MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii PBi chromosome linear

Total Repeats: 568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006156	TGACCA	2	12	2309	2320	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	51598266
2	NC_006156	GGATTA	2	12	3464	3475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51598267
3	NC_006156	AGAAAA	2	12	3838	3849	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51598267
4	NC_006156	AAAAAT	2	12	6991	7002	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598269
5	NC_006156	AAGAAA	2	12	7008	7019	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51598269
6	NC_006156	CAATAA	2	12	8926	8937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598271
7	NC_006156	TCTATT	2	12	8958	8969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51598271
8	NC_006156	AATAAA	2	12	9366	9377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598272
9	NC_006156	TAAAAA	2	12	9836	9847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598272
10	NC_006156	AGACAA	2	12	10985	10996	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51598274
11	NC_006156	CAGATA	2	12	11032	11043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51598274
12	NC_006156	AAATTA	2	12	13331	13342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598277
13	NC_006156	AAAACA	2	12	13793	13804	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	51598277
14	NC_006156	GAAAAA	2	12	15692	15703	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51598280
15	NC_006156	TGGACT	3	18	16133	16150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	51598280
16	NC_006156	AACTAT	2	12	18895	18906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598283
17	NC_006156	GTAAAT	2	12	26228	26239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51598290
18	NC_006156	AACATA	2	12	27973	27984	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598293
19	NC_006156	TCAAAC	2	12	28581	28592	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	51598294
20	NC_006156	TAAAAA	2	12	29821	29832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598295
21	NC_006156	AAAGAA	2	12	31160	31171	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51598296
22	NC_006156	TATCAA	2	12	32664	32675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598298
23	NC_006156	AGAAGC	2	12	33574	33585	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	51598298
24	NC_006156	TCAAAA	2	12	36379	36390	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598300
25	NC_006156	ATTATA	2	12	37102	37113	50 %	50 %	0 %	0 %	51598301
26	NC_006156	TAAATT	2	12	37687	37698	50 %	50 %	0 %	0 %	51598301
27	NC_006156	ATTTTT	2	12	38550	38561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51598302
28	NC_006156	TATGAA	2	12	39691	39702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51598303
29	NC_006156	AATATA	2	12	39722	39733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598303
30	NC_006156	AAAATC	2	12	40944	40955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598304
31	NC_006156	ATTAAA	2	12	42694	42705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598306
32	NC_006156	TAAATT	2	12	43633	43644	50 %	50 %	0 %	0 %	51598307
33	NC_006156	AAATAA	2	12	48218	48229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598312
34	NC_006156	TAAAAA	2	12	49490	49501	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598314
35	NC_006156	AATAAA	2	12	49828	49839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598314
36	NC_006156	GAATTA	2	12	50239	50250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	51598315
37	NC_006156	TCAAAT	2	12	51298	51309	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598317
38	NC_006156	TAAATT	2	12	55514	55525	50 %	50 %	0 %	0 %	51598320
39	NC_006156	TTAAAA	2	12	57187	57198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598323
40	NC_006156	AAATTT	2	12	57208	57219	50 %	50 %	0 %	0 %	51598323
41	NC_006156	AAAAAT	2	12	57528	57539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598323
42	NC_006156	ATTTTC	2	12	62126	62137	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51598328
43	NC_006156	AAATTT	2	12	62556	62567	50 %	50 %	0 %	0 %	51598328
44	NC_006156	AACAAT	2	12	67870	67881	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598333
45	NC_006156	TATCTT	2	12	69252	69263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51598333
46	NC_006156	ATAAAA	2	12	69468	69479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598334
47	NC_006156	TAATTT	2	12	69610	69621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51598334
48	NC_006156	TAGAAA	2	12	72115	72126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51598336
49	NC_006156	AATAGA	2	12	73151	73162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51598337
50	NC_006156	AATTTC	2	12	75334	75345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51598339
51	NC_006156	TTGCTA	2	12	76063	76074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	51598340
52	NC_006156	AAAAGA	2	12	77509	77520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51598341
53	NC_006156	TTTAGA	2	12	77644	77655	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	51598342
54	NC_006156	AAAACT	2	12	78164	78175	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598342
55	NC_006156	TAAATC	2	12	78454	78465	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598342
56	NC_006156	AGGAAT	2	12	80058	80069	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51598344
57	NC_006156	TTAAAT	2	12	80162	80173	50 %	50 %	0 %	0 %	51598344
58	NC_006156	TTTTAT	2	12	80530	80541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51598344
59	NC_006156	AAAAAT	2	12	80616	80627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598345
60	NC_006156	TACAAA	2	12	81143	81154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598346
61	NC_006156	AATACT	2	12	85665	85676	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598351
62	NC_006156	AGCAAC	2	12	85857	85868	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	51598352
63	NC_006156	AAACAA	2	12	87037	87048	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	51598353
