MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid lp54

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006129	CCTTT	2	10	1162	1171	0 %	60 %	0 %	40 %	51038625
2	NC_006129	AAAAG	2	10	2067	2076	80 %	0 %	20 %	0 %	51038626
3	NC_006129	GGCAT	2	10	2843	2852	20 %	20 %	40 %	20 %	51038627
4	NC_006129	TAAAT	2	10	4573	4582	60 %	40 %	0 %	0 %	51038628
5	NC_006129	TTAAA	2	10	5218	5227	60 %	40 %	0 %	0 %	51038629
6	NC_006129	AAGAA	2	10	5413	5422	80 %	0 %	20 %	0 %	51038629
7	NC_006129	AATAT	2	10	5591	5600	60 %	40 %	0 %	0 %	51038630
8	NC_006129	CTTTA	2	10	5782	5791	20 %	60 %	0 %	20 %	51038630
9	NC_006129	TTAAA	2	10	6343	6352	60 %	40 %	0 %	0 %	51038631
10	NC_006129	ATAAA	2	10	9453	9462	80 %	20 %	0 %	0 %	51038637
11	NC_006129	ATTTT	2	10	9598	9607	20 %	80 %	0 %	0 %	51038637
12	NC_006129	TGAAA	2	10	9807	9816	60 %	20 %	20 %	0 %	51038638
13	NC_006129	CAAAA	2	10	11977	11986	80 %	0 %	0 %	20 %	51038640
14	NC_006129	ATAAA	2	10	12736	12745	80 %	20 %	0 %	0 %	51038640
15	NC_006129	TTAAA	2	10	14102	14111	60 %	40 %	0 %	0 %	51038642
16	NC_006129	GATTT	2	10	14441	14450	20 %	60 %	20 %	0 %	51038642
17	NC_006129	AAAAT	2	10	15090	15099	80 %	20 %	0 %	0 %	51038643
18	NC_006129	TCTAG	2	10	16868	16877	20 %	40 %	20 %	20 %	51038645
19	NC_006129	AAATT	2	10	17615	17624	60 %	40 %	0 %	0 %	51038646
20	NC_006129	TATTT	2	10	18111	18120	20 %	80 %	0 %	0 %	51038647
21	NC_006129	TTCTT	2	10	20126	20135	0 %	80 %	0 %	20 %	51038649
22	NC_006129	ATTTC	2	10	20376	20385	20 %	60 %	0 %	20 %	51038649
23	NC_006129	AATTT	2	10	23464	23473	40 %	60 %	0 %	0 %	51038652
24	NC_006129	ATTTT	2	10	25769	25778	20 %	80 %	0 %	0 %	51038655
25	NC_006129	AAAAC	2	10	28480	28489	80 %	0 %	0 %	20 %	51038660
26	NC_006129	CCAAA	2	10	29058	29067	60 %	0 %	0 %	40 %	51038661
27	NC_006129	TAATT	2	10	30827	30836	40 %	60 %	0 %	0 %	51038665
28	NC_006129	AGTAC	2	10	32407	32416	40 %	20 %	20 %	20 %	51038669
29	NC_006129	TAATG	2	10	32423	32432	40 %	40 %	20 %	0 %	51038669
30	NC_006129	TGGTT	2	10	33110	33119	0 %	60 %	40 %	0 %	51038670
31	NC_006129	ATTTT	2	10	34317	34326	20 %	80 %	0 %	0 %	51038672
32	NC_006129	AATAA	2	10	34646	34655	80 %	20 %	0 %	0 %	51038672
33	NC_006129	AGATT	2	10	34676	34685	40 %	40 %	20 %	0 %	51038672
34	NC_006129	TATTT	2	10	36730	36739	20 %	80 %	0 %	0 %	51038677
35	NC_006129	TGATT	2	10	41232	41241	20 %	60 %	20 %	0 %	51038684
36	NC_006129	TTTCA	2	10	43529	43538	20 %	60 %	0 %	20 %	51038687
37	NC_006129	ATTTG	2	10	43694	43703	20 %	60 %	20 %	0 %	51038687
38	NC_006129	TTTGT	2	10	44623	44632	0 %	80 %	20 %	0 %	51038688
39	NC_006129	TGTTA	2	10	45141	45150	20 %	60 %	20 %	0 %	51038689
40	NC_006129	ACTTG	2	10	46078	46087	20 %	40 %	20 %	20 %	51038689
41	NC_006129	AGTTT	2	10	47483	47492	20 %	60 %	20 %	0 %	51038690
42	NC_006129	AGTTT	2	10	48590	48599	20 %	60 %	20 %	0 %	51038691
43	NC_006129	GTTTT	2	10	49977	49986	0 %	80 %	20 %	0 %	51038693
44	NC_006129	AGTTT	2	10	50557	50566	20 %	60 %	20 %	0 %	51038694
45	NC_006129	TGTCT	2	10	50984	50993	0 %	60 %	20 %	20 %	51038695
46	NC_006129	TTTAG	2	10	51581	51590	20 %	60 %	20 %	0 %	51038695
47	NC_006129	TTTGA	2	10	52489	52498	20 %	60 %	20 %	0 %	51038696
48	NC_006129	ATTTT	2	10	53253	53262	20 %	80 %	0 %	0 %	51038697
49	NC_006129	AATAA	2	10	53281	53290	80 %	20 %	0 %	0 %	51038697
50	NC_006129	TCCTT	2	10	53500	53509	0 %	60 %	0 %	40 %	51038697

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.