MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004663	TG	3	6	29714	29719	0 %	50 %	50 %	0 %	29345443
502	NC_004663	ACT	2	6	29722	29727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345443
503	NC_004663	TGA	2	6	29781	29786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345443
504	NC_004663	TG	3	6	29794	29799	0 %	50 %	50 %	0 %	29345443
505	NC_004663	AGAC	2	8	29807	29814	50 %	0 %	25 %	25 %	29345443
506	NC_004663	TCA	2	6	29830	29835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345443
507	NC_004663	TCAT	2	8	29902	29909	25 %	50 %	0 %	25 %	29345443
508	NC_004663	AGT	2	6	29922	29927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345443
509	NC_004663	ATTGA	2	10	29941	29950	40 %	40 %	20 %	0 %	29345443
510	NC_004663	TCT	2	6	30293	30298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345444
511	NC_004663	GTT	2	6	30421	30426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345444
512	NC_004663	GTT	2	6	30811	30816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345444
513	NC_004663	ATTC	2	8	30845	30852	25 %	50 %	0 %	25 %	29345444
514	NC_004663	GAA	2	6	30931	30936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345444
515	NC_004663	CAA	2	6	31048	31053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345444
516	NC_004663	AGAT	2	8	31059	31066	50 %	25 %	25 %	0 %	29345444
517	NC_004663	CAA	3	9	31142	31150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345444
518	NC_004663	AAT	2	6	31199	31204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345444
519	NC_004663	TA	3	6	31232	31237	50 %	50 %	0 %	0 %	29345444
520	NC_004663	CTTC	2	8	31242	31249	0 %	50 %	0 %	50 %	29345444
521	NC_004663	GCC	2	6	31265	31270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345444
522	NC_004663	GGAA	2	8	31333	31340	50 %	0 %	50 %	0 %	29345444
523	NC_004663	ACA	2	6	31357	31362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345444
524	NC_004663	ATAC	2	8	31427	31434	50 %	25 %	0 %	25 %	29345444
525	NC_004663	GAAAA	2	10	31466	31475	80 %	0 %	20 %	0 %	29345444
526	NC_004663	AAAG	2	8	31476	31483	75 %	0 %	25 %	0 %	29345444
527	NC_004663	GCA	2	6	31484	31489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345444
528	NC_004663	AAAAT	2	10	31942	31951	80 %	20 %	0 %	0 %	29345445
529	NC_004663	TCAC	2	8	31957	31964	25 %	25 %	0 %	50 %	29345445
530	NC_004663	T	6	6	32042	32047	0 %	100 %	0 %	0 %	29345445
531	NC_004663	T	7	7	32108	32114	0 %	100 %	0 %	0 %	29345445
532	NC_004663	ATT	2	6	32115	32120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345445
533	NC_004663	TCA	2	6	32123	32128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345445
534	NC_004663	ATTCC	2	10	32132	32141	20 %	40 %	0 %	40 %	29345445
535	NC_004663	TTA	2	6	32374	32379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345446
536	NC_004663	CCG	2	6	32436	32441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345446
537	NC_004663	TCG	2	6	32466	32471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345446
538	NC_004663	TCCG	2	8	32476	32483	0 %	25 %	25 %	50 %	29345446
539	NC_004663	CTG	2	6	32510	32515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345446
540	NC_004663	GGA	2	6	32530	32535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345446
541	NC_004663	ATC	2	6	32555	32560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345446
542	NC_004663	G	6	6	32580	32585	0 %	0 %	100 %	0 %	29345446
543	NC_004663	CGA	2	6	32596	32601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345446
544	NC_004663	CGG	2	6	32620	32625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345446
545	NC_004663	GA	3	6	32752	32757	50 %	0 %	50 %	0 %	29345446
546	NC_004663	CGA	2	6	32767	32772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345446
547	NC_004663	CGGG	2	8	32817	32824	0 %	0 %	75 %	25 %	29345446
548	NC_004663	GCGG	2	8	32863	32870	0 %	0 %	75 %	25 %	29345446
549	NC_004663	TA	3	6	32871	32876	50 %	50 %	0 %	0 %	29345446
550	NC_004663	CCGTG	2	10	32878	32887	0 %	20 %	40 %	40 %	29345446
551	NC_004663	AAG	2	6	33098	33103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345446
552	NC_004663	AAC	2	6	33110	33115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345446
553	NC_004663	CGG	2	6	33131	33136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345446
554	NC_004663	CAG	2	6	33149	33154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345446
555	NC_004663	TGCA	2	8	33176	33183	25 %	25 %	25 %	25 %	29345446
556	NC_004663	ACA	2	6	33201	33206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345446
557	NC_004663	CTT	2	6	33224	33229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345446
558	NC_004663	AT	3	6	33268	33273	50 %	50 %	0 %	0 %	29345446
559	NC_004663	GGAA	2	8	33315	33322	50 %	0 %	50 %	0 %	29345446
560	NC_004663	GTCC	2	8	33331	33338	0 %	25 %	25 %	50 %	29345446
561	NC_004663	GC	3	6	33356	33361	0 %	0 %	50 %	50 %	29345446
562	NC_004663	ACA	2	6	33440	33445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345446
563	NC_004663	CCA	2	6	33477	33482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345446
564	NC_004663	ATA	2	6	33523	33528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345446
565	NC_004663	CGA	2	6	34082	34087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345447
566	NC_004663	G	6	6	34125	34130	0 %	0 %	100 %	0 %	29345447
