MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. A2012 plasmid pXO1

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003980	CTAATG	2	12	1883	1894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	21392692
2	NC_003980	TTTCAT	2	12	4314	4325	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	21392696
3	NC_003980	TCAATT	2	12	4334	4345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	21392696
4	NC_003980	CTCTTT	2	12	9372	9383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21392701
5	NC_003980	CGTCTG	2	12	10655	10666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21392701
6	NC_003980	ACAAAA	2	12	15039	15050	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	21392706
7	NC_003980	TTTCTT	2	12	15800	15811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21392707
8	NC_003980	TTTTAA	2	12	16749	16760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21392707
9	NC_003980	TTAATT	2	12	16919	16930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21392707
10	NC_003980	ATGAAT	2	12	18588	18599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21392707
11	NC_003980	ACGCCA	2	12	19797	19808	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	21392708
12	NC_003980	AGTGAT	2	12	25597	25608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21392713
13	NC_003980	GTCTAC	2	12	32520	32531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	21392722
14	NC_003980	TTTTGA	2	12	36261	36272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21392729
15	NC_003980	ATGTAA	2	12	41048	41059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	21392734
16	NC_003980	TTTTTC	2	12	50354	50365	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21392743
17	NC_003980	ATTCTA	2	12	50590	50601	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	21392744
18	NC_003980	TTATTT	2	12	52154	52165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21392750
19	NC_003980	CCGAAT	2	12	55313	55324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21392750
20	NC_003980	GTTCCT	2	12	58638	58649	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	21392753
21	NC_003980	TGAATT	2	12	64440	64451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21392761
22	NC_003980	ATTGAT	2	12	65414	65425	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	21392762
23	NC_003980	ACAGCA	2	12	67706	67717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	21392765
24	NC_003980	TTTGGT	2	12	67883	67894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21392765
25	NC_003980	TTTTGA	2	12	69260	69271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21392766
26	NC_003980	ATCCAG	2	12	70042	70053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	21392766
27	NC_003980	TATAAA	2	12	70068	70079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21392766
28	NC_003980	TAAAGG	2	12	70574	70585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	21392766
29	NC_003980	AAAAAG	2	12	71510	71521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21392767
30	NC_003980	GTTATT	2	12	77302	77313	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21392774
31	NC_003980	ACAGAT	2	12	78958	78969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21392778
32	NC_003980	ATTTGT	2	12	79641	79652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21392778
33	NC_003980	AGAAAT	2	12	80301	80312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21392779
34	NC_003980	CAGAAG	2	12	80738	80749	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	21392779
35	NC_003980	GATTGT	2	12	81858	81869	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21392781
36	NC_003980	AATGAA	2	12	83605	83616	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21392784
37	NC_003980	AATAAA	2	12	87374	87385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	21392788
38	NC_003980	TCAAAT	2	12	87446	87457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	21392788
39	NC_003980	AAGAGA	2	12	93173	93184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21392792
40	NC_003980	AAGAGG	2	12	97859	97870	50 %	0 %	50 %	0 %	21392796
41	NC_003980	ATTTTT	2	12	110329	110340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21392810
42	NC_003980	ATTTTT	2	12	119037	119048	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	21392816
43	NC_003980	TAACTT	2	12	120709	120720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	21392819
44	NC_003980	GAAAAA	2	12	122770	122781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21392820
45	NC_003980	TTCCTT	2	12	128988	128999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21392822
46	NC_003980	AAATTA	2	12	130522	130533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21392825
47	NC_003980	TCTACT	2	12	134337	134348	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21392830
48	NC_003980	TACAAC	2	12	138371	138382	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	21392833
49	NC_003980	GTTAGA	2	12	138530	138541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21392833
50	NC_003980	GAATCA	2	12	143896	143907	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21392840
51	NC_003980	TTCTAA	2	12	144165	144176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	21392840
52	NC_003980	CTTTTT	2	12	150568	150579	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	21392848
53	NC_003980	TCTCTT	2	12	151642	151653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21392848
54	NC_003980	ATGCCC	2	12	156203	156214	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21392858
55	NC_003980	AAAAGA	2	12	158346	158357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21392862
56	NC_003980	TGTTAG	2	12	165409	165420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	21392870
57	NC_003980	AAGAAA	2	12	168001	168012	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	21392873
58	NC_003980	TTCCGG	2	12	170120	170131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21392874
59	NC_003980	TAATTT	2	12	170412	170423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21392874
60	NC_003980	TTTATG	2	12	180729	180740	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	21392890

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.