MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 43446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004307	CGC	3	9	215223	215231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465889
4002	NC_004307	GCCG	2	8	215242	215249	0 %	0 %	50 %	50 %	23465889
4003	NC_004307	CGC	2	6	215282	215287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465889
4004	NC_004307	TTC	2	6	215323	215328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465889
4005	NC_004307	GTTG	2	8	215337	215344	0 %	50 %	50 %	0 %	23465889
4006	NC_004307	GCCG	2	8	215412	215419	0 %	0 %	50 %	50 %	23465889
4007	NC_004307	CGA	2	6	215484	215489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465889
4008	NC_004307	GCC	2	6	215524	215529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465889
4009	NC_004307	TGA	2	6	215559	215564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465889
4010	NC_004307	GGA	2	6	215586	215591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465889
4011	NC_004307	GGA	2	6	215604	215609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465889
4012	NC_004307	GAT	2	6	215623	215628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465889
4013	NC_004307	TGC	2	6	215998	216003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4014	NC_004307	TCA	2	6	216139	216144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465890
4015	NC_004307	CG	3	6	216145	216150	0 %	0 %	50 %	50 %	23465890
4016	NC_004307	CGCT	2	8	216178	216185	0 %	25 %	25 %	50 %	23465890
4017	NC_004307	TTGG	2	8	216292	216299	0 %	50 %	50 %	0 %	23465890
4018	NC_004307	CGG	2	6	216314	216319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465890
4019	NC_004307	TCA	2	6	216358	216363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465890
4020	NC_004307	CGT	2	6	216487	216492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4021	NC_004307	TTACCG	2	12	216493	216504	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	23465890
4022	NC_004307	AGTTC	2	10	216547	216556	20 %	40 %	20 %	20 %	23465890
4023	NC_004307	CGC	2	6	216566	216571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465890
4024	NC_004307	ACT	2	6	216592	216597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465890
4025	NC_004307	CGT	2	6	216611	216616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4026	NC_004307	TC	3	6	216624	216629	0 %	50 %	0 %	50 %	23465890
4027	NC_004307	ACG	2	6	216640	216645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4028	NC_004307	ACA	2	6	216715	216720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465890
4029	NC_004307	TGA	2	6	216919	216924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465890
4030	NC_004307	GCC	2	6	216927	216932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465890
4031	NC_004307	CGG	2	6	217019	217024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465890
4032	NC_004307	GCG	2	6	217057	217062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465890
4033	NC_004307	CGT	2	6	217118	217123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4034	NC_004307	CCG	2	6	217309	217314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465890
4035	NC_004307	ACAAGG	2	12	217369	217380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	23465890
4036	NC_004307	CCGA	2	8	217387	217394	25 %	0 %	25 %	50 %	23465890
4037	NC_004307	ATGGCG	2	12	217414	217425	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	23465890
4038	NC_004307	GCG	3	9	217423	217431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465890
4039	NC_004307	GAC	2	6	217512	217517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4040	NC_004307	TTC	2	6	217518	217523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465890
4041	NC_004307	AGGCCG	2	12	217546	217557	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	23465890
4042	NC_004307	CAG	2	6	217623	217628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4043	NC_004307	GAA	2	6	217653	217658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465890
4044	NC_004307	TGC	2	6	217759	217764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4045	NC_004307	GAA	2	6	217827	217832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465890
4046	NC_004307	TCG	2	6	218006	218011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4047	NC_004307	CGGCT	2	10	218018	218027	0 %	20 %	40 %	40 %	23465890
4048	NC_004307	GCT	2	6	218042	218047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4049	NC_004307	GT	3	6	218048	218053	0 %	50 %	50 %	0 %	23465890
4050	NC_004307	GCC	2	6	218061	218066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465890
4051	NC_004307	GAT	2	6	218084	218089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465890
4052	NC_004307	TCGA	2	8	218241	218248	25 %	25 %	25 %	25 %	23465890
4053	NC_004307	ACC	2	6	218250	218255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465890
4054	NC_004307	CCG	2	6	218266	218271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465890
4055	NC_004307	CGA	3	9	218297	218305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4056	NC_004307	CCA	2	6	218311	218316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465890
4057	NC_004307	GAATG	2	10	218367	218376	40 %	20 %	40 %	0 %	23465890
4058	NC_004307	GCT	2	6	218387	218392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4059	NC_004307	TTCG	2	8	218523	218530	0 %	50 %	25 %	25 %	23465890
4060	NC_004307	GAT	2	6	218610	218615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465890
4061	NC_004307	CCA	2	6	218690	218695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465890
4062	NC_004307	CGC	3	9	218744	218752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465890
4063	NC_004307	CGA	2	6	218770	218775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465890
4064	NC_004307	CGC	2	6	218795	218800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465890
