MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brucella suis 1330 chromosome II

Total Repeats: 21329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_004311	TCAA	2	8	1187342	1187349	50 %	25 %	0 %	25 %	23500898
21002	NC_004311	CCG	2	6	1187448	1187453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500898
21003	NC_004311	TGA	2	6	1187456	1187461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23500898
21004	NC_004311	CAT	2	6	1187598	1187603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500898
21005	NC_004311	CGGT	2	8	1187694	1187701	0 %	25 %	50 %	25 %	23500898
21006	NC_004311	CCT	2	6	1187748	1187753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23500898
21007	NC_004311	TTG	2	6	1187867	1187872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	23500898
21008	NC_004311	TCA	2	6	1187906	1187911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500898
21009	NC_004311	CAG	2	6	1187972	1187977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500898
21010	NC_004311	TGG	3	9	1188003	1188011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23500898
21011	NC_004311	CTT	2	6	1188048	1188053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23500898
21012	NC_004311	TGCC	2	8	1188063	1188070	0 %	25 %	25 %	50 %	23500898
21013	NC_004311	TGCC	2	8	1188146	1188153	0 %	25 %	25 %	50 %	23500898
21014	NC_004311	CG	3	6	1188227	1188232	0 %	0 %	50 %	50 %	23500898
21015	NC_004311	AGC	2	6	1188273	1188278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500898
21016	NC_004311	GAT	2	6	1188282	1188287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23500898
21017	NC_004311	AAT	2	6	1188484	1188489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23500899
21018	NC_004311	ATA	2	6	1188497	1188502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23500899
21019	NC_004311	CCAT	2	8	1188569	1188576	25 %	25 %	0 %	50 %	23500899
21020	NC_004311	ATC	2	6	1188747	1188752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500899
21021	NC_004311	GC	3	6	1188791	1188796	0 %	0 %	50 %	50 %	23500899
21022	NC_004311	AAG	2	6	1188828	1188833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23500899
21023	NC_004311	CCA	2	6	1188853	1188858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23500899
21024	NC_004311	GCG	2	6	1188909	1188914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500899
21025	NC_004311	TTTG	2	8	1188919	1188926	0 %	75 %	25 %	0 %	23500899
21026	NC_004311	TGA	2	6	1188964	1188969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23500899
21027	NC_004311	CAT	2	6	1188976	1188981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500899
21028	NC_004311	GAGC	2	8	1189006	1189013	25 %	0 %	50 %	25 %	23500899
21029	NC_004311	AGC	2	6	1189017	1189022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500899
21030	NC_004311	TCT	2	6	1189054	1189059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23500899
21031	NC_004311	CCT	2	6	1189090	1189095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	23500899
21032	NC_004311	AAT	2	6	1189324	1189329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23500899
21033	NC_004311	ATT	2	6	1189444	1189449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	23500900
21034	NC_004311	GCT	2	6	1189480	1189485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500900
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21036	NC_004311	GCGG	2	8	1189604	1189611	0 %	0 %	75 %	25 %	23500900
21037	NC_004311	CAT	2	6	1189654	1189659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500900
21038	NC_004311	TGA	2	6	1189663	1189668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23500900
21039	NC_004311	TGC	2	6	1189781	1189786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500900
21040	NC_004311	GC	4	8	1189794	1189801	0 %	0 %	50 %	50 %	23500900
21041	NC_004311	GCT	2	6	1189813	1189818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500900
21042	NC_004311	GCC	2	6	1189823	1189828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500900
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21044	NC_004311	CG	3	6	1189912	1189917	0 %	0 %	50 %	50 %	23500900
21045	NC_004311	CGC	2	6	1189999	1190004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500900
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21053	NC_004311	CTG	2	6	1190353	1190358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500901
21054	NC_004311	GCG	2	6	1190384	1190389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500901
21055	NC_004311	CCA	2	6	1190445	1190450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23500901
