MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides fragilis YCH46 DNA

Total Repeats: 60393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006347	CAT	3	9	60	68	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711292
2	NC_006347	AGA	2	6	108	113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711292
3	NC_006347	AAG	2	6	119	124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711292
4	NC_006347	ATA	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711292
5	NC_006347	CTC	2	6	248	253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	53711292
6	NC_006347	TAA	2	6	315	320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711292
7	NC_006347	GAA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711292
8	NC_006347	GCA	2	6	468	473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711292
9	NC_006347	CAG	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711292
10	NC_006347	ATT	2	6	757	762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711293
11	NC_006347	ATC	3	9	865	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711293
12	NC_006347	ATT	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711293
13	NC_006347	CAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53711293
14	NC_006347	ATA	2	6	1047	1052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711293
15	NC_006347	TAC	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711293
16	NC_006347	AGG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53711293
17	NC_006347	ATT	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711293
18	NC_006347	GCA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711293
19	NC_006347	GAG	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53711293
20	NC_006347	CAA	2	6	1301	1306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53711293
21	NC_006347	AAT	2	6	1550	1555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711293
22	NC_006347	CTA	2	6	1615	1620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711293
23	NC_006347	GAA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711293
24	NC_006347	CAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53711293
25	NC_006347	ATA	2	6	1851	1856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711293
26	NC_006347	AAT	2	6	1871	1876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711293
27	NC_006347	ATG	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711293
28	NC_006347	ATG	2	6	2091	2096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711293
29	NC_006347	TAC	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711293
30	NC_006347	CTT	2	6	2140	2145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711293
31	NC_006347	TTG	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711294
32	NC_006347	TAA	2	6	2392	2397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711294
33	NC_006347	TAA	2	6	2461	2466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711294
34	NC_006347	AAT	2	6	2522	2527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711294
35	NC_006347	AGC	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711294
36	NC_006347	ATT	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711294
37	NC_006347	ATT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711294
38	NC_006347	TTA	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711294
39	NC_006347	GAA	2	6	2839	2844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711294
40	NC_006347	GTA	2	6	2878	2883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711294
41	NC_006347	ATA	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711294
42	NC_006347	ATG	2	6	2914	2919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711294
43	NC_006347	TAA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711294
44	NC_006347	TGA	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711294
45	NC_006347	TGT	2	6	3210	3215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711295
46	NC_006347	TCT	2	6	3331	3336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711295
47	NC_006347	ATT	2	6	3337	3342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711295
48	NC_006347	GAT	2	6	3457	3462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711295
49	NC_006347	AAC	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53711295
50	NC_006347	ACT	2	6	3652	3657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711295
51	NC_006347	AGG	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53711295
52	NC_006347	CAA	2	6	3845	3850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53711295
53	NC_006347	AAG	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711295
54	NC_006347	TAA	2	6	4033	4038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711295
55	NC_006347	CAA	3	9	4061	4069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53711296
56	NC_006347	TAG	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711296
57	NC_006347	GAG	2	6	4514	4519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53711296
58	NC_006347	GGT	2	6	4702	4707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	53711297
59	NC_006347	AAT	2	6	4862	4867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711297
60	NC_006347	AAG	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711297
61	NC_006347	ATA	2	6	4908	4913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711297
62	NC_006347	ATC	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711297
63	NC_006347	AAT	2	6	5033	5038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711297
64	NC_006347	CGA	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711297
65	NC_006347	TAG	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711297
66	NC_006347	TTC	2	6	5434	5439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711297
67	NC_006347	TTC	2	6	5554	5559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711297
68	NC_006347	TTA	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711297
69	NC_006347	CTG	2	6	5645	5650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53711297
70	NC_006347	CTT	2	6	5717	5722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711297
71	NC_006347	CTG	2	6	5724	5729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53711297
72	NC_006347	CGG	2	6	5804	5809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53711297
73	NC_006347	ATG	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711297
74	NC_006347	AGT	2	6	6062	6067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711297
75	NC_006347	CCT	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	53711297
76	NC_006347	TGA	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711297
77	NC_006347	TAT	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711298
78	NC_006347	GCC	2	6	6742	6747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53711298
79	NC_006347	CCG	2	6	6765	6770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53711298
80	NC_006347	AAT	2	6	6874	6879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711298
81	NC_006347	CGG	2	6	7020	7025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53711298
82	NC_006347	AAT	2	6	7119	7124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711298
83	NC_006347	TTG	2	6	7162	7167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711298
84	NC_006347	TCT	2	6	7270	7275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711298
85	NC_006347	GAA	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711298
86	NC_006347	CTT	2	6	7341	7346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711298
87	NC_006347	CTT	2	6	7398	7403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711298
88	NC_006347	CGA	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711298
89	NC_006347	TCT	2	6	7458	7463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711298
90	NC_006347	CGG	2	6	7543	7548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53711298
91	NC_006347	AAT	2	6	7557	7562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711298
