MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004663	TGTTCT	2	12	253086	253097	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29345642
4502	NC_004663	TCA	2	6	253153	253158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345642
4503	NC_004663	GAT	2	6	253223	253228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345642
4504	NC_004663	TA	3	6	253265	253270	50 %	50 %	0 %	0 %	29345642
4505	NC_004663	AG	3	6	253284	253289	50 %	0 %	50 %	0 %	29345642
4506	NC_004663	CAA	2	6	253309	253314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345642
4507	NC_004663	T	7	7	253344	253350	0 %	100 %	0 %	0 %	29345642
4508	NC_004663	ATT	2	6	253356	253361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345642
4509	NC_004663	CTT	2	6	253727	253732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345643
4510	NC_004663	TGT	2	6	253793	253798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345643
4511	NC_004663	TCT	2	6	254056	254061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345643
4512	NC_004663	GTG	2	6	254070	254075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345643
4513	NC_004663	ACAT	2	8	254076	254083	50 %	25 %	0 %	25 %	29345643
4514	NC_004663	TCC	2	6	254112	254117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345643
4515	NC_004663	AAGG	2	8	254168	254175	50 %	0 %	50 %	0 %	29345643
4516	NC_004663	GAGCA	2	10	254191	254200	40 %	0 %	40 %	20 %	29345643
4517	NC_004663	AGT	2	6	254350	254355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345643
4518	NC_004663	GCT	2	6	254358	254363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345643
4519	NC_004663	CAG	2	6	254411	254416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345643
4520	NC_004663	CTTGC	2	10	254468	254477	0 %	40 %	20 %	40 %	29345643
4521	NC_004663	TGC	2	6	254505	254510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345643
4522	NC_004663	TTC	2	6	254520	254525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345643
4523	NC_004663	GAA	2	6	254582	254587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345643
4524	NC_004663	AGGTTG	2	12	254652	254663	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	29345643
4525	NC_004663	TTC	2	6	254682	254687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345643
4526	NC_004663	TAGATG	2	12	254697	254708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345643
4527	NC_004663	ATA	2	6	254762	254767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345643
4528	NC_004663	ATA	2	6	254774	254779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345643
4529	NC_004663	GTCC	2	8	254791	254798	0 %	25 %	25 %	50 %	29345643
4530	NC_004663	AGC	2	6	254986	254991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345644
4531	NC_004663	AT	3	6	255109	255114	50 %	50 %	0 %	0 %	29345644
4532	NC_004663	CTG	2	6	255115	255120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345644
4533	NC_004663	TTC	2	6	255175	255180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345644
4534	NC_004663	CAT	2	6	255291	255296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345644
4535	NC_004663	GAA	2	6	255343	255348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345644
4536	NC_004663	TCA	2	6	255350	255355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345644
4537	NC_004663	CTT	2	6	255439	255444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345644
4538	NC_004663	AAT	2	6	255477	255482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345644
4539	NC_004663	CAT	2	6	255492	255497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345644
4540	NC_004663	TTG	2	6	255513	255518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345644
4541	NC_004663	CTTGCT	2	12	255565	255576	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	29345644
4542	NC_004663	TCT	2	6	255615	255620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345644
4543	NC_004663	CTG	2	6	255650	255655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345644
4544	NC_004663	CTG	2	6	255802	255807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345644
4545	NC_004663	TTC	2	6	255812	255817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345644
4546	NC_004663	TATT	2	8	256392	256399	25 %	75 %	0 %	0 %	29345645
4547	NC_004663	GAA	2	6	256445	256450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345645
4548	NC_004663	TGT	2	6	256452	256457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345645
4549	NC_004663	AGT	2	6	256474	256479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345645
4550	NC_004663	TCA	2	6	256502	256507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345645
4551	NC_004663	T	6	6	256523	256528	0 %	100 %	0 %	0 %	29345645
4552	NC_004663	ATA	2	6	256590	256595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345645
4553	NC_004663	TTAC	2	8	256620	256627	25 %	50 %	0 %	25 %	29345645
4554	NC_004663	AGT	2	6	256702	256707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345645
4555	NC_004663	TGC	2	6	256848	256853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345645
4556	NC_004663	TTC	2	6	256856	256861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345645
4557	NC_004663	GAA	2	6	256888	256893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345645
4558	NC_004663	ACA	2	6	256933	256938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345645
4559	NC_004663	GTG	2	6	256940	256945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345645
4560	NC_004663	TCC	2	6	256951	256956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345645
4561	NC_004663	GAA	2	6	256991	256996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345645
