MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004663	GTTCC	2	10	56824	56833	0 %	40 %	20 %	40 %	29345471
1002	NC_004663	GGT	2	6	56851	56856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345471
1003	NC_004663	TCA	2	6	56946	56951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345471
1004	NC_004663	TGC	2	6	56955	56960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1005	NC_004663	TCGT	2	8	56975	56982	0 %	50 %	25 %	25 %	29345471
1006	NC_004663	G	6	6	57026	57031	0 %	0 %	100 %	0 %	29345471
1007	NC_004663	CTGC	2	8	57032	57039	0 %	25 %	25 %	50 %	29345471
1008	NC_004663	CGG	2	6	57085	57090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345471
1009	NC_004663	CGT	2	6	57154	57159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1010	NC_004663	GCA	2	6	57198	57203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1011	NC_004663	AGG	3	9	57216	57224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345471
1012	NC_004663	GTC	2	6	57229	57234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1013	NC_004663	TCA	2	6	57363	57368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345471
1014	NC_004663	TCA	2	6	57381	57386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345471
1015	NC_004663	GGC	2	6	57401	57406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345471
1016	NC_004663	AGC	2	6	57432	57437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1017	NC_004663	GGCC	2	8	57466	57473	0 %	0 %	50 %	50 %	29345471
1018	NC_004663	TCA	2	6	57546	57551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345471
1019	NC_004663	CGC	2	6	57616	57621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345471
1020	NC_004663	CTGAAG	2	12	57653	57664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	29345471
1021	NC_004663	CAG	2	6	57685	57690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1022	NC_004663	GTG	2	6	57704	57709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345471
1023	NC_004663	GAG	2	6	57710	57715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345471
1024	NC_004663	AAC	2	6	57719	57724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345471
1025	NC_004663	ATC	2	6	57749	57754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345471
1026	NC_004663	ACA	2	6	57765	57770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345471
1027	NC_004663	ACG	2	6	57798	57803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1028	NC_004663	CG	3	6	57802	57807	0 %	0 %	50 %	50 %	29345471
1029	NC_004663	GCC	2	6	57810	57815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345471
1030	NC_004663	ACC	2	6	57839	57844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345471
1031	NC_004663	CCA	2	6	57849	57854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345471
1032	NC_004663	GCA	2	6	57883	57888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1033	NC_004663	AGG	2	6	57897	57902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345471
1034	NC_004663	CGG	2	6	57926	57931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345471
1035	NC_004663	GAG	2	6	57932	57937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345471
1036	NC_004663	ACA	2	6	57963	57968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345471
1037	NC_004663	CG	3	6	57970	57975	0 %	0 %	50 %	50 %	29345471
1038	NC_004663	GGAC	2	8	57991	57998	25 %	0 %	50 %	25 %	29345471
1039	NC_004663	CTG	2	6	58034	58039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1040	NC_004663	TCG	2	6	58050	58055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1041	NC_004663	GTG	2	6	58073	58078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345471
1042	NC_004663	TTCCT	2	10	58146	58155	0 %	60 %	0 %	40 %	29345471
1043	NC_004663	AGG	2	6	58176	58181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345471
1044	NC_004663	A	6	6	58271	58276	100 %	0 %	0 %	0 %	29345471
1045	NC_004663	GTC	2	6	58292	58297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
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1047	NC_004663	TGG	2	6	58389	58394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345471
1048	NC_004663	GCC	2	6	58422	58427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345471
1049	NC_004663	CGA	2	6	58468	58473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345471
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1052	NC_004663	CAT	2	6	58528	58533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345471
1053	NC_004663	GCT	2	6	58567	58572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1054	NC_004663	TGG	2	6	58596	58601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345471
1055	NC_004663	CAT	2	6	58627	58632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345471
1056	NC_004663	GTG	2	6	58706	58711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345471
1057	NC_004663	GCCG	2	8	58715	58722	0 %	0 %	50 %	50 %	29345471
1058	NC_004663	CCG	2	6	58729	58734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345471
