25850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074114
582	NC_008273	TAA	2	6	25949	25954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074114
583	NC_008273	TAC	2	6	25958	25963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074114
584	NC_008273	T	6	6	25982	25987	0 %	100 %	0 %	0 %	111074114
585	NC_008273	AAT	2	6	26019	26024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074114
586	NC_008273	TA	3	6	26052	26057	50 %	50 %	0 %	0 %	111074114
587	NC_008273	A	6	6	26095	26100	100 %	0 %	0 %	0 %	111074114
588	NC_008273	ATCC	2	8	26117	26124	25 %	25 %	0 %	50 %	111074114
589	NC_008273	T	8	8	26136	26143	0 %	100 %	0 %	0 %	111074114
590	NC_008273	TAT	2	6	26180	26185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074114
591	NC_008273	TGT	2	6	26196	26201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074114
592	NC_008273	TCT	2	6	26251	26256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074114
593	NC_008273	TTA	2	6	26303	26308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074114
594	NC_008273	ATTTT	2	10	26311	26320	20 %	80 %	0 %	0 %	111074114
595	NC_008273	TCA	2	6	26327	26332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074114
596	NC_008273	TTATT	2	10	26372	26381	20 %	80 %	0 %	0 %	111074115
597	NC_008273	T	6	6	26402	26407	0 %	100 %	0 %	0 %	111074115
598	NC_008273	ATA	2	6	26417	26422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074115
599	NC_008273	GAA	2	6	26433	26438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074115
600	NC_008273	T	6	6	26462	26467	0 %	100 %	0 %	0 %	111074115
601	NC_008273	ATT	2	6	26532	26537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074115
602	NC_008273	TTTA	2	8	26609	26616	25 %	75 %	0 %	0 %	111074115
603	NC_008273	TAT	2	6	26672	26677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074115
604	NC_008273	AAT	2	6	26680	26685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074115
605	NC_008273	ATT	2	6	26739	26744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074115
606	NC_008273	T	6	6	26779	26784	0 %	100 %	0 %	0 %	111074115
607	NC_008273	TAT	2	6	26849	26854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074115
608	NC_008273	TA	3	6	26891	26896	50 %	50 %	0 %	0 %	111074115
609	NC_008273	A	6	6	26967	26972	100 %	0 %	0 %	0 %	111074115
610	NC_008273	AT	3	6	27037	27042	50 %	50 %	0 %	0 %	111074115
611	NC_008273	ACC	2	6	27077	27082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074115
612	NC_008273	TTA	2	6	27100	27105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074115
613	NC_008273	T	6	6	27113	27118	0 %	100 %	0 %	0 %	111074115
614	NC_008273	T	6	6	27154	27159	0 %	100 %	0 %	0 %	111074116
615	NC_008273	ATA	2	6	27207	27212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074116
616	NC_008273	ATTC	2	8	27229	27236	25 %	50 %	0 %	25 %	111074116
617	NC_008273	A	7	7	27275	27281	100 %	0 %	0 %	0 %	111074116
618	NC_008273	ATA	2	6	27310	27315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074116
619	NC_008273	T	6	6	27374	27379	0 %	100 %	0 %	0 %	111074116
620	NC_008273	A	6	6	27399	27404	100 %	0 %	0 %	0 %	111074116
621	NC_008273	CTT	2	6	27423	27428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074116
622	NC_008273	CAA	2	6	27453	27458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074116
623	NC_008273	TTCT	2	8	27459	27466	0 %	75 %	0 %	25 %	111074116
624	NC_008273	TTCTT	2	10	27504	27513	0 %	80 %	0 %	20 %	111074116
625	NC_008273	T	8	8	27521	27528	0 %	100 %	0 %	0 %	111074116
626	NC_008273	CAT	2	6	27559	27564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074116
627	NC_008273	TCAA	2	8	27602	27609	50 %	25 %	0 %	25 %	111074116
628	NC_008273	T	7	7	27652	27658	0 %	100 %	0 %	0 %	111074116
629	NC_008273	CTT	2	6	27699	27704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074117
630	NC_008273	ATT	2	6	27718	27723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074117
631	NC_008273	T	6	6	27728	27733	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
632	NC_008273	TAA	2	6	27742	27747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074117
633	NC_008273	ATA	3	9	27751	27759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074117
634	NC_008273	TAT	2	6	27762	27767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074117
635	NC_008273	AT	3	6	27766	27771	50 %	50 %	0 %	0 %	111074117
636	NC_008273	TAT	2	6	27774	27779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074117
637	NC_008273	CTTTT	2	10	27844	27853	0 %	80 %	0 %	20 %	111074117
638	NC_008273	T	6	6	27919	27924	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
639	NC_008273	CAATT	2	10	27925	27934	40 %	40 %	0 %	20 %	111074117
640	NC_008273	TTA	2	6	27954	27959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074117
641	NC_008273	AAT	2	6	27988	27993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074117
642	NC_008273	ATTT	2	8	28036	28043	25 %	75 %	0 %	0 %	111074117
643	NC_008273	T	8	8	28066	28073	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
644	NC_008273	T	7	7	28081	28087	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
645	NC_008273	TTA	2	6	28139	28144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074117
646	NC_008273	TGTT	2	8	28154	28161	0 %	75 %	25 %	0 %	111074117
647	NC_008273	T	7	7	28254	28260	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
648	NC_008273	T	7	7	28293	28299	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
649	NC_008273	TTC	2	6	28303	28308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074117
650	NC_008273	ATTT	2	8	28321	28328	25 %	75 %	0 %	0 %	111074117
651	NC_008273	CTT	2	6	28329	28334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074117
652	NC_008273	TAT	2	6	28338	28343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074117
653	NC_008273	TTA	2	6	28346	28351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074117
654	NC_008273	T	6	6	28382	28387	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
655	NC_008273	T	6	6	28440	28445	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
656	NC_008273	CATT	2	8	28475	28482	25 %	50 %	0 %	25 %	111074117
657	NC_008273	T	7	7	28481	28487	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
658	NC_008273	GTA	2	6	28540	28545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074117
659	NC_008273	GTTG	2	8	28546	28553	0 %	50 %	50 %	0 %	111074117
660	NC_008273	GTA	2	6	28607	28612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074117
661	NC_008273	T	6	6	28662	28667	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117
662	NC_008273	TA	3	6	28693	28698	50 %	50 %	0 %	0 %	111074117
663	NC_008273	TGT	2	6	28730	28735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074117
664	NC_008273	TGT	2	6	28740	28745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074117
665	NC_008273	T	6	6	28757	28762	0 %	100 %	0 %	0 %	111074117

< Previous 12Next >