4562	NC_004663	AT	3	6	257014	257019	50 %	50 %	0 %	0 %	29345645
4563	NC_004663	GGA	2	6	257047	257052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345645
4564	NC_004663	AT	3	6	257063	257068	50 %	50 %	0 %	0 %	29345645
4565	NC_004663	AGG	2	6	257112	257117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345645
4566	NC_004663	AGAT	2	8	257151	257158	50 %	25 %	25 %	0 %	29345645
4567	NC_004663	ATCT	2	8	257221	257228	25 %	50 %	0 %	25 %	29345645
4568	NC_004663	ATG	2	6	257298	257303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345645
4569	NC_004663	TTTGA	2	10	257339	257348	20 %	60 %	20 %	0 %	29345645
4570	NC_004663	TCGT	2	8	257394	257401	0 %	50 %	25 %	25 %	29345645
4571	NC_004663	ACG	2	6	257419	257424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345645
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4573	NC_004663	CTGGAA	2	12	257432	257443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	29345645
4574	NC_004663	ATT	2	6	257493	257498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345645
4575	NC_004663	TATT	2	8	257775	257782	25 %	75 %	0 %	0 %	29345646
4576	NC_004663	TCA	2	6	257794	257799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345646
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4578	NC_004663	GGC	2	6	257862	257867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345646
4579	NC_004663	GAG	2	6	257875	257880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345646
4580	NC_004663	TCC	2	6	257979	257984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345646
4581	NC_004663	TAT	2	6	257987	257992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345646
4582	NC_004663	TA	3	6	258059	258064	50 %	50 %	0 %	0 %	29345646
4583	NC_004663	CTTC	2	8	258110	258117	0 %	50 %	0 %	50 %	29345646
4584	NC_004663	GTA	2	6	258136	258141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345646
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4586	NC_004663	AGTC	2	8	258195	258202	25 %	25 %	25 %	25 %	29345646
4587	NC_004663	GATA	2	8	258224	258231	50 %	25 %	25 %	0 %	29345646
4588	NC_004663	CAT	2	6	258258	258263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345646
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4590	NC_004663	ATGGCA	2	12	258316	258327	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	29345646
4591	NC_004663	TA	3	6	258389	258394	50 %	50 %	0 %	0 %	29345646
4592	NC_004663	T	6	6	258402	258407	0 %	100 %	0 %	0 %	29345646
4593	NC_004663	GTT	2	6	258524	258529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345646
4594	NC_004663	GCA	2	6	258557	258562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345646
4595	NC_004663	GGGAA	2	10	258592	258601	40 %	0 %	60 %	0 %	29345646
4596	NC_004663	T	6	6	258667	258672	0 %	100 %	0 %	0 %	29345646
4597	NC_004663	TGT	2	6	258696	258701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345646
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4599	NC_004663	ATC	2	6	258825	258830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345646
4600	NC_004663	TTC	2	6	258858	258863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345646
4601	NC_004663	TTG	2	6	258864	258869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345646
4602	NC_004663	TACT	2	8	258955	258962	25 %	50 %	0 %	25 %	29345646
4603	NC_004663	AT	3	6	259090	259095	50 %	50 %	0 %	0 %	29345646
4604	NC_004663	T	6	6	259173	259178	0 %	100 %	0 %	0 %	29345646
4605	NC_004663	AGA	2	6	259314	259319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345646
4606	NC_004663	G	6	6	259320	259325	0 %	0 %	100 %	0 %	29345646
4607	NC_004663	ATA	2	6	259371	259376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345646
4608	NC_004663	TCC	2	6	259383	259388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345646
4609	NC_004663	AAT	2	6	259487	259492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345646
4610	NC_004663	T	6	6	259515	259520	0 %	100 %	0 %	0 %	29345646
4611	NC_004663	TGT	2	6	259657	259662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345646
4612	NC_004663	ATG	2	6	259683	259688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345646
4613	NC_004663	AGA	2	6	259710	259715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345646
4614	NC_004663	ACA	2	6	259750	259755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345646
4615	NC_004663	AG	3	6	259765	259770	50 %	0 %	50 %	0 %	29345646
4616	NC_004663	TA	3	6	259784	259789	50 %	50 %	0 %	0 %	29345646
4617	NC_004663	TCATT	2	10	259949	259958	20 %	60 %	0 %	20 %	29345647
4618	NC_004663	GTT	2	6	260037	260042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345647
4619	NC_004663	CAC	2	6	260057	260062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345647
4620	NC_004663	ACC	2	6	260139	260144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29345647
4621	NC_004663	TCTT	2	8	260212	260219	0 %	75 %	0 %	25 %	29345647
4622	NC_004663	TGT	3	9	260295	260303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345647
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4624	NC_004663	GAGCA	2	10	260442	260451	40 %	0 %	40 %	20 %	29345647
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4741	NC_004663	ATACA	2	10	266769	266778	60 %	20 %	0 %	20 %	29345652
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4998	NC_004663	AG	3	6	280287	280292	50 %	0 %	50 %	0 %	29345662
4999	NC_004663	CTG	2	6	280414	280419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345662
5000	NC_004663	ACG	2	6	280455	280460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345662

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