MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Bacteroides fragilis NCTC 9343 plasmid pBF9343

Total Repeats: 752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006873	AACC	2	8	26390	26397	50 %	0 %	0 %	50 %	60650176
502	NC_006873	GCT	2	6	26435	26440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650176
503	NC_006873	ATT	2	6	26474	26479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650176
504	NC_006873	GCT	2	6	26492	26497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650176
505	NC_006873	TCT	2	6	26564	26569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650176
506	NC_006873	TCT	2	6	26573	26578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650176
507	NC_006873	ATT	2	6	26614	26619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650176
508	NC_006873	CAT	2	6	26622	26627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650176
509	NC_006873	CTT	2	6	26652	26657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650176
510	NC_006873	A	6	6	26670	26675	100 %	0 %	0 %	0 %	60650176
511	NC_006873	TAC	2	6	26712	26717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650176
512	NC_006873	ATG	2	6	26727	26732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650176
513	NC_006873	ATG	2	6	26760	26765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650176
514	NC_006873	ATA	2	6	26784	26789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650176
515	NC_006873	TA	4	8	26794	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	60650176
516	NC_006873	T	7	7	26802	26808	0 %	100 %	0 %	0 %	60650176
517	NC_006873	ATT	2	6	26817	26822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650177
518	NC_006873	CTA	2	6	26840	26845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650177
519	NC_006873	T	7	7	26890	26896	0 %	100 %	0 %	0 %	60650177
520	NC_006873	TGC	2	6	27051	27056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650177
521	NC_006873	TTA	2	6	27103	27108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650177
522	NC_006873	AT	3	6	27145	27150	50 %	50 %	0 %	0 %	60650177
523	NC_006873	CCT	2	6	27226	27231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60650177
524	NC_006873	A	6	6	27240	27245	100 %	0 %	0 %	0 %	60650177
525	NC_006873	ATCACC	2	12	27249	27260	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	60650177
526	NC_006873	A	7	7	27278	27284	100 %	0 %	0 %	0 %	60650177
527	NC_006873	GAA	2	6	27353	27358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650178
528	NC_006873	TTA	2	6	27502	27507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650178
529	NC_006873	TAG	2	6	27545	27550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650178
530	NC_006873	TTTG	2	8	27553	27560	0 %	75 %	25 %	0 %	60650178
531	NC_006873	T	6	6	27561	27566	0 %	100 %	0 %	0 %	60650178
532	NC_006873	TTA	2	6	27616	27621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650178
533	NC_006873	CAT	2	6	27707	27712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650178
534	NC_006873	ATTT	2	8	27716	27723	25 %	75 %	0 %	0 %	60650178
535	NC_006873	T	6	6	27721	27726	0 %	100 %	0 %	0 %	60650178
536	NC_006873	CTA	2	6	27850	27855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650178
537	NC_006873	TA	3	6	27854	27859	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
538	NC_006873	AT	3	6	27865	27870	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
539	NC_006873	A	6	6	27876	27881	100 %	0 %	0 %	0 %	60650178
540	NC_006873	CTT	2	6	27917	27922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650178
541	NC_006873	AG	3	6	27940	27945	50 %	0 %	50 %	0 %	60650178
542	NC_006873	CAA	2	6	27965	27970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650178
543	NC_006873	AT	3	6	27983	27988	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
544	NC_006873	TTG	2	6	28036	28041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650178
545	NC_006873	TA	3	6	28045	28050	50 %	50 %	0 %	0 %	60650178
546	NC_006873	TTC	2	6	28059	28064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650178
547	NC_006873	TAA	2	6	28124	28129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650178
548	NC_006873	ATT	2	6	28170	28175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650179
549	NC_006873	A	7	7	28199	28205	100 %	0 %	0 %	0 %	60650179
550	NC_006873	TAT	2	6	28212	28217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650179
551	NC_006873	T	8	8	28235	28242	0 %	100 %	0 %	0 %	60650179
552	NC_006873	TAC	2	6	28269	28274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650179
553	NC_006873	TGA	2	6	28393	28398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650179
554	NC_006873	CTT	2	6	28413	28418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650179
555	NC_006873	ATC	2	6	28573	28578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650179
556	NC_006873	T	6	6	28653	28658	0 %	100 %	0 %	0 %	60650179
557	NC_006873	CTTTT	2	10	28723	28732	0 %	80 %	0 %	20 %	60650179
558	NC_006873	T	8	8	28747	28754	0 %	100 %	0 %	0 %	60650179
559	NC_006873	TA	3	6	28789	28794	50 %	50 %	0 %	0 %	60650179
560	NC_006873	TCT	2	6	28823	28828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650179
561	NC_006873	TAG	2	6	28884	28889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650179
562	NC_006873	TTG	2	6	28903	28908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650179
563	NC_006873	TCA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650179
564	NC_006873	CTT	4	12	29010	29021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650179
