MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 199300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_004463	TGA	2	6	146896	146901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3003	NC_004463	CGT	2	6	146906	146911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3004	NC_004463	GC	4	8	146926	146933	0 %	0 %	50 %	50 %	27375261
3005	NC_004463	CGTTCC	2	12	146941	146952	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	27375261
3006	NC_004463	CGG	2	6	146981	146986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3007	NC_004463	GGCT	2	8	147036	147043	0 %	25 %	50 %	25 %	27375261
3008	NC_004463	CCG	2	6	147051	147056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375261
3009	NC_004463	ACG	2	6	147132	147137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3010	NC_004463	ATG	2	6	147195	147200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3011	NC_004463	TCG	2	6	147247	147252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3012	NC_004463	CCT	2	6	147253	147258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375261
3013	NC_004463	CGT	2	6	147272	147277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3014	NC_004463	GCT	2	6	147284	147289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3015	NC_004463	CTCG	2	8	147290	147297	0 %	25 %	25 %	50 %	27375261
3016	NC_004463	CTT	2	6	147317	147322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3017	NC_004463	ACGA	2	8	147324	147331	50 %	0 %	25 %	25 %	27375261
3018	NC_004463	CGG	2	6	147335	147340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3019	NC_004463	GAT	2	6	147347	147352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3020	NC_004463	GATCTG	2	12	147365	147376	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	27375261
3021	NC_004463	TCT	2	6	147421	147426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3022	NC_004463	GGT	2	6	147491	147496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
3023	NC_004463	CAC	2	6	147528	147533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375261
3024	NC_004463	TTC	2	6	147534	147539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3025	NC_004463	TTC	2	6	147570	147575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375261
3026	NC_004463	CAC	2	6	147581	147586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375261
3027	NC_004463	GAT	2	6	147587	147592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3028	NC_004463	GAT	2	6	147671	147676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375261
3029	NC_004463	CGG	2	6	147710	147715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3030	NC_004463	CTG	2	6	147729	147734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3031	NC_004463	GCC	2	6	147740	147745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375261
3032	NC_004463	TGC	2	6	147757	147762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3033	NC_004463	ACA	2	6	147763	147768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375261
3034	NC_004463	ATC	2	6	147801	147806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375261
3035	NC_004463	GGC	2	6	147807	147812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375261
3036	NC_004463	GTG	2	6	147813	147818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
3037	NC_004463	ATT	2	6	147841	147846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27375261
3038	NC_004463	GTTCTG	2	12	147899	147910	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	27375261
3039	NC_004463	GTC	2	6	147912	147917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3040	NC_004463	CGC	2	6	147972	147977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375261
3041	NC_004463	CGA	2	6	147989	147994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3042	NC_004463	CGC	2	6	148022	148027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375261
3043	NC_004463	AGC	2	6	148102	148107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3044	NC_004463	CG	3	6	148136	148141	0 %	0 %	50 %	50 %	27375261
3045	NC_004463	CCT	2	6	148159	148164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375261
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3047	NC_004463	CGT	2	6	148199	148204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3048	NC_004463	GTG	2	6	148220	148225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
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3050	NC_004463	AGC	2	6	148287	148292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3051	NC_004463	ATC	2	6	148305	148310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375261
3052	NC_004463	TGG	2	6	148359	148364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375261
3053	NC_004463	GCC	2	6	148368	148373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375261
3054	NC_004463	GAC	2	6	148449	148454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375261
3055	NC_004463	CG	3	6	148472	148477	0 %	0 %	50 %	50 %	27375261
3056	NC_004463	TCT	2	6	148546	148551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375262
3057	NC_004463	CGA	2	6	148559	148564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375262
3058	NC_004463	CTCG	2	8	148592	148599	0 %	25 %	25 %	50 %	27375262
3059	NC_004463	TGA	2	6	148615	148620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375262
3060	NC_004463	CGC	2	6	148649	148654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375262
3061	NC_004463	CGC	2	6	148679	148684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375262
3062	NC_004463	TCGACC	2	12	148708	148719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27375262
3063	NC_004463	TGC	3	9	148741	148749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375262
3064	NC_004463	GTC	2	6	148751	148756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375262
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3069	NC_004463	CAGCG	2	10	148908	148917	20 %	0 %	40 %	40 %	27375262
3070	NC_004463	CTT	2	6	148931	148936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375262
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3078	NC_004463	TGA	2	6	149265	149270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375263
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3080	NC_004463	TCA	2	6	149307	149312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375263
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3088	NC_004463	GC	3	6	149563	149568	0 %	0 %	50 %	50 %	27375264
3089	NC_004463	CGC	2	6	149644	149649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375264
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3100	NC_004463	CAA	2	6	150012	150017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375264
3101	NC_004463	CGC	2	6	150054	150059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375264
