MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

< Previous12...213214215216217218219220221222223224225Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
112001	NC_004663	CT	3	6	6253370	6253375	0 %	50 %	0 %	50 %	29350178
112002	NC_004663	GGCA	2	8	6253380	6253387	25 %	0 %	50 %	25 %	29350178
112003	NC_004663	TTC	2	6	6253456	6253461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29350178
112004	NC_004663	CT	3	6	6253489	6253494	0 %	50 %	0 %	50 %	29350178
112005	NC_004663	TGG	2	6	6253511	6253516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29350178
112006	NC_004663	A	6	6	6253567	6253572	100 %	0 %	0 %	0 %	29350178
112007	NC_004663	GTG	2	6	6253576	6253581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29350178
112008	NC_004663	CAGCGG	2	12	6253611	6253622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29350178
112009	NC_004663	ACCA	2	8	6253636	6253643	50 %	0 %	0 %	50 %	29350178
112010	NC_004663	CTG	2	6	6253681	6253686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350178
112011	NC_004663	AGA	2	6	6253733	6253738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350178
112012	NC_004663	ATTT	2	8	6253756	6253763	25 %	75 %	0 %	0 %	29350178
112013	NC_004663	TACA	2	8	6253764	6253771	50 %	25 %	0 %	25 %	29350178
112014	NC_004663	TTTC	2	8	6253787	6253794	0 %	75 %	0 %	25 %	29350178
112015	NC_004663	GGA	2	6	6253809	6253814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29350178
112016	NC_004663	GGA	2	6	6253878	6253883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29350178
112017	NC_004663	AGA	2	6	6253952	6253957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350178
112018	NC_004663	AAGG	2	8	6254001	6254008	50 %	0 %	50 %	0 %	29350178
112019	NC_004663	TTA	2	6	6254088	6254093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29350178
112020	NC_004663	CTG	2	6	6254116	6254121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350178
112021	NC_004663	TGT	2	6	6254178	6254183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29350178
112022	NC_004663	AATCC	2	10	6254191	6254200	40 %	20 %	0 %	40 %	29350178
112023	NC_004663	CAT	2	6	6254217	6254222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350178
112024	NC_004663	TAAA	2	8	6254240	6254247	75 %	25 %	0 %	0 %	29350178
112025	NC_004663	GAT	2	6	6254274	6254279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350178
112026	NC_004663	AAGG	2	8	6254311	6254318	50 %	0 %	50 %	0 %	29350178
112027	NC_004663	GAT	2	6	6254398	6254403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350178
112028	NC_004663	CAA	2	6	6254439	6254444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29350178
112029	NC_004663	ACC	2	6	6254665	6254670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29350178
112030	NC_004663	AAC	2	6	6254741	6254746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29350178
112031	NC_004663	TGAA	2	8	6254930	6254937	50 %	25 %	25 %	0 %	29350179
112032	NC_004663	AAGG	2	8	6254939	6254946	50 %	0 %	50 %	0 %	29350179
112033	NC_004663	GACG	2	8	6254983	6254990	25 %	0 %	50 %	25 %	29350179
112034	NC_004663	GAC	2	6	6255068	6255073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350179
112035	NC_004663	TGA	2	6	6255166	6255171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350179
112036	NC_004663	TACT	2	8	6255186	6255193	25 %	50 %	0 %	25 %	29350179
112037	NC_004663	AAAG	2	8	6255194	6255201	75 %	0 %	25 %	0 %	29350179
112038	NC_004663	CTG	2	6	6255246	6255251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350180
112039	NC_004663	GAT	2	6	6255530	6255535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350181
112040	NC_004663	GAA	2	6	6255558	6255563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350181
112041	NC_004663	GAA	2	6	6255600	6255605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350181
112042	NC_004663	AGC	2	6	6255606	6255611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350181
112043	NC_004663	CTG	3	9	6255615	6255623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350181
112044	NC_004663	GAAG	2	8	6255629	6255636	50 %	0 %	50 %	0 %	29350181
112045	NC_004663	CAT	2	6	6255683	6255688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350181
112046	NC_004663	GCA	2	6	6255772	6255777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350181
112047	NC_004663	AGA	2	6	6255778	6255783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350181
112048	NC_004663	AC	3	6	6255819	6255824	50 %	0 %	0 %	50 %	29350181
112049	NC_004663	TGC	2	6	6255911	6255916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350182
112050	NC_004663	ATG	2	6	6255934	6255939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350182
112051	NC_004663	CAT	2	6	6256089	6256094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350182
112052	NC_004663	TTC	2	6	6256096	6256101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29350182
112053	NC_004663	TGG	2	6	6256166	6256171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29350182
112054	NC_004663	CAG	2	6	6256174	6256179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350182
112055	NC_004663	GAA	2	6	6256191	6256196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350182
112056	NC_004663	TGC	2	6	6256235	6256240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350182
112057	NC_004663	TGA	2	6	6256269	6256274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350182
112058	NC_004663	GAT	2	6	6256329	6256334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350182
112059	NC_004663	CTG	2	6	6256399	6256404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350182
112060	NC_004663	CTT	2	6	6256410	6256415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29350182
112061	NC_004663	GCT	2	6	6256428	6256433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350182
112062	NC_004663	TTC	2	6	6256453	6256458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29350182
112063	NC_004663	TGTCC	2	10	6256464	6256473	0 %	40 %	20 %	40 %	29350182
112064	NC_004663	CAC	2	6	6256530	6256535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29350182
112065	NC_004663	GCA	2	6	6256626	6256631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350182
112066	NC_004663	GT	3	6	6256682	6256687	0 %	50 %	50 %	0 %	29350182
