MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004663	GAA	2	6	226217	226222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345617
4002	NC_004663	TTG	2	6	226289	226294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345617
4003	NC_004663	TTTA	2	8	226333	226340	25 %	75 %	0 %	0 %	29345617
4004	NC_004663	TCT	2	6	226490	226495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345617
4005	NC_004663	TAT	2	6	226505	226510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345617
4006	NC_004663	GGAC	2	8	226521	226528	25 %	0 %	50 %	25 %	29345617
4007	NC_004663	TTG	2	6	226745	226750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345617
4008	NC_004663	TAA	2	6	226765	226770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345617
4009	NC_004663	GCA	2	6	226861	226866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345617
4010	NC_004663	GGT	2	6	226937	226942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345617
4011	NC_004663	CAATG	2	10	226963	226972	40 %	20 %	20 %	20 %	29345617
4012	NC_004663	AGC	2	6	227093	227098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345617
4013	NC_004663	GAT	2	6	227114	227119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345617
4014	NC_004663	ATT	2	6	227122	227127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345617
4015	NC_004663	GAA	2	6	227220	227225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345618
4016	NC_004663	ATT	3	9	227226	227234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345618
4017	NC_004663	AGC	2	6	227244	227249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345618
4018	NC_004663	TGC	2	6	227253	227258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345618
4019	NC_004663	TCCG	2	8	227654	227661	0 %	25 %	25 %	50 %	29345618
4020	NC_004663	TGT	2	6	227691	227696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345618
4021	NC_004663	GATAC	2	10	227810	227819	40 %	20 %	20 %	20 %	29345618
4022	NC_004663	TGA	2	6	227933	227938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345618
4023	NC_004663	CTT	2	6	227957	227962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345618
4024	NC_004663	ATC	2	6	228027	228032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345618
4025	NC_004663	TACGG	2	10	228034	228043	20 %	20 %	40 %	20 %	29345618
4026	NC_004663	A	7	7	228116	228122	100 %	0 %	0 %	0 %	29345618
4027	NC_004663	AGTTT	2	10	228148	228157	20 %	60 %	20 %	0 %	29345619
4028	NC_004663	TGT	2	6	228187	228192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345619
4029	NC_004663	GCT	2	6	228199	228204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345619
4030	NC_004663	CTTA	2	8	228215	228222	25 %	50 %	0 %	25 %	29345619
4031	NC_004663	GAT	4	12	228252	228263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4032	NC_004663	A	6	6	228318	228323	100 %	0 %	0 %	0 %	29345619
4033	NC_004663	CAT	2	6	228361	228366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345619
4034	NC_004663	CAA	2	6	228367	228372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345619
4035	NC_004663	AAC	2	6	228390	228395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345619
4036	NC_004663	GTA	2	6	228411	228416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4037	NC_004663	CTA	2	6	228454	228459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345619
4038	NC_004663	ATAACG	2	12	228472	228483	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29345619
4039	NC_004663	GGT	2	6	228513	228518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345619
4040	NC_004663	GCA	2	6	228552	228557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345619
4041	NC_004663	GAA	2	6	228582	228587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345619
4042	NC_004663	GCAA	2	8	228644	228651	50 %	0 %	25 %	25 %	29345619
4043	NC_004663	TGC	2	6	228662	228667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345619
4044	NC_004663	GGT	2	6	228699	228704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345619
4045	NC_004663	TTG	2	6	228709	228714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345619
4046	NC_004663	GTG	2	6	228736	228741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345619
4047	NC_004663	ATA	2	6	228750	228755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345619
4048	NC_004663	GAT	2	6	228759	228764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4049	NC_004663	GAA	2	6	228822	228827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345619
4050	NC_004663	ATTCT	2	10	228836	228845	20 %	60 %	0 %	20 %	29345619
4051	NC_004663	ATG	2	6	228859	228864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4052	NC_004663	TAA	2	6	228905	228910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345619
4053	NC_004663	TAC	2	6	228986	228991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345619
4054	NC_004663	GAT	2	6	229035	229040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4055	NC_004663	GTA	2	6	229047	229052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4056	NC_004663	CAA	2	6	229070	229075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345619
