MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 199300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_004463	CGC	2	6	61666	61671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375180
1003	NC_004463	GC	3	6	61690	61695	0 %	0 %	50 %	50 %	27375180
1004	NC_004463	CAC	2	6	61731	61736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375180
1005	NC_004463	CGG	2	6	61749	61754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375180
1006	NC_004463	TCGGT	2	10	61812	61821	0 %	40 %	40 %	20 %	27375180
1007	NC_004463	ATC	2	6	61837	61842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375180
1008	NC_004463	TCG	2	6	61895	61900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375180
1009	NC_004463	GCA	2	6	61902	61907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375180
1010	NC_004463	ATG	2	6	61909	61914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375180
1011	NC_004463	GCG	2	6	61928	61933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375180
1012	NC_004463	GAT	2	6	61953	61958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375180
1013	NC_004463	GAT	2	6	61975	61980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375180
1014	NC_004463	TCC	3	9	62018	62026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375180
1015	NC_004463	ATG	2	6	62063	62068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375180
1016	NC_004463	GCG	2	6	62085	62090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375180
1017	NC_004463	GC	3	6	62119	62124	0 %	0 %	50 %	50 %	27375180
1018	NC_004463	CG	3	6	62130	62135	0 %	0 %	50 %	50 %	27375180
1019	NC_004463	GC	3	6	62192	62197	0 %	0 %	50 %	50 %	27375181
1020	NC_004463	TCC	2	6	62284	62289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375181
1021	NC_004463	GGC	2	6	62311	62316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375181
1022	NC_004463	GCA	2	6	62372	62377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375181
1023	NC_004463	GCCG	2	8	62387	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	27375181
1024	NC_004463	CG	3	6	62415	62420	0 %	0 %	50 %	50 %	27375181
1025	NC_004463	TA	3	6	62502	62507	50 %	50 %	0 %	0 %	27375181
1026	NC_004463	GCT	2	6	62539	62544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375181
1027	NC_004463	GGC	2	6	62794	62799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375182
1028	NC_004463	GTC	2	6	62831	62836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375182
1029	NC_004463	CCG	2	6	62894	62899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375182
1030	NC_004463	GAT	2	6	63011	63016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375183
1031	NC_004463	TGA	2	6	63022	63027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375183
1032	NC_004463	GAC	2	6	63236	63241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375183
1033	NC_004463	TCG	2	6	63258	63263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375183
1034	NC_004463	GCT	2	6	63298	63303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375183
1035	NC_004463	CTA	2	6	63376	63381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375183
1036	NC_004463	GCAT	2	8	63390	63397	25 %	25 %	25 %	25 %	27375183
1037	NC_004463	CGG	3	9	63416	63424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375183
1038	NC_004463	GAAGGA	2	12	63430	63441	50 %	0 %	50 %	0 %	27375183
1039	NC_004463	GAA	2	6	63460	63465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375183
1040	NC_004463	GC	3	6	63485	63490	0 %	0 %	50 %	50 %	27375183
1041	NC_004463	GAG	2	6	63548	63553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375183
1042	NC_004463	CGC	2	6	63607	63612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375183
1043	NC_004463	CCG	2	6	63632	63637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375183
1044	NC_004463	CGC	2	6	63642	63647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375183
1045	NC_004463	TCA	3	9	63648	63656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375183
1046	NC_004463	GAC	2	6	63664	63669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375183
1047	NC_004463	TGT	2	6	63747	63752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375183
1048	NC_004463	GCC	2	6	63770	63775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375183
1049	NC_004463	GC	3	6	63815	63820	0 %	0 %	50 %	50 %	27375183
1050	NC_004463	CG	3	6	63830	63835	0 %	0 %	50 %	50 %	27375183
1051	NC_004463	CGA	2	6	63838	63843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375183
1052	NC_004463	CGC	2	6	63844	63849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375183
1053	NC_004463	ACCG	2	8	63905	63912	25 %	0 %	25 %	50 %	27375183
1054	NC_004463	GCC	2	6	63983	63988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375183
1055	NC_004463	GGA	2	6	64009	64014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375183
