MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia AU 1054 chromosome 1

Total Repeats: 86033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008060	TCGGC	2	10	156770	156779	0 %	20 %	40 %	40 %	107021710
4002	NC_008060	GCG	2	6	156802	156807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021710
4003	NC_008060	GAA	2	6	156875	156880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107021710
4004	NC_008060	TCG	2	6	156913	156918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021710
4005	NC_008060	GGCG	2	8	156923	156930	0 %	0 %	75 %	25 %	107021710
4006	NC_008060	AAGG	2	8	156987	156994	50 %	0 %	50 %	0 %	107021710
4007	NC_008060	GCT	2	6	157004	157009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021710
4008	NC_008060	GGC	2	6	157025	157030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021710
4009	NC_008060	GC	4	8	157315	157322	0 %	0 %	50 %	50 %	107021711
4010	NC_008060	GC	3	6	157327	157332	0 %	0 %	50 %	50 %	107021711
4011	NC_008060	GC	3	6	157361	157366	0 %	0 %	50 %	50 %	107021711
4012	NC_008060	CCG	2	6	157381	157386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021711
4013	NC_008060	ACC	2	6	157420	157425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107021711
4014	NC_008060	GTT	2	6	157473	157478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	107021711
4015	NC_008060	CGCA	2	8	157492	157499	25 %	0 %	25 %	50 %	107021711
4016	NC_008060	GGC	2	6	157527	157532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021711
4017	NC_008060	TCG	2	6	157568	157573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021711
4018	NC_008060	GTGA	2	8	157615	157622	25 %	25 %	50 %	0 %	107021711
4019	NC_008060	CGG	2	6	157631	157636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021711
4020	NC_008060	CG	3	6	157662	157667	0 %	0 %	50 %	50 %	107021711
4021	NC_008060	CGAA	2	8	157703	157710	50 %	0 %	25 %	25 %	107021711
4022	NC_008060	ATCG	2	8	157725	157732	25 %	25 %	25 %	25 %	107021711
4023	NC_008060	CGT	2	6	157755	157760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021711
4024	NC_008060	GAG	2	6	157801	157806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	107021711
4025	NC_008060	GGA	2	6	157815	157820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	107021711
4026	NC_008060	CG	5	10	157827	157836	0 %	0 %	50 %	50 %	107021711
4027	NC_008060	CGA	2	6	157889	157894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021711
4028	NC_008060	CCGA	2	8	157896	157903	25 %	0 %	25 %	50 %	107021711
4029	NC_008060	TGC	2	6	157970	157975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021711
4030	NC_008060	CGT	2	6	157980	157985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021711
4031	NC_008060	TGA	2	6	157994	157999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107021711
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4033	NC_008060	GC	3	6	158366	158371	0 %	0 %	50 %	50 %	229220687
4034	NC_008060	CGC	2	6	158378	158383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220687
4035	NC_008060	GCCG	2	8	158396	158403	0 %	0 %	50 %	50 %	229220687
4036	NC_008060	GCA	2	6	158413	158418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220687
4037	NC_008060	CG	3	6	158419	158424	0 %	0 %	50 %	50 %	229220687
4038	NC_008060	CGCGTG	2	12	158449	158460	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	229220687
4039	NC_008060	TCG	2	6	158472	158477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220687
4040	NC_008060	CAG	2	6	158504	158509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220687
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4042	NC_008060	GCGG	2	8	158523	158530	0 %	0 %	75 %	25 %	229220687
4043	NC_008060	GCT	2	6	158555	158560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229220687
4044	NC_008060	GC	3	6	158562	158567	0 %	0 %	50 %	50 %	229220687
4045	NC_008060	CAG	3	9	158573	158581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220687
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4050	NC_008060	ACG	2	6	158697	158702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220687
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4052	NC_008060	ACG	2	6	158751	158756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220687
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4054	NC_008060	CCG	2	6	158782	158787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229220687
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4056	NC_008060	CTCGGC	2	12	158876	158887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	229220687
4057	NC_008060	GC	3	6	158914	158919	0 %	0 %	50 %	50 %	229220687
4058	NC_008060	CGA	2	6	158935	158940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220687
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4062	NC_008060	CGGC	2	8	159031	159038	0 %	0 %	50 %	50 %	229220687
4063	NC_008060	GC	3	6	159057	159062	0 %	0 %	50 %	50 %	229220687
4064	NC_008060	GCG	2	6	159066	159071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229220687
4065	NC_008060	CGA	2	6	159073	159078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229220687
