MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM400

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004604	CT	3	6	217	222	0 %	50 %	0 %	50 %	294663010
2	NC_004604	CT	3	6	249	254	0 %	50 %	0 %	50 %	294663010
3	NC_004604	CA	3	6	1050	1055	50 %	0 %	0 %	50 %	294663012
4	NC_004604	AT	3	6	4324	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	294663014
5	NC_004604	TA	3	6	4490	4495	50 %	50 %	0 %	0 %	294663014
6	NC_004604	AG	3	6	4535	4540	50 %	0 %	50 %	0 %	294663014
7	NC_004604	TA	3	6	5523	5528	50 %	50 %	0 %	0 %	28894864
8	NC_004604	AG	4	8	5681	5688	50 %	0 %	50 %	0 %	28894864
9	NC_004604	AT	3	6	6764	6769	50 %	50 %	0 %	0 %	294663015
10	NC_004604	GA	3	6	7156	7161	50 %	0 %	50 %	0 %	28894865
11	NC_004604	GT	3	6	8346	8351	0 %	50 %	50 %	0 %	294663017
12	NC_004604	GA	4	8	8548	8555	50 %	0 %	50 %	0 %	294663017
13	NC_004604	TC	3	6	8953	8958	0 %	50 %	0 %	50 %	294663017
14	NC_004604	AT	3	6	10811	10816	50 %	50 %	0 %	0 %	28894862
15	NC_004604	GT	3	6	11321	11326	0 %	50 %	50 %	0 %	28894867
16	NC_004604	AT	3	6	11935	11940	50 %	50 %	0 %	0 %	294663018
17	NC_004604	TG	3	6	12759	12764	0 %	50 %	50 %	0 %	28894869
18	NC_004604	GT	3	6	12937	12942	0 %	50 %	50 %	0 %	28894869
19	NC_004604	AT	3	6	13146	13151	50 %	50 %	0 %	0 %	28894869
20	NC_004604	TA	3	6	13220	13225	50 %	50 %	0 %	0 %	28894869
21	NC_004604	TA	3	6	13992	13997	50 %	50 %	0 %	0 %	28894905
22	NC_004604	AT	3	6	14924	14929	50 %	50 %	0 %	0 %	294663019
23	NC_004604	AG	3	6	15274	15279	50 %	0 %	50 %	0 %	294663019
24	NC_004604	CA	3	6	15789	15794	50 %	0 %	0 %	50 %	28894871
25	NC_004604	AT	3	6	16085	16090	50 %	50 %	0 %	0 %	28894871
26	NC_004604	AT	3	6	17227	17232	50 %	50 %	0 %	0 %	294663020
27	NC_004604	AC	3	6	17618	17623	50 %	0 %	0 %	50 %	294663021
28	NC_004604	TC	3	6	17832	17837	0 %	50 %	0 %	50 %	294663022
29	NC_004604	TA	3	6	17856	17861	50 %	50 %	0 %	0 %	294663022
30	NC_004604	CT	4	8	17974	17981	0 %	50 %	0 %	50 %	294663022
31	NC_004604	CT	3	6	18666	18671	0 %	50 %	0 %	50 %	294663022
32	NC_004604	GC	3	6	18707	18712	0 %	0 %	50 %	50 %	294663022
33	NC_004604	AG	3	6	19449	19454	50 %	0 %	50 %	0 %	294663022
34	NC_004604	GA	3	6	19956	19961	50 %	0 %	50 %	0 %	294663023
35	NC_004604	TA	3	6	20098	20103	50 %	50 %	0 %	0 %	294663023
36	NC_004604	AT	3	6	21256	21261	50 %	50 %	0 %	0 %	294663024
37	NC_004604	CT	3	6	22977	22982	0 %	50 %	0 %	50 %	294663026
38	NC_004604	TC	4	8	24125	24132	0 %	50 %	0 %	50 %	294663027
39	NC_004604	GA	3	6	24199	24204	50 %	0 %	50 %	0 %	294663027
40	NC_004604	CA	3	6	26555	26560	50 %	0 %	0 %	50 %	294663031
41	NC_004604	AG	3	6	26626	26631	50 %	0 %	50 %	0 %	294663031
42	NC_004604	TA	3	6	28193	28198	50 %	50 %	0 %	0 %	28894882
43	NC_004604	AG	3	6	28267	28272	50 %	0 %	50 %	0 %	28894882
44	NC_004604	CT	3	6	28565	28570	0 %	50 %	0 %	50 %	28894882
45	NC_004604	AG	4	8	32209	32216	50 %	0 %	50 %	0 %	294663037
46	NC_004604	TA	4	8	33731	33738	50 %	50 %	0 %	0 %	294663038
47	NC_004604	CT	3	6	34619	34624	0 %	50 %	0 %	50 %	28894886
48	NC_004604	CA	3	6	35102	35107	50 %	0 %	0 %	50 %	28894886
49	NC_004604	AG	3	6	36060	36065	50 %	0 %	50 %	0 %	28894886
50	NC_004604	GA	3	6	36181	36186	50 %	0 %	50 %	0 %	28894886
51	NC_004604	TC	3	6	38048	38053	0 %	50 %	0 %	50 %	28894907
52	NC_004604	TC	3	6	42220	42225	0 %	50 %	0 %	50 %	294663047
53	NC_004604	AT	3	6	42255	42260	50 %	50 %	0 %	0 %	294663047
54	NC_004604	AT	3	6	42827	42832	50 %	50 %	0 %	0 %	294663048
55	NC_004604	AT	3	6	42976	42981	50 %	50 %	0 %	0 %	294663048
56	NC_004604	AT	3	6	44051	44056	50 %	50 %	0 %	0 %	294663049
57	NC_004604	TA	3	6	45456	45461	50 %	50 %	0 %	0 %	28894894

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.