MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004663	TAC	2	6	142855	142860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345550
2502	NC_004663	TAT	2	6	142907	142912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345550
2503	NC_004663	ATAATT	2	12	142941	142952	50 %	50 %	0 %	0 %	29345550
2504	NC_004663	TTC	2	6	142960	142965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345550
2505	NC_004663	AATAG	2	10	143212	143221	60 %	20 %	20 %	0 %	29345550
2506	NC_004663	GGT	2	6	143313	143318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345551
2507	NC_004663	TCT	2	6	143391	143396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345551
2508	NC_004663	ATG	2	6	143404	143409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345551
2509	NC_004663	AATTC	2	10	143478	143487	40 %	40 %	0 %	20 %	29345551
2510	NC_004663	TTG	2	6	143544	143549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345551
2511	NC_004663	AT	3	6	143591	143596	50 %	50 %	0 %	0 %	29345551
2512	NC_004663	T	6	6	143609	143614	0 %	100 %	0 %	0 %	29345551
2513	NC_004663	ACTT	2	8	143635	143642	25 %	50 %	0 %	25 %	29345551
2514	NC_004663	ATC	2	6	143661	143666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345551
2515	NC_004663	AAG	2	6	143670	143675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345551
2516	NC_004663	AGT	2	6	143729	143734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345551
2517	NC_004663	TTA	2	6	143740	143745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345551
2518	NC_004663	GAT	2	6	143748	143753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345551
2519	NC_004663	AGGA	2	8	143806	143813	50 %	0 %	50 %	0 %	29345551
2520	NC_004663	AAG	2	6	143824	143829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345551
2521	NC_004663	CTTTC	2	10	143839	143848	0 %	60 %	0 %	40 %	29345551
2522	NC_004663	AGC	2	6	143942	143947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345551
2523	NC_004663	TGAT	2	8	143956	143963	25 %	50 %	25 %	0 %	29345551
2524	NC_004663	ACAG	2	8	143997	144004	50 %	0 %	25 %	25 %	29345551
2525	NC_004663	TCT	2	6	144090	144095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345551
2526	NC_004663	TCG	2	6	144116	144121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345551
2527	NC_004663	TG	3	6	144217	144222	0 %	50 %	50 %	0 %	29345551
2528	NC_004663	ATG	2	6	144223	144228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345551
2529	NC_004663	TTG	2	6	144519	144524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345551
2530	NC_004663	AT	3	6	144540	144545	50 %	50 %	0 %	0 %	29345551
2531	NC_004663	GA	4	8	144546	144553	50 %	0 %	50 %	0 %	29345551
2532	NC_004663	TGA	2	6	144725	144730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345551
2533	NC_004663	CAG	2	6	144748	144753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345551
2534	NC_004663	ATG	2	6	144835	144840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345551
2535	NC_004663	TGT	3	9	144848	144856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345551
2536	NC_004663	CAGTTA	2	12	144912	144923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29345551
2537	NC_004663	AAT	2	6	144958	144963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345551
2538	NC_004663	TTA	2	6	145052	145057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345552
2539	NC_004663	ATGA	2	8	145100	145107	50 %	25 %	25 %	0 %	29345552
2540	NC_004663	AATG	2	8	145117	145124	50 %	25 %	25 %	0 %	29345552
2541	NC_004663	TCA	2	6	145145	145150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345552
2542	NC_004663	CAT	2	6	145233	145238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345552
2543	NC_004663	GAT	2	6	145288	145293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345552
2544	NC_004663	AT	3	6	145303	145308	50 %	50 %	0 %	0 %	29345552
2545	NC_004663	GAA	2	6	145487	145492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345552
2546	NC_004663	TCAAG	2	10	145559	145568	40 %	20 %	20 %	20 %	29345552
2547	NC_004663	GTA	2	6	145595	145600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345552
2548	NC_004663	AAG	2	6	145608	145613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345552
2549	NC_004663	GATAT	2	10	145650	145659	40 %	40 %	20 %	0 %	29345552
2550	NC_004663	GAT	2	6	145660	145665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345552
2551	NC_004663	ATT	2	6	145720	145725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345552
2552	NC_004663	TAC	2	6	145735	145740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345552
2553	NC_004663	CTG	2	6	145782	145787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345552
2554	NC_004663	AGT	2	6	145858	145863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345552
2555	NC_004663	AGT	2	6	145873	145878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345552
2556	NC_004663	TA	3	6	146191	146196	50 %	50 %	0 %	0 %	29345552
2557	NC_004663	GAC	2	6	146251	146256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345552
2558	NC_004663	GTAC	2	8	146315	146322	25 %	25 %	25 %	25 %	29345552
2559	NC_004663	AGAAAA	2	12	146356	146367	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	29345552
2560	NC_004663	AAAT	2	8	146372	146379	75 %	25 %	0 %	0 %	29345552
2561	NC_004663	AT	3	6	146398	146403	50 %	50 %	0 %	0 %	29345553
2562	NC_004663	ATG	2	6	146438	146443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345553
