MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bartonella henselae str. Houston-1 chromosome

Total Repeats: 972

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005956	GTAAA	2	10	2479	2488	60 %	20 %	20 %	0 %	49474835
2	NC_005956	TGCTT	2	10	3348	3357	0 %	60 %	20 %	20 %	49474836
3	NC_005956	AAAAT	2	10	9729	9738	80 %	20 %	0 %	0 %	49474840
4	NC_005956	TGCAG	2	10	9945	9954	20 %	20 %	40 %	20 %	49474840
5	NC_005956	AAGCC	2	10	10169	10178	40 %	0 %	20 %	40 %	49474840
6	NC_005956	TATTG	2	10	11821	11830	20 %	60 %	20 %	0 %	49474841
7	NC_005956	CCTGT	2	10	12561	12570	0 %	40 %	20 %	40 %	49474842
8	NC_005956	ATCAT	2	10	13219	13228	40 %	40 %	0 %	20 %	49474843
9	NC_005956	GGTTC	2	10	15859	15868	0 %	40 %	40 %	20 %	49474847
10	NC_005956	GTTTT	2	10	21527	21536	0 %	80 %	20 %	0 %	49474852
11	NC_005956	AAAAC	2	10	24431	24440	80 %	0 %	0 %	20 %	49474853
12	NC_005956	AGATG	2	10	25072	25081	40 %	20 %	40 %	0 %	49474853
13	NC_005956	TTGAT	2	10	39153	39162	20 %	60 %	20 %	0 %	49474858
14	NC_005956	GTTGT	2	10	39575	39584	0 %	60 %	40 %	0 %	49474858
15	NC_005956	TAAGA	2	10	41443	41452	60 %	20 %	20 %	0 %	49474859
16	NC_005956	TCGGA	2	10	47812	47821	20 %	20 %	40 %	20 %	49474863
17	NC_005956	AATCA	2	10	50477	50486	60 %	20 %	0 %	20 %	49474864
18	NC_005956	AATCA	2	10	50657	50666	60 %	20 %	0 %	20 %	49474864
19	NC_005956	TGTGG	2	10	51491	51500	0 %	40 %	60 %	0 %	49474865
20	NC_005956	CTTTT	2	10	51588	51597	0 %	80 %	0 %	20 %	49474865
21	NC_005956	TCCAT	2	10	51806	51815	20 %	40 %	0 %	40 %	49474865
22	NC_005956	GAACA	2	10	55645	55654	60 %	0 %	20 %	20 %	49474867
23	NC_005956	GTTTG	2	10	59824	59833	0 %	60 %	40 %	0 %	49474869
24	NC_005956	TGCCA	2	10	60029	60038	20 %	20 %	20 %	40 %	49474869
25	NC_005956	AGTGA	2	10	60295	60304	40 %	20 %	40 %	0 %	49474869
26	NC_005956	ATTTT	2	10	65727	65736	20 %	80 %	0 %	0 %	49474871
27	NC_005956	TCTAT	2	10	68101	68110	20 %	60 %	0 %	20 %	49474871
28	NC_005956	ATATT	2	10	70821	70830	40 %	60 %	0 %	0 %	49474872
29	NC_005956	CTTTA	2	10	72518	72527	20 %	60 %	0 %	20 %	49474873
30	NC_005956	TGGTT	2	10	73157	73166	0 %	60 %	40 %	0 %	49474874
31	NC_005956	ATTTT	2	10	73909	73918	20 %	80 %	0 %	0 %	49474875
32	NC_005956	CATAC	2	10	74163	74172	40 %	20 %	0 %	40 %	49474875
33	NC_005956	TTGTT	2	10	75197	75206	0 %	80 %	20 %	0 %	49474876
34	NC_005956	ATGCA	2	10	77664	77673	40 %	20 %	20 %	20 %	49474878
35	NC_005956	ATTGT	2	10	77970	77979	20 %	60 %	20 %	0 %	49474878
36	NC_005956	TCAAG	2	10	78697	78706	40 %	20 %	20 %	20 %	49474879
37	NC_005956	TTCTC	2	10	81516	81525	0 %	60 %	0 %	40 %	49474882
38	NC_005956	TATTT	2	10	82797	82806	20 %	80 %	0 %	0 %	49474884
39	NC_005956	GAAGG	2	10	82850	82859	40 %	0 %	60 %	0 %	49474885
40	NC_005956	AAGGT	2	10	83213	83222	40 %	20 %	40 %	0 %	49474885
41	NC_005956	AAGAG	2	10	84959	84968	60 %	0 %	40 %	0 %	49474886
42	NC_005956	CCATC	2	10	85183	85192	20 %	20 %	0 %	60 %	49474886
43	NC_005956	ATCTT	2	10	88215	88224	20 %	60 %	0 %	20 %	49474889
44	NC_005956	GGAAC	2	10	98991	99000	40 %	0 %	40 %	20 %	49474894
45	NC_005956	CTTTT	2	10	103394	103403	0 %	80 %	0 %	20 %	49474899