4065	NC_004307	GAT	2	6	218859	218864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465890
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4067	NC_004307	TGC	2	6	218923	218928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465890
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4069	NC_004307	CGG	2	6	219020	219025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465890
4070	NC_004307	AGC	2	6	219028	219033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465890
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4072	NC_004307	CGC	2	6	219359	219364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465891
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4078	NC_004307	TGCCG	2	10	219641	219650	0 %	20 %	40 %	40 %	23465891
4079	NC_004307	CTTC	2	8	219665	219672	0 %	50 %	0 %	50 %	23465891
4080	NC_004307	CGC	2	6	219686	219691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465891
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4084	NC_004307	CATCC	2	10	219899	219908	20 %	20 %	0 %	60 %	23465891
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4087	NC_004307	CAAG	2	8	220237	220244	50 %	0 %	25 %	25 %	23465891
4088	NC_004307	AGG	3	9	220249	220257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	23465891
4089	NC_004307	AAG	2	6	220311	220316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465891
4090	NC_004307	GAC	2	6	220350	220355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465891
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4092	NC_004307	CGA	2	6	220373	220378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465891
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4094	NC_004307	GGCCC	2	10	220440	220449	0 %	0 %	40 %	60 %	23465891
4095	NC_004307	CCA	2	6	220468	220473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465891
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4099	NC_004307	AAGCG	2	10	220576	220585	40 %	0 %	40 %	20 %	23465892
4100	NC_004307	GC	3	6	220597	220602	0 %	0 %	50 %	50 %	23465892
4101	NC_004307	TGC	2	6	220671	220676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465892
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4103	NC_004307	TCG	2	6	220773	220778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465892
4104	NC_004307	ACCG	2	8	220805	220812	25 %	0 %	25 %	50 %	23465892
4105	NC_004307	TTC	2	6	220829	220834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465892
4106	NC_004307	TCG	2	6	220838	220843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465892
4107	NC_004307	TGG	2	6	220902	220907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465892
4108	NC_004307	CAT	2	6	220921	220926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465892
4109	NC_004307	CTT	2	6	220930	220935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465892
4110	NC_004307	AC	3	6	220950	220955	50 %	0 %	0 %	50 %	23465892
4111	NC_004307	TCA	2	6	220959	220964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465892
4112	NC_004307	CGT	3	9	220972	220980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465892
4113	NC_004307	CAC	2	6	221053	221058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465892
4114	NC_004307	GCTG	2	8	221082	221089	0 %	25 %	50 %	25 %	23465892
4115	NC_004307	GGC	2	6	221191	221196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465892
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4117	NC_004307	TGC	2	6	221277	221282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465892
4118	NC_004307	CGG	2	6	221341	221346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465892
4119	NC_004307	TCA	2	6	221379	221384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465892
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4121	NC_004307	CAT	2	6	221464	221469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465892
4122	NC_004307	TTCA	2	8	221483	221490	25 %	50 %	0 %	25 %	23465892
4123	NC_004307	GGCA	2	8	221511	221518	25 %	0 %	50 %	25 %	23465893
4124	NC_004307	CA	3	6	221517	221522	50 %	0 %	0 %	50 %	23465893
4125	NC_004307	CAT	2	6	221574	221579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465893
4126	NC_004307	CTG	2	6	221593	221598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465893
4127	NC_004307	GGC	2	6	221607	221612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465893
4128	NC_004307	CTG	2	6	221617	221622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465893
4129	NC_004307	CGC	2	6	221667	221672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465893
4130	NC_004307	TCG	2	6	221711	221716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465893
4131	NC_004307	GGC	2	6	221769	221774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465893
4132	NC_004307	CAT	2	6	221793	221798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465893
4133	NC_004307	CTG	2	6	221866	221871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465893
4134	NC_004307	AAC	2	6	221947	221952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465893
4135	NC_004307	TTGCC	2	10	221963	221972	0 %	40 %	20 %	40 %	23465893
4136	NC_004307	TTC	2	6	221996	222001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465893
4137	NC_004307	GAT	2	6	222036	222041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465893
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4139	NC_004307	CTGA	2	8	222184	222191	25 %	25 %	25 %	25 %	23465893
4140	NC_004307	TCT	2	6	222302	222307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465893
4141	NC_004307	AAT	2	6	222362	222367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	23465893
4142	NC_004307	GCT	2	6	222520	222525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465894
4143	NC_004307	CTGG	2	8	222664	222671	0 %	25 %	50 %	25 %	23465894
4144	NC_004307	GCA	2	6	222687	222692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465894