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4071	NC_008060	CG	3	6	159322	159327	0 %	0 %	50 %	50 %	107021713
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4090	NC_008060	CG	4	8	159986	159993	0 %	0 %	50 %	50 %	107021714
4091	NC_008060	GGCC	2	8	160000	160007	0 %	0 %	50 %	50 %	107021714
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4107	NC_008060	CCGA	2	8	160332	160339	25 %	0 %	25 %	50 %	107021714
4108	NC_008060	CGGC	2	8	160346	160353	0 %	0 %	50 %	50 %	107021714
4109	NC_008060	GCCG	2	8	160369	160376	0 %	0 %	50 %	50 %	107021714
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4121	NC_008060	CGA	2	6	161175	161180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4122	NC_008060	TCG	2	6	161204	161209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4123	NC_008060	CAC	2	6	161212	161217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107021715
4124	NC_008060	ACGT	2	8	161218	161225	25 %	25 %	25 %	25 %	107021715
4125	NC_008060	GCTC	2	8	161273	161280	0 %	25 %	25 %	50 %	107021715
4126	NC_008060	GCTGAA	2	12	161289	161300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	107021715
4127	NC_008060	ACG	2	6	161318	161323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4128	NC_008060	TCGA	2	8	161335	161342	25 %	25 %	25 %	25 %	107021715
4129	NC_008060	CGT	2	6	161349	161354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4130	NC_008060	ACG	2	6	161366	161371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4131	NC_008060	ACG	2	6	161429	161434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4132	NC_008060	CTG	2	6	161493	161498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4133	NC_008060	CGG	2	6	161535	161540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021715
4134	NC_008060	ACG	2	6	161543	161548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4135	NC_008060	CGGCG	2	10	161553	161562	0 %	0 %	60 %	40 %	107021715
4136	NC_008060	GAA	2	6	161572	161577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107021715
4137	NC_008060	CG	3	6	161588	161593	0 %	0 %	50 %	50 %	107021715
4138	NC_008060	GAAG	2	8	161658	161665	50 %	0 %	50 %	0 %	107021715
4139	NC_008060	CGC	2	6	161703	161708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021715
4140	NC_008060	CG	3	6	161713	161718	0 %	0 %	50 %	50 %	107021715
4141	NC_008060	CGG	2	6	161726	161731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021715
4142	NC_008060	GCC	2	6	161734	161739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021715
4143	NC_008060	CAA	2	6	161760	161765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	107021715
4144	NC_008060	GCCG	2	8	161769	161776	0 %	0 %	50 %	50 %	107021715
4145	NC_008060	GCG	2	6	161794	161799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021715
4146	NC_008060	ATC	2	6	161800	161805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021715
4147	NC_008060	GC	3	6	161820	161825	0 %	0 %	50 %	50 %	107021715
4148	NC_008060	GCA	2	6	161853	161858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4149	NC_008060	CGC	3	9	161874	161882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021715
4150	NC_008060	GCT	2	6	161892	161897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4151	NC_008060	CGG	2	6	161898	161903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021715
4152	NC_008060	CG	3	6	161959	161964	0 %	0 %	50 %	50 %	107021715
4153	NC_008060	TGC	2	6	161984	161989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4154	NC_008060	GCG	2	6	162034	162039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021715
4155	NC_008060	CGG	2	6	162060	162065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021715
4156	NC_008060	CGG	2	6	162078	162083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021715
4157	NC_008060	TGA	2	6	162137	162142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107021715
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4159	NC_008060	TCGA	2	8	162211	162218	25 %	25 %	25 %	25 %	107021715
4160	NC_008060	ACG	2	6	162251	162256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021715
4161	NC_008060	CCGT	2	8	162318	162325	0 %	25 %	25 %	50 %	107021715
4162	NC_008060	GCC	2	6	162341	162346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021715
4163	NC_008060	TCG	2	6	162434	162439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021715
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4166	NC_008060	GC	3	6	162526	162531	0 %	0 %	50 %	50 %	107021715
4167	NC_008060	TGC	2	6	162593	162598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021715
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4193	NC_008060	GACG	2	8	163447	163454	25 %	0 %	50 %	25 %	107021716
4194	NC_008060	CG	4	8	163475	163482	0 %	0 %	50 %	50 %	107021716
4195	NC_008060	CCAC	2	8	163488	163495	25 %	0 %	0 %	75 %	107021716
4196	NC_008060	CGA	2	6	163506	163511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021716
4197	NC_008060	TGC	2	6	163542	163547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021716
4198	NC_008060	CGA	2	6	163590	163595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021716