565	NC_006873	AAT	2	6	29043	29048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650179
566	NC_006873	AGA	2	6	29050	29055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650179
567	NC_006873	T	6	6	29056	29061	0 %	100 %	0 %	0 %	60650179
568	NC_006873	TC	4	8	29097	29104	0 %	50 %	0 %	50 %	60650179
569	NC_006873	TTC	2	6	29140	29145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650179
570	NC_006873	CTA	2	6	29151	29156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650179
571	NC_006873	CTG	2	6	29169	29174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650179
572	NC_006873	TTAA	2	8	29195	29202	50 %	50 %	0 %	0 %	60650179
573	NC_006873	ATG	2	6	29243	29248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	60650179
574	NC_006873	TATT	2	8	29285	29292	25 %	75 %	0 %	0 %	60650180
575	NC_006873	TAT	2	6	29298	29303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650180
576	NC_006873	TCT	2	6	29327	29332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	60650180
577	NC_006873	TTCT	2	8	29348	29355	0 %	75 %	0 %	25 %	60650180
578	NC_006873	T	8	8	29416	29423	0 %	100 %	0 %	0 %	60650180
579	NC_006873	GGC	2	6	29427	29432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	60650180
580	NC_006873	TTCTT	2	10	29456	29465	0 %	80 %	0 %	20 %	60650180
581	NC_006873	AAAG	2	8	29525	29532	75 %	0 %	25 %	0 %	60650180
582	NC_006873	TAA	2	6	29584	29589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650180
583	NC_006873	TTA	2	6	29603	29608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650180
584	NC_006873	AAG	2	6	29635	29640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	60650180
585	NC_006873	TCTTT	2	10	29673	29682	0 %	80 %	0 %	20 %	60650180
586	NC_006873	T	6	6	29725	29730	0 %	100 %	0 %	0 %	60650181
587	NC_006873	ATA	2	6	29776	29781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650181
588	NC_006873	ATT	2	6	29793	29798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650181
589	NC_006873	GTT	2	6	29904	29909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650181
590	NC_006873	ATCT	2	8	29913	29920	25 %	50 %	0 %	25 %	60650181
591	NC_006873	GTT	2	6	29994	29999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650181
592	NC_006873	ATC	2	6	30018	30023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650181
593	NC_006873	TGT	2	6	30047	30052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	60650181
594	NC_006873	TGG	2	6	30072	30077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	60650181
595	NC_006873	TGTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	25 %	0 %	60650181
596	NC_006873	CAT	2	6	30173	30178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650181
597	NC_006873	AT	3	6	30189	30194	50 %	50 %	0 %	0 %	60650181
598	NC_006873	TTTC	3	12	30195	30206	0 %	75 %	0 %	25 %	60650181
599	NC_006873	ATTTT	2	10	30301	30310	20 %	80 %	0 %	0 %	60650181
600	NC_006873	TAA	2	6	30320	30325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650181
601	NC_006873	T	7	7	30357	30363	0 %	100 %	0 %	0 %	60650182
602	NC_006873	GCT	2	6	30396	30401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650182
603	NC_006873	TGC	2	6	30419	30424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650182
604	NC_006873	TCC	2	6	30425	30430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60650182
605	NC_006873	CCT	2	6	30438	30443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	60650182
606	NC_006873	GAAG	2	8	30532	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	60650182
607	NC_006873	ACAT	2	8	30567	30574	50 %	25 %	0 %	25 %	60650182
608	NC_006873	AATTTC	2	12	30611	30622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	60650182
609	NC_006873	TAC	2	6	30644	30649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650182
610	NC_006873	TA	3	6	30668	30673	50 %	50 %	0 %	0 %	60650182
611	NC_006873	TA	3	6	30722	30727	50 %	50 %	0 %	0 %	60650182
612	NC_006873	AAC	2	6	30848	30853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650182
613	NC_006873	TACA	2	8	30899	30906	50 %	25 %	0 %	25 %	60650182
614	NC_006873	TATCT	2	10	30920	30929	20 %	60 %	0 %	20 %	60650182
615	NC_006873	T	6	6	30965	30970	0 %	100 %	0 %	0 %	60650182
616	NC_006873	CAA	2	6	30997	31002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	60650182
617	NC_006873	TAA	2	6	31016	31021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650182
618	NC_006873	GA	3	6	31060	31065	50 %	0 %	50 %	0 %	60650182
619	NC_006873	TAA	2	6	31147	31152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650182
620	NC_006873	AAT	2	6	31197	31202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650182
621	NC_006873	AAT	2	6	31205	31210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650182
622	NC_006873	T	6	6	31217	31222	0 %	100 %	0 %	0 %	60650182
623	NC_006873	TCA	2	6	31231	31236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	60650182
624	NC_006873	TGC	2	6	31277	31282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	60650182
625	NC_006873	AAT	2	6	31347	31352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	60650182
626	NC_006873	ATTC	2	8	31375	31382	25 %	50 %	0 %	25 %	60650182
627	NC_006873	ATT	2	6	31390	31395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650183
628	NC_006873	TAT	2	6	31406	31411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650183
629	NC_006873	TTA	2	6	31421	31426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	60650183
630	NC_006873	TC	3	6	31471	31476	0 %	50 %	0 %	50 %	60650183
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