MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 110 chromosome

Total Repeats: 199300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004463	GA	3	6	232957	232962	50 %	0 %	50 %	0 %	27375349
5002	NC_004463	CGT	2	6	232983	232988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375349
5003	NC_004463	GGCG	2	8	233034	233041	0 %	0 %	75 %	25 %	27375349
5004	NC_004463	ATTC	2	8	233058	233065	25 %	50 %	0 %	25 %	27375349
5005	NC_004463	GC	3	6	233067	233072	0 %	0 %	50 %	50 %	27375349
5006	NC_004463	CG	3	6	233081	233086	0 %	0 %	50 %	50 %	27375349
5007	NC_004463	CAA	2	6	233088	233093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375349
5008	NC_004463	CGT	2	6	233118	233123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375349
5009	NC_004463	CGC	4	12	233192	233203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375349
5010	NC_004463	CGAT	2	8	233261	233268	25 %	25 %	25 %	25 %	27375349
5011	NC_004463	ACG	2	6	233302	233307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375349
5012	NC_004463	TCA	2	6	233333	233338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375349
5013	NC_004463	CGA	2	6	233376	233381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375349
5014	NC_004463	CGC	2	6	233396	233401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375349
5015	NC_004463	CG	4	8	233622	233629	0 %	0 %	50 %	50 %	27375349
5016	NC_004463	CGTC	2	8	233634	233641	0 %	25 %	25 %	50 %	27375349
5017	NC_004463	TCG	2	6	233648	233653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375349
5018	NC_004463	CGA	2	6	233712	233717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375349
5019	NC_004463	CCG	2	6	233747	233752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375349
5020	NC_004463	GA	3	6	233778	233783	50 %	0 %	50 %	0 %	27375350
5021	NC_004463	TGA	2	6	233862	233867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375350
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5023	NC_004463	TTC	2	6	233888	233893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375350
5024	NC_004463	CTG	3	9	233933	233941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375350
5025	NC_004463	ACC	2	6	233942	233947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375350
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5028	NC_004463	GGC	2	6	234028	234033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375350
5029	NC_004463	CAT	2	6	234052	234057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	27375350
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5031	NC_004463	CGGC	2	8	234102	234109	0 %	0 %	50 %	50 %	27375350
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5033	NC_004463	TGC	2	6	234129	234134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375350
5034	NC_004463	TCGG	2	8	234158	234165	0 %	25 %	50 %	25 %	27375350
5035	NC_004463	GCG	2	6	234203	234208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375350
5036	NC_004463	GCC	2	6	234290	234295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375350
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5039	NC_004463	CTT	2	6	234349	234354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375350
5040	NC_004463	GC	3	6	234391	234396	0 %	0 %	50 %	50 %	27375350
5041	NC_004463	GCA	2	6	234426	234431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375350
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5050	NC_004463	CTT	2	6	234796	234801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375350
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5060	NC_004463	CGA	2	6	235117	235122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375351
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5069	NC_004463	TCGA	2	8	235538	235545	25 %	25 %	25 %	25 %	27375351
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5105	NC_004463	GCA	2	6	237362	237367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375353
5106	NC_004463	CGG	2	6	237561	237566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375353
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5111	NC_004463	CCAT	2	8	237773	237780	25 %	25 %	0 %	50 %	27375353
5112	NC_004463	CGGC	2	8	237802	237809	0 %	0 %	50 %	50 %	27375353
5113	NC_004463	CGA	2	6	237863	237868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375353
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5118	NC_004463	CCT	2	6	238034	238039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	27375353
5119	NC_004463	CGA	2	6	238136	238141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375353
5120	NC_004463	TCG	2	6	238234	238239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375353
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5122	NC_004463	GAT	2	6	238287	238292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375353
5123	NC_004463	TCG	2	6	238351	238356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375353
5124	NC_004463	GCG	2	6	238403	238408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375353
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5226	NC_004463	CG	3	6	243213	243218	0 %	0 %	50 %	50 %	27375357
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5230	NC_004463	CAGCG	2	10	243398	243407	20 %	0 %	40 %	40 %	27375357
5231	NC_004463	GCC	2	6	243409	243414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375357
5232	NC_004463	CGG	2	6	243447	243452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375357
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5236	NC_004463	CTT	2	6	243601	243606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	27375357
5237	NC_004463	ACA	2	6	243617	243622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	27375357
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5239	NC_004463	CGGC	2	8	243676	243683	0 %	0 %	50 %	50 %	27375357
5240	NC_004463	TGATGG	2	12	243705	243716	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	27375357
5241	NC_004463	AGG	2	6	243728	243733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	27375357
5242	NC_004463	CGC	2	6	243741	243746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	27375357
5243	NC_004463	GC	3	6	243752	243757	0 %	0 %	50 %	50 %	27375357
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5360	NC_004463	ATG	3	9	248946	248954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	27375362
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5362	NC_004463	CGG	2	6	248983	248988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375362
5363	NC_004463	CGG	2	6	249001	249006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	27375362
5364	NC_004463	ATGG	2	8	249025	249032	25 %	25 %	50 %	0 %	27375362
5365	NC_004463	GCA	2	6	249058	249063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	27375362
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5367	NC_004463	CGT	2	6	249162	249167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	27375363
5368	NC_004463	CG	3	6	249192	249197	0 %	0 %	50 %	50 %	27375363
5369	NC_004463	CGGCT	2	10	249253	249262	0 %	20 %	40 %	40 %	27375363
5370	NC_004463	CAC	2	6	249279	249284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	27375363
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5373	NC_004463	GC	3	6	249327	249332	0 %	0 %	50 %	50 %	27375363
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5402	NC_004463	TG	3	6	250585	250590	0 %	50 %	50 %	0 %	161511112
5403	NC_004463	GCA	2	6	250596	250601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511112
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5475	NC_004463	CATGA	2	10	253711	253720	40 %	20 %	20 %	20 %	27375368
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5489	NC_004463	GC	3	6	254545	254550	0 %	0 %	50 %	50 %	27375368
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