64	NC_006156	AAATAA	2	12	87812	87823	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598354
65	NC_006156	ATAAAA	2	12	88099	88110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598354
66	NC_006156	GCAATT	2	12	88519	88530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51598354
67	NC_006156	CAGAAA	2	12	90503	90514	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51598356
68	NC_006156	AACATT	2	12	94991	95002	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598361
69	NC_006156	TCTTTC	2	12	95199	95210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51598361
70	NC_006156	ATTAAT	2	12	95471	95482	50 %	50 %	0 %	0 %	51598361
71	NC_006156	CTAAAT	2	12	96052	96063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598361
72	NC_006156	AACATA	2	12	98366	98377	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598363
73	NC_006156	TAAGAA	2	12	99006	99017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51598364
74	NC_006156	TGGACT	2	12	99925	99936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	51598364
75	NC_006156	GAAATA	2	12	105174	105185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51598369
76	NC_006156	TTGCTG	2	12	105788	105799	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	51598371
77	NC_006156	AAAATC	2	12	111552	111563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598376
78	NC_006156	TAAACT	2	12	111704	111715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598376
79	NC_006156	CAATAT	2	12	111754	111765	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598377
80	NC_006156	ATTTAT	2	12	115088	115099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51598380
81	NC_006156	AAAAAG	2	12	115388	115399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51598381
82	NC_006156	AACTTA	2	12	116851	116862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598382
83	NC_006156	AATTTC	2	12	119680	119691	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51598386
84	NC_006156	ATCTTT	2	12	121824	121835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51598390
85	NC_006156	TCTCTT	2	12	123474	123485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51598391
86	NC_006156	TAACTT	2	12	124093	124104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51598392
87	NC_006156	AATTCT	2	12	124751	124762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51598393
88	NC_006156	CTGAAT	2	12	128039	128050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51598396
89	NC_006156	TATTAA	2	12	131762	131773	50 %	50 %	0 %	0 %	51598398
90	NC_006156	TGATAT	2	12	132129	132140	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	51598398
91	NC_006156	ATTTTT	2	12	132491	132502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51598399
92	NC_006156	ATTTCC	2	12	134887	134898	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	51598400
93	NC_006156	TTAAAA	2	12	135198	135209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598400
94	NC_006156	AAACTA	2	12	136950	136961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598401
95	NC_006156	TCCCAC	2	12	138561	138572	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	51598403
96	NC_006156	ATTTTA	2	12	139496	139507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51598403
97	NC_006156	ATTCCA	2	12	140330	140341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51598403
98	NC_006156	AAAACT	2	12	142451	142462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598404
99	NC_006156	TGGAAT	2	12	142565	142576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51598405
100	NC_006156	AAAAGA	2	12	143742	143753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51598405
101	NC_006156	AAAATA	2	12	145808	145819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598407
102	NC_006156	AAATCA	2	12	146219	146230	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598408
103	NC_006156	ATACTT	2	12	146593	146604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51598408
104	NC_006156	TTTCAT	2	12	146910	146921	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51598408
105	NC_006156	CATTGC	2	12	147296	147307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	51598409
106	NC_006156	AAACAT	2	12	152087	152098	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598412
107	NC_006156	CAAGAA	2	12	152245	152256	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	51598412
108	NC_006156	GTTGGA	2	12	152343	152354	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	51598412
109	NC_006156	AATTCA	2	12	153149	153160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598413
110	NC_006156	TAAAAA	2	12	156341	156352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51598415
111	NC_006156	AATACT	2	12	156474	156485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51598415
112	NC_006156	AATTAA	2	12	156819	156830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598415
113	NC_006156	GAAAAT	2	12	159053	159064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51598419
114	NC_006156	AAAATT	2	12	159304	159315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598419
115	NC_006156	CTAGAA	2	12	160168	160179	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51598420
116	NC_006156	ATTTTT	2	12	160583	160594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	51598420
117	NC_006156	TCATAT	2	12	161051	161062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	51598421
118	NC_006156	AATCAA	2	12	167837	167848	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	51598426
119	NC_006156	CACCAA	2	12	168029	168040	50 %	0 %	0 %	50 %	51598426
120	NC_006156	CTTGCT	2	12	168182	168193	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	51598426
121	NC_006156	CTTTTT	2	12	168946	168957	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	51598426
122	NC_006156	ATCTTT	2	12	173953	173964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	51598433
123	NC_006156	ATTAAA	2	12	174635	174646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51598433
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