MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 plasmid pBF9343

Total Repeats: 427

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006873	ATA	2	6	135	140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650142
2	NC_006873	AAG	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650142
3	NC_006873	ATA	2	6	480	485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650142
4	NC_006873	GAC	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650142
5	NC_006873	AGC	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650142
6	NC_006873	ATT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650142
7	NC_006873	TGA	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650142
8	NC_006873	AGA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650142
9	NC_006873	GTG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650143
10	NC_006873	TAT	2	6	1432	1437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650143
11	NC_006873	ATT	2	6	1440	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650143
12	NC_006873	ATC	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650143
13	NC_006873	ATG	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650143
14	NC_006873	AGA	3	9	1506	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
15	NC_006873	AGC	2	6	1533	1538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650143
16	NC_006873	AAG	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
17	NC_006873	TGA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650143
18	NC_006873	GAA	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
19	NC_006873	AGA	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
20	NC_006873	AGA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
21	NC_006873	GTA	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650143
22	NC_006873	GAA	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
23	NC_006873	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650143
24	NC_006873	TGA	2	6	3467	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650144
25	NC_006873	TCT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650144
26	NC_006873	GAA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650144
27	NC_006873	TGA	2	6	3635	3640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650145
28	NC_006873	CTG	2	6	3752	3757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650145
29	NC_006873	GAA	2	6	3787	3792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650145
30	NC_006873	TCA	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650146
31	NC_006873	GGA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650146
32	NC_006873	GGA	2	6	4090	4095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650146
33	NC_006873	CTT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650146
34	NC_006873	GGT	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650146
35	NC_006873	ACA	3	9	4202	4210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650147
36	NC_006873	TTA	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650147
37	NC_006873	GAA	2	6	4253	4258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650147
38	NC_006873	ACA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650147
39	NC_006873	AAT	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650147
40	NC_006873	ATG	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650147
41	NC_006873	TGA	3	9	4387	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650147
42	NC_006873	AAT	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650148
43	NC_006873	GAT	2	6	4612	4617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650148
44	NC_006873	ATT	2	6	4624	4629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650148
45	NC_006873	GTG	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650149
46	NC_006873	ATG	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650149
47	NC_006873	AGG	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650149
48	NC_006873	ATG	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650149
49	NC_006873	GAA	2	6	4871	4876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650149
50	NC_006873	ACA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650149
51	NC_006873	ATA	2	6	5052	5057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650150
52	NC_006873	GAT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650150
53	NC_006873	AGA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650150
54	NC_006873	ACA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650150
55	NC_006873	GTT	3	9	5342	5350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650150
56	NC_006873	ATT	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650150
57	NC_006873	CGA	2	6	5601	5606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650151
58	NC_006873	GGA	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	60650152
59	NC_006873	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650152
60	NC_006873	TTC	2	6	5843	5848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650152
61	NC_006873	AGA	2	6	5934	5939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
62	NC_006873	AAG	2	6	6266	6271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
63	NC_006873	GGT	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650153
64	NC_006873	GAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650153
65	NC_006873	TTG	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650153
66	NC_006873	TTA	2	6	6755	6760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650153
67	NC_006873	AGA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
68	NC_006873	CAG	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650153
69	NC_006873	AAT	2	6	6889	6894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650153
70	NC_006873	GCA	2	6	6898	6903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650153
71	NC_006873	TTA	2	6	6991	6996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650153
72	NC_006873	AAT	2	6	7020	7025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650153
73	NC_006873	GAA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650153
74	NC_006873	GAA	2	6	8274	8279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650154
75	NC_006873	ATT	2	6	8317	8322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650154
76	NC_006873	ATA	2	6	8422	8427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650154
77	NC_006873	GAA	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650154
78	NC_006873	ATA	2	6	8570	8575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650154
79	NC_006873	GTA	3	9	9011	9019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