4199	NC_008060	TCG	2	6	163608	163613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021716
4200	NC_008060	GAAG	2	8	163669	163676	50 %	0 %	50 %	0 %	107021716
4201	NC_008060	GC	3	6	163686	163691	0 %	0 %	50 %	50 %	107021716
4202	NC_008060	ACG	2	6	163713	163718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021716
4203	NC_008060	TCGA	2	8	163730	163737	25 %	25 %	25 %	25 %	107021716
4204	NC_008060	TCG	2	6	163757	163762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021716
4205	NC_008060	CGACG	2	10	163768	163777	20 %	0 %	40 %	40 %	107021716
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4207	NC_008060	CGCGAA	2	12	163873	163884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021716
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4209	NC_008060	CGA	2	6	164004	164009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021717
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4211	NC_008060	CG	3	6	164087	164092	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4212	NC_008060	CGG	2	6	164101	164106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021717
4213	NC_008060	GCC	2	6	164117	164122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021717
4214	NC_008060	ATCCCC	2	12	164141	164152	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	107021717
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4216	NC_008060	TCG	2	6	164172	164177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021717
4217	NC_008060	CGT	2	6	164209	164214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021717
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4224	NC_008060	CGGC	2	8	164304	164311	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4225	NC_008060	ATCGT	2	10	164315	164324	20 %	40 %	20 %	20 %	107021717
4226	NC_008060	CAC	2	6	164377	164382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107021717
4227	NC_008060	CGGC	2	8	164406	164413	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4228	NC_008060	ATC	2	6	164420	164425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021717
4229	NC_008060	CCG	2	6	164437	164442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021717
4230	NC_008060	GCG	2	6	164453	164458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021717
4231	NC_008060	GCA	2	6	164526	164531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021717
4232	NC_008060	CGGC	2	8	164532	164539	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4233	NC_008060	AGC	2	6	164540	164545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021717
4234	NC_008060	CGA	2	6	164557	164562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021717
4235	NC_008060	CGC	2	6	164592	164597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021717
4236	NC_008060	CG	5	10	164623	164632	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4237	NC_008060	CTG	2	6	164635	164640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021717
4238	NC_008060	CG	4	8	164647	164654	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4239	NC_008060	GC	4	8	164719	164726	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4240	NC_008060	GCGCG	2	10	164790	164799	0 %	0 %	60 %	40 %	107021717
4241	NC_008060	TTC	2	6	164812	164817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107021717
4242	NC_008060	GC	3	6	164834	164839	0 %	0 %	50 %	50 %	107021717
4243	NC_008060	GCC	2	6	165044	165049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021718
4244	NC_008060	GC	3	6	165050	165055	0 %	0 %	50 %	50 %	107021718
4245	NC_008060	GCG	2	6	165118	165123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021718
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4248	NC_008060	CGA	2	6	165180	165185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021718
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4364	NC_008060	GATC	2	8	169269	169276	25 %	25 %	25 %	25 %	162218064
4365	NC_008060	CGC	2	6	169277	169282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162218064
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4367	NC_008060	GC	4	8	169339	169346	0 %	0 %	50 %	50 %	162218064
4368	NC_008060	GAA	2	6	169453	169458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107021722
4369	NC_008060	CG	3	6	169465	169470	0 %	0 %	50 %	50 %	107021722
4370	NC_008060	CGG	2	6	169509	169514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021722
4371	NC_008060	CG	4	8	169524	169531	0 %	0 %	50 %	50 %	107021722
4372	NC_008060	CGA	2	6	169542	169547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021722
4373	NC_008060	CG	3	6	169549	169554	0 %	0 %	50 %	50 %	107021722
4374	NC_008060	CAG	3	9	169573	169581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021722
4375	NC_008060	ATG	2	6	169619	169624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107021722
4376	NC_008060	GCT	2	6	169630	169635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021722
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4378	NC_008060	CGC	2	6	169654	169659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021722
4379	NC_008060	ATGA	2	8	169672	169679	50 %	25 %	25 %	0 %	107021722