567	NC_004663	CAT	2	6	34225	34230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345447
568	NC_004663	AAAG	2	8	34326	34333	75 %	0 %	25 %	0 %	29345447
569	NC_004663	GCC	2	6	34456	34461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345447
570	NC_004663	ATT	3	9	34544	34552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345447
571	NC_004663	TC	3	6	34622	34627	0 %	50 %	0 %	50 %	29345447
572	NC_004663	GGA	2	6	34654	34659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345447
573	NC_004663	AT	3	6	34681	34686	50 %	50 %	0 %	0 %	29345447
574	NC_004663	GGA	2	6	34727	34732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345447
575	NC_004663	AGC	2	6	34733	34738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345447
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577	NC_004663	ATC	2	6	34755	34760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345447
578	NC_004663	T	7	7	34803	34809	0 %	100 %	0 %	0 %	29345447
579	NC_004663	A	6	6	34890	34895	100 %	0 %	0 %	0 %	29345447
580	NC_004663	TGA	2	6	34902	34907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345447
581	NC_004663	TTC	2	6	34924	34929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345447
582	NC_004663	GAA	2	6	34936	34941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345447
583	NC_004663	TA	3	6	34962	34967	50 %	50 %	0 %	0 %	29345447
584	NC_004663	ATG	2	6	34999	35004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345447
585	NC_004663	ATA	2	6	35005	35010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345447
586	NC_004663	AT	3	6	35057	35062	50 %	50 %	0 %	0 %	29345447
587	NC_004663	AAGA	2	8	35503	35510	75 %	0 %	25 %	0 %	29345448
588	NC_004663	AGT	2	6	35583	35588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345448
589	NC_004663	TTGCCA	2	12	36062	36073	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29345449
590	NC_004663	ATC	2	6	36200	36205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345449
591	NC_004663	GAA	3	9	36208	36216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345449
592	NC_004663	TGA	2	6	36270	36275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345449
593	NC_004663	CTAT	2	8	36308	36315	25 %	50 %	0 %	25 %	29345449
594	NC_004663	GAT	2	6	36318	36323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345449
595	NC_004663	TGAA	2	8	36353	36360	50 %	25 %	25 %	0 %	29345449
596	NC_004663	TAA	2	6	36415	36420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345449
597	NC_004663	CA	3	6	36483	36488	50 %	0 %	0 %	50 %	29345450
598	NC_004663	AT	3	6	36616	36621	50 %	50 %	0 %	0 %	29345450
599	NC_004663	TGT	2	6	36624	36629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345450
600	NC_004663	TCC	3	9	36661	36669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345450
601	NC_004663	TTC	2	6	36742	36747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345450
602	NC_004663	CAT	2	6	36765	36770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345450
603	NC_004663	AGT	2	6	36783	36788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345450
604	NC_004663	GCG	2	6	36793	36798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345450
605	NC_004663	GCA	2	6	36859	36864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345450
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607	NC_004663	TGG	2	6	37001	37006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345450
608	NC_004663	TAT	2	6	37105	37110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345450
609	NC_004663	GTTC	2	8	37178	37185	0 %	50 %	25 %	25 %	29345450
610	NC_004663	CCG	2	6	37211	37216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345450
611	NC_004663	TTG	2	6	37219	37224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345450
612	NC_004663	GCC	2	6	37279	37284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345450
613	NC_004663	TGC	2	6	37308	37313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345450
614	NC_004663	TTG	2	6	37465	37470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345450
615	NC_004663	TGC	2	6	37544	37549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345450
616	NC_004663	CGG	2	6	37632	37637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345450
617	NC_004663	TGA	3	9	37643	37651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345450
618	NC_004663	TTG	2	6	37668	37673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345450
619	NC_004663	TGG	3	9	37706	37714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345450
620	NC_004663	TGC	2	6	37732	37737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345450
621	NC_004663	T	7	7	37754	37760	0 %	100 %	0 %	0 %	29345450
622	NC_004663	AT	3	6	37791	37796	50 %	50 %	0 %	0 %	29345450
623	NC_004663	ATGT	2	8	37802	37809	25 %	50 %	25 %	0 %	29345450
624	NC_004663	GT	4	8	37900	37907	0 %	50 %	50 %	0 %	29345450
625	NC_004663	GT	4	8	37913	37920	0 %	50 %	50 %	0 %	29345450
626	NC_004663	CG	3	6	37966	37971	0 %	0 %	50 %	50 %	29345450
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628	NC_004663	TG	3	6	38061	38066	0 %	50 %	50 %	0 %	29345451
629	NC_004663	AAGG	2	8	38106	38113	50 %	0 %	50 %	0 %	29345451
630	NC_004663	ATTG	2	8	38148	38155	25 %	50 %	25 %	0 %	29345451
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