MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 plasmid pBT9727

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006578	ATTA	2	8	1582	1589	50 %	50 %	0 %	0 %	56899874
2	NC_006578	GTAT	2	8	1665	1672	25 %	50 %	25 %	0 %	56899874
3	NC_006578	TGGA	2	8	2160	2167	25 %	25 %	50 %	0 %	56899875
4	NC_006578	GTAA	2	8	2588	2595	50 %	25 %	25 %	0 %	56899876
5	NC_006578	TCTT	2	8	3264	3271	0 %	75 %	0 %	25 %	56899877
6	NC_006578	TTCA	2	8	3740	3747	25 %	50 %	0 %	25 %	56899878
7	NC_006578	AGTA	2	8	4940	4947	50 %	25 %	25 %	0 %	56899879
8	NC_006578	TTGT	2	8	5786	5793	0 %	75 %	25 %	0 %	56899879
9	NC_006578	AAAT	2	8	5797	5804	75 %	25 %	0 %	0 %	56899879
10	NC_006578	CAAA	2	8	5921	5928	75 %	0 %	0 %	25 %	56899879
11	NC_006578	ATAC	2	8	5954	5961	50 %	25 %	0 %	25 %	56899879
12	NC_006578	TAAA	2	8	6043	6050	75 %	25 %	0 %	0 %	56899879
13	NC_006578	TATT	2	8	7217	7224	25 %	75 %	0 %	0 %	56899881
14	NC_006578	TATT	2	8	7820	7827	25 %	75 %	0 %	0 %	56899883
15	NC_006578	TTAT	2	8	9093	9100	25 %	75 %	0 %	0 %	56899884
16	NC_006578	TTAT	2	8	9183	9190	25 %	75 %	0 %	0 %	56899884
17	NC_006578	TTAT	2	8	9273	9280	25 %	75 %	0 %	0 %	56899884
18	NC_006578	TTAT	2	8	9363	9370	25 %	75 %	0 %	0 %	56899884
19	NC_006578	TTAT	2	8	9453	9460	25 %	75 %	0 %	0 %	56899884
20	NC_006578	TTAT	2	8	9543	9550	25 %	75 %	0 %	0 %	56899884
21	NC_006578	TTTC	2	8	9799	9806	0 %	75 %	0 %	25 %	56899884
22	NC_006578	TTAC	2	8	10077	10084	25 %	50 %	0 %	25 %	56899884
23	NC_006578	TAAA	2	8	10459	10466	75 %	25 %	0 %	0 %	56899884
24	NC_006578	TAAC	2	8	11047	11054	50 %	25 %	0 %	25 %	56899884
25	NC_006578	CCAT	2	8	11321	11328	25 %	25 %	0 %	50 %	56899884
26	NC_006578	TTTC	2	8	11705	11712	0 %	75 %	0 %	25 %	56899885
27	NC_006578	TTCA	2	8	11841	11848	25 %	50 %	0 %	25 %	56899885
28	NC_006578	TTTG	2	8	12185	12192	0 %	75 %	25 %	0 %	56899885
29	NC_006578	GCTT	2	8	12202	12209	0 %	50 %	25 %	25 %	56899885
30	NC_006578	TTTA	2	8	12828	12835	25 %	75 %	0 %	0 %	56899885
31	NC_006578	GATT	2	8	13480	13487	25 %	50 %	25 %	0 %	56899885
32	NC_006578	ATCA	2	8	13506	13513	50 %	25 %	0 %	25 %	56899885
33	NC_006578	AGGA	2	8	13827	13834	50 %	0 %	50 %	0 %	56899885
34	NC_006578	AACC	2	8	13871	13878	50 %	0 %	0 %	50 %	56899885
35	NC_006578	CATA	2	8	14320	14327	50 %	25 %	0 %	25 %	56899886
36	NC_006578	ATTT	2	8	14701	14708	25 %	75 %	0 %	0 %	56899886
37	NC_006578	TTTC	2	8	14749	14756	0 %	75 %	0 %	25 %	56899886
38	NC_006578	TTCT	2	8	15052	15059	0 %	75 %	0 %	25 %	56899886
39	NC_006578	AGTT	2	8	15434	15441	25 %	50 %	25 %	0 %	56899886
40	NC_006578	CTTC	2	8	15541	15548	0 %	50 %	0 %	50 %	56899886
41	NC_006578	CTGT	2	8	15606	15613	0 %	50 %	25 %	25 %	56899886
42	NC_006578	TCAC	2	8	16728	16735	25 %	25 %	0 %	50 %	56899888
43	NC_006578	CCTT	2	8	17849	17856	0 %	50 %	0 %	50 %	56899890
44	NC_006578	GTTT	2	8	18047	18054	0 %	75 %	25 %	0 %	56899890
45	NC_006578	ACCA	2	8	18281	18288	50 %	0 %	0 %	50 %	56899891
46	NC_006578	TTTG	2	8	18552	18559	0 %	75 %	25 %	0 %	56899891
47	NC_006578	AAAT	2	8	18857	18864	75 %	25 %	0 %	0 %	56899891
