MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 94743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002929	CGC	2	6	49421	49426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591315
1002	NC_002929	GC	3	6	49443	49448	0 %	0 %	50 %	50 %	33591315
1003	NC_002929	CG	3	6	49474	49479	0 %	0 %	50 %	50 %	33591315
1004	NC_002929	GCG	2	6	49495	49500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591315
1005	NC_002929	GC	3	6	49504	49509	0 %	0 %	50 %	50 %	33591315
1006	NC_002929	GCG	2	6	49543	49548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591315
1007	NC_002929	CGA	2	6	49562	49567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591315
1008	NC_002929	GCG	2	6	49594	49599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591315
1009	NC_002929	CAG	2	6	49611	49616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591315
1010	NC_002929	CGA	2	6	49643	49648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591315
1011	NC_002929	CAG	2	6	49650	49655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591315
1012	NC_002929	GTG	2	6	49665	49670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591315
1013	NC_002929	GC	3	6	49734	49739	0 %	0 %	50 %	50 %	33591315
1014	NC_002929	GTG	2	6	49746	49751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591315
1015	NC_002929	ACA	2	6	49840	49845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591315
1016	NC_002929	GC	3	6	49919	49924	0 %	0 %	50 %	50 %	33591315
1017	NC_002929	TG	3	6	50220	50225	0 %	50 %	50 %	0 %	33591316
1018	NC_002929	GC	3	6	50409	50414	0 %	0 %	50 %	50 %	33591316
1019	NC_002929	CAGC	2	8	50437	50444	25 %	0 %	25 %	50 %	33591316
1020	NC_002929	GCCG	2	8	50498	50505	0 %	0 %	50 %	50 %	33591316
1021	NC_002929	GGT	2	6	50510	50515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591316
1022	NC_002929	CTG	2	6	50544	50549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591316
1023	NC_002929	AAG	2	6	50562	50567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591316
1024	NC_002929	CTTCGT	2	12	50642	50653	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	33591316
1025	NC_002929	C	7	7	50693	50699	0 %	0 %	0 %	100 %	33591316
1026	NC_002929	CTA	2	6	50747	50752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591316
1027	NC_002929	CGC	2	6	50822	50827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591316
1028	NC_002929	CCA	2	6	51014	51019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591316
1029	NC_002929	GC	3	6	51029	51034	0 %	0 %	50 %	50 %	33591316
1030	NC_002929	GCT	2	6	51188	51193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1031	NC_002929	AGC	2	6	51231	51236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1032	NC_002929	GCC	2	6	51359	51364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591317
1033	NC_002929	GCC	2	6	51376	51381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591317
1034	NC_002929	TGC	2	6	51391	51396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1035	NC_002929	TGC	2	6	51406	51411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1036	NC_002929	GCC	3	9	51414	51422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591317
1037	NC_002929	CTG	2	6	51459	51464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1038	NC_002929	TGG	2	6	51475	51480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591317
1039	NC_002929	TGG	2	6	51487	51492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33591317
1040	NC_002929	TGC	2	6	51544	51549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1041	NC_002929	GCG	2	6	51562	51567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591317
1042	NC_002929	CGG	2	6	51617	51622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591317
1043	NC_002929	GCTG	2	8	51646	51653	0 %	25 %	50 %	25 %	33591317
1044	NC_002929	GGC	2	6	51681	51686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591317
1045	NC_002929	GC	3	6	51700	51705	0 %	0 %	50 %	50 %	33591317
1046	NC_002929	GCCCGA	2	12	51722	51733	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33591317
1047	NC_002929	CGGC	2	8	51735	51742	0 %	0 %	50 %	50 %	33591317
1048	NC_002929	CGC	2	6	51748	51753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591317
1049	NC_002929	CGGCG	2	10	51761	51770	0 %	0 %	60 %	40 %	33591317
1050	NC_002929	TTC	2	6	51792	51797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33591317
1051	NC_002929	GCC	2	6	51799	51804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591317
1052	NC_002929	GCG	2	6	51805	51810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591317
1053	NC_002929	TGC	3	9	51820	51828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1054	NC_002929	GC	3	6	51865	51870	0 %	0 %	50 %	50 %	33591317
1055	NC_002929	CCA	2	6	51874	51879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33591317
1056	NC_002929	CTG	2	6	51885	51890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1057	NC_002929	CAA	2	6	51929	51934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33591317
1058	NC_002929	GCC	2	6	51948	51953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591317
1059	NC_002929	TCG	2	6	51958	51963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1060	NC_002929	GC	3	6	51964	51969	0 %	0 %	50 %	50 %	33591317
1061	NC_002929	CGG	2	6	51974	51979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591317
1062	NC_002929	CAT	2	6	51983	51988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33591317
1063	NC_002929	CGCT	2	8	52008	52015	0 %	25 %	25 %	50 %	33591317
1064	NC_002929	CTG	2	6	52029	52034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1065	NC_002929	GCG	2	6	52126	52131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591317
1066	NC_002929	CCT	2	6	52144	52149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33591317
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1068	NC_002929	GCC	2	6	52174	52179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591317
1069	NC_002929	GCT	2	6	52205	52210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
1070	NC_002929	ACCT	2	8	52236	52243	25 %	25 %	0 %	50 %	33591317
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1072	NC_002929	GCT	2	6	52334	52339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591317
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1082	NC_002929	GC	3	6	53771	53776	0 %	0 %	50 %	50 %	33591318
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1091	NC_002929	CG	3	6	54195	54200	0 %	0 %	50 %	50 %	33591318
1092	NC_002929	TGC	2	6	54227	54232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33591318
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1099	NC_002929	CGA	2	6	54452	54457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552528637
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1101	NC_002929	CAT	2	6	54528	54533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552528637
1102	NC_002929	CG	3	6	54545	54550	0 %	0 %	50 %	50 %	552528637
1103	NC_002929	ATC	2	6	54559	54564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	552528637
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1105	NC_002929	GC	3	6	54647	54652	0 %	0 %	50 %	50 %	552528637
1106	NC_002929	GCT	3	9	54668	54676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	552528637
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1109	NC_002929	GC	3	6	54752	54757	0 %	0 %	50 %	50 %	552528637
1110	NC_002929	CGA	2	6	54773	54778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552528637
1111	NC_002929	TGA	2	6	54821	54826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	552528637
1112	NC_002929	GCCCGA	2	12	54837	54848	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	552528637
1113	NC_002929	GAC	2	6	54858	54863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	552528637
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1117	NC_002929	CGA	2	6	55058	55063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33591319
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1119	NC_002929	GGC	2	6	55269	55274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591319
1120	NC_002929	CG	3	6	55286	55291	0 %	0 %	50 %	50 %	33591319
1121	NC_002929	GC	3	6	55309	55314	0 %	0 %	50 %	50 %	33591319
1122	NC_002929	GGC	2	6	55332	55337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591319
1123	NC_002929	GCC	2	6	55374	55379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33591319
1124	NC_002929	CAGC	2	8	55407	55414	25 %	0 %	25 %	50 %	33591319
1125	NC_002929	AGA	2	6	55445	55450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33591319
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1127	NC_002929	GGC	2	6	55529	55534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33591319
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