46	NC_005956	GGCAT	2	10	107072	107081	20 %	20 %	40 %	20 %	49474904
47	NC_005956	CGTAT	2	10	108314	108323	20 %	40 %	20 %	20 %	49474906
48	NC_005956	TTGTC	2	10	113871	113880	0 %	60 %	20 %	20 %	49474910
49	NC_005956	CTTAT	2	10	114837	114846	20 %	60 %	0 %	20 %	49474911
50	NC_005956	TGGGT	2	10	115486	115495	0 %	40 %	60 %	0 %	49474912
51	NC_005956	CGGTA	2	10	118569	118578	20 %	20 %	40 %	20 %	49474914
52	NC_005956	CATAA	2	10	118657	118666	60 %	20 %	0 %	20 %	49474914
53	NC_005956	TTTTG	2	10	119822	119831	0 %	80 %	20 %	0 %	49474914
54	NC_005956	GTTTA	2	10	120814	120823	20 %	60 %	20 %	0 %	49474914
55	NC_005956	TCGGG	2	10	121293	121302	0 %	20 %	60 %	20 %	49474914
56	NC_005956	GGTGC	2	10	122328	122337	0 %	20 %	60 %	20 %	49474914
57	NC_005956	GTATT	2	10	122770	122779	20 %	60 %	20 %	0 %	49474914
58	NC_005956	TCCCA	2	10	125129	125138	20 %	20 %	0 %	60 %	49474914
59	NC_005956	AAAGA	2	10	125554	125563	80 %	0 %	20 %	0 %	49474914
60	NC_005956	GTTTT	2	10	127642	127651	0 %	80 %	20 %	0 %	49474915
61	NC_005956	ATTGT	2	10	128769	128778	20 %	60 %	20 %	0 %	49474915
62	NC_005956	ATCAC	2	10	136958	136967	40 %	20 %	0 %	40 %	49474920
63	NC_005956	AGAAT	2	10	147402	147411	60 %	20 %	20 %	0 %	49474926
64	NC_005956	TAATA	2	10	148853	148862	60 %	40 %	0 %	0 %	49474927
65	NC_005956	AATAT	2	10	150744	150753	60 %	40 %	0 %	0 %	49474928
66	NC_005956	GAGAA	2	10	152112	152121	60 %	0 %	40 %	0 %	49474929
67	NC_005956	TAAGA	2	10	153130	153139	60 %	20 %	20 %	0 %	49474931
68	NC_005956	GAACA	2	10	154534	154543	60 %	0 %	20 %	20 %	49474933
69	NC_005956	TTGGT	2	10	158995	159004	0 %	60 %	40 %	0 %	49474936
70	NC_005956	GAAGA	2	10	159221	159230	60 %	0 %	40 %	0 %	49474936
71	NC_005956	TCTTT	2	10	161831	161840	0 %	80 %	0 %	20 %	49474938
72	NC_005956	GTGAA	2	10	161946	161955	40 %	20 %	40 %	0 %	49474938
73	NC_005956	GGTTT	2	10	162581	162590	0 %	60 %	40 %	0 %	49474938
74	NC_005956	TATGC	2	10	163987	163996	20 %	40 %	20 %	20 %	49474940
75	NC_005956	TATTT	2	10	164846	164855	20 %	80 %	0 %	0 %	49474941
76	NC_005956	TTTGT	2	10	166024	166033	0 %	80 %	20 %	0 %	49474941
77	NC_005956	TGGTA	2	10	166056	166065	20 %	40 %	40 %	0 %	49474941
78	NC_005956	TGGAA	2	10	166822	166831	40 %	20 %	40 %	0 %	49474942
79	NC_005956	AGATG	2	10	169275	169284	40 %	20 %	40 %	0 %	49474944
80	NC_005956	ATTTT	2	10	170807	170816	20 %	80 %	0 %	0 %	49474946
81	NC_005956	ATTAG	2	10	172688	172697	40 %	40 %	20 %	0 %	49474948
82	NC_005956	TGAAC	2	10	173517	173526	40 %	20 %	20 %	20 %	49474949
83	NC_005956	TTTCA	2	10	174914	174923	20 %	60 %	0 %	20 %	49474950
84	NC_005956	CGCAT	2	10	178661	178670	20 %	20 %	20 %	40 %	49474951
85	NC_005956	GTTGC	2	10	178842	178851	0 %	40 %	40 %	20 %	49474951
86	NC_005956	TTGGG	2	10	180006	180015	0 %	40 %	60 %	0 %	49474952
87	NC_005956	TTTCT	2	10	180510	180519	0 %	80 %	0 %	20 %	49474952
88	NC_005956	TTGGG	2	10	183267	183276	0 %	40 %	60 %	0 %	49474953
89	NC_005956	AAAAC	2	10	184055	184064	80 %	0 %	0 %	20 %	49474953
90	NC_005956	CTTGG	2	10	186896	186905	0 %	40 %	40 %	20 %	49474956
91	NC_005956	TGAAA	2	10	187329	187338	60 %	20 %	20 %	0 %	49474956