4057	NC_004663	AATG	2	8	229107	229114	50 %	25 %	25 %	0 %	29345619
4058	NC_004663	GGT	2	6	229134	229139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345619
4059	NC_004663	TCT	2	6	229213	229218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345619
4060	NC_004663	CAT	2	6	229262	229267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345619
4061	NC_004663	TTC	2	6	229312	229317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345619
4062	NC_004663	AGAA	2	8	229327	229334	75 %	0 %	25 %	0 %	29345619
4063	NC_004663	ATTG	2	8	229395	229402	25 %	50 %	25 %	0 %	29345619
4064	NC_004663	TGA	2	6	229649	229654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4065	NC_004663	GGA	2	6	229710	229715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345619
4066	NC_004663	ATG	2	6	229771	229776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4067	NC_004663	GTA	2	6	229777	229782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4068	NC_004663	ATT	2	6	229795	229800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345619
4069	NC_004663	A	6	6	229838	229843	100 %	0 %	0 %	0 %	29345619
4070	NC_004663	CCG	2	6	229845	229850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345619
4071	NC_004663	ATG	2	6	229909	229914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345619
4072	NC_004663	TAA	2	6	230035	230040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345619
4073	NC_004663	AGCA	2	8	230058	230065	50 %	0 %	25 %	25 %	29345619
4074	NC_004663	AT	3	6	230080	230085	50 %	50 %	0 %	0 %	29345619
4075	NC_004663	TTC	2	6	230160	230165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345620
4076	NC_004663	CTG	2	6	230184	230189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345620
4077	NC_004663	GAT	2	6	230217	230222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345620
4078	NC_004663	GAG	2	6	230226	230231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345620
4079	NC_004663	AAC	2	6	230294	230299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345620
4080	NC_004663	AGA	2	6	230341	230346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345620
4081	NC_004663	GGT	2	6	230351	230356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345620
4082	NC_004663	ACC	2	6	230373	230378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345620
4083	NC_004663	TAT	2	6	230484	230489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345620
4084	NC_004663	TGA	2	6	230504	230509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345620
4085	NC_004663	GGA	2	6	230562	230567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345620
4086	NC_004663	AAG	2	6	230632	230637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345620
4087	NC_004663	TGA	2	6	230701	230706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345620
4088	NC_004663	CAC	2	6	230723	230728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345620
4089	NC_004663	AGA	2	6	230759	230764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345620
4090	NC_004663	GTA	2	6	230868	230873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345620
4091	NC_004663	ACC	2	6	230880	230885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345620
4092	NC_004663	ACA	2	6	230959	230964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345620
4093	NC_004663	CGG	2	6	231007	231012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345620
4094	NC_004663	TAT	2	6	231078	231083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345620
4095	NC_004663	CAA	2	6	231128	231133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345620
4096	NC_004663	ATA	2	6	231175	231180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345620
4097	NC_004663	TTCG	2	8	231272	231279	0 %	50 %	25 %	25 %	29345620
4098	NC_004663	ATT	2	6	231308	231313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345620
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4100	NC_004663	GAAA	2	8	231348	231355	75 %	0 %	25 %	0 %	29345620
4101	NC_004663	CTA	2	6	231423	231428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345620
4102	NC_004663	TGAAA	2	10	231452	231461	60 %	20 %	20 %	0 %	29345620
4103	NC_004663	AAG	2	6	231468	231473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345620
4104	NC_004663	ATA	2	6	231604	231609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345620
4105	NC_004663	GAA	2	6	231663	231668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345620
4106	NC_004663	CTT	2	6	231743	231748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345620
4107	NC_004663	TGC	2	6	231803	231808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345620
4108	NC_004663	T	6	6	231871	231876	0 %	100 %	0 %	0 %	29345620
4109	NC_004663	TAA	2	6	231887	231892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345620
4110	NC_004663	CTT	2	6	231916	231921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345620
4111	NC_004663	AGA	2	6	231925	231930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345620
4112	NC_004663	TG	3	6	231954	231959	0 %	50 %	50 %	0 %	29345620
4113	NC_004663	ATA	2	6	231961	231966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345620