92	NC_006347	GGA	3	9	7581	7589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53711298
93	NC_006347	TGA	2	6	7599	7604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711298
94	NC_006347	TGA	2	6	7794	7799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711298
95	NC_006347	CCG	2	6	7805	7810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53711298
96	NC_006347	TCG	2	6	7888	7893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53711298
97	NC_006347	CTG	2	6	7895	7900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53711298
98	NC_006347	ATG	2	6	8047	8052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711298
99	NC_006347	TTA	2	6	8668	8673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711299
100	NC_006347	TAT	2	6	8675	8680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711299
101	NC_006347	ATC	2	6	8759	8764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711299
102	NC_006347	ACT	2	6	8803	8808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711299
103	NC_006347	TAC	2	6	8864	8869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711299
104	NC_006347	GAA	2	6	8886	8891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711299
105	NC_006347	GAA	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711299
106	NC_006347	ATT	2	6	9700	9705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711299
107	NC_006347	AGC	2	6	9802	9807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711299
108	NC_006347	TTG	2	6	9818	9823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711299
109	NC_006347	ATT	2	6	9953	9958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711299
110	NC_006347	ATT	2	6	9998	10003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711299
111	NC_006347	GTT	2	6	10345	10350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711299
112	NC_006347	AAC	2	6	10430	10435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53711300
113	NC_006347	CAT	2	6	10506	10511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711300
114	NC_006347	CTT	2	6	10536	10541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711300
115	NC_006347	GAA	2	6	10764	10769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711300
116	NC_006347	ATG	2	6	10788	10793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711300
117	NC_006347	GAA	2	6	10796	10801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711300
118	NC_006347	ATT	2	6	10802	10807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711300
119	NC_006347	CAT	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711300
120	NC_006347	ATT	2	6	10864	10869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711300
121	NC_006347	ATT	2	6	11067	11072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711300
122	NC_006347	TAT	2	6	11078	11083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711300
123	NC_006347	ATG	2	6	11095	11100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711300
124	NC_006347	GCC	2	6	11268	11273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53711300
125	NC_006347	GAA	2	6	11481	11486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711300
126	NC_006347	AGA	2	6	11492	11497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711300
127	NC_006347	CAT	2	6	11499	11504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711300
128	NC_006347	AAT	2	6	11508	11513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711300
129	NC_006347	CGG	2	6	11578	11583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53711301
130	NC_006347	GAT	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711301
131	NC_006347	GAC	2	6	11743	11748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711301
132	NC_006347	ATT	2	6	11777	11782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711301
133	NC_006347	ATA	2	6	11794	11799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711301
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140	NC_006347	ATT	2	6	12288	12293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711302
141	NC_006347	GCA	2	6	12426	12431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53711302
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163	NC_006347	TTA	2	6	14159	14164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711303
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250	NC_006347	ATC	2	6	22135	22140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711309
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253	NC_006347	ATT	2	6	22205	22210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711309
254	NC_006347	CTT	2	6	22221	22226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711309
255	NC_006347	ATG	2	6	22256	22261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711309
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257	NC_006347	ATA	2	6	22396	22401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53711310
258	NC_006347	GTT	2	6	22429	22434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711310
259	NC_006347	GTA	2	6	22490	22495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711310
260	NC_006347	CAT	2	6	22744	22749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711310
261	NC_006347	AGT	2	6	22843	22848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711310
262	NC_006347	GAT	2	6	22854	22859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711310
263	NC_006347	GTA	2	6	23024	23029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711310
264	NC_006347	ATG	2	6	23075	23080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711310
265	NC_006347	CTG	2	6	23138	23143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53711310
266	NC_006347	TTA	2	6	23183	23188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711310
267	NC_006347	ATT	2	6	23210	23215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711310
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270	NC_006347	TAT	2	6	23529	23534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53711310
271	NC_006347	TGC	2	6	23560	23565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53711310
272	NC_006347	TTG	2	6	23624	23629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711310
273	NC_006347	TGT	2	6	23661	23666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711310
274	NC_006347	TAC	2	6	23995	24000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711310
275	NC_006347	TGA	2	6	24066	24071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711310
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277	NC_006347	GTT	3	9	24560	24568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	53711310
278	NC_006347	TGG	2	6	24573	24578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	53711310
279	NC_006347	ACT	2	6	24632	24637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53711310
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282	NC_006347	GAT	2	6	25167	25172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711311
283	NC_006347	TTC	2	6	25209	25214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711311
284	NC_006347	TGG	2	6	25220	25225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	53711311
285	NC_006347	TGA	2	6	25340	25345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53711311
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287	NC_006347	GAA	2	6	25446	25451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53711311
288	NC_006347	TTC	2	6	25486	25491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	53711311
289	NC_006347	AGG	2	6	25597	25602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53711311
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291	NC_006347	CCA	2	6	25705	25710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	53711311
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365	NC_006347	GAG	2	6	32652	32657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53711317
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