92	NC_005956	GTATC	2	10	197123	197132	20 %	40 %	20 %	20 %	49474963
93	NC_005956	TGTGG	2	10	197180	197189	0 %	40 %	60 %	0 %	49474963
94	NC_005956	ACTGA	2	10	202147	202156	40 %	20 %	20 %	20 %	49474963
95	NC_005956	TGCGG	2	10	205627	205636	0 %	20 %	60 %	20 %	49474965
96	NC_005956	CTCTT	2	10	206276	206285	0 %	60 %	0 %	40 %	49474965
97	NC_005956	ATATC	2	10	223085	223094	40 %	40 %	0 %	20 %	49474973
98	NC_005956	GCAAT	2	10	225228	225237	40 %	20 %	20 %	20 %	49474976
99	NC_005956	AGCAG	2	10	225280	225289	40 %	0 %	40 %	20 %	49474976
100	NC_005956	TTCAA	2	10	226973	226982	40 %	40 %	0 %	20 %	49474977
101	NC_005956	TTGGG	2	10	227364	227373	0 %	40 %	60 %	0 %	49474978
102	NC_005956	ATTTA	2	10	227956	227965	40 %	60 %	0 %	0 %	49474979
103	NC_005956	TGCTT	2	10	228843	228852	0 %	60 %	20 %	20 %	49474980
104	NC_005956	ATTTT	2	10	236088	236097	20 %	80 %	0 %	0 %	49474985
105	NC_005956	TTTCT	2	10	238148	238157	0 %	80 %	0 %	20 %	49474986
106	NC_005956	GTATT	2	10	238460	238469	20 %	60 %	20 %	0 %	49474986
107	NC_005956	ATTTT	2	10	240484	240493	20 %	80 %	0 %	0 %	49474988
108	NC_005956	TGATT	2	10	243240	243249	20 %	60 %	20 %	0 %	49474991
109	NC_005956	GCAGT	2	10	250874	250883	20 %	20 %	40 %	20 %	49474995
110	NC_005956	TATAA	2	10	251186	251195	60 %	40 %	0 %	0 %	49474995
111	NC_005956	TCTGA	2	10	252637	252646	20 %	40 %	20 %	20 %	49474996
112	NC_005956	TAATG	2	10	254479	254488	40 %	40 %	20 %	0 %	49474998
113	NC_005956	GTTAT	2	10	255027	255036	20 %	60 %	20 %	0 %	49474999
114	NC_005956	ACATA	2	10	255058	255067	60 %	20 %	0 %	20 %	49474999
115	NC_005956	ATCCA	2	10	255904	255913	40 %	20 %	0 %	40 %	49475000
116	NC_005956	AAGAT	2	10	260667	260676	60 %	20 %	20 %	0 %	49475003
117	NC_005956	ATCAG	2	10	262463	262472	40 %	20 %	20 %	20 %	49475006
118	NC_005956	AATGC	2	10	262494	262503	40 %	20 %	20 %	20 %	49475006
119	NC_005956	CCAAT	2	10	263560	263569	40 %	20 %	0 %	40 %	49475006
120	NC_005956	TTTTA	2	10	265086	265095	20 %	80 %	0 %	0 %	49475007
121	NC_005956	AACGG	2	10	268504	268513	40 %	0 %	40 %	20 %	49475011
122	NC_005956	CATCC	2	10	269047	269056	20 %	20 %	0 %	60 %	49475011
123	NC_005956	AATTT	2	10	271271	271280	40 %	60 %	0 %	0 %	49475012
124	NC_005956	GTTTG	2	10	271929	271938	0 %	60 %	40 %	0 %	49475012
125	NC_005956	TTTGG	2	10	273371	273380	0 %	60 %	40 %	0 %	49475013
126	NC_005956	AATCA	2	10	278297	278306	60 %	20 %	0 %	20 %	49475017
127	NC_005956	TGCGC	2	10	280693	280702	0 %	20 %	40 %	40 %	49475020
128	NC_005956	AAGGA	2	10	283933	283942	60 %	0 %	40 %	0 %	49475022
129	NC_005956	CACGC	2	10	283972	283981	20 %	0 %	20 %	60 %	49475022
130	NC_005956	TTTAA	2	10	286511	286520	40 %	60 %	0 %	0 %	49475024
131	NC_005956	TGTAT	2	10	292409	292418	20 %	60 %	20 %	0 %	49475028
132	NC_005956	ACGCC	2	10	292703	292712	20 %	0 %	20 %	60 %	49475028
133	NC_005956	GATTT	2	10	293755	293764	20 %	60 %	20 %	0 %	49475029
134	NC_005956	TACCG	2	10	294000	294009	20 %	20 %	20 %	40 %	49475029
135	NC_005956	ATTTT	2	10	294025	294034	20 %	80 %	0 %	0 %	49475029
136	NC_005956	TAATT	2	10	294252	294261	40 %	60 %	0 %	0 %	49475029
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