1056	NC_004463	GTC	2	6	64052	64057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375183
1057	NC_004463	GCA	2	6	64111	64116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375183
1058	NC_004463	CGG	2	6	64132	64137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375183
1059	NC_004463	GTTC	2	8	64141	64148	0 %	50 %	25 %	25 %	27375183
1060	NC_004463	CCG	2	6	64149	64154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375183
1061	NC_004463	ATC	2	6	64163	64168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375183
1062	NC_004463	GCG	2	6	64172	64177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375183
1063	NC_004463	CA	3	6	64206	64211	50 %	0 %	0 %	50 %	27375183
1064	NC_004463	GTG	2	6	64235	64240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375184
1065	NC_004463	GCC	2	6	64302	64307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375184
1066	NC_004463	CCG	2	6	64445	64450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375184
1067	NC_004463	TAC	2	6	64496	64501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375184
1068	NC_004463	ATGC	2	8	64525	64532	25 %	25 %	25 %	25 %	27375184
1069	NC_004463	CGA	2	6	64546	64551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375184
1070	NC_004463	GC	3	6	64627	64632	0 %	0 %	50 %	50 %	27375184
1071	NC_004463	AGCG	2	8	64648	64655	25 %	0 %	50 %	25 %	27375184
1072	NC_004463	GCC	2	6	64656	64661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375184
1073	NC_004463	CGT	2	6	64663	64668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375184
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1080	NC_004463	CG	3	6	64855	64860	0 %	0 %	50 %	50 %	27375185
1081	NC_004463	CGATC	2	10	64862	64871	20 %	20 %	20 %	40 %	27375185
1082	NC_004463	CG	3	6	64886	64891	0 %	0 %	50 %	50 %	27375185
1083	NC_004463	GATC	2	8	64937	64944	25 %	25 %	25 %	25 %	27375185
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1088	NC_004463	CAGC	2	8	65140	65147	25 %	0 %	25 %	50 %	27375185
1089	NC_004463	GCCT	2	8	65198	65205	0 %	25 %	25 %	50 %	27375185
1090	NC_004463	CGAAG	2	10	65243	65252	40 %	0 %	40 %	20 %	27375185
1091	NC_004463	TCGCAC	2	12	65299	65310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	27375185
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1093	NC_004463	GCT	2	6	65339	65344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375185
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1096	NC_004463	C	6	6	65417	65422	0 %	0 %	0 %	100 %	27375185
1097	NC_004463	CG	3	6	65507	65512	0 %	0 %	50 %	50 %	27375185
1098	NC_004463	CGA	2	6	65531	65536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375185
1099	NC_004463	ACG	2	6	65575	65580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375185
1100	NC_004463	GCG	2	6	65585	65590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375185
1101	NC_004463	GCT	2	6	65669	65674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375185
1102	NC_004463	ACA	2	6	65764	65769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375185
1103	NC_004463	ATCG	2	8	65770	65777	25 %	25 %	25 %	25 %	27375185
1104	NC_004463	CAAC	2	8	66187	66194	50 %	0 %	0 %	50 %	27375186
1105	NC_004463	CCGT	2	8	66218	66225	0 %	25 %	25 %	50 %	27375186
1106	NC_004463	TCG	2	6	66255	66260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375186
1107	NC_004463	CGA	2	6	66286	66291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375186
1108	NC_004463	TTA	2	6	66385	66390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	27375186
1109	NC_004463	GCTT	2	8	66468	66475	0 %	50 %	25 %	25 %	27375186
1110	NC_004463	CCG	2	6	66491	66496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375186
1111	NC_004463	TCT	2	6	66559	66564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375186
1112	NC_004463	TGG	2	6	66566	66571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375186
1113	NC_004463	TGC	2	6	66678	66683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375186
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1116	NC_004463	CGA	2	6	67018	67023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375187
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1119	NC_004463	CGG	2	6	67170	67175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375187
1120	NC_004463	GCT	2	6	67287	67292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375187
1121	NC_004463	GTT	2	6	67296	67301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375187
1122	NC_004463	TCG	2	6	67324	67329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375187
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1124	NC_004463	CA	3	6	67342	67347	50 %	0 %	0 %	50 %	27375187
1125	NC_004463	TCA	2	6	67441	67446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375187
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