4114	NC_004663	ACTG	2	8	232004	232011	25 %	25 %	25 %	25 %	29345620
4115	NC_004663	ATA	2	6	232099	232104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345620
4116	NC_004663	AT	3	6	232112	232117	50 %	50 %	0 %	0 %	29345620
4117	NC_004663	AT	3	6	232123	232128	50 %	50 %	0 %	0 %	29345620
4118	NC_004663	TAA	2	6	232175	232180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345620
4119	NC_004663	GTT	2	6	232207	232212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345620
4120	NC_004663	GATG	2	8	232214	232221	25 %	25 %	50 %	0 %	29345620
4121	NC_004663	CAA	2	6	232331	232336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345620
4122	NC_004663	ACT	2	6	232407	232412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345620
4123	NC_004663	TGA	2	6	232448	232453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345620
4124	NC_004663	TACCT	2	10	232466	232475	20 %	40 %	0 %	40 %	29345620
4125	NC_004663	ACT	2	6	232623	232628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345620
4126	NC_004663	TA	3	6	232704	232709	50 %	50 %	0 %	0 %	29345620
4127	NC_004663	GTAT	2	8	232777	232784	25 %	50 %	25 %	0 %	29345620
4128	NC_004663	ATA	2	6	232844	232849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345620
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4132	NC_004663	AGG	2	6	232996	233001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345621
4133	NC_004663	AGA	2	6	233007	233012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345621
4134	NC_004663	GGT	2	6	233038	233043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345621
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4136	NC_004663	GGTTAC	2	12	233188	233199	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29345621
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4142	NC_004663	GAAT	2	8	233490	233497	50 %	25 %	25 %	0 %	29345621
4143	NC_004663	TGG	2	6	233559	233564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345621
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4150	NC_004663	TTCAG	2	10	233893	233902	20 %	40 %	20 %	20 %	29345621
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4162	NC_004663	GAC	2	6	234484	234489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345621
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4244	NC_004663	TAAT	2	8	238926	238933	50 %	50 %	0 %	0 %	29345625
4245	NC_004663	A	6	6	238954	238959	100 %	0 %	0 %	0 %	29345626
4246	NC_004663	GTT	2	6	239053	239058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345626
4247	NC_004663	GGT	2	6	239068	239073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345626
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4251	NC_004663	GAA	2	6	239260	239265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345626
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4263	NC_004663	ATC	2	6	239926	239931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345627
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4287	NC_004663	ATTG	2	8	241575	241582	25 %	50 %	25 %	0 %	29345630
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4360	NC_004663	TTG	2	6	245341	245346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345635
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4365	NC_004663	CCATAG	2	12	245692	245703	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29345635
4366	NC_004663	CTG	2	6	245746	245751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345635
4367	NC_004663	ACAG	2	8	245794	245801	50 %	0 %	25 %	25 %	29345635
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4369	NC_004663	ATA	2	6	245858	245863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345635
4370	NC_004663	TA	3	6	245877	245882	50 %	50 %	0 %	0 %	29345635
4371	NC_004663	TACA	2	8	245937	245944	50 %	25 %	0 %	25 %	29345636
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4479	NC_004663	TGC	2	6	251935	251940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345640
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4490	NC_004663	ATTC	2	8	252476	252483	25 %	50 %	0 %	25 %	29345641
4491	NC_004663	ATT	2	6	252589	252594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345642
4492	NC_004663	CAT	2	6	252613	252618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345642
4493	NC_004663	CCA	2	6	252630	252635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345642
4494	NC_004663	TCA	2	6	252645	252650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345642
4495	NC_004663	CAT	2	6	252661	252666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345642
4496	NC_004663	TTC	2	6	252687	252692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345642
4497	NC_004663	TCC	2	6	252990	252995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345642
4498	NC_004663	CTT	2	6	253000	253005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345642
4499	NC_004663	AC	3	6	253020	253025	50 %	0 %	0 %	50 %	29345642
4500	NC_004663	TGA	2	6	253067	253072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345642

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