1059	NC_004663	CTG	2	6	58736	58741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345471
1060	NC_004663	GGA	2	6	58750	58755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345471
1061	NC_004663	CCG	2	6	58816	58821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345471
1062	NC_004663	TGC	2	6	59078	59083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345472
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1064	NC_004663	GGAA	2	8	59227	59234	50 %	0 %	50 %	0 %	29345473
1065	NC_004663	CTA	2	6	59247	59252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345473
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1067	NC_004663	ATA	2	6	59346	59351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345473
1068	NC_004663	TGAA	2	8	59374	59381	50 %	25 %	25 %	0 %	29345474
1069	NC_004663	CTTG	2	8	59410	59417	0 %	50 %	25 %	25 %	29345474
1070	NC_004663	CAC	2	6	59508	59513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345474
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1072	NC_004663	TCT	2	6	59605	59610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345474
1073	NC_004663	CATCTA	2	12	59619	59630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345474
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1075	NC_004663	GACA	2	8	59839	59846	50 %	0 %	25 %	25 %	29345474
1076	NC_004663	CCA	2	6	59855	59860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345474
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1079	NC_004663	TGA	2	6	59924	59929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345474
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1082	NC_004663	TACG	2	8	60105	60112	25 %	25 %	25 %	25 %	29345474
1083	NC_004663	CGA	2	6	60141	60146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345474
1084	NC_004663	CGAT	2	8	60164	60171	25 %	25 %	25 %	25 %	29345474
1085	NC_004663	GGGT	2	8	60200	60207	0 %	25 %	75 %	0 %	29345474
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1091	NC_004663	CCT	2	6	60593	60598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345474
1092	NC_004663	GGC	2	6	60607	60612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345474
1093	NC_004663	ACA	2	6	60665	60670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345474
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1095	NC_004663	ACC	2	6	60877	60882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345474
1096	NC_004663	ACG	2	6	60926	60931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345474
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1098	NC_004663	TAT	2	6	61012	61017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345474
1099	NC_004663	TAA	2	6	61044	61049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345474
1100	NC_004663	TCGGCT	2	12	61066	61077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345474
1101	NC_004663	ATC	2	6	61096	61101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345474
1102	NC_004663	A	7	7	61125	61131	100 %	0 %	0 %	0 %	29345474
1103	NC_004663	ATA	2	6	61229	61234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345474
1104	NC_004663	GCG	2	6	61262	61267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345474
1105	NC_004663	AAC	2	6	61333	61338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345474
1106	NC_004663	CAA	4	12	61350	61361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345474
1107	NC_004663	CGCC	2	8	61476	61483	0 %	0 %	25 %	75 %	29345474
1108	NC_004663	GGT	2	6	61534	61539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345474
1109	NC_004663	GA	3	6	61808	61813	50 %	0 %	50 %	0 %	29345475
1110	NC_004663	ACCA	2	8	61882	61889	50 %	0 %	0 %	50 %	29345475
1111	NC_004663	CCT	2	6	61913	61918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345475
1112	NC_004663	CTA	2	6	61959	61964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345475
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1114	NC_004663	C	6	6	62078	62083	0 %	0 %	0 %	100 %	29345475
1115	NC_004663	CTT	2	6	62127	62132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345475
1116	NC_004663	GCT	2	6	62178	62183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345475
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1118	NC_004663	CGG	3	9	62217	62225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345475
1119	NC_004663	ATGGA	2	10	62293	62302	40 %	20 %	40 %	0 %	29345475
1120	NC_004663	CAT	2	6	62412	62417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345475
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1125	NC_004663	GCCG	2	8	62731	62738	0 %	0 %	50 %	50 %	29345475
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1127	NC_004663	AAG	2	6	62819	62824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345475
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1252	NC_004663	ATGG	2	8	72433	72440	25 %	25 %	50 %	0 %	29345485
1253	NC_004663	AGA	2	6	72459	72464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345485
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