MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 199300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004463	TCC	2	6	34068	34073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375148
502	NC_004463	TCGA	2	8	34117	34124	25 %	25 %	25 %	25 %	27375148
503	NC_004463	CT	3	6	34158	34163	0 %	50 %	0 %	50 %	27375148
504	NC_004463	GTC	2	6	34270	34275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375148
505	NC_004463	CGAT	2	8	34284	34291	25 %	25 %	25 %	25 %	27375148
506	NC_004463	AGT	2	6	34687	34692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375149
507	NC_004463	GAA	2	6	34707	34712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375149
508	NC_004463	CGA	2	6	34715	34720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375149
509	NC_004463	TCT	2	6	34725	34730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375149
510	NC_004463	GCC	2	6	34782	34787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375149
511	NC_004463	A	6	6	34852	34857	100 %	0 %	0 %	0 %	27375149
512	NC_004463	GCT	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375150
513	NC_004463	CGA	2	6	35326	35331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375150
514	NC_004463	AAGG	2	8	35357	35364	50 %	0 %	50 %	0 %	27375150
515	NC_004463	GC	3	6	35409	35414	0 %	0 %	50 %	50 %	27375150
516	NC_004463	CGAG	2	8	35454	35461	25 %	0 %	50 %	25 %	27375150
517	NC_004463	CTG	2	6	35849	35854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375151
518	NC_004463	CTG	2	6	35955	35960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375151
519	NC_004463	GGCT	2	8	35966	35973	0 %	25 %	50 %	25 %	27375151
520	NC_004463	GC	3	6	36108	36113	0 %	0 %	50 %	50 %	27375151
521	NC_004463	AGAT	2	8	36252	36259	50 %	25 %	25 %	0 %	27375152
522	NC_004463	ATA	2	6	36307	36312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	27375152
523	NC_004463	GCGCG	2	10	36339	36348	0 %	0 %	60 %	40 %	27375152
524	NC_004463	CTCG	2	8	36368	36375	0 %	25 %	25 %	50 %	27375152
525	NC_004463	GAA	2	6	36387	36392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375152
526	NC_004463	GAA	2	6	36401	36406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375152
527	NC_004463	GTC	2	6	36413	36418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375152
528	NC_004463	AC	4	8	36427	36434	50 %	0 %	0 %	50 %	27375152
529	NC_004463	AGTC	2	8	36874	36881	25 %	25 %	25 %	25 %	27375153
530	NC_004463	TCC	2	6	36891	36896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375153
531	NC_004463	TTGA	2	8	36923	36930	25 %	50 %	25 %	0 %	27375153
532	NC_004463	CGG	2	6	36933	36938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375153
533	NC_004463	GGC	2	6	36995	37000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375153
534	NC_004463	AG	3	6	37045	37050	50 %	0 %	50 %	0 %	27375153
535	NC_004463	GC	3	6	37088	37093	0 %	0 %	50 %	50 %	27375153
536	NC_004463	CGG	2	6	37098	37103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375153
537	NC_004463	AGC	2	6	37130	37135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375153
538	NC_004463	AGCGAC	2	12	37194	37205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375153
539	NC_004463	GCG	2	6	37218	37223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375153
540	NC_004463	CTT	2	6	37277	37282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375153
541	NC_004463	T	6	6	37281	37286	0 %	100 %	0 %	0 %	27375153
542	NC_004463	TCG	2	6	37318	37323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375154
543	NC_004463	GAGG	2	8	37332	37339	25 %	0 %	75 %	0 %	27375154
544	NC_004463	GC	3	6	37344	37349	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
545	NC_004463	CAT	2	6	37359	37364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375154
546	NC_004463	TCGA	2	8	37464	37471	25 %	25 %	25 %	25 %	27375154
547	NC_004463	GCT	2	6	37478	37483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375154
548	NC_004463	CGG	2	6	37493	37498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375154
549	NC_004463	GTC	2	6	37524	37529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375154
550	NC_004463	GCG	2	6	37556	37561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375154
551	NC_004463	GCC	2	6	37593	37598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375154
552	NC_004463	CGG	2	6	37617	37622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375154
553	NC_004463	ATG	2	6	37627	37632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375154
554	NC_004463	GC	3	6	37662	37667	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
555	NC_004463	CTT	2	6	37668	37673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375154
556	NC_004463	CAT	2	6	37698	37703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375154
557	NC_004463	TCG	2	6	37711	37716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375154
558	NC_004463	CAT	2	6	37731	37736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375154
559	NC_004463	AGC	2	6	37750	37755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375154
560	NC_004463	GGGC	2	8	37756	37763	0 %	0 %	75 %	25 %	27375154
561	NC_004463	TTC	2	6	37825	37830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375154
562	NC_004463	TCG	2	6	37888	37893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375154
563	NC_004463	GTT	2	6	37938	37943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	27375154
564	NC_004463	GAA	2	6	38034	38039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375154
565	NC_004463	GCCG	2	8	38045	38052	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