21056	NC_004311	GCG	2	6	1190522	1190527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500901
21057	NC_004311	TGA	2	6	1190529	1190534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23500901
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21059	NC_004311	AAGA	2	8	1190596	1190603	75 %	0 %	25 %	0 %	23500901
21060	NC_004311	GAA	2	6	1190683	1190688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23500901
21061	NC_004311	GC	3	6	1190713	1190718	0 %	0 %	50 %	50 %	23500901
21062	NC_004311	CCATC	2	10	1190728	1190737	20 %	20 %	0 %	60 %	23500901
21063	NC_004311	GA	3	6	1190783	1190788	50 %	0 %	50 %	0 %	23500901
21064	NC_004311	AT	3	6	1190808	1190813	50 %	50 %	0 %	0 %	23500901
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21066	NC_004311	CCGGG	2	10	1190868	1190877	0 %	0 %	60 %	40 %	23500901
21067	NC_004311	CAC	2	6	1190881	1190886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23500901
21068	NC_004311	GAG	2	6	1190902	1190907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23500901
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21075	NC_004311	CG	3	6	1191121	1191126	0 %	0 %	50 %	50 %	23500902
21076	NC_004311	C	6	6	1191156	1191161	0 %	0 %	0 %	100 %	23500902
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21083	NC_004311	GCCCT	2	10	1191492	1191501	0 %	20 %	20 %	60 %	23500902
21084	NC_004311	ATTG	2	8	1191615	1191622	25 %	50 %	25 %	0 %	23500902
21085	NC_004311	GCG	3	9	1191633	1191641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500902
21086	NC_004311	CGA	2	6	1191680	1191685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500902
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21088	NC_004311	GCCA	2	8	1191858	1191865	25 %	0 %	25 %	50 %	23500902
21089	NC_004311	ACTG	2	8	1191894	1191901	25 %	25 %	25 %	25 %	23500902
21090	NC_004311	CCGTCA	2	12	1192344	1192355	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	23500903
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21094	NC_004311	ATTCC	2	10	1192518	1192527	20 %	40 %	0 %	40 %	23500903
21095	NC_004311	AGGC	2	8	1192550	1192557	25 %	0 %	50 %	25 %	23500903
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21101	NC_004311	GC	3	6	1192785	1192790	0 %	0 %	50 %	50 %	23500903
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21104	NC_004311	GC	3	6	1192941	1192946	0 %	0 %	50 %	50 %	23500903
21105	NC_004311	GGTCG	2	10	1192962	1192971	0 %	20 %	60 %	20 %	23500903
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21115	NC_004311	GCA	2	6	1193723	1193728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500903
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21155	NC_004311	AT	3	6	1196175	1196180	50 %	50 %	0 %	0 %	23500906
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21235	NC_004311	GCA	2	6	1201518	1201523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500910
21236	NC_004311	CG	3	6	1201555	1201560	0 %	0 %	50 %	50 %	23500910
21237	NC_004311	GCCA	2	8	1201564	1201571	25 %	0 %	25 %	50 %	23500910
21238	NC_004311	GCT	2	6	1201671	1201676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500910
21239	NC_004311	TCG	2	6	1201828	1201833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500910
21240	NC_004311	CAC	2	6	1201901	1201906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23500910
21241	NC_004311	CAA	2	6	1201945	1201950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23500910
21242	NC_004311	TCA	2	6	1201993	1201998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500910
21243	NC_004311	TGG	2	6	1202047	1202052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23500910
21244	NC_004311	AGA	2	6	1202070	1202075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23500910
21245	NC_004311	GCG	2	6	1202115	1202120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500910
21246	NC_004311	AAG	2	6	1202132	1202137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23500910
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21251	NC_004311	GTTT	2	8	1202687	1202694	0 %	75 %	25 %	0 %	23500911
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21253	NC_004311	TGCC	2	8	1202751	1202758	0 %	25 %	25 %	50 %	23500911
21254	NC_004311	TCA	2	6	1202833	1202838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500911
21255	NC_004311	GCG	2	6	1202874	1202879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500911
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21260	NC_004311	GGT	2	6	1203089	1203094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23500911
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21264	NC_004311	TTC	2	6	1203432	1203437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23500911