2563	NC_004663	AGT	2	6	146450	146455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345553
2564	NC_004663	GAA	2	6	146504	146509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345553
2565	NC_004663	AAGA	2	8	146519	146526	75 %	0 %	25 %	0 %	29345553
2566	NC_004663	AAGC	2	8	146634	146641	50 %	0 %	25 %	25 %	29345553
2567	NC_004663	A	6	6	146667	146672	100 %	0 %	0 %	0 %	29345553
2568	NC_004663	TGCTT	2	10	146677	146686	0 %	60 %	20 %	20 %	29345553
2569	NC_004663	AAT	2	6	146714	146719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345553
2570	NC_004663	GTAT	2	8	146760	146767	25 %	50 %	25 %	0 %	29345553
2571	NC_004663	TGC	2	6	146770	146775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345553
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2573	NC_004663	TGC	2	6	146833	146838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345553
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2581	NC_004663	TGA	2	6	147277	147282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345553
2582	NC_004663	TG	4	8	147333	147340	0 %	50 %	50 %	0 %	29345553
2583	NC_004663	TGA	2	6	147490	147495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345553
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2588	NC_004663	GAA	2	6	148592	148597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345555
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2590	NC_004663	ACC	2	6	148752	148757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345555
2591	NC_004663	G	6	6	148775	148780	0 %	0 %	100 %	0 %	29345555
2592	NC_004663	TGAA	2	8	148876	148883	50 %	25 %	25 %	0 %	29345555
2593	NC_004663	AAAGAC	2	12	148905	148916	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	29345555
2594	NC_004663	CAC	2	6	148934	148939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345555
2595	NC_004663	ACT	2	6	148977	148982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345555
2596	NC_004663	CAGTGG	2	12	149025	149036	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29345555
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2598	NC_004663	AT	3	6	149081	149086	50 %	50 %	0 %	0 %	29345555
2599	NC_004663	GCAG	2	8	149097	149104	25 %	0 %	50 %	25 %	29345555
2600	NC_004663	TGC	2	6	149149	149154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345555
2601	NC_004663	CTA	2	6	149182	149187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345555
2602	NC_004663	ATGGG	2	10	149241	149250	20 %	20 %	60 %	0 %	29345555
2603	NC_004663	TGTC	2	8	149263	149270	0 %	50 %	25 %	25 %	29345555
2604	NC_004663	CAA	2	6	149298	149303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345555
2605	NC_004663	AAC	2	6	149323	149328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345555
2606	NC_004663	TTAC	2	8	149417	149424	25 %	50 %	0 %	25 %	29345555
2607	NC_004663	AAG	2	6	149478	149483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345555
2608	NC_004663	CAG	2	6	149488	149493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345555
2609	NC_004663	A	6	6	149674	149679	100 %	0 %	0 %	0 %	29345556
2610	NC_004663	GAA	2	6	149681	149686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345556
2611	NC_004663	GTTG	2	8	149699	149706	0 %	50 %	50 %	0 %	29345556
2612	NC_004663	ATT	2	6	149773	149778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345556
2613	NC_004663	ATG	2	6	149841	149846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345556
2614	NC_004663	CAT	2	6	149871	149876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345556
2615	NC_004663	GAAG	2	8	149897	149904	50 %	0 %	50 %	0 %	29345556
2616	NC_004663	ACAAG	2	10	149957	149966	60 %	0 %	20 %	20 %	29345556
2617	NC_004663	GAA	2	6	149976	149981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345556
2618	NC_004663	ATGATC	2	12	150031	150042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29345556
2619	NC_004663	T	6	6	150055	150060	0 %	100 %	0 %	0 %	29345556
2620	NC_004663	ACAA	2	8	150103	150110	75 %	0 %	0 %	25 %	29345556
2621	NC_004663	CAT	2	6	150218	150223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345556
2622	NC_004663	GCA	2	6	150258	150263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345556
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2624	NC_004663	CTTA	2	8	150280	150287	25 %	50 %	0 %	25 %	29345556
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2750	NC_004663	CGGA	2	8	157077	157084	25 %	0 %	50 %	25 %	29345562
2751	NC_004663	ACCG	2	8	157190	157197	25 %	0 %	25 %	50 %	29345562
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2992	NC_004663	GAA	3	9	168366	168374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345572
2993	NC_004663	GCA	2	6	168439	168444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345572
2994	NC_004663	CG	3	6	168471	168476	0 %	0 %	50 %	50 %	29345572
2995	NC_004663	GCA	2	6	168562	168567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345572
2996	NC_004663	CTTC	2	8	168585	168592	0 %	50 %	0 %	50 %	29345572
2997	NC_004663	TCC	2	6	168671	168676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345572
2998	NC_004663	CCA	2	6	168712	168717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345572
2999	NC_004663	TCT	2	6	168804	168809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345572
3000	NC_004663	TTG	2	6	168828	168833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345572

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