MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004663	GTAG	2	8	168950	168957	25 %	25 %	50 %	0 %	29345572
3002	NC_004663	TTTTC	2	10	168970	168979	0 %	80 %	0 %	20 %	29345572
3003	NC_004663	CAG	2	6	168992	168997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345572
3004	NC_004663	AGC	2	6	169014	169019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345572
3005	NC_004663	GGCG	2	8	169049	169056	0 %	0 %	75 %	25 %	29345572
3006	NC_004663	GAA	2	6	169063	169068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345572
3007	NC_004663	GCG	2	6	169131	169136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345572
3008	NC_004663	TCC	2	6	169157	169162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345572
3009	NC_004663	TCT	2	6	169197	169202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345572
3010	NC_004663	TTC	2	6	169335	169340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345572
3011	NC_004663	GGA	2	6	169458	169463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345572
3012	NC_004663	CAG	2	6	169499	169504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345572
3013	NC_004663	ACT	2	6	169524	169529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345572
3014	NC_004663	AT	3	6	169572	169577	50 %	50 %	0 %	0 %	29345572
3015	NC_004663	A	6	6	169587	169592	100 %	0 %	0 %	0 %	29345572
3016	NC_004663	T	6	6	169613	169618	0 %	100 %	0 %	0 %	29345572
3017	NC_004663	GAA	2	6	169637	169642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345572
3018	NC_004663	TTC	2	6	169726	169731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345573
3019	NC_004663	GTGC	2	8	169740	169747	0 %	25 %	50 %	25 %	29345573
3020	NC_004663	CGT	2	6	169759	169764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345573
3021	NC_004663	GAA	2	6	169789	169794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345573
3022	NC_004663	TCA	2	6	169881	169886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345573
3023	NC_004663	ATC	2	6	169971	169976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345573
3024	NC_004663	TA	3	6	169984	169989	50 %	50 %	0 %	0 %	29345574
3025	NC_004663	TGGC	2	8	170168	170175	0 %	25 %	50 %	25 %	29345574
3026	NC_004663	TTC	2	6	170239	170244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345574
3027	NC_004663	CGG	2	6	170312	170317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345574
3028	NC_004663	TTGC	2	8	170322	170329	0 %	50 %	25 %	25 %	29345574
3029	NC_004663	GTTCCA	2	12	170331	170342	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29345574
3030	NC_004663	CTT	2	6	170454	170459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345574
3031	NC_004663	ATCCCG	2	12	170475	170486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	29345574
3032	NC_004663	TCA	2	6	170489	170494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345574
3033	NC_004663	GAA	2	6	170557	170562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345574
3034	NC_004663	GGC	2	6	170634	170639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345574
3035	NC_004663	TGGA	2	8	170659	170666	25 %	25 %	50 %	0 %	29345574
3036	NC_004663	CTG	2	6	170748	170753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3037	NC_004663	TTGC	2	8	170779	170786	0 %	50 %	25 %	25 %	29345574
3038	NC_004663	GCG	2	6	170812	170817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345574
3039	NC_004663	AAG	2	6	170906	170911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345574
3040	NC_004663	TCG	2	6	170920	170925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3041	NC_004663	CCG	2	6	170956	170961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345574
3042	NC_004663	AT	3	6	170979	170984	50 %	50 %	0 %	0 %	29345574
3043	NC_004663	CCT	2	6	171026	171031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345574
3044	NC_004663	AG	3	6	171065	171070	50 %	0 %	50 %	0 %	29345574
3045	NC_004663	ATG	2	6	171102	171107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345574
3046	NC_004663	AAG	2	6	171121	171126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345574
3047	NC_004663	GAA	3	9	171193	171201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345574
3048	NC_004663	GT	3	6	171209	171214	0 %	50 %	50 %	0 %	29345574
3049	NC_004663	CCT	2	6	171227	171232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345574
3050	NC_004663	ACC	2	6	171268	171273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345574
3051	NC_004663	GGATTC	2	12	171274	171285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29345574
3052	NC_004663	CTG	2	6	171315	171320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3053	NC_004663	TGC	2	6	171365	171370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3054	NC_004663	AGTG	2	8	171417	171424	25 %	25 %	50 %	0 %	29345574