80	NC_006873	CTT	2	6	9036	9041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650155
81	NC_006873	CTT	2	6	9092	9097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650155
82	NC_006873	GAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650155
83	NC_006873	AAT	2	6	9296	9301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
84	NC_006873	AAT	2	6	9335	9340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
85	NC_006873	AGA	2	6	9369	9374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650155
86	NC_006873	ATA	2	6	9393	9398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
87	NC_006873	ATA	2	6	9468	9473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
88	NC_006873	GCA	2	6	9508	9513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	60650155
89	NC_006873	GTT	2	6	9520	9525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650155
90	NC_006873	GTG	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650155
91	NC_006873	TGA	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
92	NC_006873	TGA	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
93	NC_006873	TAG	2	6	9867	9872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
94	NC_006873	TAA	2	6	9877	9882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
95	NC_006873	CTT	2	6	9920	9925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650155
96	NC_006873	TGA	2	6	10024	10029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
97	NC_006873	ATA	2	6	10077	10082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
98	NC_006873	AAG	2	6	10125	10130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650155
99	NC_006873	GTT	2	6	10135	10140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650155
100	NC_006873	GAT	2	6	10166	10171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
101	NC_006873	GAT	2	6	10295	10300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
102	NC_006873	TGA	2	6	10348	10353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650155
103	NC_006873	CAA	2	6	10559	10564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650155
104	NC_006873	TAA	2	6	10568	10573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650155
105	NC_006873	ATA	2	6	10589	10594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650156
106	NC_006873	TAG	2	6	10659	10664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650156
107	NC_006873	AAG	2	6	10674	10679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650156
108	NC_006873	AGA	2	6	10721	10726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650156
109	NC_006873	AGA	2	6	10729	10734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650156
110	NC_006873	ATT	2	6	10802	10807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650156
111	NC_006873	TGA	3	9	10864	10872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650156
112	NC_006873	ATA	3	9	10904	10912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650156
113	NC_006873	GAA	2	6	11164	11169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650156
114	NC_006873	AAG	2	6	11190	11195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650156
115	NC_006873	GAA	2	6	11343	11348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650157
116	NC_006873	AGT	2	6	11358	11363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650157
117	NC_006873	AAG	2	6	11383	11388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650157
118	NC_006873	CTT	2	6	11443	11448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650157
119	NC_006873	TTA	2	6	11496	11501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650157
120	NC_006873	TAA	2	6	12018	12023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650158
121	NC_006873	TAT	2	6	12114	12119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650158
122	NC_006873	TCT	3	9	12151	12159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650158
123	NC_006873	GCC	2	6	12255	12260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	60650158
124	NC_006873	TCG	2	6	12419	12424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650159
125	NC_006873	TAT	2	6	12462	12467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650159
126	NC_006873	CTG	2	6	12468	12473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650159
127	NC_006873	CTT	4	12	12510	12521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650159
128	NC_006873	TCT	2	6	12581	12586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650159
129	NC_006873	GAA	2	6	12635	12640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650159
130	NC_006873	TTG	2	6	12687	12692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650159
131	NC_006873	TCT	2	6	12700	12705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650159
132	NC_006873	CTT	2	6	12717	12722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650159
133	NC_006873	TTC	2	6	12847	12852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650159
134	NC_006873	TTA	2	6	12893	12898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650159
135	NC_006873	AGT	2	6	12914	12919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650159
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137	NC_006873	ATG	2	6	13070	13075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650159
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153	NC_006873	ACA	2	6	14962	14967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650160
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259	NC_006873	ATT	2	6	23650	23655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650173
260	NC_006873	TTA	2	6	23689	23694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650173
261	NC_006873	CTT	2	6	23835	23840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650173
262	NC_006873	TTA	2	6	23974	23979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650174
263	NC_006873	TCT	2	6	24166	24171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650174
264	NC_006873	AAT	2	6	24246	24251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650174
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387	NC_006873	ATT	2	6	33358	33363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650185
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390	NC_006873	TCC	2	6	33537	33542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60650185
391	NC_006873	TCT	2	6	33688	33693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650185
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395	NC_006873	CTT	2	6	33953	33958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650185
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.