MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 94743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002929	GCC	2	6	143175	143180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591394
3002	NC_002929	GC	3	6	143217	143222	0 %	0 %	50 %	50 %	33591394
3003	NC_002929	CGCAGG	2	12	143227	143238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33591394
3004	NC_002929	GC	3	6	143266	143271	0 %	0 %	50 %	50 %	33591394
3005	NC_002929	GC	4	8	143293	143300	0 %	0 %	50 %	50 %	33591394
3006	NC_002929	GCC	2	6	143335	143340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591394
3007	NC_002929	GCG	2	6	143378	143383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591394
3008	NC_002929	GGC	2	6	143390	143395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591394
3009	NC_002929	CGCC	2	8	143398	143405	0 %	0 %	25 %	75 %	33591394
3010	NC_002929	ACC	2	6	143413	143418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591394
3011	NC_002929	CGGCG	2	10	143456	143465	0 %	0 %	60 %	40 %	33591394
3012	NC_002929	TGC	2	6	143494	143499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591394
3013	NC_002929	GGGC	2	8	143527	143534	0 %	0 %	75 %	25 %	33591394
3014	NC_002929	CGA	2	6	143543	143548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591394
3015	NC_002929	CGA	2	6	143555	143560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591394
3016	NC_002929	CG	5	10	143678	143687	0 %	0 %	50 %	50 %	33591395
3017	NC_002929	GC	3	6	143690	143695	0 %	0 %	50 %	50 %	33591395
3018	NC_002929	CGC	2	6	143700	143705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591395
3019	NC_002929	CGT	2	6	143735	143740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591395
3020	NC_002929	CAGG	2	8	143754	143761	25 %	0 %	50 %	25 %	33591395
3021	NC_002929	TGC	2	6	143869	143874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591395
3022	NC_002929	CTG	2	6	143895	143900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591395
3023	NC_002929	TTG	2	6	143905	143910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33591395
3024	NC_002929	GCACG	2	10	143919	143928	20 %	0 %	40 %	40 %	33591395
3025	NC_002929	GGC	2	6	143931	143936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591395
3026	NC_002929	GC	3	6	143967	143972	0 %	0 %	50 %	50 %	33591395
3027	NC_002929	GAT	2	6	143988	143993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591395
3028	NC_002929	CCTT	2	8	144130	144137	0 %	50 %	0 %	50 %	33591395
3029	NC_002929	AGT	2	6	144212	144217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591395
3030	NC_002929	AGC	2	6	144256	144261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591395
3031	NC_002929	CGC	2	6	144284	144289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591395
3032	NC_002929	GC	3	6	144308	144313	0 %	0 %	50 %	50 %	33591395
3033	NC_002929	CCG	3	9	144382	144390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591395
3034	NC_002929	TCA	2	6	144419	144424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591395
3035	NC_002929	GC	3	6	144558	144563	0 %	0 %	50 %	50 %	33591395
3036	NC_002929	GGC	2	6	144696	144701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591395
3037	NC_002929	GGT	2	6	144705	144710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591395
3038	NC_002929	TTC	2	6	144727	144732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591395
3039	NC_002929	CGG	2	6	144738	144743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591395
3040	NC_002929	GTC	2	6	144759	144764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591395
3041	NC_002929	TGA	2	6	144788	144793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591395
3042	NC_002929	GGCC	2	8	144833	144840	0 %	0 %	50 %	50 %	33591395
3043	NC_002929	GC	3	6	144914	144919	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
3044	NC_002929	TGAT	2	8	144926	144933	25 %	50 %	25 %	0 %	33591396
3045	NC_002929	GGC	2	6	144955	144960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3046	NC_002929	CGG	2	6	144963	144968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3047	NC_002929	GCG	2	6	144980	144985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3048	NC_002929	CGC	2	6	145038	145043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591396
3049	NC_002929	TGC	2	6	145045	145050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591396
3050	NC_002929	GC	4	8	145052	145059	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
3051	NC_002929	CG	3	6	145070	145075	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
3052	NC_002929	TCG	2	6	145076	145081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591396
3053	NC_002929	AGC	2	6	145082	145087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591396
3054	NC_002929	AGC	2	6	145112	145117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591396
3055	NC_002929	GGC	2	6	145118	145123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3056	NC_002929	TGC	2	6	145142	145147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591396
3057	NC_002929	CGG	2	6	145155	145160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3058	NC_002929	GC	4	8	145193	145200	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
3059	NC_002929	GCA	2	6	145206	145211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591396