112067	NC_004663	ATC	2	6	6256711	6256716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350182
112068	NC_004663	ATT	2	6	6256750	6256755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29350182
112069	NC_004663	CAGG	2	8	6256756	6256763	25 %	0 %	50 %	25 %	29350182
112070	NC_004663	GCG	2	6	6256822	6256827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350182
112071	NC_004663	A	6	6	6256932	6256937	100 %	0 %	0 %	0 %	29350183
112072	NC_004663	GCA	2	6	6257112	6257117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350184
112073	NC_004663	TAC	2	6	6257251	6257256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350184
112074	NC_004663	GAT	2	6	6257289	6257294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350184
112075	NC_004663	GCA	2	6	6257382	6257387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350184
112076	NC_004663	CAT	2	6	6257388	6257393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350184
112077	NC_004663	AGC	2	6	6257401	6257406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350184
112078	NC_004663	CAC	2	6	6257427	6257432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29350184
112079	NC_004663	ACA	2	6	6257462	6257467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29350184
112080	NC_004663	AG	3	6	6257487	6257492	50 %	0 %	50 %	0 %	29350184
112081	NC_004663	CAT	2	6	6257499	6257504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350184
112082	NC_004663	A	6	6	6257545	6257550	100 %	0 %	0 %	0 %	29350185
112083	NC_004663	AT	3	6	6257584	6257589	50 %	50 %	0 %	0 %	29350185
112084	NC_004663	GCA	2	6	6257629	6257634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350185
112085	NC_004663	ATC	2	6	6257642	6257647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350185
112086	NC_004663	CGC	2	6	6257668	6257673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29350185
112087	NC_004663	GACA	2	8	6257710	6257717	50 %	0 %	25 %	25 %	29350185
112088	NC_004663	A	6	6	6257785	6257790	100 %	0 %	0 %	0 %	29350185
112089	NC_004663	AAGA	2	8	6257817	6257824	75 %	0 %	25 %	0 %	29350185
112090	NC_004663	GAA	2	6	6257873	6257878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350186
112091	NC_004663	GTG	2	6	6257919	6257924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29350186
112092	NC_004663	AC	3	6	6257977	6257982	50 %	0 %	0 %	50 %	29350186
112093	NC_004663	ACG	2	6	6258015	6258020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29350186
112094	NC_004663	GAA	2	6	6258078	6258083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350186
112095	NC_004663	GAA	2	6	6258086	6258091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350186
112096	NC_004663	GCAG	2	8	6258094	6258101	25 %	0 %	50 %	25 %	29350186
112097	NC_004663	ACGG	2	8	6258156	6258163	25 %	0 %	50 %	25 %	29350186
112098	NC_004663	GAA	2	6	6258174	6258179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350186
112099	NC_004663	GGC	2	6	6258383	6258388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350186
112100	NC_004663	GAA	2	6	6258422	6258427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350186
112101	NC_004663	GCC	2	6	6258465	6258470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29350186
112102	NC_004663	GCG	2	6	6258571	6258576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350186
112103	NC_004663	A	6	6	6258624	6258629	100 %	0 %	0 %	0 %	29350186
112104	NC_004663	ACC	2	6	6258633	6258638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29350186
112105	NC_004663	GTGG	2	8	6258678	6258685	0 %	25 %	75 %	0 %	29350187
112106	NC_004663	AG	3	6	6258767	6258772	50 %	0 %	50 %	0 %	29350187
112107	NC_004663	CGG	2	6	6258773	6258778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350187
112108	NC_004663	GAAG	2	8	6258866	6258873	50 %	0 %	50 %	0 %	29350187
112109	NC_004663	CCG	2	6	6258874	6258879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29350187
112110	NC_004663	CGCA	2	8	6258917	6258924	25 %	0 %	25 %	50 %	29350187
112111	NC_004663	CAA	2	6	6258933	6258938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29350187
112112	NC_004663	GGC	2	6	6258969	6258974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350187
112113	NC_004663	TTA	2	6	6259041	6259046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29350187
112114	NC_004663	A	6	6	6259053	6259058	100 %	0 %	0 %	0 %	29350187
112115	NC_004663	ATT	2	6	6259081	6259086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29350188
112116	NC_004663	ACCA	2	8	6259159	6259166	50 %	0 %	0 %	50 %	29350188
112117	NC_004663	CAT	2	6	6259263	6259268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29350188
112118	NC_004663	GTA	2	6	6259297	6259302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29350188
112119	NC_004663	GGC	2	6	6259311	6259316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350188
112120	NC_004663	GTT	2	6	6259367	6259372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29350188
112121	NC_004663	CGG	2	6	6259500	6259505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350188
112122	NC_004663	TGG	2	6	6259517	6259522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29350188
112123	NC_004663	AAG	2	6	6259549	6259554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350188
112124	NC_004663	AAG	2	6	6259585	6259590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29350188
112125	NC_004663	AAT	2	6	6259627	6259632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29350188
112126	NC_004663	CTG	2	6	6259636	6259641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350188
112127	NC_004663	AT	3	6	6259673	6259678	50 %	50 %	0 %	0 %	29350188
112128	NC_004663	GTG	2	6	6259708	6259713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29350188
112129	NC_004663	TGC	2	6	6259826	6259831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29350188
112130	NC_004663	GTG	2	6	6259864	6259869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29350188
112131	NC_004663	GGC	2	6	6259932	6259937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29350188
112132	NC_004663	ATA	2	6	6259965	6259970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29350188

< Previous12...213214215216217218219220221222223224225Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.