4380	NC_008060	GAAGTC	2	12	169690	169701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	107021722
4381	NC_008060	TCG	2	6	169715	169720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021722
4382	NC_008060	GC	3	6	169722	169727	0 %	0 %	50 %	50 %	107021722
4383	NC_008060	TCG	2	6	169784	169789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021722
4384	NC_008060	GAC	2	6	169792	169797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021722
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4386	NC_008060	CGGG	2	8	169854	169861	0 %	0 %	75 %	25 %	107021722
4387	NC_008060	GAC	2	6	169862	169867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021722
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4390	NC_008060	CG	3	6	169933	169938	0 %	0 %	50 %	50 %	107021722
4391	NC_008060	GCA	2	6	169944	169949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021722
4392	NC_008060	CG	3	6	169990	169995	0 %	0 %	50 %	50 %	107021722
4393	NC_008060	CTC	2	6	170008	170013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	107021722
4394	NC_008060	GCA	2	6	170034	170039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021722
4395	NC_008060	GCCT	2	8	170059	170066	0 %	25 %	25 %	50 %	107021722
4396	NC_008060	TCG	2	6	170082	170087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021722
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4399	NC_008060	ACC	2	6	170184	170189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	107021722
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4401	NC_008060	GC	3	6	170234	170239	0 %	0 %	50 %	50 %	107021722
4402	NC_008060	GTCC	2	8	170262	170269	0 %	25 %	25 %	50 %	107021722
4403	NC_008060	CTA	2	6	170292	170297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021722
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4405	NC_008060	GTC	2	6	170404	170409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021723
4406	NC_008060	TTC	2	6	170440	170445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	107021723
4407	NC_008060	CGT	2	6	170529	170534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021723
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4409	NC_008060	CGT	2	6	170595	170600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021723
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4415	NC_008060	TGA	2	6	170765	170770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107021723
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4420	NC_008060	ATC	2	6	170929	170934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021723
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4427	NC_008060	TGC	2	6	171182	171187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021723
4428	NC_008060	TGA	2	6	171194	171199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	107021723
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4432	NC_008060	TCG	2	6	171356	171361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021723
4433	NC_008060	TGC	2	6	171362	171367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021723
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4476	NC_008060	CGG	2	6	172918	172923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021725
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4480	NC_008060	CG	4	8	173010	173017	0 %	0 %	50 %	50 %	107021725
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4483	NC_008060	GCCG	2	8	173113	173120	0 %	0 %	50 %	50 %	107021725
4484	NC_008060	GC	3	6	173143	173148	0 %	0 %	50 %	50 %	107021725
4485	NC_008060	GCT	2	6	173206	173211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021725
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4487	NC_008060	CGG	2	6	173251	173256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	107021725
4488	NC_008060	CGA	2	6	173272	173277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021725
4489	NC_008060	CG	3	6	173291	173296	0 %	0 %	50 %	50 %	107021725
4490	NC_008060	TGCGG	2	10	173449	173458	0 %	20 %	60 %	20 %	107021726
4491	NC_008060	CTG	2	6	173537	173542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021726
4492	NC_008060	GAA	2	6	173564	173569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	107021726
4493	NC_008060	GGT	2	6	173602	173607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107021726
4494	NC_008060	GTG	2	6	173609	173614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	107021726
4495	NC_008060	TGC	2	6	173659	173664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021726
4496	NC_008060	CAG	2	6	173669	173674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	107021726
4497	NC_008060	GCT	2	6	173731	173736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021726
4498	NC_008060	CTG	2	6	173789	173794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	107021726
4499	NC_008060	CAT	2	6	174022	174027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	107021727
4500	NC_008060	GCC	3	9	174032	174040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	107021727

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