3060	NC_002929	GCG	2	6	145307	145312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3061	NC_002929	GCG	2	6	145319	145324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3062	NC_002929	CG	5	10	145326	145335	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
3063	NC_002929	AGC	3	9	145346	145354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591396
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3065	NC_002929	CGG	2	6	145371	145376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3066	NC_002929	CGC	2	6	145380	145385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591396
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3068	NC_002929	GC	3	6	145468	145473	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
3069	NC_002929	GCG	2	6	145476	145481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591396
3070	NC_002929	CCGG	2	8	145510	145517	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
3071	NC_002929	GCGA	2	8	145551	145558	25 %	0 %	50 %	25 %	33591396
3072	NC_002929	GAC	2	6	145594	145599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591396
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3074	NC_002929	CG	4	8	145671	145678	0 %	0 %	50 %	50 %	33591396
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3079	NC_002929	GC	4	8	146047	146054	0 %	0 %	50 %	50 %	33591397
3080	NC_002929	GAC	2	6	146055	146060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591397
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3088	NC_002929	TCG	2	6	146300	146305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591397
3089	NC_002929	GTA	2	6	146343	146348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591397
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3093	NC_002929	AGC	2	6	146515	146520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591397
3094	NC_002929	GC	3	6	146538	146543	0 %	0 %	50 %	50 %	33591397
3095	NC_002929	GCGG	2	8	146546	146553	0 %	0 %	75 %	25 %	33591397
3096	NC_002929	GC	3	6	146565	146570	0 %	0 %	50 %	50 %	33591397
3097	NC_002929	GCC	2	6	146581	146586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591397
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3104	NC_002929	GCA	2	6	148236	148241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591398
3105	NC_002929	GC	3	6	148273	148278	0 %	0 %	50 %	50 %	33591398
3106	NC_002929	CAG	2	6	148333	148338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591398
3107	NC_002929	CGC	2	6	148350	148355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591398
3108	NC_002929	ATG	2	6	148370	148375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33591398
3109	NC_002929	GC	3	6	148416	148421	0 %	0 %	50 %	50 %	33591398
3110	NC_002929	TGCCGA	2	12	148425	148436	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33591398
3111	NC_002929	GTT	2	6	148495	148500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33591398
3112	NC_002929	CAG	2	6	148522	148527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591398
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3119	NC_002929	CGA	2	6	148846	148851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591398
3120	NC_002929	GCC	2	6	148853	148858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591398
3121	NC_002929	GCA	2	6	148887	148892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591398
3122	NC_002929	GC	3	6	149031	149036	0 %	0 %	50 %	50 %	33591399
3123	NC_002929	GGC	2	6	149122	149127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591399
3124	NC_002929	CTACAC	2	12	149188	149199	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	33591399
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3232	NC_002929	GC	3	6	153565	153570	0 %	0 %	50 %	50 %	33591403
3233	NC_002929	GCCTGC	2	12	153572	153583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33591403
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3237	NC_002929	GC	3	6	153931	153936	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
3238	NC_002929	GC	3	6	153940	153945	0 %	0 %	50 %	50 %	33591404
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3242	NC_002929	TGC	2	6	154105	154110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591404
3243	NC_002929	GCG	2	6	154120	154125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591404
3244	NC_002929	ACG	2	6	154131	154136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591404
3245	NC_002929	TCG	2	6	154170	154175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591404
3246	NC_002929	TCGG	2	8	154188	154195	0 %	25 %	50 %	25 %	33591404
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3248	NC_002929	CGT	2	6	154240	154245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591404
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3493	NC_002929	GC	3	6	162223	162228	0 %	0 %	50 %	50 %	33591412
3494	NC_002929	GC	3	6	162238	162243	0 %	0 %	50 %	50 %	33591412
3495	NC_002929	AGG	2	6	162320	162325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33591412
3496	NC_002929	CGG	2	6	162332	162337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591412
3497	NC_002929	CGG	2	6	162359	162364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591412
3498	NC_002929	TCC	2	6	162370	162375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33591412
3499	NC_002929	CTG	2	6	162388	162393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591412
3500	NC_002929	GGT	2	6	162459	162464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591412

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