MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid cp26

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006128	AAAT	2	8	626	633	75 %	25 %	0 %	0 %	51038599
2	NC_006128	AATA	2	8	1296	1303	75 %	25 %	0 %	0 %	51038600
3	NC_006128	AATT	2	8	1452	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	51038600
4	NC_006128	AATT	2	8	1692	1699	50 %	50 %	0 %	0 %	51038600
5	NC_006128	CTGC	2	8	3132	3139	0 %	25 %	25 %	50 %	51038601
6	NC_006128	AATG	2	8	4603	4610	50 %	25 %	25 %	0 %	51038603
7	NC_006128	GAAA	2	8	4680	4687	75 %	0 %	25 %	0 %	51038604
8	NC_006128	ATAA	2	8	5059	5066	75 %	25 %	0 %	0 %	51038604
9	NC_006128	CTTT	2	8	5162	5169	0 %	75 %	0 %	25 %	51038604
10	NC_006128	ATAA	2	8	5768	5775	75 %	25 %	0 %	0 %	51038604
11	NC_006128	TTTA	2	8	5791	5798	25 %	75 %	0 %	0 %	51038605
12	NC_006128	CAAA	2	8	6122	6129	75 %	0 %	0 %	25 %	51038605
13	NC_006128	AAAT	2	8	6805	6812	75 %	25 %	0 %	0 %	51038606
14	NC_006128	ATTA	2	8	7956	7963	50 %	50 %	0 %	0 %	51038607
15	NC_006128	TACT	2	8	8004	8011	25 %	50 %	0 %	25 %	51038607
16	NC_006128	AATA	2	8	8016	8023	75 %	25 %	0 %	0 %	51038607
17	NC_006128	AGAA	2	8	8267	8274	75 %	0 %	25 %	0 %	51038607
18	NC_006128	GAAA	2	8	8289	8296	75 %	0 %	25 %	0 %	51038607
19	NC_006128	CAAG	2	8	9292	9299	50 %	0 %	25 %	25 %	51038609
20	NC_006128	TAAA	2	8	9413	9420	75 %	25 %	0 %	0 %	51038609
21	NC_006128	GAAA	2	8	10144	10151	75 %	0 %	25 %	0 %	51038610
22	NC_006128	AATT	2	8	10290	10297	50 %	50 %	0 %	0 %	51038610
23	NC_006128	TTAC	2	8	10484	10491	25 %	50 %	0 %	25 %	51038610
24	NC_006128	TATT	2	8	12606	12613	25 %	75 %	0 %	0 %	51038612
25	NC_006128	TGAA	2	8	12996	13003	50 %	25 %	25 %	0 %	51038612
26	NC_006128	GAAA	2	8	13958	13965	75 %	0 %	25 %	0 %	51038612
27	NC_006128	ATTT	2	8	14554	14561	25 %	75 %	0 %	0 %	51038613
28	NC_006128	TTGT	2	8	15135	15142	0 %	75 %	25 %	0 %	51038613
29	NC_006128	TGCA	2	8	15291	15298	25 %	25 %	25 %	25 %	51038613
30	NC_006128	ATTA	2	8	15793	15800	50 %	50 %	0 %	0 %	51038614
31	NC_006128	TTCA	2	8	16165	16172	25 %	50 %	0 %	25 %	51038614
32	NC_006128	TTTG	2	8	16882	16889	0 %	75 %	25 %	0 %	51038614
33	NC_006128	TTGT	2	8	16951	16958	0 %	75 %	25 %	0 %	51038614
34	NC_006128	AATT	2	8	16993	17000	50 %	50 %	0 %	0 %	51038614
35	NC_006128	TTAA	2	8	18151	18158	50 %	50 %	0 %	0 %	51038615
36	NC_006128	AATA	2	8	18887	18894	75 %	25 %	0 %	0 %	51038616
37	NC_006128	AAAT	2	8	19142	19149	75 %	25 %	0 %	0 %	51038616
38	NC_006128	TAAA	2	8	19417	19424	75 %	25 %	0 %	0 %	51038616
39	NC_006128	AATG	2	8	19436	19443	50 %	25 %	25 %	0 %	51038616
40	NC_006128	CCAA	2	8	19452	19459	50 %	0 %	0 %	50 %	51038616
41	NC_006128	ATTC	2	8	19658	19665	25 %	50 %	0 %	25 %	51038616
42	NC_006128	GATT	2	8	19941	19948	25 %	50 %	25 %	0 %	51038616
43	NC_006128	AAAT	2	8	20607	20614	75 %	25 %	0 %	0 %	51038617
44	NC_006128	TAAA	2	8	20882	20889	75 %	25 %	0 %	0 %	51038617
45	NC_006128	AATG	2	8	20901	20908	50 %	25 %	25 %	0 %	51038617
46	NC_006128	CCAA	2	8	20917	20924	50 %	0 %	0 %	50 %	51038617
47	NC_006128	TAAA	2	8	21696	21703	75 %	25 %	0 %	0 %	51038618
48	NC_006128	AATT	2	8	21817	21824	50 %	50 %	0 %	0 %	51038618
49	NC_006128	TAAA	2	8	21901	21908	75 %	25 %	0 %	0 %	51038618
50	NC_006128	ACTA	2	8	22187	22194	50 %	25 %	0 %	25 %	51038619
51	NC_006128	AATT	2	8	22235	22242	50 %	50 %	0 %	0 %	51038619
52	NC_006128	TAAA	2	8	22708	22715	75 %	25 %	0 %	0 %	51038620
53	NC_006128	ATCT	2	8	22816	22823	25 %	50 %	0 %	25 %	51038620
54	NC_006128	ATTT	2	8	23001	23008	25 %	75 %	0 %	0 %	51038620
55	NC_006128	ATTT	2	8	23373	23380	25 %	75 %	0 %	0 %	51038621
56	NC_006128	ATTT	2	8	23688	23695	25 %	75 %	0 %	0 %	51038621
57	NC_006128	CAAA	2	8	24294	24301	75 %	0 %	0 %	25 %	51038622
58	NC_006128	TACA	2	8	25794	25801	50 %	25 %	0 %	25 %	51038623
59	NC_006128	TCTT	2	8	25960	25967	0 %	75 %	0 %	25 %	51038623
60	NC_006128	TGTT	2	8	26056	26063	0 %	75 %	25 %	0 %	51038623
61	NC_006128	ATTT	2	8	26081	26088	25 %	75 %	0 %	0 %	51038623
62	NC_006128	AAAT	2	8	26254	26261	75 %	25 %	0 %	0 %	51038623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.