MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 plasmid pBT9727

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006578	TTTTC	2	10	1290	1299	0 %	80 %	0 %	20 %	56899874
2	NC_006578	CTTTT	2	10	2052	2061	0 %	80 %	0 %	20 %	56899874
3	NC_006578	ATTTC	2	10	2796	2805	20 %	60 %	0 %	20 %	56899877
4	NC_006578	TTTCT	2	10	4965	4974	0 %	80 %	0 %	20 %	56899879
5	NC_006578	TTCTT	2	10	6447	6456	0 %	80 %	0 %	20 %	56899879
6	NC_006578	TTTCA	2	10	8013	8022	20 %	60 %	0 %	20 %	56899883
7	NC_006578	ATTTC	2	10	9075	9084	20 %	60 %	0 %	20 %	56899884
8	NC_006578	CCTTT	2	10	12605	12614	0 %	60 %	0 %	40 %	56899885
9	NC_006578	ATTCT	2	10	14014	14023	20 %	60 %	0 %	20 %	56899885
10	NC_006578	TTTAA	2	10	14859	14868	40 %	60 %	0 %	0 %	56899886
11	NC_006578	CTTTG	2	10	15255	15264	0 %	60 %	20 %	20 %	56899886
12	NC_006578	AATTC	2	10	15460	15469	40 %	40 %	0 %	20 %	56899886
13	NC_006578	GAATA	2	10	16275	16284	60 %	20 %	20 %	0 %	56899887
14	NC_006578	GTCCA	2	10	16412	16421	20 %	20 %	20 %	40 %	56899887
15	NC_006578	TCTTT	2	10	18913	18922	0 %	80 %	0 %	20 %	56899891
16	NC_006578	CAAAT	2	10	23284	23293	60 %	20 %	0 %	20 %	56899895
17	NC_006578	ATTCC	2	10	28400	28409	20 %	40 %	0 %	40 %	56899899
18	NC_006578	TTTTC	2	10	30696	30705	0 %	80 %	0 %	20 %	56899904
19	NC_006578	TACAA	2	10	32668	32677	60 %	20 %	0 %	20 %	56899907
20	NC_006578	TTTTC	2	10	35015	35024	0 %	80 %	0 %	20 %	56899909
21	NC_006578	TTTTG	2	10	36658	36667	0 %	80 %	20 %	0 %	56899910
22	NC_006578	TTTCA	2	10	36675	36684	20 %	60 %	0 %	20 %	56899910
23	NC_006578	GCAAA	2	10	38052	38061	60 %	0 %	20 %	20 %	56899911
24	NC_006578	CTTCT	2	10	40025	40034	0 %	60 %	0 %	40 %	56899913
25	NC_006578	GAAAA	2	10	40924	40933	80 %	0 %	20 %	0 %	56899913
26	NC_006578	AATAG	2	10	43207	43216	60 %	20 %	20 %	0 %	56899915
27	NC_006578	TTTCC	2	10	43600	43609	0 %	60 %	0 %	40 %	56899916
28	NC_006578	CTGTA	2	10	44937	44946	20 %	40 %	20 %	20 %	56899916
29	NC_006578	CTTAT	2	10	45924	45933	20 %	60 %	0 %	20 %	56899917
30	NC_006578	GAAAG	2	10	48218	48227	60 %	0 %	40 %	0 %	56899921
31	NC_006578	CAATT	2	10	51086	51095	40 %	40 %	0 %	20 %	56899925
32	NC_006578	TTGTT	2	10	52253	52262	0 %	80 %	20 %	0 %	56899925
33	NC_006578	CTTCT	2	10	54148	54157	0 %	60 %	0 %	40 %	56899928
34	NC_006578	ACAAA	2	10	56915	56924	80 %	0 %	0 %	20 %	56899929
35	NC_006578	TCATA	2	10	57421	57430	40 %	40 %	0 %	20 %	56899929
36	NC_006578	TAATA	2	10	59319	59328	60 %	40 %	0 %	0 %	56899931
37	NC_006578	ATATC	2	10	60586	60595	40 %	40 %	0 %	20 %	56899933
38	NC_006578	ATTTT	2	10	60856	60865	20 %	80 %	0 %	0 %	56899933
39	NC_006578	TAATT	2	10	61756	61765	40 %	60 %	0 %	0 %	56899934
40	NC_006578	CTTCT	2	10	62082	62091	0 %	60 %	0 %	40 %	56899935
41	NC_006578	TTCAA	2	10	66452	66461	40 %	40 %	0 %	20 %	56899939
42	NC_006578	ATTTC	2	10	67364	67373	20 %	60 %	0 %	20 %	56899941
43	NC_006578	CCAGC	2	10	67394	67403	20 %	0 %	20 %	60 %	56899941
44	NC_006578	CCTTT	2	10	67925	67934	0 %	60 %	0 %	40 %	56899941
45	NC_006578	TGTAA	2	10	68238	68247	40 %	40 %	20 %	0 %	56899941
46	NC_006578	AAATA	2	10	71730	71739	80 %	20 %	0 %	0 %	56899944
47	NC_006578	TTTCT	2	10	76075	76084	0 %	80 %	0 %	20 %	56899949

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.