566	NC_004463	TCG	2	6	38065	38070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375154
567	NC_004463	AGG	2	6	38077	38082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375154
568	NC_004463	GCCGGC	2	12	38084	38095	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
569	NC_004463	GCG	2	6	38124	38129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375154
570	NC_004463	GGC	2	6	38185	38190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375154
571	NC_004463	TCGC	2	8	38210	38217	0 %	25 %	25 %	50 %	27375154
572	NC_004463	GCA	2	6	38250	38255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375154
573	NC_004463	CCA	2	6	38270	38275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375154
574	NC_004463	CGTT	2	8	38329	38336	0 %	50 %	25 %	25 %	27375154
575	NC_004463	CGA	2	6	38372	38377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375154
576	NC_004463	CAT	2	6	38415	38420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375154
577	NC_004463	CGT	2	6	38430	38435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375154
578	NC_004463	AAG	2	6	38461	38466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375154
579	NC_004463	GTCTT	2	10	38485	38494	0 %	60 %	20 %	20 %	27375154
580	NC_004463	GGA	2	6	38513	38518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375154
581	NC_004463	CAG	2	6	38529	38534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375154
582	NC_004463	CGC	2	6	38633	38638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375154
583	NC_004463	CGA	2	6	38667	38672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375154
584	NC_004463	CAT	2	6	38861	38866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375154
585	NC_004463	CAC	2	6	38898	38903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375154
586	NC_004463	CG	3	6	38956	38961	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
587	NC_004463	TTC	2	6	38980	38985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375154
588	NC_004463	GC	3	6	38995	39000	0 %	0 %	50 %	50 %	27375154
589	NC_004463	CCG	2	6	39023	39028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375154
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591	NC_004463	GCC	2	6	39039	39044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375154
592	NC_004463	ACC	3	9	39104	39112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375154
593	NC_004463	AGA	2	6	39113	39118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	27375154
594	NC_004463	AGGC	2	8	39119	39126	25 %	0 %	50 %	25 %	27375154
595	NC_004463	AGC	2	6	39148	39153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375154
596	NC_004463	ATG	2	6	39250	39255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375154
597	NC_004463	GGC	2	6	39288	39293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375154
598	NC_004463	TCAC	2	8	39325	39332	25 %	25 %	0 %	50 %	27375154
599	NC_004463	GCC	2	6	39371	39376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375155
600	NC_004463	CG	5	10	39380	39389	0 %	0 %	50 %	50 %	27375155
601	NC_004463	GCCG	2	8	39403	39410	0 %	0 %	50 %	50 %	27375155
602	NC_004463	CGT	2	6	39460	39465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375155
603	NC_004463	TGCC	2	8	39514	39521	0 %	25 %	25 %	50 %	27375155
604	NC_004463	CGC	2	6	39529	39534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375155
605	NC_004463	CGG	2	6	39565	39570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375155
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607	NC_004463	GCT	2	6	39679	39684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375155
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609	NC_004463	GCC	2	6	39725	39730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375155
610	NC_004463	CG	4	8	39751	39758	0 %	0 %	50 %	50 %	27375155
611	NC_004463	CGC	2	6	39784	39789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375155
612	NC_004463	TCGA	2	8	39807	39814	25 %	25 %	25 %	25 %	27375155
613	NC_004463	GA	3	6	39813	39818	50 %	0 %	50 %	0 %	27375155
614	NC_004463	CGA	2	6	39880	39885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375155
615	NC_004463	GC	3	6	39895	39900	0 %	0 %	50 %	50 %	27375155
616	NC_004463	TGG	2	6	39936	39941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375155
617	NC_004463	TCG	3	9	39990	39998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375155
618	NC_004463	TGA	2	6	40114	40119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375155
619	NC_004463	CGC	2	6	40123	40128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375155
620	NC_004463	CGG	2	6	40156	40161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375155
621	NC_004463	TGA	2	6	40194	40199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375155
622	NC_004463	GCT	3	9	40261	40269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375155
623	NC_004463	CGAG	2	8	40366	40373	25 %	0 %	50 %	25 %	27375155
624	NC_004463	CGA	2	6	40374	40379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375155
625	NC_004463	GGGCGC	2	12	40426	40437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375155
626	NC_004463	CCTT	2	8	40443	40450	0 %	50 %	0 %	50 %	27375155
627	NC_004463	CGC	2	6	40495	40500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375155
628	NC_004463	GAT	2	6	40505	40510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375155
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630	NC_004463	TGG	2	6	40665	40670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	27375155
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