4145	NC_004307	CA	3	6	222820	222825	50 %	0 %	0 %	50 %	23465894
4146	NC_004307	ACG	2	6	222939	222944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465894
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4148	NC_004307	GCT	2	6	223115	223120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465894
4149	NC_004307	CCG	2	6	223179	223184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465894
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4151	NC_004307	TTC	2	6	223298	223303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465894
4152	NC_004307	CCAC	2	8	223377	223384	25 %	0 %	0 %	75 %	23465894
4153	NC_004307	CACG	2	8	223404	223411	25 %	0 %	25 %	50 %	23465894
4154	NC_004307	GCT	2	6	223460	223465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465894
4155	NC_004307	GCTC	2	8	223479	223486	0 %	25 %	25 %	50 %	23465894
4156	NC_004307	ATG	2	6	223666	223671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465894
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4158	NC_004307	GTAC	2	8	223883	223890	25 %	25 %	25 %	25 %	23465895
4159	NC_004307	CA	4	8	223912	223919	50 %	0 %	0 %	50 %	23465895
4160	NC_004307	GAC	2	6	223939	223944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465895
4161	NC_004307	GCC	2	6	223976	223981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465895
4162	NC_004307	CGG	2	6	223993	223998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465895
4163	NC_004307	CAT	2	6	224012	224017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465895
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4165	NC_004307	TCG	2	6	224092	224097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465895
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4169	NC_004307	ATG	2	6	224212	224217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465895
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4171	NC_004307	GGC	2	6	224316	224321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465895
4172	NC_004307	CCGA	2	8	224352	224359	25 %	0 %	25 %	50 %	23465895
4173	NC_004307	CTG	2	6	224373	224378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465895
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4179	NC_004307	ACCGG	2	10	224565	224574	20 %	0 %	40 %	40 %	23465895
4180	NC_004307	TGG	2	6	224607	224612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	23465895
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4183	NC_004307	ATC	2	6	224985	224990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465895
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4200	NC_004307	CG	3	6	226311	226316	0 %	0 %	50 %	50 %	23465895
4201	NC_004307	GCC	2	6	226343	226348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465895
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4203	NC_004307	TGC	2	6	226423	226428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465895
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4224	NC_004307	ATC	2	6	227367	227372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465896
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4229	NC_004307	CT	3	6	227578	227583	0 %	50 %	0 %	50 %	23465896
4230	NC_004307	CCG	2	6	227616	227621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465896
4231	NC_004307	GTC	2	6	227652	227657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465896
4232	NC_004307	CTT	2	6	227806	227811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	23465896
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4237	NC_004307	AAG	3	9	228137	228145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465896
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4239	NC_004307	CGA	2	6	228346	228351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465896
4240	NC_004307	CGTT	2	8	228443	228450	0 %	50 %	25 %	25 %	23465896
4241	NC_004307	ACA	2	6	228594	228599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465896
4242	NC_004307	CTG	2	6	228635	228640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	23465896
4243	NC_004307	CGA	2	6	228649	228654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465896
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4245	NC_004307	CAAG	2	8	228717	228724	50 %	0 %	25 %	25 %	23465896
4246	NC_004307	CCGTCA	2	12	228744	228755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	23465896
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4365	NC_004307	TGA	2	6	235116	235121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	23465901
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4369	NC_004307	CGG	2	6	235329	235334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	23465901
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4490	NC_004307	CCA	2	6	241975	241980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465906
4491	NC_004307	ACGGCA	2	12	242071	242082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465906
4492	NC_004307	AAG	2	6	242103	242108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	23465906
4493	NC_004307	CAC	2	6	242129	242134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	23465906
4494	NC_004307	ACA	2	6	242158	242163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465906
4495	NC_004307	CCG	2	6	242185	242190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	23465906
4496	NC_004307	AGGC	2	8	242221	242228	25 %	0 %	50 %	25 %	23465906
4497	NC_004307	ACA	2	6	242272	242277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	23465906
4498	NC_004307	CGA	2	6	242294	242299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	23465906
4499	NC_004307	GT	3	6	242308	242313	0 %	50 %	50 %	0 %	23465906
4500	NC_004307	ACT	2	6	242344	242349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	23465906

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