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21269	NC_004311	ATG	2	6	1203681	1203686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23500911
21270	NC_004311	CCG	2	6	1203696	1203701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500911
21271	NC_004311	ATC	2	6	1203750	1203755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500911
21272	NC_004311	GTG	2	6	1203816	1203821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23500911
21273	NC_004311	CAGC	2	8	1203905	1203912	25 %	0 %	25 %	50 %	23500911
21274	NC_004311	GGA	2	6	1204140	1204145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23500912
21275	NC_004311	GCC	2	6	1204207	1204212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500912
21276	NC_004311	AT	3	6	1204238	1204243	50 %	50 %	0 %	0 %	23500912
21277	NC_004311	CAG	2	6	1204271	1204276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500912
21278	NC_004311	T	8	8	1204277	1204284	0 %	100 %	0 %	0 %	23500912
21279	NC_004311	CCAT	2	8	1204331	1204338	25 %	25 %	0 %	50 %	23500912
21280	NC_004311	TCCAC	2	10	1204396	1204405	20 %	20 %	0 %	60 %	23500913
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21284	NC_004311	CGA	2	6	1204958	1204963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500914
21285	NC_004311	CTG	2	6	1205007	1205012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500914
21286	NC_004311	CCG	2	6	1205028	1205033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500914
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21288	NC_004311	GAA	2	6	1205108	1205113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23500914
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21292	NC_004311	CCG	2	6	1205252	1205257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500914
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21298	NC_004311	ATC	2	6	1205529	1205534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23500914
21299	NC_004311	GAATAT	2	12	1205556	1205567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	23500914
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21302	NC_004311	GTC	3	9	1205661	1205669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500914
21303	NC_004311	CCG	2	6	1205679	1205684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500914
21304	NC_004311	GCA	2	6	1205718	1205723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500914
21305	NC_004311	GGCA	2	8	1205818	1205825	25 %	0 %	50 %	25 %	23500914
21306	NC_004311	GGC	2	6	1205826	1205831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500914
21307	NC_004311	CAAA	2	8	1205990	1205997	75 %	0 %	0 %	25 %	23500914
21308	NC_004311	TCAT	2	8	1206091	1206098	25 %	50 %	0 %	25 %	23500914
21309	NC_004311	GAA	2	6	1206189	1206194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23500915
21310	NC_004311	CGG	2	6	1206224	1206229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500915
21311	NC_004311	GCC	2	6	1206277	1206282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500915
21312	NC_004311	CGA	2	6	1206303	1206308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500915
21313	NC_004311	CTTC	2	8	1206380	1206387	0 %	50 %	0 %	50 %	23500915
21314	NC_004311	CGA	2	6	1206411	1206416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23500915
21315	NC_004311	CTG	2	6	1206433	1206438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500915
21316	NC_004311	TCCGCA	2	12	1206483	1206494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	23500915
21317	NC_004311	GC	3	6	1206544	1206549	0 %	0 %	50 %	50 %	23500915
21318	NC_004311	GCCAGG	2	12	1206611	1206622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	23500915
21319	NC_004311	TTC	2	6	1206664	1206669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23500915
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21321	NC_004311	GCC	2	6	1206715	1206720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23500915
21322	NC_004311	GGA	2	6	1206777	1206782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23500915
21323	NC_004311	CTG	2	6	1206787	1206792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23500915
21324	NC_004311	CGGCC	2	10	1206798	1206807	0 %	0 %	40 %	60 %	23500915
21325	NC_004311	GCTG	2	8	1206827	1206834	0 %	25 %	50 %	25 %	23500915
21326	NC_004311	AAG	2	6	1206865	1206870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23500915
21327	NC_004311	GCG	2	6	1206871	1206876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23500915
21328	NC_004311	GGCG	2	8	1206958	1206965	0 %	0 %	75 %	25 %	23500915
21329	NC_004311	CAAA	2	8	1207047	1207054	75 %	0 %	0 %	25 %	23500915

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.