48	NC_006578	ATTT	2	8	18954	18961	25 %	75 %	0 %	0 %	56899891
49	NC_006578	TTTC	2	8	18981	18988	0 %	75 %	0 %	25 %	56899891
50	NC_006578	ATAA	2	8	19251	19258	75 %	25 %	0 %	0 %	56899892
51	NC_006578	CAAA	2	8	19671	19678	75 %	0 %	0 %	25 %	56899892
52	NC_006578	TAAG	2	8	20247	20254	50 %	25 %	25 %	0 %	56899892
53	NC_006578	TAAC	2	8	20262	20269	50 %	25 %	0 %	25 %	56899892
54	NC_006578	ATTT	2	8	21134	21141	25 %	75 %	0 %	0 %	56899894
55	NC_006578	CAAC	2	8	21274	21281	50 %	0 %	0 %	50 %	56899894
56	NC_006578	ACCA	2	8	21566	21573	50 %	0 %	0 %	50 %	56899895
57	NC_006578	TAAA	2	8	21854	21861	75 %	25 %	0 %	0 %	56899895
58	NC_006578	AATC	2	8	22001	22008	50 %	25 %	0 %	25 %	56899895
59	NC_006578	TAAC	2	8	22069	22076	50 %	25 %	0 %	25 %	56899895
60	NC_006578	TTAC	2	8	22663	22670	25 %	50 %	0 %	25 %	56899895
61	NC_006578	ACCA	2	8	23028	23035	50 %	0 %	0 %	50 %	56899895
62	NC_006578	ACCA	2	8	23085	23092	50 %	0 %	0 %	50 %	56899895
63	NC_006578	ACCT	2	8	23187	23194	25 %	25 %	0 %	50 %	56899895
64	NC_006578	TGAA	2	8	24411	24418	50 %	25 %	25 %	0 %	56899895
65	NC_006578	TTTA	2	8	24573	24580	25 %	75 %	0 %	0 %	56899895
66	NC_006578	TAAT	2	8	24880	24887	50 %	50 %	0 %	0 %	56899895
67	NC_006578	AATA	2	8	24942	24949	75 %	25 %	0 %	0 %	56899895
68	NC_006578	GTTT	2	8	25331	25338	0 %	75 %	25 %	0 %	56899895
69	NC_006578	GTTT	2	8	25656	25663	0 %	75 %	25 %	0 %	56899895
70	NC_006578	TTTA	2	8	25967	25974	25 %	75 %	0 %	0 %	56899896
71	NC_006578	CATC	2	8	26619	26626	25 %	25 %	0 %	50 %	56899897
72	NC_006578	TAAT	2	8	26712	26719	50 %	50 %	0 %	0 %	56899897
73	NC_006578	TTTG	2	8	26744	26751	0 %	75 %	25 %	0 %	56899897
74	NC_006578	CTTT	2	8	27147	27154	0 %	75 %	0 %	25 %	56899898
75	NC_006578	TTTC	2	8	27435	27442	0 %	75 %	0 %	25 %	56899898
76	NC_006578	TAAT	2	8	27519	27526	50 %	50 %	0 %	0 %	56899898
77	NC_006578	TATC	2	8	28388	28395	25 %	50 %	0 %	25 %	56899899
78	NC_006578	TCAT	2	8	28506	28513	25 %	50 %	0 %	25 %	56899900
79	NC_006578	GTTT	2	8	28904	28911	0 %	75 %	25 %	0 %	56899901
80	NC_006578	AATA	2	8	29442	29449	75 %	25 %	0 %	0 %	56899902
81	NC_006578	CTTT	2	8	29643	29650	0 %	75 %	0 %	25 %	56899902
82	NC_006578	CTTC	2	8	29835	29842	0 %	50 %	0 %	50 %	56899902
83	NC_006578	TTTA	2	8	30240	30247	25 %	75 %	0 %	0 %	56899903
84	NC_006578	TGTT	2	8	30278	30285	0 %	75 %	25 %	0 %	56899903
85	NC_006578	ATCT	2	8	30423	30430	25 %	50 %	0 %	25 %	56899903
86	NC_006578	AGAA	2	8	31742	31749	75 %	0 %	25 %	0 %	56899905
87	NC_006578	CATT	2	8	31881	31888	25 %	50 %	0 %	25 %	56899905
88	NC_006578	GCAA	2	8	32001	32008	50 %	0 %	25 %	25 %	56899905
89	NC_006578	ATTA	2	8	32189	32196	50 %	50 %	0 %	0 %	56899906
90	NC_006578	TCAC	2	8	32340	32347	25 %	25 %	0 %	50 %	56899906
91	NC_006578	AATT	2	8	32545	32552	50 %	50 %	0 %	0 %	56899907
92	NC_006578	TTAG	2	8	32576	32583	25 %	50 %	25 %	0 %	56899907
93	NC_006578	TTTC	2	8	32751	32758	0 %	75 %	0 %	25 %	56899907
94	NC_006578	AAGA	2	8	35077	35084	75 %	0 %	25 %	0 %	56899909
95	NC_006578	TAAG	2	8	35385	35392	50 %	25 %	25 %	0 %	56899909