3102	NC_004463	GCG	3	9	150064	150072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375264
3103	NC_004463	CG	3	6	150071	150076	0 %	0 %	50 %	50 %	27375264
3104	NC_004463	TCG	2	6	150101	150106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375264
3105	NC_004463	ATGCCG	2	12	150107	150118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	27375264
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3110	NC_004463	CCGG	2	8	150298	150305	0 %	0 %	50 %	50 %	27375264
3111	NC_004463	TGC	2	6	150315	150320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375264
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3116	NC_004463	CCGA	2	8	150461	150468	25 %	0 %	25 %	50 %	27375265
3117	NC_004463	CGA	3	9	150466	150474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375265
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3120	NC_004463	GC	3	6	150609	150614	0 %	0 %	50 %	50 %	27375265
3121	NC_004463	TGC	2	6	150618	150623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375265
3122	NC_004463	CGC	2	6	150658	150663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375265
3123	NC_004463	GCT	2	6	150679	150684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375265
3124	NC_004463	CGC	2	6	150706	150711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375265
3125	NC_004463	GGC	2	6	150737	150742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375265
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3127	NC_004463	TGC	2	6	150795	150800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375265
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3129	NC_004463	TGG	2	6	150825	150830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375265
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3131	NC_004463	TGC	2	6	150960	150965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375265
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3137	NC_004463	CGA	2	6	151284	151289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375265
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3140	NC_004463	CAAG	2	8	151572	151579	50 %	0 %	25 %	25 %	27375265
3141	NC_004463	CGG	3	9	151588	151596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375265
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3147	NC_004463	TCGA	2	8	151833	151840	25 %	25 %	25 %	25 %	27375266
3148	NC_004463	GGA	2	6	151859	151864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375266
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3151	NC_004463	GCT	2	6	151931	151936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375266
3152	NC_004463	CACG	2	8	151940	151947	25 %	0 %	25 %	50 %	27375266
3153	NC_004463	GAG	2	6	151950	151955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375266
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3217	NC_004463	GCA	2	6	154787	154792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375270
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3220	NC_004463	GCC	2	6	154879	154884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375270
3221	NC_004463	CGA	2	6	154899	154904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375270
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3225	NC_004463	TGC	2	6	155092	155097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375270
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3230	NC_004463	CGG	2	6	155238	155243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375270
3231	NC_004463	CGG	2	6	155287	155292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375270
3232	NC_004463	GCG	2	6	155295	155300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375270
3233	NC_004463	GC	4	8	155325	155332	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3234	NC_004463	CGG	2	6	155418	155423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375270
3235	NC_004463	GC	3	6	155507	155512	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3236	NC_004463	CG	3	6	155550	155555	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3237	NC_004463	TGC	2	6	155603	155608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375270
3238	NC_004463	GC	3	6	155607	155612	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3239	NC_004463	CAG	2	6	155656	155661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375270
3240	NC_004463	CG	3	6	155675	155680	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3241	NC_004463	GC	3	6	155750	155755	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3242	NC_004463	AGC	2	6	155894	155899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375270
3243	NC_004463	GC	3	6	155932	155937	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3244	NC_004463	CG	3	6	155949	155954	0 %	0 %	50 %	50 %	27375270
3245	NC_004463	GAT	2	6	155980	155985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375270
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3344	NC_004463	TGCGT	2	10	161675	161684	0 %	40 %	40 %	20 %	27375276
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3366	NC_004463	ATGAA	2	10	162401	162410	60 %	20 %	20 %	0 %	27375277
3367	NC_004463	TCG	2	6	162419	162424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375277
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3374	NC_004463	CGGC	2	8	162683	162690	0 %	0 %	50 %	50 %	27375277
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3482	NC_004463	GCC	2	6	168137	168142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375283
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3488	NC_004463	GCT	2	6	168544	168549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375284
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3490	NC_004463	GTG	2	6	168608	168613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375284
3491	NC_004463	CGA	2	6	168849	168854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
3492	NC_004463	CGC	2	6	168867	168872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375285
3493	NC_004463	AG	4	8	168887	168894	50 %	0 %	50 %	0 %	27375285
3494	NC_004463	CCAGG	2	10	168901	168910	20 %	0 %	40 %	40 %	27375285
3495	NC_004463	GCA	2	6	168924	168929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
3496	NC_004463	TCG	2	6	169022	169027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375285
3497	NC_004463	GCG	2	6	169038	169043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375285
3498	NC_004463	CAT	2	6	169081	169086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375285
3499	NC_004463	CAG	3	9	169087	169095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375285
3500	NC_004463	GTG	2	6	169106	169111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375285

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