3055	NC_004663	CTG	2	6	171426	171431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3056	NC_004663	TTC	2	6	171487	171492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345574
3057	NC_004663	TTC	2	6	171534	171539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345574
3058	NC_004663	ACA	2	6	171569	171574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345574
3059	NC_004663	ACC	2	6	171736	171741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345574
3060	NC_004663	CCG	2	6	171820	171825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345574
3061	NC_004663	TCG	2	6	171841	171846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3062	NC_004663	GCA	2	6	172019	172024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3063	NC_004663	TGC	3	9	172231	172239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345574
3064	NC_004663	TCC	2	6	172278	172283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345574
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3067	NC_004663	GTCT	2	8	172374	172381	0 %	50 %	25 %	25 %	29345574
3068	NC_004663	TCC	2	6	172425	172430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345574
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3070	NC_004663	TCC	2	6	172518	172523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345574
3071	NC_004663	TGT	2	6	172565	172570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345574
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3074	NC_004663	GA	3	6	172772	172777	50 %	0 %	50 %	0 %	29345574
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3091	NC_004663	TTG	2	6	173950	173955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345574
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3094	NC_004663	GCCA	2	8	174124	174131	25 %	0 %	25 %	50 %	29345574
3095	NC_004663	TCT	2	6	174137	174142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345574
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3099	NC_004663	GAT	2	6	174279	174284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345574
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3102	NC_004663	TG	3	6	174535	174540	0 %	50 %	50 %	0 %	29345574
3103	NC_004663	CGG	2	6	174599	174604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345574
3104	NC_004663	TTTTG	2	10	174644	174653	0 %	80 %	20 %	0 %	29345574
3105	NC_004663	TGCC	2	8	174665	174672	0 %	25 %	25 %	50 %	29345574
3106	NC_004663	CTT	2	6	174713	174718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345574
3107	NC_004663	CTGA	2	8	174726	174733	25 %	25 %	25 %	25 %	29345574
3108	NC_004663	TCGGG	2	10	174747	174756	0 %	20 %	60 %	20 %	29345574
3109	NC_004663	TCTG	2	8	174760	174767	0 %	50 %	25 %	25 %	29345574
3110	NC_004663	T	6	6	174834	174839	0 %	100 %	0 %	0 %	29345574
3111	NC_004663	ATCGG	2	10	174907	174916	20 %	20 %	40 %	20 %	29345574
3112	NC_004663	TTC	2	6	174963	174968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345574
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3115	NC_004663	TTG	2	6	175069	175074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345574
3116	NC_004663	GA	3	6	175106	175111	50 %	0 %	50 %	0 %	29345574
3117	NC_004663	CTC	2	6	175205	175210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345574
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3119	NC_004663	GCA	2	6	175324	175329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345574
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3121	NC_004663	TGCCT	2	10	175529	175538	0 %	40 %	20 %	40 %	29345575
3122	NC_004663	TAT	2	6	175548	175553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345575
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3124	NC_004663	ATC	2	6	175752	175757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345575
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3133	NC_004663	AGAA	2	8	176104	176111	75 %	0 %	25 %	0 %	29345576
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3493	NC_004663	CTA	2	6	196338	196343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345596
3494	NC_004663	GTG	2	6	196352	196357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345596
3495	NC_004663	CATTG	2	10	196387	196396	20 %	40 %	20 %	20 %	29345596
3496	NC_004663	GGAT	2	8	196460	196467	25 %	25 %	50 %	0 %	29345596
3497	NC_004663	GAT	2	6	196649	196654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345596
3498	NC_004663	TA	3	6	196713	196718	50 %	50 %	0 %	0 %	29345596
3499	NC_004663	CCT	2	6	196769	196774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345596
3500	NC_004663	GGAC	2	8	196935	196942	25 %	0 %	50 %	25 %	29345596

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