96	NC_006578	TTAA	2	8	35863	35870	50 %	50 %	0 %	0 %	56899909
97	NC_006578	TAAA	2	8	36937	36944	75 %	25 %	0 %	0 %	56899951
98	NC_006578	TAAA	2	8	37038	37045	75 %	25 %	0 %	0 %	56899951
99	NC_006578	GATG	2	8	37101	37108	25 %	25 %	50 %	0 %	56899951
100	NC_006578	GTTA	2	8	37473	37480	25 %	50 %	25 %	0 %	56899951
101	NC_006578	TAGT	2	8	37866	37873	25 %	50 %	25 %	0 %	56899911
102	NC_006578	AAAG	2	8	37951	37958	75 %	0 %	25 %	0 %	56899911
103	NC_006578	ATTA	2	8	38305	38312	50 %	50 %	0 %	0 %	56899911
104	NC_006578	GGAG	2	8	39194	39201	25 %	0 %	75 %	0 %	56899912
105	NC_006578	ATCA	2	8	40055	40062	50 %	25 %	0 %	25 %	56899913
106	NC_006578	AAAT	2	8	41903	41910	75 %	25 %	0 %	0 %	56899914
107	NC_006578	GGAA	2	8	41979	41986	50 %	0 %	50 %	0 %	56899914
108	NC_006578	TACT	2	8	42580	42587	25 %	50 %	0 %	25 %	56899915
109	NC_006578	TGTT	2	8	44082	44089	0 %	75 %	25 %	0 %	56899916
110	NC_006578	AATT	2	8	44597	44604	50 %	50 %	0 %	0 %	56899916
111	NC_006578	GCAA	2	8	45981	45988	50 %	0 %	25 %	25 %	56899917
112	NC_006578	ATTA	2	8	46231	46238	50 %	50 %	0 %	0 %	56899917
113	NC_006578	ATTT	2	8	46544	46551	25 %	75 %	0 %	0 %	56899917
114	NC_006578	TTCG	2	8	47642	47649	0 %	50 %	25 %	25 %	56899919
115	NC_006578	GCAA	2	8	48185	48192	50 %	0 %	25 %	25 %	56899921
116	NC_006578	ATCT	2	8	48205	48212	25 %	50 %	0 %	25 %	56899921
117	NC_006578	ATAA	2	8	48270	48277	75 %	25 %	0 %	0 %	56899921
118	NC_006578	ATTT	2	8	48396	48403	25 %	75 %	0 %	0 %	56899922
119	NC_006578	TATT	2	8	49664	49671	25 %	75 %	0 %	0 %	56899924
120	NC_006578	CATT	2	8	49870	49877	25 %	50 %	0 %	25 %	56899924
121	NC_006578	AATC	2	8	49901	49908	50 %	25 %	0 %	25 %	56899924
122	NC_006578	CTTG	2	8	50237	50244	0 %	50 %	25 %	25 %	56899924
123	NC_006578	TTCC	2	8	50307	50314	0 %	50 %	0 %	50 %	56899924
124	NC_006578	TAAA	2	8	51004	51011	75 %	25 %	0 %	0 %	56899925
125	NC_006578	CTTG	2	8	51241	51248	0 %	50 %	25 %	25 %	56899925
126	NC_006578	CTTC	2	8	51262	51269	0 %	50 %	0 %	50 %	56899925
127	NC_006578	ATTT	2	8	51445	51452	25 %	75 %	0 %	0 %	56899925
128	NC_006578	TATT	2	8	51922	51929	25 %	75 %	0 %	0 %	56899925
129	NC_006578	CATT	2	8	52177	52184	25 %	50 %	0 %	25 %	56899925
130	NC_006578	TCTT	2	8	52263	52270	0 %	75 %	0 %	25 %	56899925
131	NC_006578	ATAA	2	8	53648	53655	75 %	25 %	0 %	0 %	56899927
132	NC_006578	ACAA	2	8	54715	54722	75 %	0 %	0 %	25 %	56899928
133	NC_006578	TTCC	2	8	55319	55326	0 %	50 %	0 %	50 %	56899952
134	NC_006578	TTTC	2	8	55356	55363	0 %	75 %	0 %	25 %	56899952
135	NC_006578	AATT	2	8	55379	55386	50 %	50 %	0 %	0 %	56899952
136	NC_006578	TGCT	2	8	55439	55446	0 %	50 %	25 %	25 %	56899952
137	NC_006578	TTCT	2	8	55680	55687	0 %	75 %	0 %	25 %	56899952
138	NC_006578	ATTA	2	8	56118	56125	50 %	50 %	0 %	0 %	56899929
139	NC_006578	TAAA	2	8	56405	56412	75 %	25 %	0 %	0 %	56899929
140	NC_006578	AATG	2	8	56931	56938	50 %	25 %	25 %	0 %	56899929
141	NC_006578	ATTT	2	8	56958	56965	25 %	75 %	0 %	0 %	56899929
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.